LOC120545529 (ermp1,LOC102800265)


Basic Information

Item Value
gene id LOC120545529
gene name ermp1,LOC102800265
gene type misc
species eurasian perch (Perca fluviatilis)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_053128.1
NCBI id CM020925.1
chromosome length 37416781
location 19380250 ~ 19402379 (+)
genome version GENO_Pfluv_1.0_2020_eurasian_perch_Genome

Sequence

>TU238449
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>TU238450
CCTGAGAGCGACGCTTTCAGCTCATGTACCGCTGGCTCAAAGATGGAAAGCGACACCGCTGTCAGGAGAATAAAACCCTTCGGGACACAGAATTATGTAGCGCAAGATAACGACGGTTCCCGGGGCCGGTGGGGGGATAACGGTTACAGCGATGACCCGAAGAAGAAGCCCGAAGTGAGCATATATTTGCTGCGGGAAGGGCTTGCAGCTTCTCTGGTCTCTGtgtttattttggtgctgtggGGACTTGTTCATTTGTCGTTACAGCAGCTCGTCATTGGGAACCCAACCGGCGAGTTCAACGCCGGGAGAGCCAGGTGCCAGTGATGATGCAGTGAGCTGTGCAGTGATGCTGGAAGTCCTCCATTCTCTGGCCAATCAGTCTACTCCTCTCCGTCATGGAGTTATCTTCCTTTTTAATGGGGCAGAGGAAAATATCCTTCAGGCCAGTCACGGTTTCATTACTCAGCATCCGTGGGCCAAGCAGGTGCGAGCCTTCATTAACTTGGAGGCTGCAGGTGTTGGGGGCAAGGAGGTTGTTTTCCAGACAGGTCCAGAGAATCCGTGGCTGGTCCAGGCCTACGTTCACGCAGCCAAACACCCCTTTGCCTCTGTGGTCGGCCAAGAGGTCTTTCAGAGTGGCATCATCCCCTCTGACACGGACTTCCGCATCTACAGGGACTTTGGTAACATCCCAGGCATTGATCTGGCTTTCATTGAAAACGGTTTTATCTATCACACCAAGTATGACACTGCTGACAGGATCCTGACAGACTCGATACAGAGAGCAGATTCAGCGCATGTTAGCTGGTGGGTGTGTCTGACTGTCAAGGAGAGAGCGGTCACTGCAGCAGTAGACTGGTGTGGTAGAAACAGCTGCCAACGTTGTTTTTCTGtcacagagaaaaaaacacatgctcACCCCCAGTTTCAGACTGGTGAGCACTCTGCTG
>XM_039779932.1
aaaaaaaaaaaaaagaaagaagcaacGCCTGAGAGCGACGCTTTCAGCTCATGTACCGCTGGCTCAAAGATGGAAAGCGACACCGCTGTCAGGAGAATAAAACCCTTCGGGACACAGAATTATGTAGCGCAAGATAACGACGGTTCCCGGGGCCGGTGGGGGGATAACGGTTACAGCGATGACCCGAAGAAGAAGCCCGAAGTGAGCATATATTTGCTGCGGGAAGGGCTTGCAGCTTCTCTGGTCTCTGtgtttattttggtgctgtggGGACTTGTTCATTTGTCGTTACAGCAGCTCGTCATTGGGAACCCAACCGGCGAGTTCAACGCCGGGAGAGCCAGACGGCACTTGGAGCAGATCACCAGCGTCGGCCCTCGGCCAGTGGGCAGCCAGGAGAATGAAGTCCTGACAGTGGGCTACTTATTGGAGCAGATTGAGAACATCCGGGTTGAGACCGCAGCGGGCCCCCATCAGCTCACGGTAGATGTGCAGCATCCCACTGGCACTTTCTCTATTGACTTTCTTGGAGGCTTTACTAGCTTCTATGACCGTGTCACCAACATTGTTGTCAGGCTGGAGCCTAAGAGCGGGGCGCAGCATCTCATGCTAGCCAACTGCCACTTTGACACAGTGGCCAACAGTCCAGGTGCCAGTGATGATGCAGTGAGCTGTGCAGTGATGCTGGAAGTCCTCCATTCTCTGGCCAATCAGTCTACTCCTCTCCGTCATGGAGTTATCTTCCTTTTTAATGGGGCAGAGGAAAATATCCTTCAGGCCAGTCACGGTTTCATTACTCAGCATCCGTGGGCCAAGCAGGTGCGAGCCTTCATTAACTTGGAGGCTGCAGGTGTTGGGGGCAAGGAGGTTGTTTTCCAGACAGGTCCAGAGAATCCGTGGCTGGTCCAGGCCTACGTTCACGCAGCCAAACACCCCTTTGCCTCTGTGGTCGGCCAAGAGGTCTTTCAGAGTGGCATCATCCCCTCTGACACGGACTTCCGCATCTACAGGGACTTTGGTAACATCCCAGGCATTGATCTGGCTTTCATTGAAAACGGTTTTATCTATCACACCAAGTATGACACTGCTGACAGGATCCTGACAGACTCGATACAGAGAGCAGGTGACAACATCCTGGCGGTCCTGAGGTACCTGGTAATGTCAGACAAGTTGGCCGATTCCTCAGAGTATCGTCATGGCAACATGGTATTTTTTGACCTGCTGGGGGTAGTCGTGGTGGCTTACCCATCCCGTGTTGGCACCATCCTCAACTACATTGTAGCCACGGCCACCTTCCTCTATCTGGCCAAGAAAGCCTCACGGCCAGGCAATTGGGGTGGCCGATATGTTCGAGATCTGGCCTGTGCTACAGGTGTAGCAGTCCTGAGTTGGTTCGTCACCCTGCTGTCAGTGCTGATTGTTGCTCTGCTTGTCACTCTGCTGGGCCGCTCCATGTTTTGGTACAACCACTTCTATGCCTCCATCTGCCTCTACGGGGCTGCTGCCACAGGCAAGATGATCCTCATTCACACACTGGCCAAGAACTTGTATTACGAAGGTGTCCGTTTGGTGGAGCTGGGTGATCTCTACTTTGACGTGAGCTTGTTGCTATGGTGCTGTGGCCTGGTGTGGCTGACCCACCAGGGCCTGTGTTCAGCCTACGTGCCCATGCTAATGGTGGCCTTCCCCCTGGCCACCAGACTGTTGCTGGCGAAAGAATTTAAACACAGAGGAGCATCAGTGAAGTACAGTGTGCTCTATATGTTGGGCCTGACTTTGCCTTACGTCCACTTCATGTTCCTTATCTGGGTGGTGTTTGAGATTTTCACACCCATCATGGGTCGCAGCGGCACTGAGATACCCCCTGAGGTGGTGATGGCCTCTCTTGTCACCCTGGCAAccatcttcctctcttccttttttCTGCACTTCATCTACTTGGCACAGAGCACAAAGTGGATCCTGGCTGGTCTGGGTTCAGTATTCATCATCACGTTCCTGTTGATGTCCTGTGGGCTCCTCTTTCCTTTTTCAGGCAGTCCAGACAGCCCGCGGCCAAaacgagtcttcctgcagCACACGACGCGGACCTTCCACAATCTCCAGGGCGAAGTGGAGAGCCAAGACTCAGGTCTGTGGATGAACAGTTTCGACTACACAGGCATACAGCACCTCACACCCCACATCCCTGAGATCAACGACAGCGTTCGCACTAGCTGCCGTGAGGACCGGCCCTTCTGTGGTTACCCCTGGTTCCTGCCGTTGAAGTTCCTCAGCAAAAAGAACTGGTACCTTCCTGCTCCGGAAGTGTCACCCAGCTCACCGGTGGAGTTCAGCCTGCTGTCCAGAGAGGAGACCAGCTGGGGGACGGTCAAGATGGTCTTCAGCGTGAAAGGCCCCAGCCACATGTCCCTGTATCTGATGCCTCACCGAGGAGCCAGCCTCTCCACCTGGTCCTTCGGAGACGGGACGCCTCAGTTCGACCTGAGCGGAGaatattttgtcttttattcCCACGGCCTTGACGCCCCCACATGGATCTTCTGGTTCGAAATACAGCCTCCCAGGGACCCGGACCCATCTGGCCCTGAGGGGATGATCTCCGTTGCCATCTCCACCCACTATTTCTTCGGGCCCGACAGTAGGACTGCTCAACTGGAGGACACCCTCCGCAAGCTTCCCACATGGGCTTTTCCTTCGTCTTGGGTCAGTACCTACGACATGTACCGATACTGAGGATGCCACACATCACACAGGCCGACGCTGACCAAGCTGAGAGCTACAGGGGCCCCCGAGAAAATATTTCAAGGAACAATACTGAGGACCGGCCCTGACGCCTTTTCTCTCTGACACAAACGCACACTCTAGCACACACTCACGCTCCCTCCCAGCCTGCCTGCCTGAGAGACCTCCATCACTGTGTCAGTAGGTCTAGTAGCTGACCGAGCAGGAGGACGCGCTGAGACACCCCAGAGGTAAGCTGATCAGACAGCTTACAAACTGACTAACTCAACGGCCGACACACTGGCCACCGCTAGCCTCATGCTCACTCCTGGGTTAGtgaaacaaagttttttttatttttttttattttttattttttttggtactTAATCTGTCGtgccttttgcttttttaaatccatttcaCTCCCCTCCTCACTTTCCCTCTTGCTCACTTCCTCCCTTTCTTCATCTCTCATGCTTCCTGAATGAATAACGTTGCATGGCTACTTCCCCTGCACTCTCTTTATGAGCAAACCTCTTGGGCCATTCATAGACTAGATGTGTCTCTGGCTTCCTCTGCAGAAATTACACCACCGCTATCTGCACTGTAGGTGTAGTAACATACTGAGGGATCTGTTTGGGAGAGGAAACAAAGAACGGTTTTGTTCCCCTGATCCGACTTTAACTGGAAACTTTGAAAGTTGCTTTTCATTTAACAATTTGCTCTTCATCATTTCTCGATAACACCAATGATTTGCAGCAAGTCGTAACCCTGTGTTTGTCATGTCAGGAATGCCAACAATCTGCTTTAATTGTCAGAGAATCTGGCATGCAGAGGCAGGAAACTGTGCCTGTTCAGTGAGAACAGCTGGCTTAAATCAAAATGTGAACGTGTCCTTTAGGAGAAGGAGTCACTTTCTGAAGATTTAATGCAGAGGGCAATATTCAGGGTCTTACATTTTTCAGCCTGGTGTGTTCACGCAAATGTGTATTGATTTTGGGTGCGATGAGACCAGAACTCACAGGGAAACACGGACGTGTAGCAATCTCACTGACCAGTGATTTCAGATTATTCCCTGAGCCTTGAGGGTGACTGGGTGGAAAACCAGCAATGCTACTCCACactcattaacatgatcagtatCAGTCAGCTTGTTCTCTCTCACATTATTTGCATTTGCAGTTACTGtaatagtatttatttatttagtattactATCTCCAGCAGCACCAATGCATGTCAAATTTCATATACTAAACGATGAATCAAGAAAGAAATCGGAAGATTAATAGATAGTGTAAATAACTGTTAGTTCTGACCCTAAAGGAACGTTATCCAGTCTGCATATCTTGGCTGCAGATGAAGATAAATTCATCAGACCTTGATGCATTTTCAGTTAATTGTACCACTAAAATGGCATCAAAACAGAATGATGTACTGTAGCTTCATTTGAAACCAGTTAAAAACCACGAAGGTGCAAATTTTCAACTCTATAGCAATATAGATAATATATTAATCcaagttaaaaacaaatgggtGAATCTTTGTTTTATGAGTCTTTAATTTCTAAATGATAAATTTAAtcatgtatataaaaaaatgttaagaTGTTTCCTGGATAGAACTATGCGGTTTGGTACTAATGATATGGAATATGGAGAACATGTTAAGTTGCTTCCAATTAGTTAATTTCAATTTATTAACTGATTGTTCAAAAAAAGTTCAGTCTACAGGCAAGCATACAATTCAAAACATGCGGAGAATACGGTTTCCGATAATAAGAATATTTACTgagcttttcttttaaataaattcATATTTTCCCTATAATTTACCAAATTGCATAGTTATTTCAAGGAAATATCATCAAATaacatctataaaaaaaaaaaaaaacgtcaccAAAAGCAGTCATATACAGATAGTTATGAAATGAAATTCTGTTACCATAAATACTCTGCTGAAACATCCAGCTAATTTTCAACCCAGTGAGGAGCTGCCCTATGCCAAACTGTTCATTAACTGTAATTTCTCTCTCCTCCAAGTTTTGGTGCTGCTGCAGACAGATCATACCGGTTACTATTGCTAATATTTCTTATATTTCACTCATCTCATGTGGAGCTGCATCTTTTTGGTCTAGAGCCCAAGTATCACAACCCAGTTAATACGACCTGTTTTACCTGTCTACTTCACATAGTCGACCCTTATAGAACACCATGGCACAGTTACAGCCAGGTTACACTACAAAAGAAGGGGATCGGATGACATGTTGT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Function

