LOC120573528


Basic Information

Item Value
gene id LOC120573528
gene name NA
gene type misc
species eurasian perch (Perca fluviatilis)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_053125.1
NCBI id CM020922.1
chromosome length 39125861
location 1927132 ~ 2032506 (-)
genome version GENO_Pfluv_1.0_2020_eurasian_perch_Genome

Sequence

>TU189623
caacaaccacagaagcagtaACGACAAGCACatctgcagcaacgacaacgaCAGCTGCctcaacaacaaccacagaagcagcaacaacaaccacagctgcagcaacgacaaccacagctgctccaacaacaaccacagaagcagcaacgacaatcacagctgcagcaacgacaaccacagctgccccaacaacaaccacagaagcagcaacgacaaccacagctgccccaacaacaaccacagaagcagcaacgacaaccacagctgcagcaacgacaaccacagctgctccaacaacaaccacagaagcagcaacgacaaccacagctgccccaacaacaacaacaagagcagcaacgacaaccacagctgccccaacaacaacaacagaagcagca
>TU189625
acagaagcagcaacgacaaccacagctgcccaaacaacaacaacagaagcagcaacgacaaccacagctgccccaacaacaaccacagaagcagcaacgacaaccacagctgccccaacaacaaccacagaagcagcaacgacaaccacagctgctccaacaacaaccacagaagcagcaacaacaaccacagctgcagcaacgacaaccacagctgctccaacaacaaccacagaagcagcaacgacaatcacagctgcagcaacgacaaccacagctactccaacaacaaccacagaagcagcaacgacaaccacagaagcagcaacgacaaccacagctgccccaacaacaacaacagaagcagcaacaacaaccacagctgccccaacaacaaccacagaagaagcaacgacaaccacagctgccctaacaacaaccacagaagaagcaacgacaaccacaactgccccaacaacaaccacagaagcagcaacgacaaccacagctgccccaacaacaaccacagaagaagcaacgacaaccacagctgccccaacaacaaccacagaagcagcaacgacaaccacagctgccccaacaacaaccacagaagcagcaacgacaaccacagctgctccaacaacaaccacagaagcagcaaacgagaaccacagctgccccaacaacaaccacagaagcagcaacgacaacaaccgctgccccaacaacaaccacagcagcaacaacaaccacagaagcaatAACGACAAGCACatctgcagcaacgacaaccacagctgccccaacaactaccacagaagcagcaacaacaacaacagctgccccaacaacaaccacacaaGCAGCATCAACAACCACAGAGGCAgtaacgacaaccacagctgccccaacaacaaccacagcagcaacaacaaccacagaagcagtaACGACaagcacagctgcagcaacgacaaccacagctgctccaacaacaaccacagaagcagcaacgacaaccacagctgccccaacaacaaccacagaagcagcaacaacaaccacagctgcagcaacgacaaccacagctgctcccaacaacaaccacagaagcagcaacgacaaacacagctgccccaacaacaaccatagaagcagcaacaacaaccacagaagcagtaACGACaagcacagctgcagcaacgacaaccacagctgctccaactacaaccacagaagcagcaacgacaaccacagctgccccaataacaacaacagaagcagcaacgacaaccacagcttccccaacaacaaccacagaagcagcaacgacaaccacagctgccccaacaacaaccaaagaagcagcaacgacaaccaaaGCTGCAGcgacgacaaccacagctgccccaacaactaccacagaagcagcaacgacaaccacagctgccccaacaacaaccacagaagcagtaACGACAAGCACatctgcagcaacgacaaccacagctgctttaactacaaccacagaagcagcaacgacaacgacagctgccccaacaacaacaacagaagcagcaacgacaaccacagctgccccaacaacaaccacagaaacagtaACGACAAGCACatctgcagcaacgacaaccacagctgctttaactacaaccacagaagcagcaacgacaaccacagctgccccaacaacaacaacagaagcagcaacgacaaccacagctgccccaacaacaaccacagaaggagcaacgacaaccacagctgccccaacaaccaccacagaagcagcaacgacaatcatagctgcagcaacgacaaccacagctgccacaacaaccacagaagcagcaacgacaaccacagctgcctaacaaaaaacaacaaccacaaccacagctgcagcgacgacaaccacagctgccccaacaactaccacagaagcagcaacgacaaccacagctgccccaacaacaaccacagaagcagtaACGACAAGCACatctgcagcaacgacaaccacagctgctttaactacaaccacagaagcaacAACGacaacgacagctgcccca
>TU189628
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>TU189636
AAGCAACAACGACAATCACAGCTGCAAAGCAAagcgacaaccacagctgcaaacaacaaccacagaagcagcaacgacaacgaCAGCTGCCCTAACaacaacagaagcagcaaccacaaccacagctgcagcaacgacaaccacagctgccccaacaacaaccacagaagcagcaacgacaaccacagctgccccaacaacaaccacagctgcagcaacaacaaccacagaagcagcaacgacaaccacagctgccccaacaaccacagctgcagcaacaacaaccaccgaagcagcaacgacaaccacagaagcagcaacaacaaccacagaagcagcaacgacaaccacagctgctccaacaacaaccacagaagtagcaacaacaaccacagctgcagcaacgacaaccacagctgccccaacaaccacagaagcacc
