G140582


Basic Information

Item Value
gene id G140582
gene name NA
gene type misc
species eurasian perch (Perca fluviatilis)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_053125.1
NCBI id CM020922.1
chromosome length 39125861
location 1929623 ~ 2030627 (+)
genome version GENO_Pfluv_1.0_2020_eurasian_perch_Genome

Sequence

>TU189594
TATTTATGACTCGTTCTTCAAGGTTTATGTATTCCCTGCTGCTCGGGTCAGTAAGGGCATTTGAGAAAGGTTCTCCTCCCAAGTCTAGTGAGAGGCTGTAAACAGGTTCAAGGGCCAAAGTGATGGGTGCGGCTGTTGAAGATGCGCCTGTTGTAGAAGAAGTTGTTTTAGGTGCAGTTGTcataggtgctgctgttgtacgTGCAGAAGTTGtagctgctgctgttgtaggtgctgcagtatTAGGtacagcagttgttggggcagctgttgttgttgctgcttctgtggttgttgttggagcagctgtcgTTGctacagctgtggttgtcgttgctgcttctgtggttgttgttgctccagccgttgttgttgttggggcagctgtggttgtcgttgctgcttctgtggttgttgttggggcagctgtggttgtcgttgctgcttctgtggttgtagtTGGAGCAgctgtggttgtcgttgctgcagatGTGCTTGTCGTtactgcttctgtggttgttgttggggcagctgtggttgtcgttgctgcttctgtggtagttgttggggcagctgtggttgtcgttgctgcagctgtgattgtcgttgctgcttctgtggttgttgttggagcagctgtggttgtcgttgctgcagctgtggttgttgttgctgcttctgtggttgttgttggagcagctgtggttgtcgttgctgcttctgtggttgttggggcagctgtggttgtcgttgctgcttctgttgttgttgttggggcagctgtcgttgtcgttgctgcttctgtggttgtagtTAAAgcgctgtggttgtcgttgctgcagctgtgcttGTCGTtactgcttctgtggttgttgttggggcagctgtggttgtcgtt
>TU189597
gcagctgtggttgtcgttgctgcagctgtggttgttgttgctacttctgtggttgttgttggagcagctgtggttgtcgttgctgcttctgtggttgttgttgctgcttctgtggttgtcgttgctgcttcggtggttgttgttgctgcagctgtggttgttggggcagctgtggttgtcgttgctgcttctgtggttgttgttggagcagctgtcgTTGctacagctgtggttgtcgttgctgcttctgtggttgttgttgctccagctgtggttgttgttggggcagctgtggttgtcgttacTGCCTCTGTGGTTGTTGATGCTGCttgtgtggttgttgttggggcagctgttgttgttgttgctgcttctgtggtagttgttggggcagctgtggttgtcgttgctgcagatGTGCTTGTCGTTattgcttctgtggttgttgttgctgctgtggttgttgttggggcagcggttgttgtcgttgctgcttctgtggttGTAGTtaaagcagctgtggttgtcgttgctgcttctgtggttgttgttggggcagttgtggttgtcgttgctgcttctgtggttgttgttggggcagctgtggttgtcgttgctgcttctgttgttgttgttgttggggcagttgtggttgtcgttgcttcttctgtggttgttgttggggcagctgtggttgtcgttgctgcttctgttgttgttgttggggcagctgtcgttgtcgttgctgcttctgtggttgtagttaaagcagctgtggttgtcgttgctgcagatGTGCTTGTCGTtactgcttctgtggttgttgttggggcagctgtggttgtcgttgctgcttctgtggtagttgttggggcagctgtggttgtcgttgctgcagctgtgattgtcgttgctgcttctgtggttgttgttggagcagctgtggttgtcgttgctgcagctgtggttgttgttgctgcttctgtggttgttgttggagcagctgtggttgtcgttgctgcttctgtggttgttgttggggcagctgtggttgtcgttgctgcttctgtggttgttgttggggcagctgtggttgtcgttgctgcttctgttgttgttgttggggcagctgtcgttgtcgttgctgctgtggttgttgttgctgcttctgtggttgttgttgagcagctgtggttgtcgttgctgcagctgtggttgtcgttgctgcttctgtggttgttgttgagcagctgtggttgtcgttgctgcagctgtggttgttgttgctgcttctgtggttgttgttggggcagctgtggttgtcgttgctgcttctgtggttgttgttggggcagctgtggttgtcgttgcttcttctgtggttgttgttggggcagctgtggttgtcgttgctgcttctgttgttgttgttggggcagctgtcgttgt

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU189594 False 898 TUCP 0.51 3 2022097 2030627
TU189597 True 1449 lncRNA 0.52 5 1929623 2026222

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
paqr9 paqr9 coding upstream 187254 1739323 ~ 1742369 (+)
rap1gds1 rap1gds1 coding upstream 308773 1582729 ~ 1620850 (+)
spata6l NA coding upstream 385737 1522996 ~ 1543886 (+)
trmt10a trmt10a coding upstream 410058 1508801 ~ 1519565 (+)
ccdc96 NA coding upstream 423969 1488484 ~ 1505654 (+)
LOC120572142 NA coding downstream 8343 2038970 ~ 2102372 (+)
LOC120572444 NA coding downstream 179581 2210208 ~ 2210559 (+)
ank2b ank2,LOC103361685,LOC107384730 coding downstream 248307 2278934 ~ 2450242 (+)
mad2l1 mad2l1,LOC102790739,LOC103155071,LOC106941438 coding downstream 634062 2664689 ~ 2669131 (+)
zcchc4 LOC104953644,LOC104953641 coding downstream 778273 2808900 ~ 2824015 (+)
G140579 NA non-coding upstream 7326 1917284 ~ 1922297 (+)
G140571 NA non-coding upstream 37260 1892139 ~ 1892363 (+)
G140540 NA non-coding upstream 90063 1817120 ~ 1839560 (+)
G140538 NA non-coding upstream 132745 1796612 ~ 1796878 (+)
G140537 NA non-coding upstream 136251 1793063 ~ 1793372 (+)
G140608 NA non-coding downstream 30504 2061131 ~ 2070512 (+)
G140635 NA non-coding downstream 123737 2154364 ~ 2154765 (+)
G140640 NA non-coding downstream 135609 2166236 ~ 2214162 (+)
LOC120572447 NA non-coding downstream 264114 2294741 ~ 2295714 (+)
G140650 NA non-coding downstream 304327 2334954 ~ 2335560 (+)
frem1a frem1,LOC106908230,LOC105925506,LOC101079287,LOC108244244 other upstream 204155 1677210 ~ 1725468 (+)
LOC120572292 NA other upstream 1306588 621116 ~ 623035 (+)
G140263 NA other upstream 1593447 335882 ~ 336176 (+)
G140613 NA other downstream 24812 2055439 ~ 2059367 (+)
ablim2 ablim2 other downstream 797425 2828052 ~ 2954690 (+)
mllt3 mllt3 other downstream 1225886 3256513 ~ 3433803 (+)
zgc:112271 LOC103361642,LOC104959592,LOC100706616,LOC104935668 other downstream 2282524 4313151 ~ 4315545 (+)
G141060 men1 other downstream 2410011 4440638 ~ 4444947 (+)

Expression


Co-expression Network