G15572


Basic Information

Item Value
gene id G15572
gene name NA
gene type misc
species eurasian perch (Perca fluviatilis)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_053113.1
NCBI id CM020910.1
chromosome length 48524041
location 9272899 ~ 9354628 (+)
genome version GENO_Pfluv_1.0_2020_eurasian_perch_Genome

Sequence

>TU21064
tgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtatatgtgtgtacagGGAGGGGGGCGTGGCCTGTAGCCCCCCCTACTGTCCGATCTGTAGATCCTCCAGCTCCTTCAGCAGCTGATCCTCCTTCTGGAGCTTCTCCAGCTGAGGAAAACAAACGCACCTCATTATTGATTAGTGATCAGTTATCTGTTATTAACATCTGCAAACAACATTACAGCTACAAACATGTAGAAACAAGTCACAAAACATGGGTAATAGTGACTAAAACATCACATATTGTTGCACACTTGTGTATATTTGAgtatatttgtgtatatttgagtatatttgtatatatatgagCAGTTTTTGagtatatttgtgtatatatgagcagtatttgagtatatttctgtatatatgaGCAGTATAGCAGTATATCTTTGTATATATGAGCAGTATTTGAgtatatttctgtatatatgaGCAGTATAGAATTATATTCTGTATATATGAGCAGTATTTGAgtatatttctgtatatatgaGCAGTATAGCAGTATATCTCTGTATATATGAGCAGTATATGAGTATATCTCTGTATATATGAGCAGTATTTGAgtatatttctgtatatatgagc
>TU21065
gtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtatatgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtatgtttgtctgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtatgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgttgtgtgtgtgtctctgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtctctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgt
>TU21067
tgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgttgtgtgtgtgtctctgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtctctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgt
>TU21068
tgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtatatgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtatgtttgtctgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtatatgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtatgtttgtct

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU21064 False 694 lncRNA 0.36 2 9342083 9349088
TU21065 True 883 TUCP 0.46 4 9272899 9354628
TU21067 False 880 lncRNA 0.50 4 9342083 9354628
TU21068 False 389 lncRNA 0.44 4 9342083 9349979

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
rnf168 NA coding upstream 706312 8547618 ~ 8566587 (+)
LOC120543718 NA coding upstream 803139 8429225 ~ 8469760 (+)
nyap2a LOC103360223 coding upstream 850563 8399400 ~ 8422336 (+)
LOC120551081 NA coding upstream 965689 8244631 ~ 8307210 (+)
LOC120543907 NA coding upstream 1147230 8123625 ~ 8125669 (+)
LOC120551143 NA coding downstream 189391 9544019 ~ 9554616 (+)
LOC120547748 LOC100707466,LOC102206406,LOC103373746,LOC101483620,LOC102290800 coding downstream 248632 9603260 ~ 9625781 (+)
clip3 clip3 coding downstream 396003 9750631 ~ 9797726 (+)
trnar-ucu_10 NA coding downstream 515205 9869833 ~ 9869924 (+)
trnar-ucu_11 NA coding downstream 529885 9884513 ~ 9884604 (+)
LOC120544104 NA non-coding upstream 38934 9229697 ~ 9233965 (+)
G15571 NA non-coding upstream 97094 9172832 ~ 9175805 (+)
G15567 NA non-coding upstream 153544 9118637 ~ 9119355 (+)
G15543 NA non-coding upstream 320884 8950262 ~ 8952015 (+)
G15516 NA non-coding upstream 346401 8924369 ~ 8926498 (+)
G15577 NA non-coding downstream 77734 9432362 ~ 9599857 (+)
G15629 NA non-coding downstream 130473 9485101 ~ 9506128 (+)
G15613 NA non-coding downstream 130573 9485201 ~ 9488596 (+)
G15632 NA non-coding downstream 163403 9518031 ~ 9653954 (+)
G15616 NA non-coding downstream 170287 9524915 ~ 9526067 (+)
G15565 NA other upstream 150607 9113842 ~ 9122292 (+)
LOC120543609 LOC108250351,LOC108250349 other upstream 174335 8906730 ~ 9098564 (+)
G15552 NA other upstream 180931 8994181 ~ 9091968 (+)
G15540 NA other upstream 342629 8926592 ~ 8930270 (+)
G15525 NA other upstream 422028 8849501 ~ 8850871 (+)
G15605 NA other downstream 19526 9374154 ~ 9378204 (+)
serp1 NA other downstream 56862 9411490 ~ 9485847 (+)
G15628 NA other downstream 103850 9458478 ~ 9459217 (+)
G15640 NA other downstream 243685 9598313 ~ 9669529 (+)
LOC120551159 fam13c other downstream 276763 9631391 ~ 9652831 (+)

Expression


Co-expression Network