G15144


Basic Information

Item Value
gene id G15144
gene name NA
gene type non-coding
species eurasian perch (Perca fluviatilis)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_053113.1
NCBI id CM020910.1
chromosome length 48524041
location 7309629 ~ 7329219 (+)
genome version GENO_Pfluv_1.0_2020_eurasian_perch_Genome

Sequence

>TU20362
ATTTTAGTTgtaattttatttgtttaaaattatACCAAGAATCCAAAATAATTAATGGATTCCCCaacgttttatttttaagtttctgacgttttattttgaagtttctGATGTGTTGCGTTCAAGTCAGTGAAAAAACTCAAATTagtcaaattaaaatatttatttaaagcaaTAAAACTTAACTCTTCATACACATGTGTTCAGATCTTTTATACAGTtttcagcaaaacaaaaataaaataaaacaaagtgaaaaaaaaaaaaaaaatgtaaaacttaaAAACCGTGAGTTTGTTTTTCCTCCAGAAAAAACGGTGGAATGTCCTTTAAAAACCCCGTCACCACCGCCGTCACATGACCCTGTCGGTCACATGACCCCGTCACCACCGCAGAGAAAGAAGCacacgaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaaagcagTGGAGATGTGGCCTGAGCCTGTCTGTCTAAATGAAGGTGATTTAAACGTCTGATGCTGCGTCTGCTGGCAGCCTGAGACACTAACGATCCCAAACTCTACACAGGTGATGCTGCGTTCAggtgacacacaaacaaacggaaacttcagaGCGATTAGATATTTAGAACCAGGGCTCGTCTCTTTCACATCTAGTACTAgtactagggatgcactgaatccaggattgggcttctgattcggctgaatattgaGCTTCTTGACAGGGTTctggtttctgctgaaccttagaattttgttcccagggaaccgaaccctacgcttgcactcggcgcgctacgctggtcgccgtagtgacggcgccgttgattacgggaaggtgtttacgtaggtggagcgttcaatgcagcaggctgtgaggaagtggacatggatctggtgagcagaacaagtggacatggatctggtgagcagaacaagtggacatggatctggtgagcagaaaaagtggacatggatctggtgagcagaacaagttgttgtttggcagaactttcagtcaaaagaaggccattcaagtccagctacatgttcaatctgttcaatgctgattggtctggtggtggcgaggaccctaaactatacacaacatggccgctgttacaacatctggtctgaaacatctgaaagaagacgagttgtgcacgaaggaatctccagacagcagccagaatgcagcaacttcaggtacagcaaaggaaggacagtccctgtttacttcattcatgagtttactgggttcatggactgaggatgggaggaggagtcagcaccatctcaaccagggggttcAGGATTCAGACGaaaaccagtccctccagaaaaacgcgatcgcataattcaacgcataatcagccaaagtcggcatattcatgcgggggccacatttttttcgccgcataaattgccgatttccgcgtaaaatatgcggtgcttgcatgaattcataatccccgcatttgcGTTGCAAAAGAAGTCACATATTTCTTAATATTtcttagcagaaagttgaaaaaatgttgcgtttacttaacACGAGAGCGGcagttttcccctgttgccatgggaacgttatgaagtgatgtaattacgccACGTGAACACATGGATCAGAGTGATAAGGCTCtgcgtgaacatcatcgaaagtCAGCGTgctggaggttgaatttgacgtTTACTCTGAGTCTCTTAAGCTGGTATCCaatcagaaagctatcttaatatctgatattatctgtctaagtgctcctgctgtctatattattaatgatttttgaaagtctgtctcttttgtatcttttatttctctctgtttagactattacttttatttttactttaatattatattatttgtatatatttttgtatcgtatttgtttacttattgcaatgactgaatatctgtaaa
>TU20366
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AGGGCACTGACGGTGCCGGCCACCTGGGGGAGCCCTCGCTCCTCCAGGATGTGCAGAGGAA

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU20362 False 1919 lncRNA 0.46 2 7309629 7329219
TU20366 True 5061 lncRNA 0.47 3 7309629 7314793

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
or55e1 LOC104939064 coding upstream 368195 6935046 ~ 6941434 (+)
LOC120543617 NA coding upstream 380044 6913684 ~ 6929585 (+)
LOC120545568 LOC102303044,LOC101479096 coding upstream 398139 6910543 ~ 6911490 (+)
LOC120545541 NA coding upstream 410047 6898638 ~ 6899582 (+)
LOC120545533 LOC101478539 coding upstream 415132 6893550 ~ 6894497 (+)
LOC120545619 abcf3 coding downstream 36577 7365796 ~ 7396634 (+)
trnal-cag NA coding downstream 82611 7411830 ~ 7411912 (+)
LOC120543955 NA coding downstream 101724 7430943 ~ 7440997 (+)
ece2b LOC103361209,LOC101485402 coding downstream 205880 7535099 ~ 7570718 (+)
ano7 ano7,LOC103361833,LOC108228741 coding downstream 244505 7573724 ~ 7603726 (+)
LOC120544121 NA non-coding upstream 31333 7277923 ~ 7278296 (+)
G15127 NA non-coding upstream 129577 7167378 ~ 7180052 (+)
G15124 NA non-coding upstream 151981 7157290 ~ 7157648 (+)
G15123 LOC108250351 non-coding upstream 166016 7142772 ~ 7143613 (+)
G15122 NA non-coding upstream 167462 7141875 ~ 7142167 (+)
G15162 lrch3 non-coding downstream 25779 7354998 ~ 7356557 (+)
LOC120544109 NA non-coding downstream 53419 7382638 ~ 7388682 (+)
G15171 NA non-coding downstream 62194 7391413 ~ 7392310 (+)
G15174 NA non-coding downstream 71546 7400765 ~ 7402776 (+)
G15179 NA non-coding downstream 96221 7425440 ~ 7459538 (+)
G15019 NA other upstream 320233 6972845 ~ 6989396 (+)
spcs2 spcs2 other upstream 892120 6407985 ~ 6417509 (+)
rnf169 NA other upstream 905204 6393062 ~ 6404425 (+)
G14344 NA other upstream 1781010 5510757 ~ 5528619 (+)
G14187 LOC107380983,LOC108250349,LOC108250351,LOC103477369,LOC103473932,LOC107835021,LOC106936810,LOC102294474,LOC102776571,LOC108229490,LOC103360213,LOC107834023,LOC103368570,LOC102214284,LOC102800009,LOC101480046,LOC101470105,LOC102792843 other upstream 1892494 4801340 ~ 5417135 (+)
G15173 LOC102077075 other downstream 68882 7398101 ~ 7399141 (+)
G15234 NA other downstream 162146 7491365 ~ 7492057 (+)
rffl rffl other downstream 477590 7806809 ~ 7853429 (+)
LOC120543808 NA other downstream 497391 7826610 ~ 7828087 (+)
LOC120543711 LOC102298536 other downstream 528834 7858053 ~ 7892473 (+)

Expression


Co-expression Network