G15552


Basic Information

Item Value
gene id G15552
gene name NA
gene type misc
species eurasian perch (Perca fluviatilis)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_053113.1
NCBI id CM020910.1
chromosome length 48524041
location 8994181 ~ 9091968 (+)
genome version GENO_Pfluv_1.0_2020_eurasian_perch_Genome

Sequence

>TU21033
gtgtgtgtgtgtttgtgtgtgtatgtctgtgagtgtgtgtgtgtgagagagagagtgtgtgtctctgtgtgtgtgtatgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgattgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgcgttgtgtgtgtctgtctctgtgtgtgattgtgtttgtgtgtgtgtgagtgtgtgtctgtgtctgtgtgtgtgcgttgtgtgtgtctgtctctgtgtgtgattgtgtttgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtaaagtgagACAACTCCAATGTTTCTGATAAAAG
>TU21035
TTACACTCACTCACCTATACGGACTACAGATACATCTCCATGTTGGTGATTTACTGGAATCAAACAGCTGATCTGAATTTCCTTTctccagcatgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgattgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtctgtctgtgtgtgtgtgtgtatgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgagtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgagtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgagtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgagtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgagtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgagtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgagtgtgtgtgtgtgggagtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtg
>TU21036
tgtgtgtgtgtgtgtgtgtgagtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgagtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgagtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgagtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtttttgtaggtAGTTAAATACCAACCACTCCTAAACACCATCTCAGAGCTGGGCTATAGGTGCACACTACTAGTTTTCATATTTGGTAGCCTAGGAAACACACACGGGCTGGTAGTAAGAGGGCTGCAACAACTTGGGATGGCCAAAAAGAGGCTAAACAACTTGCAAAGTACTGCGCCATATCTGCTATTATTGGCAGCCGCCACATATGGCGGAGACgctgctacttatacccttaagaactgcgtattgtgctacttataccctaaAGAACTGAGTAATGTGTTACTTATCCTCTTAAGAACTGAGTAATGTGTTACCTATACCCTCGGGAAGTGAGTTTTGTGCGTGTAAGTGATATTGTGAAAATCTGCTGCGTGCCACTGGTCCATGAGTTTGTGTCTTGTACTGCATCTGTAATATTTGTGTCCCTGTACTATTTTTCTATATGTGGACTTAAAtac
>TU21037
TTACACTCACTCACCTATACGGACTACAGATACATCTCCATGTTGGTGATTTACTGGAATCAAACAGCTGATCTGAATTTCCTTTctccagcatgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgattgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtctctctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgagtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgagtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgagtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgagtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgagtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgagtgtgtgtgtgtgggagtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtg

Function

NR:

description
unnamed protein product

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU21033 False 565 TUCP 0.54 3 8994181 9041303
TU21035 True 755 TUCP 0.36 5 9040559 9082408
TU21036 False 712 lncRNA 0.45 3 9082032 9091968
TU21037 False 735 TUCP 0.49 4 9040559 9082408

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
rnf168 NA coding upstream 427594 8547618 ~ 8566587 (+)
LOC120543718 NA coding upstream 524421 8429225 ~ 8469760 (+)
nyap2a LOC103360223 coding upstream 571845 8399400 ~ 8422336 (+)
LOC120551081 NA coding upstream 686971 8244631 ~ 8307210 (+)
LOC120543907 NA coding upstream 868512 8123625 ~ 8125669 (+)
mindy4b NA coding downstream 167109 9259077 ~ 9275432 (+)
LOC120551113 NA coding downstream 191496 9283464 ~ 9301261 (+)
LOC120543803 NA coding downstream 217231 9309199 ~ 9315322 (+)
LOC120543792 NA coding downstream 217239 9309207 ~ 9329512 (+)
LOC120543784 NA coding downstream 239599 9331567 ~ 9339168 (+)
G15543 NA non-coding upstream 42166 8950262 ~ 8952015 (+)
G15516 NA non-coding upstream 67683 8924369 ~ 8926498 (+)
G15514 NA non-coding upstream 77938 8902835 ~ 8916243 (+)
G15517 NA non-coding upstream 94509 8899219 ~ 8899672 (+)
LOC120544096 NA non-coding upstream 98926 8894477 ~ 8895255 (+)
G15567 NA non-coding downstream 26669 9118637 ~ 9119355 (+)
G15571 NA non-coding downstream 80864 9172832 ~ 9175805 (+)
LOC120544104 NA non-coding downstream 137729 9229697 ~ 9233965 (+)
G15575 NA non-coding downstream 166458 9258426 ~ 9273836 (+)
G15577 NA non-coding downstream 340394 9432362 ~ 9599857 (+)
G15540 NA other upstream 63911 8926592 ~ 8930270 (+)
G15525 NA other upstream 143310 8849501 ~ 8850871 (+)
LOC120544007 LOC106595375,LOC106565963,LOC106611916,LOC106588692,LOC106572435,LOC106612550,LOC106583987,LOC103477372 other upstream 185206 8796070 ~ 8808975 (+)
LOC120543817 LOC104967478 other upstream 372527 8551591 ~ 8621654 (+)
G15415 NA other upstream 821690 8170696 ~ 8172491 (+)
G15565 NA other downstream 21874 9113842 ~ 9122292 (+)
G15572 NA other downstream 180931 9272899 ~ 9354628 (+)
G15605 NA other downstream 282186 9374154 ~ 9378204 (+)
serp1 NA other downstream 319522 9411490 ~ 9485847 (+)
G15628 NA other downstream 366510 9458478 ~ 9459217 (+)

Expression


Co-expression Network