G138817


Basic Information

Item Value
gene id G138817
gene name NA
gene type non-coding
species eurasian perch (Perca fluviatilis)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_053124.1
NCBI id CM020921.1
chromosome length 39224300
location 35971837 ~ 35998150 (+)
genome version GENO_Pfluv_1.0_2020_eurasian_perch_Genome

Sequence

>TU187062
gagacaggctgtgtccctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtccctgtgtgtgtgtgtgtgtccctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtccctgtgtgtgtgtccctgtgtgtgtgtcccctgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgttttgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtttgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtg
>TU187063
gtctgtgtgtgtgtgtgtgtctctctgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgttttgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtttgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtg
>TU187064
gtctgtgtgtgtgtgtgtgtctctctgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgttttgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtttgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtg
>TU187065
gtctgtgtgtgtgtgtgtgtctctctgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctctctgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgttttgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtttgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtg
>TU187066
gtctgtgtgtgtgtgtgtgtctctctgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgttttgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtttgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtg
>TU187067
gtctgtgtgtgtgtgtgtgtctctctgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtttctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtttctctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgttttgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtttgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtg
>TU187068
gagacaggctgtgtccctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtccctgtgtgtgtgtgtgtgtccctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtccctgtgtgtgtgtcccctgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtttgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtg

Function

NR:

description
PREDICTED: DCN1-like protein 1 isoform X1

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU187062 True 669 lncRNA 0.51 3 35973681 35998150
TU187063 False 520 lncRNA 0.50 3 35971837 35998150
TU187064 False 522 lncRNA 0.50 3 35971837 35998150
TU187065 False 550 lncRNA 0.50 3 35971837 35998150
TU187066 False 558 lncRNA 0.50 3 35971837 35998150
TU187067 False 636 lncRNA 0.49 3 35971837 35998150
TU187068 False 378 lncRNA 0.52 3 35973681 35998150

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC120571435 NA coding upstream 13369 35956417 ~ 35958468 (+)
LOC120570967 LOC106675582 coding upstream 16678 35953855 ~ 35955159 (+)
LOC120571424 LOC106633724 coding upstream 456055 35515121 ~ 35515782 (+)
LOC120571395 NA coding upstream 504667 35447774 ~ 35467170 (+)
LOC120570972 NA coding downstream 150371 36148521 ~ 36153226 (+)
LOC120571441 NA coding downstream 197200 36195350 ~ 36256121 (+)
LOC120570973 NA coding downstream 276763 36274913 ~ 36277816 (+)
LOC120571542 NA coding downstream 284133 36282283 ~ 36292736 (+)
LOC120571543 NA coding downstream 308500 36306650 ~ 36317353 (+)
G138821 NA non-coding upstream 2854 35968594 ~ 35968983 (+)
LOC120571440 fam63a non-coding upstream 32487 35780811 ~ 35939350 (+)
G138680 NA non-coding upstream 38001 35837179 ~ 35933836 (+)
G138813 NA non-coding upstream 129228 35824676 ~ 35842609 (+)
G138726 LOC101480093 non-coding upstream 134697 35808155 ~ 35837140 (+)
G138824 NA non-coding downstream 4766 36002916 ~ 36003576 (+)
G138825 NA non-coding downstream 38257 36036407 ~ 36036819 (+)
G138702 NA non-coding downstream 41377 36039527 ~ 36051154 (+)
G138746 NA non-coding downstream 97524 36095674 ~ 36130584 (+)
G138829 LOC101480093,LOC101481809 non-coding downstream 106915 36105065 ~ 36153414 (+)
LOC120571439 LOC106675582 other upstream 152871 35803304 ~ 35818966 (+)
G138806 NA other upstream 247435 35706900 ~ 35724402 (+)
LOC120570963 fam63a,LOC107589430 other upstream 357272 35518916 ~ 35614565 (+)
LOC120570962 LOC106676000,LOC106675582 other upstream 420682 35496877 ~ 35551155 (+)
LOC120571400 LOC106675582,LOC106676976,LOC106675585,LOC101480093 other upstream 455220 35439347 ~ 35516617 (+)
LOC120571445 LOC106675582,LOC106676976 other downstream 11837 36009987 ~ 36104537 (+)
G138676 NA other downstream 67221 36065371 ~ 36257319 (+)
LOC120571442 LOC106675582,LOC106676446 other downstream 108567 36106717 ~ 36215827 (+)
G138711 LOC106675582,LOC106676000 other downstream 139997 36138147 ~ 36215671 (+)
G138693 NA other downstream 231180 36229330 ~ 36247084 (+)

Expression


Co-expression Network