G151146


Basic Information

Item Value
gene id G151146
gene name NA
gene type misc
species eurasian perch (Perca fluviatilis)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_053126.1
NCBI id CM020923.1
chromosome length 38831509
location 2399809 ~ 2805411 (-)
genome version GENO_Pfluv_1.0_2020_eurasian_perch_Genome

Sequence

>TU204751
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>TU204755
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>TU204756
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>TU204757
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>TU204759
gtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgcgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgcctgtctctgtgtgtgtctctgtgtgtgtttgtgtgtctctctgtgtgtctgtgtgtgtgtgtttgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtttgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtttctgtgtgtgtgtgtcgggggtgtcactacccgatgtgagtcgagtgcagatgtgagtcgcacatgcgtcactttgcgacttCACGCAGATCTGTTTTGCTGTTAGC
>TU204760
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>TU204761
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>TU204762
gtgtatctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtctgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgctctgtgtggtgcgtttgtgtgtctctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgcctgtctctgtgtgtgtctctgtgtgtgtttgtgtgtctctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtttgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtcactgtgtatgtgtgtgtctctgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtcactgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgcgtgtctctctgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtctctgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtcactgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtctctctgtgtctgtctctgcgtgtctctctgtgtgtgtgtgtgtctgtctctgtgtgtctctctgtgtgtgtctctgtgtgtatctctgtgtgtgtctctgtgtgtgtctgtctctgtgtctgtctctgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtctgtctctgtgactctgtgtgtgtgtgtctgtctctctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtctctgtgtgtctctctgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtctgtctctctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgcagttgctgaatctgtcctcatttcagatcaacaaaggtcagctTAACAGATTTTCCTCAGactttgagagactctagtcacgctcatcccgctcctcGTTTCCAGGtgagctctccaccaatcagattggtcgtTTGAGTCCGACTTTCCACTGGCTGATTCAACAAGTCGAATCGGC
>TU204767
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>TU204768
CGGGAGCAGTGATTGGTTTCCACACGACACCACAAAAGGTCGGCATGGAcaacattaacattcacaaaccaaaatattaacaatggaaacaCTCAAAATTGGTTTTATATGAAACTTAACGGCAAAGTTACACAAAAATATCAACGTAGAGGAACTCGAGGCACTGTAGACTATTATGAAAACAACGTAGGTGCACATATGGTCGACTCTAAAGGCTCTGAcgcaccaaccagacggccaatcagacggcagtaaagccagtcgggctgatcggtctccccgagttggtccagaaagttcctcagaactcaccgaagagacgagacctgATCTGTGACGtcgccccaaaaaatgaaaaccagcagctgattggacgaacgcgtcacatgggtttgttttcttcgggaaattcaaagccagactgtcatggcggctcgttcagaatacgatctcatatcggactaaaatagttcaccgaaaaaacgtgtttctggaaacatctgaagagagaaataggctgtgtgtctctctgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtcactgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtctctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctctatgtgtgtctctgtgtgtctctctgtgtgtgtgtgtgtcactgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtctctctgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtctctgtgtgtctctctgtgtgtgtgtgtgtctcactgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtctctgtgtgtgtctgtctctgtgtctgtctctgcgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtctgtctctgtgactctgtgtgtgtgtgtctgtctctctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtctgtctctctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtCGCTTTGTGG
>TU204769
gtgtctctgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctctatgtgtgtctctgtgtgtctctctgtgtgtgtgtgtgtcactgtgtgtgtgtgtgtctctgcgtgtctctctgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtctctgtgtgtctctctgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtctgtctctctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtctctctgtgtgtgtctgtgtctgtgtgtgtgcagttgctgaatctgtcctcatttcagatcaacaaaggtcagctTAACAGATTTTCCTCAGactttgagagactctagtcacgctcatcccgctcctcGTTTCCAGGtgagctctccaccaatcagattggtcgtTTGAGTCCGACTTTCCACTGGCTGATTCAACAAGTCGAATCGGC

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU204751 True 1728 TUCP 0.48 4 2596802 2598982
TU204755 False 1105 lncRNA 0.47 4 2540287 2598982
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TU204761 False 1057 lncRNA 0.47 3 2540287 2598982
TU204762 False 1094 lncRNA 0.50 7 2596802 2805411
TU204767 False 1067 lncRNA 0.47 4 2540287 2598982
TU204768 False 1115 TUCP 0.48 5 2542429 2598982
TU204769 False 580 lncRNA 0.49 3 2596802 2598188

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC120573916 LOC103358683,LOC104942087,LOC104930238,LOC103393647 coding downstream 174841 2214594 ~ 2224968 (-)
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LOC120574768 LOC103358687,LOC104930242 coding downstream 341170 2004876 ~ 2058639 (-)
LOC120574288 LOC108233705,LOC103393603 coding downstream 752740 1620674 ~ 1647069 (-)
LOC120573930 LOC103363959,LOC101479828,LOC102300806,LOC102197709 coding downstream 856399 1520386 ~ 1543410 (-)
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trir csgr03h19orf43,clg4h19orf43,LOC103154935,LOC107087651,LOC103376077,LOC102224489 coding upstream 194239 2999650 ~ 3003392 (-)
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s1pr5a s1pr5,LOC103393734,LOC104952115 coding upstream 597589 3403000 ~ 3407242 (-)
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LOC120573864 NA other downstream 527717 1845740 ~ 1872092 (-)
LOC120573867 LOC108236047,LOC107376309,LOC101475947,LOC100695382,LOC106520692,LOC105918010 other downstream 577681 1816065 ~ 1822128 (-)
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G151227 LOC103393680 other upstream 105915 2911326 ~ 2915367 (-)
G151344 smarca4 other upstream 506316 3311727 ~ 3316915 (-)
LOC120575464 NA other upstream 1556437 4361848 ~ 4367343 (-)
LOC120575466 LOC102292836,LOC101471904,LOC100692969,LOC103393382,LOC103468414,LOC102212070,LOC103143659,LOC102784177 other upstream 1610766 4416177 ~ 4464991 (-)

Expression


Co-expression Network