G14246


Basic Information

Item Value
gene id G14246
gene name NA
gene type misc
species eurasian perch (Perca fluviatilis)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_053113.1
NCBI id CM020910.1
chromosome length 48524041
location 4367603 ~ 4420822 (+)
genome version GENO_Pfluv_1.0_2020_eurasian_perch_Genome

Sequence

>TU18979
acacacacacacagacacacacacacaaacacacacacacacacagacacacagacacacacacacacacagacacacacacacacacacacagacacgcacacacacacacagacacacacacacacacggacacacacacacacacacaccccagacacagacgcgcacacacacagacacagacacacacacacacacacacacacacgtacacacagacacagacacacgcacacacacagacacacacacacacacagacacactcacgcacacacagacacacacacgcacacacagagacacacgcacacacacatgcacacacacacaaacacaggcacacacacacacaaacacaggcacacacacacacaccccgcgCTTGGTGATGTAATCAGTGTGTTGTTCCTCGGAGCtccgtgacctttgacctctctctgttttgttttaactTCAGTGTTTATGTTGCTGCTCTGCTTTGTTCTAATGATGATTTCTTTATGCAGTGTTGATTTGATGAGTTAACCCTTCAGATGGCAGCTCCTCCCCGCCTGGAAAGGTTTAACATGTTTTAgggtctaagtgactgatgggaacaacaatcttcaGCCcagaaatcaccatcaccaaacccaccagactccatgtaaataatcaggacttttatcatcgtaaaacacacttcattcaaagtggacagaaactaaataaaactaccaaaagccgtcttggttcatctttccactgttccaacaatcaccactctggtttggttgaaataaacccttaattcacccatttacatgtggagatatgctggctctatacacgctaaaagtcctgattatttacatggagtctggtggaaacatgctggctctatacacactaaaagtcccgattatttacatggagtctggtggagatatgctggctctatacacgctaaaagtcctgattatttacatggagtctggtggagatgttctggctctatacacgctaaaagtcctgattatttacatggagtctggtggagatatgctggctctatacacgctaaaagtcctgattatttacatggagtctggtggagatatgctggctctatacacgctaaaagtcctgattatttacatggagtctggtggagatatgctggctctatacacgctaaaagtcctgattatttacatggagtctgatggGTAAAGTGTTCTCTGCTCCATTAACATTGTAAACAGTTTTGAAGGTAATTCATGTAAAAACATGCACATAACAATTGCATCTTCCTCTCAAGGGGGGCACTAAAGTCTAATCCTGTAGGTAATATTTAAGTAGTAATGTCTCACGGCCACCGGGGGGAGCTGTCGTCTGAATCCCGAAAGGCGACGGAAAttctgaaaaaagcaacaaaaacatctaaaaacGTGACGAAAACCTTAAAACAGGAACAAAAACTTCTACAAAGCCCCCCATAAATCCTGCCTATGTGTACTTAGTGTTCTCTCCACGTTAGTTATCTGGACATTAGGGCTCAACCATGTGGGGAAAACTTCTAATTGTGATTTTTCTGCCAAGttagtctctggtctcttcagggttagtttctggctctgtgATGGTAAATCtaatgtttctacttcacttcttatttcctgagcACGTGTGAAggactcttgtgttgaagatcAGAAagctgtctgcagcagttagtgtTGGTCGGTCTATTCACTGACAGGACTGATGTGGAGAcaacatgactcagctcttttattctctaactaaatctactaatatggaGCTGAGTCACTATGAGCTGGTCCTCCTCCAACAGGAACTAGAGTCCAATCCTAATCAGGACCCTCTACAGTTATAGGAGGTGGAGACCACTCTCAGCTATCATTTGGTGCCACAGTGGAGAGAACAAACTTCTGACGTCTAAATTCCTGCATTCAGATATATTAGTATGCATGAATTTATGTTACAAAATGTTGTAGGTTTCCCCAGAATGAAGCCGTAGCTCGACGCTCTTCTAAATCTCCTCGTCTTAATCCACATTAAAAAATCCACAGGACCACACGGTAAAAGTTTAACTATTTACTTTTACACAAGAAAGAATAGACCTCTGAACTACACTCagtctatatggttcattcagAATATCCATCTTATtatcttataatatattctgttaatacacggCATCtat
>TU18980
acacacacacacagacacacacacacaaacacacacacacacacagacacacagacacacacacacacacagacacacacacacacacacacagacacgcacacacacacacagacacacacacacacacggacacacacacacacacacaccccagacacagacgcgcacacacacagacacagacacacacacacacacacacacacacgtacacacagacacagacacacgcacacacacagacacacacacacacacagacacactcacgcacacacagacacacacacgcacacacagagacacacgcacacacacatgcacacacacacaaacacaggcacacacacacacaaacacaggcacacacacacacaccccgcgCTTGGTGATGTAATCAGTGTGTTGTTCCTCGGAGCtccgtgacctttgacctctctctgttttgttttaactTCAGTGTTTATGTTGCTGCTCTGCTTTGTTCTAATGATGATTTCTTTATGCAGTGTTGATTTGATGAGTTAACCCTTCAGATGGCAGCTCCTCCCCGCCTGGAAAGGTTTAACATGTTTTAgggtctaagtgactgatgggaacaacaatcttcaGCCcagaaatcaccatcaccaaacccaccagactccatgtaaataatcaggacttttatcatcgtaaaacacacttcattcaaagtggacagaaactaaataaaactaccaaaagccgtcttggttcatctttccactgttccaacaatcaccactctggtttggttgaaataaacccttaattcacccatttacatgtggagatatgctggctctatacacgctaaaagtcctgattatttacatggagtctggtggaaacatgctggctctatacacactaaaagtcccgattatttacatggagtctggtggagatatgctggctctatacacgctaaaagtcctgattatttacatggagtctggtggagatgttctggctctatacacgctaaaagtcctgattatttacatggagtctggtggagatatgctggctctatacacgctaaaagtcctgattatttacatggagtctggtggagatatgctggctctatacacgctaaaagtcctgattatttacatggagtctggtggagatatgctggctctatacacgctaaaagtcctgattatttacatggagtctgatggGTAAAGTGTTCTCTGCTCCATTAACATTGTAAACAGTTTTGAAGGTAATTCATGTAAAAACATGCACATAACAATTGCATCTTCCTCTCAAGGGGGGCACTAAAGTCTAATCCTGTAGGTAATATTTAAGTAGTAATGTCTCACGGCCACCGGGGGGAGCTGTCGTCTGAATCCCGAAAGGCGACGGAAAttctgaaaaaagcaacaaaaacatctaaaaacGTGACGAAAACCTTAAAACAGGAACAAAAACTTCTACAAAGCCCCCCATAAATCCTGCCTATGTGTACTTAGTGTTCTCTCCACGTTAGTTATCTGGACATTAGGGCTCAACCATGTGGGGAAAACTTCTAATTGTGATTTTTCTGCCAAGttagtctctggtctcttcagggttagtttctggctctgtgATGttaaatataatgtttctacttcacttcttatttcctgagaaagtttggacgactcttgtgttgaagataaatctacatgttgtaacatgaactactacagaggAGGTTTTAAATACTT

