rfx3 (rfx3)


Basic Information

Item Value
gene id rfx3
gene name rfx3
gene type coding
species eurasian perch (Perca fluviatilis)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_053128.1
NCBI id CM020925.1
chromosome length 37416781
location 19195656 ~ 19213465 (+)
genome version GENO_Pfluv_1.0_2020_eurasian_perch_Genome

Sequence

>XM_039780159.1
TAAGGTTGCGCGCTCCCGGTGAGTTTTATAGCAACTGTTGCCCAGTGAGGCAGCGCCATAGTCACCGTAGTCCTGGCGACTGTAACCCACCAACAACAACCTCTCGCTCCATCATTACCACCTCCTCCACCATCCTCATCTTCATCAACCAGTCCACAGCTCAGGCGCCATGCAGACCCCTGAAGCAGGCGCTGACTCCACCTCCACTGTCCCTCTTCAGACCACCGTGCCTGTCCAGCCTACCGGCTCCACCCAGCAGGTGCCTGTCCAGCAACAGGCCCAGACTGTTCAACAGGTTCAGCATGTTTACCCAGCACAGGTGCAGTATGTGGAGGAAAACAGTGGCGTGTACACCAATGGCAACATAAGAACATACTCGTACTCAGAGCCGCAGCTGTATAGCCAGAACAGTGGAGGGAGCTACTTTGACACACAGGGCAGCTCATCACAAGTGTCCACTGTGGTGACATCTCATGGCATGACCAACAATGGAGGAGGGGGCAGTGGAGGAATGAGCATGAATCTGGCGGGGGGTCAGGTAATCAGCACCAGTCCTGGGGCTTACATCATGGACAACACTGGACCCCACCCTGCCACCCAGACGGCACGAGCTTCCCCAGCTACTATTGAAATGGCGATTGAGACGCTCCAAAAATCTGAGGGTTTATCCAGTCAGAGAAGCTCGCTGCTCAACAGCCATCTCCAGTGGCTGTTGGACAATTACGAGACAGCAGAGGGCGTAAGTCTACCACGATCCACCCTCTACAATCATTATCTGCGCCACTGCCAGGAGCAGAAACTGGACCCTGTAAATGCAGCCTCTTTTGGCAAACTCATCCGCTCCATCTTCATGGGACTTCGTACAAGGCGTCTTGGGACAAGAGGGAACTCCAAATATCATTACTATGGTATACGTGTGAAACCAGACTCCCCACTAAATAGACTCCAAGAAGACATGCAGTACATGGCCCTCAGACAGCAACCTGTTCAGCAAAAACAGAGGTTCAAGCCAGTGCAGAAGTTTGATGGCTGCTCTGGGGAGAATTACTCAGGTGGAGGCCAGCACCATCCTGGTGCAGAGGAGCAGACAGTCATTGCACAGAGTCAACACCACCAGCAGTTCCTAGATGCATCACGGGCCCTCCCTGATTTTGTAGAGCTGGACCTGGGACAGAGCAATACGGAGAACATCAGCCCGGAGGATGTGAAAGCTCTCCAGGCCCTTTACAGAGAGCACTGTGAGGCTATCCTGGATGTGGTTGTCAACCTCCAGTTCAGTCTAATTGAGAAGTTGTGGCAGACATTCTGGCGTTATTCTCCCCCTGACTCTGCAGAGGGGGCCACTGTAACAGAAAACAGCAGTTTAAGTGAGATTGAAGCACGGCTACCCCGTTCACAGCTATTGGAACTGTGTAGAAACGAGGCTGTACTCAAATGGATGAGCACATGTGACCATCTTATGTACCAGGCCCTTGTGGAGATCCTCATTCCTGATGTCCTGAGACCCATTCCCAgtgCCTTGACTCAAGCCATTCGCAACTTTGCCAAAAGCCTGGAAGGTTGGCTCAATAATGCCATGAATGCCATTCCACAGAGAATGATCCAGACCAAGATTGCCGCTGTTAGTGCCTTTGCGCAAACACTGCGCAGATACACATCTCTGAACCACCTGGCTCAGGCGGCACGTGCTGTTTTGCAAAACACGTCACAGATTAACCAGATGTTGAGTGATCTCAATCGTGTTGACTTTGCCAACGTACAGGAGCAGGCATCATGGGTGTGCCAGTGTGAAGAGGGAGTAGTTCAGCACTTGGAGCAGGACTTCAAGGCCACACTACAGCAGCAAAGCTCTCTGGAGCAATGGGCAGCCTGGCTGGAAAATGTGGTCACTCAGGTGCTCAAGCCTTACGAGCACCGGCCCAGCTTCCCCAGGGCAGCTCGACAATTCCTGCTCAAGTGGTCCTTTTACAgTTCTATGGTGATCAGGGACCTGACCCTGCGCAGTGCTGCCAGCTTTGGTTCCTTCCACTTGATTCGCCTGCTGTACGATGAATACATGTTTTACCTAGTGGAGCATCGTGTGGCACAAGCTACTGGAGAGACACCCATTGGTGTCATGGGAGAGTTCGACAGCCTCAACACCCTGTCCCTCTCTAATATTGATAAAGATGAAACGAGTGGGATGGACAGTGATTTGGAAGATGACGTGGAGGAGTCCGGGGAACCTCTTGCCAAGCGAGAGAAGTCGGAGCATGAAGTGATCCAGGTGATCCAGGTCGGGGCACTAGAGGACGGGTCCCACCCTGTGGTGGGGGTCGTCCAGCCAGGTGTCCTCCACTCACTGCCCCAGCCCCCGCAGGACCACACTGAGCACATCCTAACCCCCTCTGCCAGTACTCCCACCATCCGCCACTGCAGCGCCACAGGCAACACATATGCCTCCGTTTGAGGGTCTGAGGGCACAGCGGACCTTGTCTGGACTGTTTTCACTCTCCACATATCTTTCTCTCTGTAAGTCTAGATGTTTCCGTCTTTTTCACGCATTGTCTGTGTCTGCACTTGTGCGGACACGCTCTCCGCTCCCTATCTAGCCCAGTCAGTGGAGGAGTGCTGAAATGATGATACTCTGGCCAAGATGTGCTGTCCGTGTCTGACTGTCTTAGATTCTGGATGTGGTGTCATCACATAAGTCTGTGCTCTATCCCAATGGGGCAGCTGCAGGAGGACTAACTTGACCCGTTAAATGTTTCCTGCCTAGACATGACTTAACACCTCTGTCTGTCCACACAGACTGGTTCTGTCTTGAAGGAAAATTCAACTCTTTCAAACTGCTGATGTCTCAGAGCTCAAATCCATGTCACTAGTCCCAGTGGAGCAAAGTCATCGATTGACTCAAGACCTTCACCTATTGTAAATAGTTTTGCTGTATTTTCAATTGGTATTACCCAAAACTCATGGTGCTAtcgttgttttgttttgatttccATTTATCCCTCCTACTTTTAGCATGATTTATGTCCACATGCATTCCAACTGCTGATAAACGTTTGGCTGAACAAAATATTTTTAGTATTGTATGTAGCTAAAAAACAAGGGGAGGACGTTCTATGTATCTATGGCATTTGAAACAGGATCATGGGGCAgttttttctgttctgtttaaaaaatatatatatggtagCCACCCACTGATAACCATTTTAGCCACAGAAAATAGAAACCCCTAAAGAAATATCTGTGCTGCTACTTGTGTATATAGAAATGAGATTAAGAAGACCGGCTGTACAAAACCACTTCCTCAATGCTAGCTTTTCTATGCACTCTGTGCATAACGCTTGCCTTTCTTCATTTTAGATGCTCTGTAGTGTGGTTTACTTGACCAGCCAGCTGTAATCTTGAAAACAACTTACTGGAtattttccccttttctttGCAGTTTATGTCTTAATGAAATTTTGCTATGTTCACAAAGGaccaaaaacaaaccaacaagaGGAAGCTGAGAGGGAGCCAATCGGGCCACCTGAAAGCTGTTTCCTGTCCCACAGTGCCATGTTGCAGAGCAGACGGAATGTCAGGGATTTAATGTACCTCGGCTTTATCATAGTGCCTTATCCTTAAATGCAGCTGTCCTTGTAGTCCTGACTGTGTGCTGCAGGAAGCCCACACTCGCTCTGCATTGTCCAAGCCACAACTTTGGCTTTCTGGTGACTTGTGGCTGGATTTGGGCTGGCTCATCAGTGTCGAAACCAAGGAATGCAGGCACAGAAAcaactgttgttttttctcttgATCAGCTCTACAAAGCTTGTTACTTATCTGAATCATGGTCTTTAGCCTTGCTCCTGCCCTCACTCTGCCCTCTAGAGGCCTATTCTTGCATTAGCCTTTGTTATcgggtgaagtgtgtgtgtgcgcgcgcgcatgtgtatgtgcgcatgtgtgtgtgtgaacacggATGCATAGGTCTGCactgtgtttttatgtgcatgtgtatataagcctgtgtgtctgcgtgcttgtgtgaatgtgttggaACACATCCATCAGTCACCCTACCTCAAACCAGTGGTGCCAGCCCTTTGACGCGTGCAGCACAGTCACCAAACCTTATTGCACACACACCACTGTACTGCACAACTCTCAACGCGATAGAGAAAAACTGCTTTGCTTTTCTCTCACCTCtgatacattttcatttcagtttttaGCCCATAAAAATGCTTTCATCCTTTGTTCCCTGTTTAAAGATCATCTTTGTACAGTGGACCAAAAGTAGATATTTTGTGATATTCAAagaaatatatagatatatatagatatatatgtatagtatatataatgaTGATACACTACATATATCTGTTGCTTTATACGTGATTGTTTTCTTTTCGTAGCTCCTCTGTAATTAGTTCATTGACTGTGAAATGGGAAAGGCATGGGGACTAACTTCTGATTCATTAGACTACATCTTAATACTTGAACTGTTATAGCATTCTATGTTGTGGAGATTATTGAGATTAATCCTCTAAATAGGAACATTTTGTTACTAAAAatgatttttgttattgttttttccaTGCTTGTTGAAATGGTCTGCACGATTTCTTTGCAGAGatgtttatttattgatatttattGTGTTTTGGTTTAGATGCTTACGCATTACAACATATTATAATGGGTACTGATAATGAATCATGAATTACACCACTGGAAACGGCAGACCTACTGTACAGGAGGACCAGagggtttttgttgttgttgttttgtttttctttataagTCATGATGTATGTAGATTGattaaggtttaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaggttggcaCTATATTTGCTTTAATCACTTTCCTTAGGCTCTATCACCAGTATCTCCAATGATTCCTTCAAATACTAGAAGTACACACGGGATCTTTGCCAAATTTTTTCTTTGTGCCTGTGTAGAAAACGTGCTTAGCAGTAGAAGAGGGTGG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Function

symbol description
rfx3 Predicted to enable DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific and RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding activity. Predicted to be involved in several processes, including cilium-dependent cell motility; epithelial cilium movement involved in determination of left/right asymmetry; and regulation of insulin secretion. Predicted to act upstream of or within cell differentiation. Predicted to be located in nucleus. Orthologous to human RFX3 (regulatory factor X3).

NR:

description
PREDICTED: protein RCC2 homolog

GO:

id name namespace
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GO:0005634 nucleus cellular_component
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KEGG:

id description
K09173 RFX1_2_3; regulatory factor X 1/2/3

RNA

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Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
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Expression


Co-expression Network