G15339


Basic Information

Item Value
gene id G15339
gene name NA
gene type non-coding
species eurasian perch (Perca fluviatilis)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_053113.1
NCBI id CM020910.1
chromosome length 48524041
location 7774441 ~ 7897904 (-)
genome version GENO_Pfluv_1.0_2020_eurasian_perch_Genome

Sequence

>TU20664
tgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctgtctgtgtgtgtctctgtctgtctgtgtgtgtgtgtctctgtctgtctgtgtgtgtgtgtgtctctgtctgtgtgtgtctctgtctgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtctgtctgtgtgtgtctctgtctgtgtgtgtctgtctgtctgtctgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtctgtctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtcttttgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtctctgtgtgtgtctctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtaccttctCTCTACAGAGGTGTGTGGAGACCTCGTGGAGGTGCAGGTAGTCCCGGAGCTCCTTCACCTTCAGCTTCATCAGCTCGGCCCGCTCCAGCAGGTTGCCGTAGAAACGCTGGCAGGTGTGACAAAGCCGGGGGCGGAGCTCCAGCTGGGCCGAGCAGAGGCTGCAGTAGTCCTTCTTacagtccacacacacatgctgacacacagacaggcagac
>TU20665
tgtctgtctgtctgtctgtctgtctgtctgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgttctgtctgtctgtctgtctgtcgtctgtgtgttgtctgtgtctgtgtgtgtgtgtgtctgtctgtctgtgtgtgtgtctgtgtctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtctgtgtgtgtgtctgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtctgtctgtctgtctgtctgtgtgtgtgtctgtgtctgtgtgtgtgtgtgtctgtctgtctgtgtgtgtgtctgtgtctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtatgtgtgtgtctctctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtatgtgtgtg
>TU20666
tgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctgtctgtgtgtgtctctgtctgtctgtgtgtgtgtgtctctgtctgtctgtgtgtgtgtgtgtctctgtctgtgtgtgtctctgtctgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtctgtctgtgtgtgtctctgtctgtgtgtgtctgtctgtctgtctgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtctgtctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtctcctgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtcttttgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtctctgtgtgtgtctctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtaccttctCTCTACAGAGGTGTGTGGAGACCTCGTGGAGGTGCAGGTAGTCCCGGAGCTCCTTCACCTTCAGCTTCATCAGCTCGGCCCGCTCCAGCAGGTTGCCGTAGAAACGCTGGCAGGTGTGACAAAGCCGGGGGCGGAGCTCCAGCTGGGCCGAGCAGAGGCTGCAGTAGTCCTTCTTacagtccacacacacatgctgacacacagacaggcagac
>TU20667
ctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgttgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtttgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtggtccAGCAGGTTCTGGTACTGACCCCTGAGGTTCTGCTGGTCCTGGTACAGCCGTCTCACCCTCTCCATCAGCTCCCACTTCTCACAGCAGCCCTTGTAGTTGACGAAGTTCCTGGCCAGGATCTCCTTCAGCTGGCGCACGCTCAGCGCCTCGATGTCCTGCAGCCCGCTGAGGTCAGACAGGGAGGCCCGGCGGCCCGACACCGGGGCGTCCTCGGGGTCAGACACCtggggagacagacaggcagaacacacacacacacacacagacagacagacagacaggcagacagacagacagacacacagacagacagagtcagCACacaacagtgtttcctctaggattttttttagcagtgggggcagatctgtcggaCCCTCCCC
>TU20669
gtctctgtgtgtgtatgtgtgtttctgtgtctctttgtgtgcgtgtgtctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtctctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtataagcgtgtgtgtgtctctctctctctctgtgtgtgtttctgtgtgtgtttgtgtctgtgtgtgtgtctgtatgtgtgtctgtgtgtgtgtgtg
>TU20670
ctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtatatctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtatgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtatgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtatgtgtgtgtgtgtctgtgtatgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtttgtgtgt
>TU20671
tgtctgtctgtctgtctgtctgtctgtctgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgttctgtctgtctgtctgtctgtcgtctgtgtgttgtctgtgtctgtgtgtgtgtgtgtctgtctgtctgtgtgtgtgtctgtgtctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtctgtgtgtgtgtctgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtctgtctgtctgtctgtctgtgtgtgtgtctgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtatgtgtgtctgtgtgtgtgtgtg
>TU20673
tctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtatgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtctgtgtgtgtctgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtctctgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctctctgtctgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtctgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtctgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtctgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgt
>TU20674
gtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtcttttgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtctctgtgtgtgtctctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtgt
>TU20675
ctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgttgtgtgtctgtgtgttgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtctctgtgtgtgtctctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctctgtgtatgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctct
>TU20677
tgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtctctgtctgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtctctgtctgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtctctctgtgtctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtatgtgtgtgtgtgtctgtgtatgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtatgtgtgtgtgtgtc
>TU20678
tgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtctctgtgtgtgtctctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtctctgtgtg
>TU20679
tgtctgtctgtctgtctgtctgtctgtctgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgttctgtctgtctgtctgtctgtcgtctgtgtgttgtctgtgtctgtgtgtgtgtgtgtctgtctgtctgtgtgtgtgtctgtgtctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtctgtctgtgtgtatgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtctgtctgtctgtctgtctgtctgtctgtctgtctgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtctgtgagtgtgtatgtgtgt
>TU20680
tgtctgtctgtctgtctgtctgtctgtctgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgttctgtctgtctgtctgtctgtcgtctgtgtgttgtctgtgtctgtgtgtgtgtgtgtctgtctgtctgtgtgtgtgtctgtgtctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtctgtgtgtgtgtctgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtctgtctgtctgtctgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtctgtctgtctgtctgtctgtctgtctgtctgtctgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtctgtgagtgtgtatgtgtgt
>TU20681
tgtctgtctgtctgtctgtctgtctgtctgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgttctgtctgtctgtctgtctgtcgtctgtgtgttgtctgtgtctgtgtgtgtgtgtgtctgtctgtctgtgtgtgtgtctgtgtctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtctgtgtgtgtgtctgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtctgtctgtctgtctgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtctgtctgtctgtctgtctgtctgtctgtctgtctgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtctgtgagtgtgtatgtgtgt
>TU20682
gtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtctgtctgtctgtctgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgcgtctgtttatgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtctctgtgtg
>TU20683
tctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtatgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtctctgtctgtgtgtgtctgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtctctgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtctgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtctgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgt
>TU20684
tgtctgtctgtctgtctgtctgtctgtctgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgttctgtctgtctgtctgtctgtcgtctgtgtgttgtctgtgtctgtgtgtgtgtgtgtctgtctgtctgtgtgtgtgtctgtgtctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtctgtgtgtgtgtctgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtctgtctgtctgtctgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgcgtgcgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtctgtctgtgtgtatgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtctgtctgtctgtctgtctgtctgtctgtctgtctgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtctgtgagtgtgtatgtgtgt
>TU20685
gtgtgtgtgtctctgtctgtctgtgtgtgtgtctctgtctgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctctctgtctgtgtgtgtctgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtatgtgtgtgtctgtgtatgtgtgtgtctgtctgtgtgt
>TU20686
tctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtatgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtctgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtatgtgtgtgtgtgtctgtgtatgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtttgtgtgt

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU20664 False 725 lncRNA 0.53 3 7841147 7885902
TU20665 False 441 lncRNA 0.49 2 7805143 7840118
TU20666 True 770 lncRNA 0.45 3 7841147 7885902
TU20667 False 609 lncRNA 0.43 2 7844914 7845704
TU20669 False 243 lncRNA 0.42 2 7798877 7799459
TU20670 False 332 lncRNA 0.40 2 7800299 7870281
TU20671 False 303 lncRNA 0.50 2 7798877 7840118
TU20673 False 371 lncRNA 0.41 3 7884862 7897904
TU20674 False 247 lncRNA 0.41 3 7806112 7841849
TU20675 False 296 lncRNA 0.49 3 7800539 7845704
TU20677 False 448 lncRNA 0.55 4 7774441 7885902
TU20678 False 138 lncRNA 0.50 3 7824703 7885902
TU20679 False 340 lncRNA 0.41 2 7839445 7840118
TU20680 False 366 lncRNA 0.49 2 7839445 7840118
TU20681 False 360 lncRNA 0.49 2 7839445 7840118
TU20682 False 249 lncRNA 0.33 2 7824703 7839328
TU20683 False 363 lncRNA 0.50 4 7884862 7897904
TU20684 False 448 lncRNA 0.50 2 7839445 7840118
TU20685 False 316 lncRNA 0.39 5 7783760 7885723
TU20686 False 359 lncRNA 0.49 5 7800299 7897904

