G153137


Basic Information

Item Value
gene id G153137
gene name NA
gene type non-coding
species eurasian perch (Perca fluviatilis)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_053126.1
NCBI id CM020923.1
chromosome length 38831509
location 8700109 ~ 8776266 (-)
genome version GENO_Pfluv_1.0_2020_eurasian_perch_Genome

Sequence

>TU207433
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>TU207435
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>TU207436
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>TU207437
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>TU207438
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>TU207439
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Function

NR:

description
PREDICTED: high mobility group protein 20A isoform X3

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU207433 False 1487 lncRNA 0.41 2 8700109 8701788
TU207435 False 1585 lncRNA 0.40 2 8718193 8719900
TU207436 False 765 lncRNA 0.49 2 8718193 8776266
TU207437 False 1843 lncRNA 0.40 2 8700109 8719900
TU207438 True 1847 lncRNA 0.40 2 8700109 8719900
TU207439 False 1598 lncRNA 0.40 2 8718193 8719900

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
nudt9 nudt9 coding downstream 34455 8660302 ~ 8665654 (-)
si:ch211-11k18.4 LOC101474882,LOC102302894 coding downstream 40890 8651632 ~ 8659219 (-)
rabep2 rabep2 coding downstream 59674 8627083 ~ 8640435 (-)
LOC120573875 LOC104929518,LOC103375462,LOC108242957 coding downstream 179522 8513629 ~ 8520587 (-)
LOC120575363 LOC103375241,LOC104929519,LOC102212394,LOC101477022,LOC102794201,LOC102305637 coding downstream 188269 8506317 ~ 8511840 (-)
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G153139 NA non-coding downstream 15356 8659611 ~ 8684753 (-)
G153143 NA non-coding downstream 52818 8647083 ~ 8647291 (-)
G153142 NA non-coding downstream 55084 8644784 ~ 8645025 (-)
G153130 atp2a1 non-coding downstream 83997 8612277 ~ 8616112 (-)
G153127 atp2a1,LOC102238060,LOC106906942,LOC103469116 non-coding downstream 88112 8551296 ~ 8611997 (-)
G153274 NA non-coding upstream 285030 9061296 ~ 9111224 (-)
G153275 NA non-coding upstream 288730 9064996 ~ 9085687 (-)
G153455 NA non-coding upstream 420492 9196758 ~ 9203859 (-)
G153456 NA non-coding upstream 423392 9199658 ~ 9501467 (-)
G153462 NA non-coding upstream 443333 9219599 ~ 9219903 (-)
G152952 NA other downstream 255728 8441179 ~ 8444381 (-)
LOC120574885 LOC103375378,LOC104925605,LOC104966930 other downstream 599711 8082138 ~ 8100398 (-)
grin2aa grin2a,LOC102780805 other downstream 976195 7569718 ~ 7723914 (-)
arhgdig NA other downstream 1898573 6772880 ~ 6801536 (-)
G152567 NA other downstream 1979466 6719784 ~ 6720643 (-)
natd1 natd1 other upstream 36064 8812330 ~ 8816305 (-)
tufm tufm,LOC106606342,LOC101070424,LOC106606341,LOC106931188,LOC103145412 other upstream 74177 8850443 ~ 8857571 (-)
zgc:55558 p-ras,LOC105029053,LOC104950842,LOC104930345,LOC103392975,LOC101069736,LOC106606379,LOC103023536,LOC108413997 other upstream 119516 8895782 ~ 8907662 (-)
LOC120574599 NA other upstream 410984 9187250 ~ 9204006 (-)
LOC120574343 NA other upstream 413118 9189384 ~ 9190066 (-)

Expression


Co-expression Network