G177091


Basic Information

Item Value
gene id G177091
gene name NA
gene type non-coding
species eurasian perch (Perca fluviatilis)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_053128.1
NCBI id CM020925.1
chromosome length 37416781
location 23172252 ~ 23177502 (+)
genome version GENO_Pfluv_1.0_2020_eurasian_perch_Genome

Sequence

>TU239698
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TGATGGgtgcatgcagctgtgtgtgtgtgcgtcttgaaGGCACGTGTGTGGCCATACACAGCACACGAGCTGTAGAGTTCATGAAGTTCATTACTGTTACGTTatttgtgaagtgtttcctaCATTACCTTACAAGGATATGGAAGTACATATAGTACGTCCCT

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU239698 True 5164 lncRNA 0.37 2 23172252 23177502

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
amacr amacr coding upstream 7051 23155838 ~ 23165201 (+)
LOC120545462 ppef2,LOC103366113 coding upstream 83842 23074570 ~ 23088410 (+)
LOC120544950 LOC103473489,LOC103142714,LOC106917991,LOC106959058,LOC108231074 coding upstream 136156 23015127 ~ 23036096 (+)
sdad1 sdad1 coding upstream 175411 22990154 ~ 22996841 (+)
LOC120545187 NA coding upstream 182936 22985204 ~ 22989316 (+)
nxnl2 nxnl2 coding downstream 46185 23223687 ~ 23226613 (+)
csgalnact1a LOC102302787 coding downstream 52335 23229837 ~ 23259542 (+)
plpp1a plpp1,LOC102797153 coding downstream 85970 23263472 ~ 23277088 (+)
dhx29 LOC103364531 coding downstream 124087 23301589 ~ 23312531 (+)
itga1 itga1 coding downstream 178721 23356223 ~ 23406309 (+)
G177089 NA non-coding upstream 574 23166559 ~ 23171678 (+)
G177079 NA non-coding upstream 30317 23141729 ~ 23141935 (+)
G177043 NA non-coding upstream 37365 23134649 ~ 23134887 (+)
G177039 scarb2,LOC104955650,LOC107395254 non-coding upstream 55536 23104642 ~ 23116716 (+)
G176974 NA non-coding upstream 238607 22893156 ~ 22933645 (+)
G177093 NA non-coding downstream 3198 23180700 ~ 23181267 (+)
G177169 NA non-coding downstream 152648 23330150 ~ 23331248 (+)
G177170 golph3,LOC103364537,LOC106962713 non-coding downstream 154396 23331898 ~ 23335577 (+)
LOC120545237 NA non-coding downstream 158805 23336307 ~ 23347393 (+)
G177177 NA non-coding downstream 247342 23424844 ~ 23426902 (+)
klhl8 klhl8 other upstream 163418 22998253 ~ 23008834 (+)
G176870 cplx4 other upstream 634915 22531908 ~ 22537337 (+)
LOC120545252 NA other upstream 647847 22496413 ~ 22524405 (+)
G176753 NA other upstream 890089 22278880 ~ 22282163 (+)
G176526 NA other upstream 2225197 20946684 ~ 20947055 (+)
G177094 NA other downstream 5171 23182673 ~ 23184262 (+)
hnrpkl LOC103364541,LOC100706673,LOC103155138,LOC103473466 other downstream 263481 23440983 ~ 23458605 (+)
rpl37 rpl37 other downstream 545976 23723478 ~ 23727242 (+)
LOC120546142 NA other downstream 546664 23724166 ~ 23724245 (+)
LOC120546141 NA other downstream 548472 23725974 ~ 23726052 (+)

Expression


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