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC120551046 LOC106510929 coding downstream 59404 7712652 ~ 7715037 (-)
trnag-ucc NA coding downstream 264370 7510000 ~ 7510071 (-)
polr2d polr2d coding downstream 265296 7495033 ~ 7509145 (-)
LOC120543849 NA coding downstream 361934 7398193 ~ 7412507 (-)
LOC120544032 NA coding downstream 506727 7262974 ~ 7267714 (-)
LOC120551059 NA coding upstream 85190 7983094 ~ 7986427 (-)
LOC120543635 NA coding upstream 124724 8022628 ~ 8063341 (-)
LOC120543856 NA coding upstream 181320 8079224 ~ 8098464 (-)
LOC120543874 LOC101482597,LOC103360230,LOC107102854 coding upstream 471865 8369769 ~ 8392277 (-)
LOC120543728 NA coding upstream 724578 8622482 ~ 8638087 (-)
G15330 NA non-coding downstream 28780 7667197 ~ 7745661 (-)
G15332 NA non-coding downstream 65764 7682726 ~ 7708677 (-)
G15325 eif4h,LOC102797691,LOC106535584 non-coding downstream 115479 7642621 ~ 7658962 (-)
G15316 NA non-coding downstream 137418 7569982 ~ 7637023 (-)
G15301 NA non-coding downstream 202262 7505947 ~ 7572179 (-)
LOC120544065 NA non-coding upstream 173688 8071592 ~ 8072887 (-)
G15403 NA non-coding upstream 221611 8119515 ~ 8125709 (-)
G15428 NA non-coding upstream 356969 8254873 ~ 8255584 (-)
G15430 NA non-coding upstream 362247 8260151 ~ 8260686 (-)
G15439 NA non-coding upstream 426917 8324821 ~ 8325783 (-)
lrch3 lrch3 other downstream 430548 7309914 ~ 7343893 (-)
LOC120544114 NA other downstream 563075 7207735 ~ 7211366 (-)
LOC120543599 LOC102193948,LOC103360213,LOC102310147,LOC107834023,LOC106944350,LOC103473932 other downstream 574902 7142729 ~ 7199539 (-)
rpl35a rpl35a other downstream 638279 7129626 ~ 7136162 (-)
LOC120543742 abcc5 other downstream 648043 7114719 ~ 7126398 (-)
trnaa-cgc NA other upstream 38352 7936256 ~ 7936327 (-)
LOC120551075 LOC103475274,LOC105922519 other upstream 239397 8137301 ~ 8155303 (-)
G15757 NA other upstream 570453 8468357 ~ 8469760 (-)
G15771 NA other upstream 704013 8601917 ~ 8656963 (-)
LOC120544569 dgkd,LOC102780004 other upstream 794170 8692074 ~ 8742123 (-)

Expression


Co-expression Network