G15109


Basic Information

Item Value
gene id G15109
gene name NA
gene type non-coding
species eurasian perch (Perca fluviatilis)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_053113.1
NCBI id CM020910.1
chromosome length 48524041
location 7096459 ~ 7102085 (-)
genome version GENO_Pfluv_1.0_2020_eurasian_perch_Genome

Sequence

>TU20314
CAGGAGACCATCAGGACCTCCTTCCAGCACTGCACCACCCTGACCATCGCTCACCGGCTCACCTCGGTGCTCACCGCTGATAGGGTCATGGTGCTCAACCAGGGACAGGTGGCGGAGTTTGACGAGCCGTCCAAGCTGCTGGCCAATGAGAACTCTCGGCTGCGCTCCATGCTGGTCGCCATGGAGACCAAGGTGTCTGTAcgaggatgaagaagaggatGAAGATGTACGTGTTCCTGGACTGATCCGAGATCTGAGATCAGAGATCAGAGCTGACAGAATCTAAATCACTTTTGAGTCTGAACACAGAGGGGAAGCCCCGCCCCTTCCTGTgtttaagccccgcccccttcctCCGTAATACCTGCTACGGCCAATAGAGGGCTCTGGGTCAGAATCATGCTGGAACAAACCATCTGGGGGAGTTTTTCGGGGGTCGACAGACTCTAAATGATTACTTTTCTGTCATTAGAGGATCGGTCATCTGGGAGGAAATACTGAGTGTTTTATAAACCTAAAGATATAAAGAAATACTGAAGTTACGTCATAAACATATAAGCATATTAAATAACCTCCAGTTAACTGTAAACACGTTAAATTAGAAGTCAGGCTGTCCTTAAGTCTAGAAACAAATGGTTTGGCTTAAAATCACACGTTTTAGTCGCCTTTTTTCAgactttattgtcacttttttcaacattttgtcgcttttttttgtCGTTTATGTCACTTTATTTAAAAACTTTAGTTGTTTTGCTGCCAgtatataaacataaataaagatCGTATTTATATTTGATGCCTAAACACAGTCCTGTGAGAGTGTTGCCATGGTTTTATTAACCTAAATGCTGGAAGATCTCCTGAACATTTCAACATGAAGATGTAAATAGAACATATATATTCTTCTGCTTGgtttggttttattgttttaacttTAATCTTCAGATTAGATGAGTTATTAGCTGTCAGGACTTCTGACTTCTTCCTGTTTGTCCTTACGTCTCGTAACCATGGAAACACGGGATCTATGGACACAGAATTATCCGCAGAAttcatacaaaataaaagcccctaATGTCTCATAACTGATGGGTTGaaccaccaaaataaaagcccctaATGTCTCATAACTCATGGATTGtaccaccaaaataaaagcccctaATATCTCATAATTGATGGATTGaaccaccaaaataaaagcccctaATGTCTCATAACTAATGGATTGaaccaccaaaataaaagcccctaATTTCTCATAACTGATGGGTTGaaccaccaaaataaaagcccctaATGTCTCATAACTGATGGGTTGaaccaccaaaataaaagcccctaATGTCTCATAACTGATGGATTGtaccaccaaaataaaagcccctaATGTCTCATAACTAATAGATTGAACCACAAAAATAAAAGCCCCTAATGTCTCATAACTGATGGATAAaaccaccaaaataaaagcccctaATGTCTCATAACTAATGGATTGaaccaccaaaataaaagcccctaATGTCTCATAACTGATGGATAAaaccaccaaaataaaagcccctaATGTCTCATAACTGATGGATAAAACCACCAAAATAATAGCCCCTACTGTCTCATAATTGATGGATTGaaccaccaaaataaaagcccctaATGTCTCATAACTGATGGATAAaaccaccaaaataaaagcccctaCTGTCTCATAATTGATGGATTGaaccaccaaaataaaagcccctaATATCTCATAACTGATGGATAAAACCACCAAAATAATAGCCCCTACTGTCTCATAATTGATGGATTGAACCACCAAAATAAAAGACCCTAATGTCTCATAACTGATGGATAAAACCACCAAAATAATAGCCCCTACTGTCTCATAATTGATGGATTGaaccaccaaaataaaagcccctaATGTCTCATAATTGATGGATTGaaccaccaaaataaaagcccctaATGTCTCATAACTGATGGATTGaaccaccaaaataaaagctacTAATGTCTCATAACTGATGGATTTaaccaccaaaataaaagcccctaATGTCTCATAACTGATGGATTGaaccaccaaaataaaagcccctaATGTCTCATAACTGATggataaaaacaccaaaataaaagcccctaCTGTCTCATAACTGATGGATAGaaccaccaaaataaaagcccctaATGTCTCATAACTGATGGATTTaaccaccaaaataaaagctacTAATGTCTCATAACTGAGGGATAGaaccaccaaaataaaagcccctaATGTCTCATAACTGATGGATAAaaccaccaaaataaaagctacTAATGTCTCATAACTGATGGATTGtaccaccaaaataaaagcccccaaTGTCTCATAATTGATGGGTTGTActgccaaaataaaagcccctaATGCCTCATAACTGATGGATTGtaccaccaaaataaaagctcctAATATCTCATAACTGATGGATTGaaccaccaaaataaaagcccctaATGTCTCATAACTGATGGATAAaaccaccaaaataaaagcccttaATGTCTCATAATTGATGGATTGaaccaccaaaataaaagctcctAATGTCTCATAACTGATGGATTGaaccaccaaaataaaagcccctaATGTCTCATAACTGATGGATAAaaccaccaaaataaaagcccctaATGTCTCATAACTGATGGATAAaaccaccaaaataaaagcccctaATGTCTCATAATTGATGGATTGaaccaccaaaataaaagctcctAATGTCTCATAACTGATGGATTGaaccaccaaaataaaagcccctaATGTCTCATAATTGATGGATTGaaccaccaaaataaaagctacTATTGTCTCATAACTGATGGATGaaccaccaaaataaaagctacTAATGTCTCatacaccaaaataaaagcctgttagTACTAGATGAACAGAGCAGACAGGAAGTGCAGCATGACGTCATATCTGCCTTGTTGGG
>TU20315
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>TU20317
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>TU20318
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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU20314 True 3011 lncRNA 0.41 3 7096459 7102085
TU20315 False 2921 lncRNA 0.42 3 7096459 7102085
TU20317 False 2966 lncRNA 0.65 3 7096459 7102085
TU20318 False 2831 lncRNA 0.38 4 7096459 7102085

