G153596


Basic Information

Item Value
gene id G153596
gene name NA
gene type non-coding
species eurasian perch (Perca fluviatilis)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_053126.1
NCBI id CM020923.1
chromosome length 38831509
location 9907240 ~ 10018859 (-)
genome version GENO_Pfluv_1.0_2020_eurasian_perch_Genome

Sequence

>TU208085
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>TU208092
CTTGCATCACTGTTGATTATTCaagataaatgaataaaaatgaaatgaaatgaaatatattAGCTATTTTCATATTGTGCTGTGAGACATATGGCACACATACTTACTTTGacaaatacttattttttttataaattcctGATTCTTGTGAATGGACTTGCATGTAAAACTTGAGCCATATGCCCAAACAGTCCTATTTGGCTCAATCTCACTGCTTAGACTGAAGGTTTTGTCCTCCACACTCTGCAGCTTTGTTGTGATTGTGGCAATAGTTAGAGGCTGGTTGTCCTGCTTCCACTCCACACTCAGTCCGTCTGGGCAGAAGCCTCTTAGGGTGCAGAGGAGTCTGACTGGTGAGGCCCCATATTCACCTTCCCAGACAGGGTGTAATGTGATGTTTGGATAGACGATCCGATCAACTAAAATAGAAAAGAGATCATTTTGTCTTTAATTGGATATTTTAAACATGGGATattgacttttgttttatttatttatttatatattttaaaatatgagCTGATTTAATCTTTCTCAGTTATACATACCTTTTAGATATTGGTTAAGTAACCAACTGTGGTGTCTCAATTCTAAGTGTAACATCTCTGTATTTAGGCTAGGTGGCAGAGGTGTACTTTTACAGTGTCTGGTGGCTTAAAGTCAGGTGGAGAAATTGCTGGAGGTCTGTTGCACAGCTGTTGCAGCATGATGGGGCAGAGTGATCAGGGCTAGCAGCAAGCGGAAGCATTGAGTCACACCCAGGTCCCCAAAGGTACCGAAATACAGAAGTGAAACAATGCAAAGAGCAACGGTGCATCACAGACACCAGGTGTGAGGTGTGGTGGTGCCAGTAAGAGAAACAGAGTGCACATTTAAATATATCATTTCAGTTTAGATTGTGTGTTCACATAGATTTCAAATGGCCTCTCATGACTTTGCTAAAGGTTTTAGTTCTCGACTCTATTAATAATAATAGACTGGAGAACTAACCGACTGTGAAATCTCCAAATTTACACATTGTGTTGAACATGGGCTGTTGATTCCAGATGCTAGGGAGGTGAACATAGGAACATATtacataatgaaataatttttaaaatgaGCAAGCATGAACAATTTCAAAATAATGGCAGAGAAAAAAAGGCTGGAGGAGCAACATcaatgtttttcttcatttaagcatttattttcaaaaagacacaaagctcttgtaatgaaatgaaaaaggacaaTTGTGATTACTTACATGAAACTATGAGTTTATAAGAAGAAGTGTGAAAAATACTTTTACACAGAAAGTTCACTTTGTTTCATTTAACCTGAAGCAGTGGTTCCAATGGTAAAAAGCAGAGTGATGAGGAAGAGAAGGATGAAGGTGAGGGCCGTGCTTCCCATGTTATCTTCTTCTGCCTCTGTGGCACCATTCCATTGGTCGATGAAGTATGAACATACTGCAGAGTAATTATTGAGTTAATACTTTGGACAAACCCCGCTCAAAACAGTAGGCTAGCTCATGAAACAAATCACCAAATTATATGAATGACCAAATTGGATTCATATCCTGTAATAGGGTAATGCATTTCATAACCTCACAGGTCGGAGTGAATctaatcagtcagtcagtcagtcagtcagtcagtcagtcaaagTATAAAATCCACAACATAAATTTAAAGAACGGTAGCGGCATATGTCTTGTtacttattacattgttattagtGTACCATAGGACCTTATAGTTTTGCATGTGATTATGGTGATTACAATCATCCTACAATGATCCTGAATTACTTTTGAAAGACCCCATTATTGGTGTGGCATGCATGACTTGGCTTGTGAATCAGTATATTCTGATATTTGACTGAGAGACCACAGAGCTGGAGCTAGAGTTTAAACAAGTATCCGTCTTTTGTTGGGGGTGCAAGACCCAGTAGaggaaacacacaaagacaagtcACACAAACAGTGTTACTGCACTGACTACAAATGACATTGAACAAATAGGCTTCATTAAGGTCAATTGTTGGCTAAAGTTAGCGTTATTCTAGTGAATACTATACggtgttaaaaaagtttgataTATTGTATTCAAACATGGTGATAGCTACGTCTAATTTGTGTTGCATTAGGATAGCActgtgacacacacaacaaacatgtAGCTCAAAATATTGGTTAAATAAAGACATAAACAGCATGCGACATACATCAACAGAGTTGCaaagtgcttttttttattttttattttgaatctgcattaaaaagacaaacacaatgTCAAATCACAAGCAACAAACATTAAACAACAAACAGCAGAAGACACAGCGACACAGAACGACGTCTACTAGGCCTTGCACGTTTCAGGGATGTTCATGTTGAGGTTGACCAGGTTggttttttcaaatgttctgtGCCCGATGGACCTGACAATAGCTTTAGCTGTGTTAACCACAGACTCATGGTGAACTACACAGCTATACACCACGTCACTGTCTTGCCACTGCTCAAGGGTGAGAGATAACTGGCTGTAAACAGAATAGGATCCTTTGTTTTCTACAGGGTTTGTGGTATGGAACTTAAATTCTGAGTCTGCTTTCACGTCATCAACAAGCCAAGAAACGAAAACCTCCCGAGGGAAGAAGTCTTTCACAAAGCATGTCAGGGTCACCGTTTCCTTTTTAGTTTGTTCTAGTGGAGGCAGCATAAACACTGAAAGAAACGAAAACCTCCCGAGGGAAGAAGTCTTTCACAAAGCATGTCAGGGTCACCGTTTCCTTTTTAGTATGTTCTAGTGGAGGCAGCATAAACACTGAAGGACGCTGAATCTGTCCTCCTGCAAGCATGAGAGAACAATTAGGACTCCTGCTACAGATAAACACACCTGCAGTACTGTAGGAAATCTATGCTACAAAATACACTTAGAAATCACACTAATAACGGGTTTGATGGCATGACAAGAGGAATTAAACACCgacttttttttgcacaattgCTGGATAGTTTTCTTACCGACAGTCCTTCCGTAGGTTTTATTAAGTGGAATAACCCAATTGTCATGTGACACTACGCAGACAAACTTTGTCCCCTTGATCCATTCGTCATAAGTGATGGCAAGTGAAGATCTAAATACGCCTGTACTTCCTTTTGGGGGAACTACTGAAGCACCATGTATTGGTTTTTCATCGTGGGTCTCCCATGAAATTTCAGTGACGGATGGTTTGTTTATCTTGACCTGACATGTTATGTTTCCTTTTCCTTCACGTGAAAACATGTCCTCCATTGTGGGTCCTATGATATCTATCTCCACATCTGATTCAAGACATACTCCATCTTCTGAATGTGTAATTAATAAACAATTAATAAACAGAAATGGCTGAAACACCATAAGAATTAGCCTGACATTTACATATTATGTTTATAGAAACAGTAGCACTTTACTCACCAGTTGAAGGGAGTGGTTGGTAGATCACAGTTGAATTGAGCTGTGTAGGACACGCTCCACTTTTCCCTTTAAACTCACATGTAACCTGAGTGTTTAAAGGCATCTCTTCGGATTTCACCGTGAGAAAACTTGCTGCGCTGTACCGTGTAGTTCCATTATTGTCCATTCTTCCCTCATAATGTGTTTGGATCTCGTCTATTTTGTTGACAatttcttcttcatttttcaGCCATTTGATCTCATAATCTTTTGGTGAAAAATCTTTGGCAAAGCAGGAGAAGGAAGCCTCGGTTCCCTCATCAGAGGAGGCCAACACACTAAGGGTTGGTGGATAACAAGGCACCtctgaaaaacaaacatacacaaatatcTGTATGCGGAAGCAGGGAatcctatatacagtatatatatatgcagaaGCAAAGGTAAACAATGTGCTACAGTGCTCATGTAATCTAGATTTTACGATAGACTGGCAAaatatgactttatcacttttctgaactactgtatgttatgcaacttgcacacacatatatgcacattgtgattatgtacCTCGAATTAACACTTACTGTAGCTTGTTTCTAAATTGTGCAGACAGAGTCAAAAGGAAAATTAGGTTTTCATAGTATCACAATTACAAAATTGAAGAGCAGAGTTTAAATGTACACTTCTGCATATACATTGATTGCTCGGGAAAGCGAACACAGCTTGAATGTTATTATCAACATGCAGTGAAAGcggagacagacaggaagaacTAGGAttatgcagacagacagaaagaagcaGAACACTGCAATAAGGTGCAGAGGACATACAGCATATAAGTAAAGAACAAAATAGAGTGAGTCAGCAGCTGAGCTTCAGCCTTTTCTTTCCAC
>TU208093
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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU208085 True 4924 lncRNA 0.37 4 9907240 10016313
TU208092 False 4330 lncRNA 0.39 3 9966582 10018859
TU208093 False 4069 lncRNA 0.37 2 10010156 10016313

