G157147 (cdhr2)


Basic Information

Item Value
gene id G157147
gene name cdhr2
gene type unknown
species eurasian perch (Perca fluviatilis)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_053126.1
NCBI id CM020923.1
chromosome length 38831509
location 21849095 ~ 21856016 (-)
genome version GENO_Pfluv_1.0_2020_eurasian_perch_Genome

Sequence

>TU212955
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>TU212956
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Function

symbol description
cdhr2 Orthologous to human CDHR2 (cadherin related family member 2).

NR:

description
PREDICTED: cadherin-related family member 2

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU212955 False 6837 TUCP 0.42 1 21849180 21856016
TU212956 True 6922 TUCP 0.42 1 21849095 21856016

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
cldni cldn32a,LOC103367325,LOC104930709,LOC103392689 coding downstream 29610 21816010 ~ 21819485 (-)
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LOC120575109 NA coding downstream 63833 21778647 ~ 21785262 (-)
si:dkey-66i24.7 LOC102077857,LOC102782865,LOC102307613,LOC101474966,LOC103367331,LOC104934487 coding downstream 102669 21744086 ~ 21746426 (-)
pheta2 LOC103367340,LOC104943744,LOC104930231,LOC103392672 coding downstream 154293 21690695 ~ 21694802 (-)
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akt1s1 akt1s1,LOC102786700 coding upstream 365357 22221373 ~ 22226314 (-)
LOC120574468 NA coding upstream 439174 22295190 ~ 22303508 (-)
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G157161 shank1 non-coding upstream 71956 21927972 ~ 21932946 (-)
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G157162 NA non-coding upstream 88177 21944193 ~ 21945964 (-)
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LOC120575106 LOC103367329,LOC107658449,LOC107564019,LOC107674165,LOC104934486 other downstream 92904 21754741 ~ 21756191 (-)
G157096 LOC102782282,LOC100692966,LOC103367351,LOC107084765,LOC104927186,LOC102201015 other downstream 108392 21734382 ~ 21740703 (-)
LOC120574354 NA other downstream 130366 21715014 ~ 21718729 (-)
G157034 NA other downstream 226134 21621030 ~ 21622961 (-)
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G157384 LOC102296880,LOC102202593,LOC101475579 other upstream 769770 22625786 ~ 22639389 (-)
LOC120575271 LOC104967158,LOC103366161 other upstream 952520 22808536 ~ 22834656 (-)
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cbx2 cbx2,LOC104963701 other upstream 1671428 23527444 ~ 23534409 (-)
G157645 LOC103366762 other upstream 2277032 24133048 ~ 24138023 (-)

Expression


Co-expression Network