symbol description
ermp1 Predicted to enable metal ion binding activity and metalloexopeptidase activity. Involved in cellular response to oxidative stress. Acts upstream of or within endoplasmic reticulum unfolded protein response. Located in membrane.

NR:

description
PREDICTED: endoplasmic reticulum metallopeptidase 1

GO:

id name namespace
GO:0006508 proteolysis biological_process
GO:0008233 peptidase activity molecular_function

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU238449 False 3198 lncRNA 0.40 1 19399170 19402367
TU238450 False 953 TUCP 0.52 6 19380277 19387442
XM_039779932.1 True 7872 mRNA 0.45 15 19380250 19402379

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
mlana mlana coding upstream 58011 19318972 ~ 19322239 (+)
LOC120545863 NA coding upstream 105617 19273397 ~ 19274633 (+)
rfx3 rfx3 coding upstream 166785 19195656 ~ 19213465 (+)
glis3 NA coding upstream 186852 19177139 ~ 19193398 (+)
bmpr1bb bmpr1b,LOC102795848,LOC101481773,LOC102310602 coding upstream 413925 18906742 ~ 18966325 (+)
exosc2 exosc2 coding downstream 39197 19441576 ~ 19447599 (+)
abl1 abl1 coding downstream 47184 19449563 ~ 19486106 (+)
ddx54 NA coding downstream 114431 19516810 ~ 19525324 (+)
trnac-gca_32 NA coding downstream 114856 19517235 ~ 19517306 (+)
lman2la lman2l,LOC108231067 coding downstream 491737 19894116 ~ 19900260 (+)
G175973 NA non-coding upstream 525702 18851078 ~ 18854548 (+)
G175974 NA non-coding upstream 543496 18836175 ~ 18836754 (+)
G175925 LOC103360647,LOC104958910,LOC102220109 non-coding upstream 706285 18670383 ~ 18673965 (+)
G175917 NA non-coding upstream 721966 18657690 ~ 18658284 (+)
G175891 NA non-coding upstream 791957 18587759 ~ 18588293 (+)
G176173 LOC104959907,LOC106527788,LOC107745368,LOC106563285 non-coding downstream 85931 19488310 ~ 19492082 (+)
G176177 NA non-coding downstream 93657 19496036 ~ 19502184 (+)
G176225 LOC104956387,LOC101069739 non-coding downstream 160867 19563246 ~ 19565919 (+)
G176226 LOC103367784 non-coding downstream 164560 19566939 ~ 19567169 (+)
LOC120546000 NA non-coding downstream 188363 19590742 ~ 19593712 (+)
srsf9 srsf9,LOC104958899,LOC100707309 other upstream 656465 18676021 ~ 18723785 (+)
LOC120545610 NA other upstream 722631 18656524 ~ 18657619 (+)
cabp7b cabp7,LOC104925332 other upstream 729181 18635026 ~ 18651069 (+)
myo1hb LOC103374943,LOC101465300,LOC102786650 other upstream 832109 18536631 ~ 18548141 (+)
tmem120b tmem120b,LOC101471304,LOC102195879 other upstream 979804 18391739 ~ 18400446 (+)
LOC120545241 LOC105930800,LOC102780299,LOC103149678,LOC107095870,LOC100701678 other downstream 509457 19911836 ~ 19914680 (+)
pappaa pappa other downstream 1112968 20515347 ~ 20620786 (+)
G176526 NA other downstream 1544305 20946684 ~ 20947055 (+)
G176753 NA other downstream 2876501 22278880 ~ 22282163 (+)
LOC120545252 NA other downstream 3094034 22496413 ~ 22524405 (+)

Expression


Co-expression Network