LOC120570356 (ypelc,ypel2,LOC106931471,LOC106940241,LOC101067200,LOC107659943,LOC106603438,LOC107599611,LOC101078269,LOC104940871)
Chromosome Information
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NC_053113.1 |
NCBI id |
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location |
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Sequence
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>XM_039818702.1
TGCACTATCACTTTTTCCACgtgcaaatatgaaaacactgctTACACAAAGGCCTTATGCTGGTCGTAACACAGCTGCACAACATAAATCTGTTTAATGTGTCTCATCAATAGAAGTTTTCATGTTGTGGAAAATAAAGGCCTGCAAGAAAGTAACTGCATCGCAAGAGTCCTTCCAGGGCAGCCAAGGCAGAGCCTACCTGTTCAACTCAGTggtgAACGTCGGGTGTGGCCCTGCAGAGGAGAGAGTTCTGCTCACAGGCCTGCATGCTGTCGCAGATATCTACTGTGAGAACTGCAAGACCACCCTGGGCTGGAAATACGAACATGCCTTTGAGAGCAGTCAGAAGTATAAAGAGGGCAAGTTCATCATCGAGCTGGCCCACATGATCAAGGACAACGGCTGGGACTGAGGGACAAGCAGCTGGGACACGACCAcagcagaggagagggaggggggagggggctgGATGGACAAATGGATGGGAGAGATGGGGGTCGTGTGTGGTGGGTGAGTGTGTGACTTTGGTTTGGCTGATTTACAATTAACCCTGTGTTAACTCTCTGCCCATCCCTCCCTACCACGCCTCttgatgtacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacaaacacacaaacacacagacacacacattcatcaaGGTCCCAGACATCCCAGcttgacagagagacagactagGCAGGCTTTTGCACAGCTAGCAGGTCTAGATGACTGGCCAGCAAGATGTctcattttcacatttaaaaaaacatgatttgatAGCTCATTCAGAGGGTAGCAACACTCCCTCTATACCTGCTAGAAGACATCTTCATTGTGTGAAGTATTCCACCTTGTCTAACAATAATGATTAAGCCAGTTGTATACGGGTCATTCAGTGGAAATTTAGCCAGAAGGAAGGCAGTTAGGCCGGCCTGGCGGGTTTCATTGGCCTTGGTTGAAGAGCTGACGGGCATTCTCTCTGTCCACAGCTTGAATCAGATGACCTAAGATGATTATAGCAAATCCAGCTGATCGGGGCCATGCCAGCTGGGCCAGTGATGAGGCCTGGCTCTGAGGCTTGGCACAGAGGCCTGAGCACATGGGTGTTGGGTTGTGGCGCAGGGCTGGGGTGATTGCGGGGATTGCCGCCCACCAGGCCGCTCTCTCAACATGGTGGGGAGGGGAAAATCCTGATCCAGTTATGCAGTGGCATTGATGGCTTCTGGCTGGGATTCACTCCATGTCTTGCCAGTGATGCAGCTCATGACGGGccaagagtgaaagagatacagacagacaaccACCGGCTTGTCCTAAAACCTCACAGGAATTTGCCCTCGCAGCAGCAAAGCAGCTCCCCTTGGTTAATACAACAAGTCGTGTATAGGGATCTGCTGATACTTCCCGTGTATGTTTGGTGTCatcagatgcatcgttgcatccACCTTTGTTACTTGGCCAGGTAGAATTACACAATATAAGCGTGTCTCAGGTGAACAACTTTGGCTGGGATTCCCAAAGGTTTGCAAGCACTGTGAACATCTTTCTGCTGTTGGAGGTGGATGAACTAAGGTGACGAAGCTCTGCAGGCCTTGGGAAGGCTGGGGGCGGCTAGTGATCAGTGAGATACAAACACAACCCCTGCTGATCAGTGAGATACAAACACAACCCCTGCTATCATGCAAATAACAGTGTGATTTGTGGCCGGACTGCATTTACTGGTTTCATGGGCCAAGGGAAAATGCAAATAGTAAAGAAATTCACACGGAAAGTAAATGATTACTTTCACTGAAGTTACGAGGTATATACATACCACAGCGGTGTGTACTGTAGAtgaatatgtttaaaatgtatcaCTCTTAGGCTCTCTTTCAGTCTGGGATGACTGCTGTTTAACTGCTGTTACACTGATCTTCACTAACTGGCCCTCATGAAACATTATAACAAAAACTACTGGACAACATTATAAAGAAATGCACTAGATAGACCAACTTGCCTATTCTTTTGTTCCTTAATGCACCAACACATTATCTTTTTAGGTTTtgcccaagtttttttttttttttcagttagctAAAATATTCCTAATGCATCATGGGCCTTTGATTTATGACACCTGGGTAATATTTGAGGTAACATTAATGGGAAGCATTGCTCAGGTACTTTCATTCTACCTTTTCTTTGCTAAGGCCAGAATCCTACTTAATGTGCTGGATGTGTTATTATTCTCTGATGGAAATGTATTATTTTCAAATGAGAGAATCCATCCCATGGATATGCAACATGAATGCATGCATGAAGTAAAACAAGTGTTCTGACCAGTTTTGTGCTCGGTCCTCATCACATTTTTGTGAAAAGAACATTTTGTGTATACTAGAGTTGCAATGAAACCTTGTGCTGTAATACAACATCTAATCAGTTTCACCCCAGTTCATTTAAGCTGCGAGATCCGTCTTCTTTAGATTAAATGTGATCATGGTTTAGAAAAGTCAAATTAGCTGCACCGTTTGTCACACAGTTTCCCGTTGTTGCGAACATTGCTCTAGATGTTGCCCTGTATATGGTGAGTGCTGTTCAAGACTCTCCAGTTACAAccaaacctaaacagataactCTCTTCAGTAACACTCAGCAAGTGACTGCTGAGTTGGAGGCTGCGACATTAAACCCAGCACAACCAAAGAACCCACTCGTCAACAATAAATTGACCAAACAAAAGATCCAATTTTGCTTTGTCAAGTGTTGCAAAACAAGAGGATGTGTACAGCTGAAAGCCAAGGTTGTGGATAGCCTTTCTCTGTGATATATATAATGCATTATGATTTTGTAAACATAAGATcttaatatatgaatatattatatttactgtattcacCACGAGGATTACCATTCATGTCAACCTCTGTGTTACAGACTGTAAATAGTGTTAATGTATTGTGTTTTATCTATGATCCATACAGCGATTAATGAATATGATTTAGGTCATGTCATGCTTTCTCTCTGGTACCCCACATTGGCTGTACGATACTACTTTTTTACTGAAAATGTTTCAATTTTAATGTCTTTTGTAAAGGAGGATGCTGATGTTGACTATATATCATTGGATCTTCATCTAATAAAATGCACCTTGATATCTGTA
>XR_005641048.1
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>XR_005641049.1
tctgcctcttctGAACTCTGCTGGGCATCATTGCGCGTCAAAACATTGCGTCTCTGCAGGACTTGCCAGGGCCGAGAGAAAAGGAACATTTTCCTGGGAAGGAATGCGAAAGGGGGTTTAGGATTGGCACTGCCAAGAAGAAAACGAGGAGGTGCGACATTTTCTAAGATACGTGGAGatccgttttttttcttcccttcaAAGGTGTTCACCTCCCAACCCACCGCCCACCACGGCCCTCACCTGTGTGTTGCGGTGCTTCCCTTGTGAGCCGACCTGGGCTGGCAGTCCCTTCTTGCACCGCCCGCCGACTCCGCCCATGGTCAGAATGACGCGCTCCAAGACCTTCCAGGCGTACCTGCCAAGCTGCCACCGAACGTACAGCTGCATCCACTGCCGAGCTCATCTGGCCAACCACGACGAGCTCATCTCCAAGTCCTTCCAGGGCAGCCAAGGCAGAGCCTACCTGTTCAACTCAGTggtgAACGTCGGGTGTGGCCCTGCAGAGGAGAGAGTTCTGCTCACAGGCCTGCATGCTGTCGCAGATATCTACTGTGAGAACTGCAAGACCACCCTGGGCTGGAAATACGAACATGCCTTTGAGAGCAGTCAGAAGTATAAAGAGGGCAAGTTCATCATCGAGCTGGCCCACATGATCAAGGACAACGGCTGGGACTGAGGGACAAGCAGCTGGGACACGACCAcagcagaggagagggaggggggagggggctgGATGGACAAATGGATGGGAGAGATGGGGGTCGTGTGTGGTGGaAACACATCCACCATCTGAGTCTCATGGGTTGCACCTGTACCTTATCTCCGTGACAACATCATCAGATGTTTCCAGGGATACAGATGCTGAAGAAAAGcGTCAGGGGGAAGCAGAGCCGCAACACAGAGTGAAGTGTTCATATGGGTCTGATATTCGGCTTCTCAATGGACGAAGAACAATACACCTTCAGAGTCTAATGTGGAAACtttattaatttaaattgtTATTCAAACTCACATATCATAGTCCTTACAAATTATTAAATCATCGTATCTccata
Function
symbol |
description |
ypel2
|
Predicted to enable metal ion binding activity. Predicted to be located in nucleolus.
