G164499 (LOC103354813,LOC104919172,LOC107387201,LOC100712488)


Basic Information

Item Value
gene id G164499
gene name LOC103354813,LOC104919172,LOC107387201,LOC100712488
gene type non-coding
species eurasian perch (Perca fluviatilis)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_053127.1
NCBI id CM020924.1
chromosome length 37730433
location 10245812 ~ 10254978 (-)
genome version GENO_Pfluv_1.0_2020_eurasian_perch_Genome

Sequence

>TU222955
TCTTTATTTAAAGCACACAGATGATGACAGTGGTCTCAGGCTTCTTTCTTTAGAAGTTTCTCGCTGCAAATGATCCACAAATTCTTTCATGATAGCCATCTGGatttttattctctctctctcatctctatcGGTCTTTGAAAACGCTGCAGGCTTTGACACCTTGTACCACATACATTGTATACGTATATTGTCTTACCAGCTAAACGACGAGCTGAAACTCGCTGTACAGCTccgaggggagctgcagattcaggtgaTCATTCTCTGTAGGTCCATACAAGCAACCCTTTTcacattgttttcacatttttcatttgatataaaaaaatattgattatagcggCTTTAAGTTTACTGTTCCAAGCAACTCTTCCTTACGGCAGCTTCTGTGTCAAATGAAATGGAACTGATGAGTCAATTGCTATGGatttgagcaaaaaaaaaaaaaaaaatcccaacaaGAAAATGGGCTAACATGAACACAATGTCAGGCTAAATGaaaagtgaaagataaatatttcatgtttttgtgaaatatctATAAGTTTTCAGGGGCTTTCAAATTAAATTGAAAACTAATAAAGTCTAATAATGGATGTTGATGGTGTGCAAAACACATGAgacaaggaaaacaaaacacttgTTCAAAACAGTCTATCAAATCAAATTTATTGAATTTTAAAGGGGTGCTCTGAATTCACAAGTTGCAGCTACAGTACATAACTCCTCTCACATCAATAGTTTTAAGCTATTTCGTAAAACAGTCCAGTCTCTTTTCAGATTTCAGAAATTTCCTCCAAAAAAGGTCacgctacaaaaaaaaaaagacaaatgcaTCAAATCTgatatataggctatatgtaTGAAAAATAAGAACGCTATCAAAAATAATGTGGGGCAAGACGTGTTGTGAGGTTGTGAAGGTGCTGCATTTAAGTCGGCAGAACAGTGAGTAAAATGGACAGCAAGTCAAGATTCAAACTCAAATCTCCAAAACACAACACGTCCCATCAACCCGACAGATGAAAGGTctaaaacaacagaaacacagaaaacaaattcaCAAATTATCTATGCTTTAAAAGGTGTTCGACCTCAAATGATGCATTATGGGATTTGCTTGATACTTTGAAAATATAGATTAAATGCTACAAAATATGAAATGCTAAAACATAACATGAAGGCCTTAATTTCATCAGAATCAAAAGGAAGTTTTATTCTCATTCTAGTAGTAAATGCATAGCAATTTCTAATAGTTTCAACCAGTTAAAATATGAATGATatgatttaaacaaacaatgagaCTTTTCTTGATGATTGCAGTGAAcaccaaaatgacaaacatGTTCTTAaggatatgatgatgatgataataataaaacagccaCAACCTGTAAACACCGCCTGCCAGCTTAGCTCTTTCACACGACTTTTGTGGGTATCACACATCGATTTTTCACAAGGCACTGGAGACCAAATTTGGTTCACTGTCCACGGATCAAAATCAGTTACAGCAACAGTTGTTTATTTGCAGCGCTCGAAATCCAAGCTCACCCGAAATCTGTACGATAACATGTCTCAAAGTTAACTTTCGTGCAGCTCATCAGCCTAATGCCGCATTCACATCAtatcagaagaaaaacaaacaactaaatATTGTTGCTATGTGTTTAAAGACACCGATTTTGATGTTATAGGTAGAGGTGATTTTCCTGAACTACTGATGTGTGCATTTTCTGctgtttgaaaacattttgcaaCAGACACCAACTGGGTAATGACACACCCTGCATAATATTACGTATCACTTGTTATAACTACTAATGCCGGGCTCACACTACACAATATTTATGCCTTTTGAGATGGTCGCTGTGTCAGACAAAACAGTCATAGGTTCATAAATGGATCAACGGTCAATCGCAGCTTGCCGTTCAGATGCGATGGGAAAGGAGGTACCAGGGACTGACTTCACTGTTCCACCTGACAGCGCCAAAACAAAATTTTTCATATCAATTTATTTAAATCTTTGTCTTTACAGTTGTGCAAAGAGGAGCTGTGCTCCGATGGGTCACCAAAGACCATcatcagggttcaaaattaacttctACGTTCACCAGCCAAATTGCTAGTGaatgttttttggctggtgagtgaagcaaatctgccagccacttgcatattttaccagcattttgGTTGGTAGATGGTGTTAATTTTGAAACCTGACCATCATGGTCATAAATGTTGTCAAACTATGTGAGAGATGGCAAAAACAGAATCAACTGGAGCAGGGGTAAAAAGGAGAGGGGGTTATCATTCCCATTCCAGTTATCATTCCCAAAACTTCATACTGGGTAGCATATTTTCTTTGTTATGTTGGTATTACTTTGGATGTAAAATGACAATTAATGCATGAATAAATATGTCTTGACTTCACTGATGGGAACATAGACACCAAACGTTTGCCACGTTTGTTGAACATTGTGCTATTTCCAGcacctttaaaataaacatgccATATGCCCGCAGATGATATGGAGCTCTCACATAGTTCTAGActcaataaaaacagaaatagtTTGGGGAGTTTTACATTTCAGCATTATTGGCAACAACCCTTAGCCATAAAGAAAGCCAAAGTCCTGCCCCATTTATAATTTCCATTCTCGGTTCCTAAAAGGTTTCTTGTCATAGACAGTTTCTTTAATATGCATTTCTGAAAAGGTGTTAGCATCCAACATCTCCCATCTGCCATGGCTGTCAATGTCTCATGGGAGCTGAACTTAATGGAAGCTAACTAATTTAGCATAGGCCCAGGCTGAATGATTAGCATGGAGCCTACTATCACTTAACATAGTGTGTGATAAGGTGTTGGCTTTGAGTCAACTACCTCTCAACATATATAAAGTGTTCGTTTGATGATGCTTGCTATCATATCAAGATAAAGTGTTAGCATGTAGCATATATCCACTCAGTAGTACTGTGTGCTAAAGTGTTAGCATGAAGTATATGCTTACTCAAAATAGCGTTAGCAAGAACTGACCATTGCTCAGCGTAGTGTAGGCCTGTGCTAAAGTTTTCATCAACCACCACTTAACACTTATTAAATGTTAGCTTGGAGCTTGATACGACTCAACAATGTAAAGATAAATTATTAGCATGAACTCTACATCCACTCAACATAAAACCGATGCTGAAGTGTTAGCATGGAGTGAACCCTCACTCAAAATAGTGTTACCAAGAAGCGGACTACTGCTCAGCATAGTGTAGGCCTATGCTAAATAGCGTTAGCATGGTGACACAGCCATCTCGGTTCACGTGTTATTTTGGTGTCCATGTTCCCATTCTCATTCTATTCTTACATACAAGTACAAGGAATACAAAGCATCTGgttttttacattaatgtgtCCGTTTACTGTGTAATGCAAAAACTTTATCAGTATAATCATTATGTAGTTTCAAACCCAATGTGCTCAAATTACGGAGTAAAATGTCACTGCCCCATAGACTAAACttaaatggtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtAATTACCTAAAACACTTGGCAAGTATCCACTAAATCCTTCGAGGTAACGTCCATCACAAACTCAACATGTTGGTCACACTCTAGGACCCAAAGAAAGACGTGAGACTGGAGCgtagttatgtttttaagtgagaagtgggtcacttagCTATTAAGACAAATCATCTACGGCATGTCTAAAAATACAGAGAAGCAAATGGATCTCACTTCATATCACTACGGTTACTGTGATTAACTGAAGTGCCTGACAGTCTTTGGTTTACCAACCcttagaagttgaagtatcgcAAGCCATGTCAGAAAGCATTAATACAAGAAAAATCTATAATGGAAAACAAAACgctttaaaaatataatttagaaAAGAAACACCATACCACTCTAGATGTGATCATCTTCAGAATCAGTCTCACAATTTCATCATCTTACAATAAacctctatacacacacacacgcatatgtTAACAACTTCATCAAACTTCATCAAACCCTGAGCAAAGATGAACTTAAGACTTTCGATAAGAAGAATCTATCAAGTAACAAAAGAATACCGGTTAAGATATGTGTACTCTGCATGACTCGAACCTTTTAGAATTCCTACTGAGGGATTCACAGATTTAGGATCAGATGCCATTTATGCCATCCAGATTCCTAGCGATGGGAATAATGAGGCCCGTCTTCCATTGGCTATAAAAGTTACAATAACTTTAGTCAGGTCagtgtgatcagatcagaccaATTAAAtcggatttctttttttttattattagtaaAATTGAAGCGGCAAATCAAGGTCATCAGTTTATAAATGGGGGTTAATTTGCAGATAtagaaaatacatttgaattttGGACACCGTCACTTACAAATATATAATTTCGCTTTCTTAATTAGCAGATGGAcacaatgaaaagaaagaataaaCTGCTTAAGAGAGCAAACAAAAAAGGGAACTTTTGATAATTAAATTGAGGAAAATGTTACGAAAAAATCGTGGAATGTTAACATTTTCTATATTCTCTCAGACTCTCACCTATTTCCTGTCAAATAGACCTTGTTCAAAGGGGAGTTTAATGATTTTGAAAAACTGTCACAACAGGCTCAACTTTAGGGTGCTAAGGAGCTGCTACTACACCTTAAATTGTTTTGTCATGATGGTATAAATGCTCTTTCAATGGCTTTTCTACCCGAGATAAAACAAGAATGAAATTTTGGCAGAAATGTCGGTGTTAAAATGGTCGGATTTAAGTAATCCTTAACACCAACCATTAATCAAATCAATATCGCGCTTTAAGGGATGACATAAAAGCATTCAAACAAAGCCATGTGTCAGTTTTGTCAGTGTATTAAGTAGAAGGTGAGGTCATGGTGGCATGACAATGGAGATGCATGTATCTGAATGCGGCACACTACATAGGAGACATGCAGTTTCAATAGGAAATGCCC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Function

