elavl3 (elavl3,LOC106607222,LOC102780136,LOC107754020)


Basic Information

Item Value
gene id elavl3
gene name elavl3,LOC106607222,LOC102780136,LOC107754020
gene type coding
species eurasian perch (Perca fluviatilis)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_053126.1
NCBI id CM020923.1
chromosome length 38831509
location 16840432 ~ 16856848 (-)
genome version GENO_Pfluv_1.0_2020_eurasian_perch_Genome

Sequence

>XM_039826133.1
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Function

symbol description
elavl3 Predicted to enable RNA binding activity. Acts upstream of or within regulation of neurogenesis. Predicted to be located in viral nucleocapsid. Predicted to be part of ribonucleoprotein complex. Is expressed in several structures, including nervous system; neural plate; neural tube; neuronal stem cell; and presumptive structure. Orthologous to human ELAVL3 (ELAV like RNA binding protein 3).

NR:

description
ELAV-like protein 3 isoform X2

GO:

id name namespace
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GO:0003723 RNA binding molecular_function

KEGG:

id description
K13208 ELAVL2_3_4; ELAV like protein 2/3/4

RNA

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Neighbor

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s1pr2 s1pr2,LOC103392577 coding downstream 163993 16657915 ~ 16676439 (-)
dnmt1 dnmt1 coding downstream 184473 16643191 ~ 16655959 (-)
icam5 NA coding downstream 218730 16616403 ~ 16621702 (-)
trip10a trip10,LOC104918559,LOC103358209 coding downstream 224576 16599258 ~ 16615856 (-)
rdh8a rdh8,LOC103358204,LOC102201298 coding downstream 400591 16433623 ~ 16439841 (-)
angptl8 NA coding upstream 18236 16875084 ~ 16876941 (-)
LOC120575000 LOC100174873 coding upstream 64298 16921146 ~ 16922018 (-)
LOC120575001 LOC100174873 coding upstream 68304 16925152 ~ 16925977 (-)
LOC120574105 LOC100174873 coding upstream 72227 16929075 ~ 16935610 (-)
LOC120574104 LOC100174873 coding upstream 82472 16939320 ~ 16940190 (-)
G155697 NA non-coding downstream 145 16839035 ~ 16840287 (-)
G155696 NA non-coding downstream 1715 16836993 ~ 16838717 (-)
G155693 NA non-coding downstream 4043 16834366 ~ 16836389 (-)
G155659 NA non-coding downstream 70494 16767433 ~ 16769938 (-)
G155644 NA non-coding downstream 97471 16741412 ~ 16742961 (-)
G155722 kank2 non-coding upstream 53426 16910274 ~ 16911079 (-)
G155759 NA non-coding upstream 110945 16967793 ~ 16968083 (-)
G155775 NA non-coding upstream 180330 17037178 ~ 17037710 (-)
G155796 NA non-coding upstream 260424 17117272 ~ 17117596 (-)
G155799 NA non-coding upstream 267342 17124190 ~ 17124481 (-)
G155583 eif3g other downstream 198301 16569446 ~ 16642131 (-)
angptl6 angptl6 other downstream 213699 16621826 ~ 16626733 (-)
LOC120574432 LOC103392867,LOC102312066,LOC104952514,LOC105932031,LOC102787456,LOC101484431,LOC102198284 other downstream 581407 16230459 ~ 16259025 (-)
LOC120574545 chchd5 other downstream 684365 16153787 ~ 16156067 (-)
G155323 LOC108415010,LOC101162128,LOC104945817 other downstream 1025063 15813058 ~ 15815369 (-)
mgrn1b mgrn1 other upstream 155563 17012411 ~ 17023208 (-)
polr3k polr3k other upstream 176137 17032985 ~ 17035040 (-)
unkl unkl,LOC102789129 other upstream 289260 17146108 ~ 17162165 (-)
gper1 gper1,LOC104918709,LOC100699814,LOC101483480 other upstream 308634 17165482 ~ 17173284 (-)
baiap3 baiap3 other upstream 370285 17227133 ~ 17265305 (-)

Expression


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