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC120574373 NA coding downstream 470374 9435292 ~ 9436866 (-)
LOC120574659 NA coding downstream 482194 9424509 ~ 9425046 (-)
LOC120574660 NA coding downstream 486542 9420152 ~ 9420698 (-)
LOC120574369 NA coding downstream 498758 9407854 ~ 9408482 (-)
LOC120574368 NA coding downstream 500436 9391565 ~ 9406804 (-)
cacna1aa NA coding upstream 42427 10061286 ~ 10149482 (-)
gtf2f1 gtf2f1 coding upstream 147853 10166712 ~ 10176011 (-)
luc7l3 luc7l3,LOC102798435 coding upstream 590139 10608998 ~ 10618057 (-)
LOC120574864 tob1 coding upstream 654483 10673342 ~ 10677290 (-)
spag9a NA coding upstream 720049 10738908 ~ 10772253 (-)
G153597 NA non-coding downstream 64258 9794092 ~ 9842982 (-)
G153588 NA non-coding downstream 108973 9752259 ~ 9798267 (-)
G153591 NA non-coding downstream 124677 9779289 ~ 9782563 (-)
G153498 NA non-coding downstream 192179 9288303 ~ 9715061 (-)
G153622 NA non-coding upstream 7 10018866 ~ 10019266 (-)
G153624 NA non-coding upstream 502 10019361 ~ 10022195 (-)
G153623 NA non-coding upstream 1312 10020171 ~ 10024766 (-)
G153629 NA non-coding upstream 6064 10024923 ~ 10025127 (-)
G153630 NA non-coding upstream 6458 10025317 ~ 10027699 (-)
LOC120574648 NA other downstream 84247 9822145 ~ 9822993 (-)
LOC120574579 NA other downstream 167935 9697643 ~ 9739305 (-)
LOC120574583 NA other downstream 170406 9735626 ~ 9736834 (-)
LOC120574609 NA other downstream 174045 9732686 ~ 9733195 (-)
LOC120574633 LOC102776372 other downstream 176000 9730610 ~ 9731240 (-)
gtpbp1 gtpbp1,LOC104924447,LOC102799794 other upstream 333299 10352158 ~ 10390176 (-)
LOC120574455 NA other upstream 765253 10784112 ~ 10791565 (-)
LOC120574486 NA other upstream 1059686 11078545 ~ 11080607 (-)
tnrc6c1 LOC103361861 other upstream 1079457 11098316 ~ 11137528 (-)
G154033 NA other upstream 1184591 11203450 ~ 11225546 (-)

Expression


Co-expression Network