|
NR:
description |
PREDICTED: protein yippee-like 2 isoform X2 |
GO:
id |
name |
namespace |
GO:0031641
|
regulation of myelination |
biological_process |
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|
negative regulation of protein kinase B signaling |
biological_process |
GO:0005634
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nucleus |
cellular_component |
KEGG: NA
RNA
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representative |
length |
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exon number |
start site |
end site |
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True |
3886 |
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XM_039818693.1 |
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XM_039818702.1 |
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mRNA |
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XR_005641048.1 |
False |
2927 |
transcript |
0.46 |
6 |
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26334719 |
XR_005641049.1 |
False |
1058 |
transcript |
0.52 |
7 |
26307064 |
26334719 |
Neighbor
gene id |
symbol |
gene type |
direction |
distance |
location |
bcl7bb |
bcl7b,LOC102791254
|
coding |
downstream |
45269 |
26259446 ~ 26261795 (-) |
baz1b |
baz1b,LOC102789732
|
coding |
downstream |
48048 |
26242881 ~ 26259016 (-) |
LOC120572189 |
LOC103357875,LOC102300835,LOC102196867,LOC101475975
|
coding |
downstream |
150519 |
26135814 ~ 26156545 (-) |
dner |
dner
|
coding |
downstream |
268506 |
25986594 ~ 26038558 (-) |
pid1 |
pid1,LOC102785909
|
coding |
downstream |
324849 |
25950551 ~ 25982215 (-) |
gdpd1 |
gdpd1
|
coding |
upstream |
2832 |
26337551 ~ 26348184 (-) |
LOC120574272 |
pde2a
|
coding |
upstream |
136921 |
26471640 ~ 26663398 (-) |
LOC120575574 |
arap1
|
coding |
upstream |
348844 |
26683563 ~ 26744794 (-) |
stard10 |
stard10
|
coding |
upstream |
413539 |
26748258 ~ 26762729 (-) |
inppl1a |
inppl1
|
coding |
upstream |
484365 |
26819084 ~ 26847951 (-) |
G19663 |
hip1
|
non-coding |
downstream |
6973 |
26296499 ~ 26300091 (-) |
G19566 |
rnf7
|
non-coding |
downstream |
136496 |
26168674 ~ 26170568 (-) |
G19551 |
NA
|
non-coding |
downstream |
178644 |
26124237 ~ 26128420 (-) |
G19466 |
NA
|
non-coding |
downstream |
575949 |
25721493 ~ 25731115 (-) |
G19438 |
NA
|
non-coding |
downstream |
639835 |
25622986 ~ 25667229 (-) |
G19685 |
NA
|
non-coding |
upstream |
72569 |
26407288 ~ 26408748 (-) |
G19700 |
NA
|
non-coding |
upstream |
153139 |
26487858 ~ 26559669 (-) |
G19788 |
NA
|
non-coding |
upstream |
525064 |
26859783 ~ 26861307 (-) |
G19811 |
NA
|
non-coding |
upstream |
570454 |
26905173 ~ 26908000 (-) |
G19832 |
NA
|
non-coding |
upstream |
678929 |
27013648 ~ 27021216 (-) |
trip12 |
trip12
|
other |
downstream |
217362 |
26041295 ~ 26089702 (-) |
G19270 |
ptx3
|
other |
downstream |
2054151 |
24248031 ~ 24252913 (-) |
G19140 |
gmps,LOC102797084
|
other |
downstream |
2479110 |
23823821 ~ 23827954 (-) |
slc33a1 |
slc33a1
|
other |
downstream |
2497612 |
23802515 ~ 23809452 (-) |
atm |
atm,LOC102794456
|
other |
downstream |
2548238 |
23729488 ~ 23758826 (-) |
LOC120570434 |
fam124b
|
other |
upstream |
99562 |
26434281 ~ 26445935 (-) |
cul3b |
cul3,LOC104924156,LOC100710156,LOC107099750,LOC108240497,LOC104940878,LOC103474461,LOC108428259,LOC102194569,LOC101170875
|
other |
upstream |
116661 |
26451380 ~ 26469896 (-) |
G19840 |
NA
|
other |
upstream |
753887 |
27088606 ~ 27089064 (-) |
cwf19l2 |
cwf19l2
|
other |
upstream |
1489886 |
27824605 ~ 27847548 (-) |
G20417 |
scarf1
|
other |
upstream |
3112451 |
29447170 ~ 29448655 (-) |
Expression
Homologous
species |
gene id |
symbol |
gene type |
chromosome |
NCBI id |
location |
tiger barb (Puntius tetrazona) |
G129795 |
NA
|
non-coding |
NC_056717.1 |
CM032086.1 |
1700588 ~ 1704532 (+) |