>TU189637
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>TU189640
cccaacaacaaccacagaagaagcaacgacaaccacaactgccccaacaacaaccacagaagcagcaacgacaaccacagctgccccaacaacaacagaagcagcaacgacaaccacagctgccccaacaacaaccacagaagcagcaacaacaaccacagctccAGTAACGACAATCACAGCTGCTCCAactacaaccacagaagcagcaacaacaaccacagctgccccaacaacaacaacagaagcagcaacgacaaccacagctgccccaacaacaaccacagaagcagcaacgacaaccacaactctcccaacaacaaccacagaagcagcaacgacaaccacagctgctttaactacaaccacagctgcagcaacgacaaccacagctgccccaacaactaccacagaagcagcaacgacaaccacagctgccccaacaacaaccacagaagcagtaACGACAAGCACatctgcagcaacgacaaccacagctgctttaactacaaccacagaagcaacAACGacaacgacagctgcccca
>TU189641
aacgacaaccacagctgccccaacaactaccacagaagcagcaacaacaaccacagctccAGTAACGACAATCACAGCTGCTCCAACTACAACCacagaggcagcaacaacaaccacagctgccccaacaacaacaacagaagcagcaacgacaaccacagctgccccaacaacaaccacagaagcagcaacgacaaccacaactgcccaacaacaaccacagaagcagcaacgacaaccacagctgctttaactacaaccacagaagcagcaacgacaaccacagctgccccaacaacaacagaagcagcaacgacaacaccagctgctccaacaacaaccacagaagaagcaacgacaaccacagctgccccaacaacaaccacagaagcagtaACGACAAGCACatctgcagcaacgacaacgacagctgccccaacaacaaccacagaagcagcaacaacaaccacagctgcagcaacgacaaccacagctactccaacaacaaccacagaagcagc
>TU189642
aacgacagctgccccaacaacaacaacagaagcagcaacgacaaccacagctgccccaacaacaaccacagaagaagcaacgacaaccacagctgccccaacaacaaccacagaagcagcaacgacaaccacagctgccccaacaacaaccacagaagcagcaacaacaaccacagctgcagcaacgacaaccacagctgctcaacaacaaccacagaagcagcaacgacaaccacagctgcagcaacgacaaccacagctgctcaacaacaaccacagaagcagcaacaacaaccacagcagcaacgacaacgacagctgccccaacaacaacaacagaagcagcaacgacaaccacagctgccccaacaacaaccacagaagcagcaacgacaaccacagctgccccaacaacaaccacagaagcagcaacgacaaccacagctgctccaacaacaaccacagaagcagcaacaacaaccacagctgcagcaacgacaaccacagctgctccaacaacaaccacagaagcagcaacgacaatcacagctgcagcaacgacaaccacagctgccccaacaactaccacagaagcagcaacgacaaccacagctgccccaacaacaaccacagaagcagtaACGACAAGCACatctgcagcaacgacaaccacagctgctttaactacaaccacagaagcagcaacgacaacgacagctgccccaacaacaacaacagaagcagcaacgacaaccacagctgccccaacaacaaccacagaagaagcaacgacaaccacaactgccccaacaacaaccacagaagaagcaacgacaaccacagctgccctaacaacaaccacagaagaagcaacgacaaccacaactgccccaacaacaaccacagaagcagcaacgacaaccacagctgccccaacaacaaccacagaagaagcaacgacaaccacagctgccccaacaacaaccacagaagcagcaacgacaaccacagctgccccaacaacaaccacagaagcagcaacgacaaccacagctgctccaacaacaaccacagaagcagcaaacgagaaccacagctgccccaacaacaaccacagaagcagcaacgacaacaaccgctgccccaacaacaaccacagcagcaacaacaaccacagaagcaatAACGACAAGCACatctgcagcaacgacaaccacagctgccccaacaactaccacagaagcagcaacaacaacaacagctgccccaacaacaaccacacaaGCAGCATCAACAACCACAGAGGCAgtaacgacaaccacagctgccccaacaacaaccacagctggagcaacaacaaccacagaagcagcaacgacaaccacagctgtagCAAcgacagctgctccaacaacaaccacagaagcagcaacgacaaccacagctgccccaacaaccacagctgcagcaacaacaaccaccgaagcagcaacgacaaccacagaagcagcaacaacaaccacagaagcagcaacgacaaccacagctgctccaacaacaaccacagaagtagcaacaacaaccacagctgcagcaacgacaaccacagctgccccaacaaccacagaagcacc
>TU189643
gcgacaaccacagctgccccaacaacaaccacagaagcagcaacgacaaccacagctgccccaacaacaaccacagaagcagcaacgacaatcatagctgcagcaacgacaaccacagctgccccaacaactaccacagaagcagcaacaacaaccacagctccGAGTAAACGACAATCACAGCTGCTCCAACTACAACCACAgaggcagcaacaacaaccacagctgctaaactaacaacaacagaagc
>TU189644
aacgacaaccacagctgccccaacaactaccacagaagcagcaacaacaaccacagctccAGTAACGACAATCACAGCTGCTCCAACTACAACCacagagcagcaacaacaaccacagctgcccaacaacaacagaagcagcaacgacaaccacagctgccccaacaacaaccacagaagcagcaacgacaaccacagctgccccaacaacaaccacagaagcagcaacgacaaccacaactgccccaacaacaaccacagaagcagcaacgacaaccacagctgctttaactacaaccacagaagcagcaacgacaaccacagctgccccaacaacaacagaagcagcaacgacaacaccagctgctccaacaacaaccacagaagcagcaacgacaaccacagctgccccaacaacaactacagaagcagcaacgacaaccacagctgccgcaacaacaaccacagcagcaacaacaaccacagctgccccaacaactaccacagaagcagcaacgacaaccacagctgcct
>TU189646
cagcaacgacaaccacaactgccccaacaacaacaacagaagcagcaacgacaaccacagctgctttaactacaaccacagaagcagcaacgacaaccacagctgccccaacaacaacagaagcagcaacgacaacaccagctgctccaacaacaaccacagaagaagcaacgacaaccacagctgccccaacaacaaccacagaagcagtaACGACAAGCACatctgcagcaacgacaacgacagctgccccaacaacaaccacagaagcagcaacaacaaccacagctgcagcaacgacaaccacagctactccaacaacaaccacagaagcagc
>TU189648
CAGCTGCTCCAactacaaccacagaagcagcaacgacaaccacagctaccccaacaacaaccacagaagcagcaacgacaaccacagaagcagcaacgacaacgacagctgccccaacaacaacaacagaagcagcaacgacaaccacagctgccccaacaacaaccacagaagaagcaacgacaaccacagctgccctaACAACAACCAGagaagcaacgacaaccacaactgccccaacaacaaccacagaagcagcaacgacaaccacagctgccccaacaacaaccacagaagacgcaacgacaaccacagaagcagcaacgacaaccacagctgccctaacaacaaccacagaagaagcaacgacaaccacagctgccccaacaacaaccacagaagcagcaacgacaaccacagctgccccaacaacaaccacagaagcagcaacgacaatcatagctgcagcaacgacaaccacagctgccacaacaacaaccacaaaacgcgaaacgacaaccacagctgcccctaacaacaacagaagcagcaaccacaaccacagctg
>TU189649
caacaacaaccacagaagaagcaacgacaaccacagctgccctaacaacaaccacagaagcagcaacgacaaccacagctgctccaacaacaaccacagaagcagcaacaacaaccacagctgcagcaacgacaaccacagctgctccaacaacaaccacagaagcagcaacgacaatcacagctgcagcaacgacaaccacagctgccccaacaactaccacagaagcagcaacgacaaccacagctgccccaacaacaaccacagaagcagtaACGACAAGCACatctgcagcaacgacaaccacagctgctttaactacaaccacagaagcagcaacgacaacgacagctgccccaacaacaacaacagaagcagcaacgacaaccacagctgccccaacaacaaccacagaagaagcaacgacaaccacaactgccccaacaacaaccacagaagaagcaacgacaaccacagctgccctaacaacaaccacagaagaagcaacgacaaccacaactgccccaacaacaaccacagaagcagcaacgacaaccacagctgccccaacaacaaccacagaagaagcaacgacaaccacagctgccccaacaacaaccacagaagcagcaacgacaaccacagctgccccaacaacaaccacagaagcagcaacgacaaccacagctgctccaacaacaaccacagaagcagcaaacgagaaccacagctgccccaacaacaaccacagaagcagcaacgacaacaaccgctgccccaacaacaaccacagcagcaacaacaaccacagaagcaatAACGACAAccacagctgccccaacaacaaccacagaagcagtaACGACaagcacagctgcagcaacgacaacgacagctgccccaacaacaaccacagaagcagcaacaacaaccacagctgcagcaacgacaaccacagctactccaacaacaaccacagaagcagcaacgacaaccacagaagcagcaacgacaacgacagctgccccaacaacaacaacagaagcagcaacgacaaccacagctgccccaacaacaaccacagaagcagcaacgacaaccacagctgccccaaccaCAGccacagaagcagcaacgacaaccacagctgccccaacaaccacagctgcagcaacaacaaccacagaagcagcaacgacaaccacagctgccccaacaaccaacagaagcaacaacaaca
>TU189650
agcagcaacaacaaccacagaagcagcaacaacaaccacagctgcagcaacgacaaccacagctgccccaacaactaccacagaagcagcaacaacaacaacagctgccccaacaacaaccacacaaGCAGCATCAACAACCACAGAGGCAgtaacgacaaccacagctgccccaacaacaaccacagcagcaacaacaaccacagaagcagtaACGACaagcacagctgcagcaacgacaaccacagctgctccaacaacaaccacagaagcagcaacgacaaccacagctgccccaacaacaaccacagaagcagcaacaacaaccacagctgcagcaacgacaaccacagctgctcccaacaacaaccacagaagcagcaacgacaaacacagctgccccaacaacaaccatagaagcagcaacaacaaccacagaagcagtaACGACaagcacagctgcagcaacgacaaccacagctgctccaactacaaccacagaagcagcaacgacaaccacagctgccccaataacaacaacagaagcagcaacgacaaccacagcttccccaacaacaaccacagaagcagcaacgacaaccacagctgccccaacaacaaccaaagaagcagcaacgacaaccaaaGCTGCAGcgacgacaaccacagctgctccaacaaccacagaagcagcaacgacaatcacagaagcagcaacgacaacaacagctgccccaacaaccacACAAGCGGCACCAACAACTACAGAGGCAgtaacgacaaccacagctgccccaataacaaccacagaagaagcaacgacaaccacaactgccccaacaacaaccacagaagcagcaacgacaaccacagctgccccaacaacaacagaagcagcaacgacaaccacagctgccccaacaacaaccacagaagcagcaacaacaaccacagctccATAAACGACAATCACAGCTGCTCCAACTACAACCACAgaggcagcaacaacaaccacagctgctaaactaacaacaacagaagc
>TU189653
acagaagcagcaacgacaaccacagctgcccaaacaacaacaacagaagcagcaacgacaaccacagctgccccaacaacaaccacagaagcagcaacgacaaccacagctgccccaacaacaaccacagaagcagcaacgacaaccacagctgctccaacaacaaccacagaagcagcaacaacaaccacagctgcagcaacgacaaccacagctgctccaacaacaaccacagaagcagcaacgacaatcacagctgcagcaacgacaaccacagctgccccaacaactaccacagaagcagcaacgacaaccacagctgccccaacaacaaccacagaagcagtaACGACAAGCACatctgcagcaacgacaaccacagctgctttaactacaaccacagaagcagcaacgacaacgacagctgccccaacaacaacaacagaagcagcaacgacaaccacagctgccccaacaacaaccacagaagaagcaacgacaaccacaactgccccaacaacaaccacagaagcagcaacgacaaccacagctgccccaacaacaacagaagcagcaacgacaaccacagctgccccaacaaccacagaagcagcaacgacaaccacagctgctccaacaacaaccacagaagcagcaaacgagaaccacagctgccccaacaacaaccacagaagcagcaacgacaacaaccgctgccccaacaacaaccacagcagcaacaacaaccacagaagcaatAACGACAAGCACatctgcagcaacgacaaccacagctgccccaacaactaccacagaagcagcaacaacaacaacagctgccccaacaacaaccacacaaGCAGCATCAACAACCACAGAGGCAgtaacgacaaccacagctgccccaacaacaaccacagaagcagtaACGACAAGCACatctgcagcaacgacaaccacagctgctccaactacaaccacagaagcagcaacgacaaccacagctgccccaacaacaacaacagaagcagcaacgacaaccacagctgccccaacaactaccacagaagcagcaccaacaaccacagctgaaGTAACGACAAGCCACATCTGCAgtaacgacaaccacagctgctccaacaacaaccacagaagcagcaacgacaaccacagctgccccaacaacaaccacagctgcagcaacaacaaccaccgaagcagcaacgacaaccacagaagcagcaacaacaaccacagaagcagcaacgacaaccacagctgctccaacaacaaccacagaagcagcaacaacaaccacagctgcagcaacgacaacaacagctgctccaacaacaaccacagaagcagcagggacaatcacagctgcagcaacgacaaccacagctgccccaacaactaccacagaagcagcaacaacaaccacagctgccccaacaacaaccacagaagcagcaacgacaaccacaaaAGCAACAACGACAACAACAGCTTCCCCAATAACacccacagctgcagcaacaacaaccacaccTGCTCCAactacaaccacagaagcagcaacgacaaccacagctgccccaacaacaacaacaacagaagcagcaacaaca
>XM_039823313.1
ATGGCTGTCGTGCGGATCATATCAATGTTTATGTTTCTTATAGctgccccaacaactaccacagaagcagcaacaacaacaacagctgccccaacaacaaccacacaaGCAGCATCAACAACCACAGAGGCAgtaacgacaaccacagctgccccaacaacaaccacagcagcaacaacaaccacagaagcagtaACGACaagcacagctgcagcaacgacaaccacagctgctccaacaacaaccacagaactgctcccaacaacaaccacagaagcagcaacgacaaacacagctgccccaacaacaaccatagaagcagcaacaacaaccacagaagcagtaACGACaagcacagctgcagcaacgacaaccacagctgctccaactacaaccacagaagcagcaacgacaaccacagctgccccaataacaacaacagaagcagcaacgacaaccacagcttccccaacaacaaccacagaagcagcaacgacaaccacagctgccccaacaacaaccaaagaagcagcaacgacaaccaaaGCTGCAGcgacgacaaccacagctgctccaacaaccacagaagcagcaacgacaatcacagaagcagcaacgacaacaacagctgccccaacaaccacACAAGCGGCACCAACAACTACAGAGGCAgtaacgacaaccacagctgccccaataacaaccacagctgcagcaacaacaaccaccgaagcagcaacgacaaccacagcaacaacaaccacagaagcacagcaccaacaaccacagctgaaGTAA

