cd99l2 (cd99l2)



Basic Information


Item Value
gene id cd99l2
gene name cd99l2
gene type misc
species eurasian perch (Perca fluviatilis)
category of species economic fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_053125.1
NCBI id CM020922.1
chromosome length 39125861
location 5560026 ~ 5582995 (-)
genome version GENO_Pfluv_1.0_2020_eurasian_perch_Genome

Sequence


>TU190676
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>XM_039823376.1
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Function


symbol description
cd99l2 Predicted to act upstream of or within cell adhesion. Predicted to be located in cell junction and plasma membrane. Predicted to be integral component of membrane. Is expressed in nervous system; neural plate; pharyngeal arch 3-7 skeleton; tail bud; and trigeminal placode. Orthologous to human CD99L2 (CD99 molecule like 2).

NR:

description
PREDICTED: CD99 antigen-like protein 2

GO: NA

KEGG:

id description
K06520 CD99, MIC2; CD99 antigen

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU190676 False 4354 lncRNA 0.47 1 5560031 5564384
XM_039823376.1 True 9225 mRNA 0.45 10 5560026 5582995

Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
LOC120572332 NA coding downstream 136924 5418473 ~ 5423102 (-)
LOC120573316 acox3 coding downstream 224309 5319797 ~ 5335717 (-)
LOC120573313 acox3 coding downstream 315069 5213138 ~ 5244957 (-)
znf16l LOC103362116,LOC104940792,LOC101479721 coding downstream 440699 5114994 ~ 5119327 (-)
sstr1b LOC104956125,LOC103370120,LOC106577512 coding downstream 475635 5038118 ~ 5084391 (-)
med11 med11,LOC102785859 coding upstream 33682 5616677 ~ 5620265 (-)
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si:dkey-6n21.13 LOC104944656,LOC104937154,LOC102297111 coding upstream 144641 5727636 ~ 5735182 (-)
si:dkey-6n21.12 LOC102198682,LOC106632892,LOC104937153,LOC101478675 coding upstream 158326 5741321 ~ 5757820 (-)
ache ache coding upstream 201813 5784808 ~ 5821779 (-)
G141259 NA non-coding downstream 351566 5208237 ~ 5208460 (-)
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G141222 NA non-coding downstream 536941 5022593 ~ 5023085 (-)
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G141394 NA non-coding upstream 1167 5584162 ~ 5584526 (-)
G141416 NA non-coding upstream 128439 5711434 ~ 5711716 (-)
G141467 NA non-coding upstream 386956 5969951 ~ 5970613 (-)
G141468 NA non-coding upstream 387940 5970935 ~ 5971387 (-)
G141470 NA non-coding upstream 406900 5989895 ~ 5992227 (-)
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G141234 NA other downstream 459944 5099705 ~ 5100082 (-)
G141219 NA other downstream 600021 4958679 ~ 4960005 (-)
peli3 LOC100695529,LOC102800049,LOC102202559,LOC103148873,LOC106956141,LOC107098130,LOC103480122 other downstream 730864 4773628 ~ 4829162 (-)
G141145 NA other downstream 895828 4641495 ~ 4664198 (-)
G141400 NA other upstream 13963 5596958 ~ 5600462 (-)
G141439 NA other upstream 160564 5743559 ~ 5843146 (-)
gal3st4 gal3st4,LOC104939968 other upstream 594926 6177921 ~ 6220260 (-)
LOC120572220 NA other upstream 638976 6221971 ~ 6231297 (-)
sox19b LOC104926817,LOC103365479,LOC100693580,LOC102199731,LOC101477749,LOC104962535 other upstream 725903 6308898 ~ 6315817 (-)

Expression



Co-expression Network