sstr1b (LOC104956125,LOC103370120,LOC106577512)


Basic Information

Item Value
gene id sstr1b
gene name LOC104956125,LOC103370120,LOC106577512
gene type coding
species eurasian perch (Perca fluviatilis)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_053125.1
NCBI id CM020922.1
chromosome length 39125861
location 5038118 ~ 5084391 (-)
genome version GENO_Pfluv_1.0_2020_eurasian_perch_Genome

Sequence

>XM_039823407.1
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GATTTTGgcactttctttcttcctttcctctcctttgTTCATCACTAGGCTCGTTTAAGATGAGCCAGGCCTGTGCAGAATACATCACAGgtgatcgccgcccaatgcatgccggttagattgtgtccgacttgctctgacatcatgcacacataggcaacgataacctcacgagatcgaGGCAGCTgcagtttttagagccaggcTCTGCAGTTGCTCTCCGCCGACTGCGAGACCCATGGCATGATGGGAAATgcctggctctcagctgatctaacagctgattggttcataaGTGACTCACACGCTATGATGTTTCACAtacactttttgttgttgtttaattgGAGAGGTTAAGATCGATATTTGTCTTATTTGAAGGCTTATTCTGTTAACAGAATACATTAACTAAAGTTAAGATTACAGATCGTCTACAGTCTATTGTATATTAACATCAGCGACAGATTGCCTGCAGATCATTTTAACACGCTACTCTGTCAGAATCTAATCAATCGGAGACTGAGCACGAACtgatatgggtctgataacattttaataaatcctAATCTgacctaacaggatgtgagtgtttctgtgacttcttGTACAGACTGAAGGCTGCTTCAAACGGCTATATGCTCTCCGACTCGGCCGCCCCTTTTTGTCAACGTCcccagctgctgctgcctgctccCATCCTCTTTACAAGCGAGGCACAGCTCATCTTGAACGAGCCCATTGATTGGTTCTTGCTTCCACCCTTTCTCACTCTTAATTACCTCATTAAGTTCACCTGGTGACCCCATATCAAAAGACTGCACTCCATCTCATTCATTAGCTGTGTTGTAAACCGTTCCCTATCATGGAAATAGATGTTTTCAGTGAGTGTCTGAAATCTCGTTTGGTCGGTCCCTACATAATtgactatttaataaacactacatagggaatagtgagtgggtgaatgagggaacggtttccAACACAGCTACTCTCTGTTAACCTAGCATGGGGCGGCAGTTCTGAATCACCAGCCCATGTGTGATTTTGTACTCTTTCATTTGGAACAATTttaagttttggaaaataaatcttTGTTGAGTGGA

Function

NR:

description
PREDICTED: somatostatin receptor type 1-like

GO:

id name namespace
GO:0007218 neuropeptide signaling pathway biological_process
GO:0007268 chemical synaptic transmission biological_process
GO:0038170 somatostatin signaling pathway biological_process
GO:0016021 integral component of membrane cellular_component
GO:0004994 somatostatin receptor activity molecular_function

KEGG:

id description
K04217 SSTR1; somatostatin receptor 1

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_039823407.1 True 6162 mRNA 0.41 2 5038118 5084391
XM_039823408.1 False 6106 mRNA 0.41 2 5038118 5084391

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
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peli3 LOC100695529,LOC102800049,LOC102202559,LOC103148873,LOC106956141,LOC107098130,LOC103480122 other downstream 208956 4773628 ~ 4829162 (-)
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Expression


Co-expression Network