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
wdr62 NA coding downstream 36763 7036122 ~ 7059696 (-)
LOC120554469 NA coding downstream 54086 7042082 ~ 7042373 (-)
LOC120545524 NA coding downstream 211983 6882361 ~ 6884476 (-)
LOC120545509 NA coding downstream 274229 6820147 ~ 6822230 (-)
LOC120545506 LOC101478264,LOC104929709,LOC102796112 coding downstream 316355 6779175 ~ 6780104 (-)
LOC120544032 NA coding upstream 160889 7262974 ~ 7267714 (-)
LOC120543849 NA coding upstream 296108 7398193 ~ 7412507 (-)
polr2d polr2d coding upstream 392948 7495033 ~ 7509145 (-)
trnag-ucc NA coding upstream 407915 7510000 ~ 7510071 (-)
LOC120551046 LOC106510929 coding upstream 610567 7712652 ~ 7715037 (-)
G15108 NA non-coding downstream 2123 7082808 ~ 7094336 (-)
G15104 NA non-coding downstream 33372 7062501 ~ 7063087 (-)
G15103 NA non-coding downstream 37753 7054160 ~ 7058706 (-)
G15102 NA non-coding downstream 42495 7052082 ~ 7053964 (-)
G15097 NA non-coding downstream 58931 7036678 ~ 7037528 (-)
G15111 NA non-coding upstream 2752 7104837 ~ 7105133 (-)
G15112 NA non-coding upstream 7960 7110045 ~ 7110696 (-)
G15190 NA non-coding upstream 39511 7141596 ~ 7142192 (-)
G15209 NA non-coding upstream 225611 7327696 ~ 7330920 (-)
G15211 NA non-coding upstream 243573 7345658 ~ 7419047 (-)
atg16l2 NA other downstream 63919 7020970 ~ 7032540 (-)
arrb1 arrb1,LOC102797194,LOC100705119 other downstream 128474 6941255 ~ 6967985 (-)
pgm2l1 pgm2l1 other downstream 716003 6359243 ~ 6380456 (-)
G14853 NA other downstream 793647 6302349 ~ 6302812 (-)
G14754 NA other downstream 1390482 5703387 ~ 5705977 (-)
G15110 NA other upstream 281 7102366 ~ 7104090 (-)
G15114 abcc5 other upstream 9614 7111699 ~ 7113608 (-)
LOC120543742 abcc5 other upstream 12634 7114719 ~ 7126398 (-)
rpl35a rpl35a other upstream 27541 7129626 ~ 7136162 (-)
LOC120543599 LOC102193948,LOC103360213,LOC102310147,LOC107834023,LOC106944350,LOC103473932 other upstream 40644 7142729 ~ 7199539 (-)

Expression


Co-expression Network