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU18979 True 2218 lncRNA 0.51 2 4367603 4402914
TU18980 False 1748 TUCP 0.44 3 4367603 4420822

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC120544944 NA coding upstream 142286 4223592 ~ 4225317 (+)
LOC120571237 NA coding upstream 168247 4185906 ~ 4199356 (+)
LOC120544917 NA coding upstream 213087 4150582 ~ 4154516 (+)
LOC120571287 LOC105358025 coding upstream 824398 3537939 ~ 3543205 (+)
LOC120554338 NA coding upstream 1019681 3347816 ~ 3347922 (+)
LOC120570934 NA coding downstream 501265 4922087 ~ 5063976 (+)
LOC120571428 NA coding downstream 745389 5166211 ~ 5173445 (+)
LOC120571154 NA coding downstream 798828 5219650 ~ 5230445 (+)
LOC120572059 NA coding downstream 1026324 5447146 ~ 5461510 (+)
LOC120549121 NA coding downstream 1122469 5543291 ~ 5547333 (+)
G14240 NA non-coding upstream 34182 4332891 ~ 4333421 (+)
G14239 NA non-coding upstream 35030 4332286 ~ 4332573 (+)
G14217 NA non-coding upstream 35478 4331519 ~ 4332125 (+)
G14231 NA non-coding upstream 101434 4265666 ~ 4266169 (+)
LOC120571758 NA non-coding upstream 205304 4154666 ~ 4162299 (+)
G14256 NA non-coding downstream 50445 4471267 ~ 4537198 (+)
G14257 NA non-coding downstream 56715 4477537 ~ 4477913 (+)
G14207 NA non-coding downstream 73060 4493882 ~ 4496518 (+)
G14224 LOC107835021 non-coding downstream 73504 4494326 ~ 4515290 (+)
G14259 NA non-coding downstream 82501 4503323 ~ 4505632 (+)
G14148 NA other upstream 312518 4019244 ~ 4055085 (+)
LOC120544739 NA other upstream 1371288 2977851 ~ 2996315 (+)
zgc:162872 LOC103361195,LOC100694875,LOC101467947,LOC102198539,LOC102776046 other upstream 1402831 2948634 ~ 2964772 (+)
LOC120571130 NA other upstream 1574758 2610872 ~ 2792845 (+)
G14209 LOC102792843 other downstream 79351 4500173 ~ 4527377 (+)
G14187 LOC107380983,LOC108250349,LOC108250351,LOC103477369,LOC103473932,LOC107835021,LOC106936810,LOC102294474,LOC102776571,LOC108229490,LOC103360213,LOC107834023,LOC103368570,LOC102214284,LOC102800009,LOC101480046,LOC101470105,LOC102792843 other downstream 380518 4801340 ~ 5417135 (+)
G14344 NA other downstream 1089935 5510757 ~ 5528619 (+)
rnf169 NA other downstream 1972240 6393062 ~ 6404425 (+)
spcs2 spcs2 other downstream 1987163 6407985 ~ 6417509 (+)

Expression


Co-expression Network