Function

GO:

id name namespace
GO:0005886 plasma membrane cellular_component
GO:0071944 cell periphery cellular_component

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU189623 False 398 lncRNA 0.53 2 1928405 1929518
TU189625 True 2096 lncRNA 0.52 8 1927132 2030369
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TU189648 False 568 lncRNA 0.52 2 1931474 1935675
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TU189653 False 1631 lncRNA 0.52 5 1928132 2030369
XM_039823313.1 False 798 mRNA 0.51 5 2023019 2032506

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC120573473 NA coding downstream 41445 1883902 ~ 1885687 (-)
aco1 aco1 coding downstream 152214 1749519 ~ 1774918 (-)
LOC120573508 LOC103361692 coding downstream 262187 1660137 ~ 1664945 (-)
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LOC120573289 NA coding downstream 426816 1492274 ~ 1500316 (-)
pde5ab pde5a coding upstream 646439 2678945 ~ 2797531 (-)
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LOC120573709 H2AFZ,LOC100694115,LOC102297571,LOC102200939,LOC101065890 coding upstream 1423014 3455520 ~ 3457848 (-)
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tspan5a LOC100711712,LOC102299272,LOC102195201,LOC105938388,LOC103480072 other downstream 277700 1623259 ~ 1649432 (-)
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Expression


Co-expression Network