NR:

description
PREDICTED: protein FAM57A-like

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU222955 True 7410 lncRNA 0.39 3 10245812 10254978

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC120575563 NA coding downstream 33542 10206291 ~ 10212270 (-)
ncam1a NA coding downstream 699641 9276946 ~ 9546171 (-)
zbtb16a zbtb16 coding downstream 1005956 9086835 ~ 9239856 (-)
usp28 NA coding downstream 1201881 9009685 ~ 9043931 (-)
orai2 orai2,LOC101071969,LOC103395401,LOC107685638 coding downstream 1238029 8996876 ~ 9007783 (-)
LOC120543908 LOC103363285,LOC103395367,LOC100690133 coding upstream 72931 10327909 ~ 10445705 (-)
LOC120544314 NA coding upstream 257564 10512542 ~ 10513721 (-)
LOC120544706 slc35f2 coding upstream 305062 10560040 ~ 10568349 (-)
ompb omp,LOC104919181,LOC103395359 coding upstream 363779 10618757 ~ 10619504 (-)
LOC120543735 LOC104919183,LOC103357773 coding upstream 442048 10697026 ~ 10716079 (-)
G164463 NA non-coding downstream 45918 10199006 ~ 10199894 (-)
G164434 NA non-coding downstream 90051 10155411 ~ 10155761 (-)
G164433 tecta non-coding downstream 90864 10154440 ~ 10154948 (-)
G164393 NA non-coding downstream 509203 9653309 ~ 9736609 (-)
G164394 NA non-coding downstream 578397 9666759 ~ 9667415 (-)
G164497 LOC100689869,LOC103354810,LOC104919175 non-coding upstream 31318 10286296 ~ 10291803 (-)
G164520 NA non-coding upstream 226130 10481108 ~ 10481331 (-)
G164562 NA non-coding upstream 378624 10633602 ~ 10633802 (-)
G164563 NA non-coding upstream 380038 10635016 ~ 10635238 (-)
G164564 NA non-coding upstream 386594 10641572 ~ 10645819 (-)
plekhb1 LOC107387206,LOC100711952 other downstream 118205 10109156 ~ 10127607 (-)
G164179 NA other downstream 1606651 8637714 ~ 8639161 (-)
trim37 trim37,LOC102780947 other downstream 1702309 8512174 ~ 8543503 (-)
smg8 smg8,LOC102779993 other downstream 1780013 8451577 ~ 8465799 (-)
rabgef1 rabgef1,LOC102778478 other downstream 1865237 8368495 ~ 8380575 (-)
LOC120543909 NA other upstream 208233 10463211 ~ 10489164 (-)
elmod1 elmod1 other upstream 287240 10542218 ~ 10557276 (-)
G164728 NA other upstream 769063 11024041 ~ 11025991 (-)
G164798 NA other upstream 1592627 11847605 ~ 11850970 (-)
pof1b pof1b other upstream 2006697 12261675 ~ 12293365 (-)

Expression


Co-expression Network