G196696


Basic Information

Item Value
gene id G196696
gene name NA
gene type non-coding
species eurasian perch (Perca fluviatilis)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_053130.1
NCBI id CM020927.1
chromosome length 36824488
location 25496668 ~ 25499280 (+)
genome version GENO_Pfluv_1.0_2020_eurasian_perch_Genome

Sequence

>TU267082
CCCCAGCTGAGTGCTTACACTGGATCTTTGGAATGTCGACAGTCAACAAAAACACTTGTTAATTTAAGTTCTTTATGAATGTTCCACCTTGTTACGTACTACTTTTTTACTGCTGCTGCGAACGTAGTTGCTTCATCTGAAGGTATGTGATCTCCTTTTGGACTTGAAGCCAAAATCTCTTGTCAATGAATGTATTCTGGTTTGCTTTGAAATACATAATTCTGAAATGTAtaatcatatacagtacactaaCAAGGCTATTTGAACCTTGCTTgcctttttaaaagtattttggTGTATCCAAAGAGATCATTTCATGTGGTTCCCCCTGGCCCCTGGTCTTTCCTCTATTAAGTCTGACAAAACTCCGACATCTTCATTATGGACAAGAGGTTATTGTCGGTGTATATGCTTTTTGTGTGCGATGATGTGACACAGATGTTGGGTAAATTTCTTTTGTATTGTGAGAACGGTTATTTGATCTGCATATGTTTTGTGAAGCCAAACATGTTTGTATCAGTTCATACAGTGAGTATTATGTGATACTGATCAAGAAGATATGTGGATTAGAAGCTTCTTCTCACTGATTGCCTTCCTACATCTGCTGGAGTGGGAACTCTCATGTTACTTTAACTAGTCCGTAGGGGTCGTTAGCCAGTTGTTCATGGACCTCGCTGAGCTCCTAATACTTCcgttgtacatactgtatagtcACTTTGTAATATCACTTCACCCTCCTTGGACTTTTTGCCCATCTCGTTGTGCCgcaaaatgtttgaaaatgtgCTTCCTGGCGTTTTTATTCTGTCTGAGGGTCAGTCAAAGTACGAGTTAAGTTTAATTACAATTTCAAAAGTAGCAATTAAGAGCTAAACTGACATTGGCAAACATGCATGCTAGCAAAGCAAAAGCGTGTGGTGTTCAGTGTAGGTCCTATTGTGCATCATAGAGTACGGAACAGGTGATTTACACTCAGGGCTACGGTGTACCCTAAAGCGCCGTTGCTTTGCTTGAATGctgaaataacaaatgataaggtcttttaaataaaaaaaatgttgaacacATTTGGACCCTGAGGTTATTTAGTTCAAATGGAAATTGAGGAGAGTGTTgttcaaattaattaattttgccTGTCATATTTTCTTTCAGCTTGATTGCTACATTTGCTTTGTGCTTTAATCTAATTTGGTGCTTTGAAAGATGTCAGACTAAAACGCACATCTAAATGAAAAGCATTTTCAAATAATTTTCGTGCACAACATTGTAAAGGGGTACATtgcaaaagaaacaacaaccctgcatcattattattattcttcctTGCCTCTTTGCATAATGTTTGTCATCCAATTAATGCCAGTGTTTGAATATGCAAAGCACTCAAAATGCAAAGCAGGCAAAAATTTCCTATAAAATTTGGCCACGGCCTGTGTCGTCATTTAAATTTGTATAGATTGTTTTGCACACGCATTGAAGTATGTTTTAAGTGTTGTAGGTGAAAGTCCGCGGCATTccaaaaaccaacaacaacgGTGCAAACATAAGGggattttttttctatgttGTCGAAGCATGCGTTGAACCTATTGATGAAGATGACATAAAGCTCAAGTCGGATCTCACTATTCTGCTCTGGCAGTCTTCTAAGTCTTCTACTGATAATATGATGGTGCTTGCCATAGGCCACATACAGCTGCCAGACGCTAAGACTTAAGCTCCCGCTAAATCCCCTGACGTTGCTTGTAATGTGGCACACAGTTTTGAAGGAAATGATGACTGTGTTTATGAAAGATCTCGCCAGTTAGCAAAGCTTCATTGAGTTTACAGAATGGAGTCTGGTGCACAAAGGTGCCAACACAATTCAGCCTAATTTGAGTTGAGTTTATTGCGCCAACATGGTGGAGACCTAAGATGACATTTTGATACTTACATGTTGGACTACTTCTGAAGTCGATGTGTACTGGGTCTCTGGGTTTACACGGGCACACGCCTTgtaatgtaataagataaatttAAATGGGTCTGTTTCGATACTTGTCATTTCTGCATGTTAATCACATGTTTTGATTATGTAACACTTTATATTATTGCCAAATTAAATGGCATTTTCCTGATCTAGAAACATTGATTCCACTGGATTGGGTTAATTTCCATCAACCCTCATCACACTACCGTATTGTAATGTATTCAGAATTGtatagtgttaaaaaaaaaaagtccttttCATGGGAGAAGGTAGAtgagttttgtgtgtttttattttgacaccATAGCCAATATGCAAGACTTTCATACCTGGATGTATGGGGACAAGAATGTatgccttttttgttttattattattattgtattattctcGAAACACATTGGGGTCTagaatatatatgtattataataACAAATGATGACTGTATATAAAGTGCCAACACAAGCACTAATTCATGAGAATTTggtgatgcatttttttttaatattca
>TU267083
TGGTCTTTCCTCTATTAAGTCTGACAAAACTCCGACATCTTCATTATGGACAAGAGGTTATTGTCGGTGTATATGCTTTTTGTGTGCGATGATGTGACACAGATGTTGGGTAAATTTCTTTTGTATTGTGAGAACGGTTATTTGATCTGCATATGTTTTGTGAAGCCAAACATGTTTGTATCAGTTCATACAGTGAGTATTATGTGATACTGATCAAGAAGATATGTGGATTAGAAGCTTCTTCTCACTGATTGCCTTCCTACATCTGCTGGAGTGGGAACTCTCATGTTACTTTAACTAGTCCGTAGGGGTCGTTAGCCAGTTGTTCATGGACCTCGCTGAGCTCCTAATACTTCcgttgtacatactgtatagtcACTTTGTAATATCACTTCACCCTCCTTGGACTTTTTGCCCATCTCGTTGTGCCgcaaaatgtttgaaaatgtgCTTCCTGGCGTTTTTATTCTGTCTGAGGGTCAGTCAAAGTACGAGTTAAGTTTAATTACAATTTCAAAAGTAGCAATTAAGAGCTAAACTGACATTGGCAAACATGCATGCTAGCAAAGCAAAAGCGTGTGGTGTTCAGTGTAGGTCCTATTGTGCATCATAGAGTACGGAACAGGTGATTTACACTCAGGGCTACGGTGTACCCTAAAGCGCCGTTGCTTTGCTTGAATGctgaaataacaaatgataaggtcttttaaataaaaaaaatgttgaacacATTTGGACCCTGAGGTTATTTAGTTCAAATGGAAATTGAGGAGAGTGTTgttcaaattaattaattttgccTGTCATATTTTCTTTCAGCTTGATTGCTACATTTGCTTTGTGCTTTAATCTAATTTGGTGCTTTGAAAGATGTCAGACTAAAACGCACATCTAAATGAAAAGCATTTTCAAATAATTTTCGTGCACAACATTGTAAAGGGGTACATtgcaaaagaaacaacaaccctgcatcattattattattcttcctTGCCTCTTTGCATAATGTTTGTCATCCAATTAATGCCAGTGTTTGAATATGCAAAGCACTCAAAATGCAAAGCAGGCAAAAATTTCCTATAAAATTTGGCCACGGCCTGTGTCGTCATTTAAATTTGTATAGATTGTTTTGCACACGCATTGAAGTATGTTTTAAGTGTTGTAGGTGAAAGTCCGCGGCATTccaaaaaccaacaacaacgGTGCAAACATAAGGggattttttttctatgttGTCGAAGCATGCGTTGAACCTATTGATGAAGATGACATAAAGCTCAAGTCGGATCTCACTATTCTGCTCTGGCAGTCTTCTAAGTCTTCTACTGATAATATGATGGTGCTTGCCATAGGCCACATACAGCTGCCAGACGCTAAGACTTAAGCTCCCGCTAAATCCCCTGACGTTGCTTGTAATGTGGCACACAGTTTTGAAGGAAATGATGACTGTGTTTATGAAAGATCTCGCCAGTTAGCAAAGCTTCATTGAGTTTACAGAATGGAGTCTGGTGCACAAAGGTGCCAACACAATTCAGCCTAATTTGAGTTGAGTTTATTGCGCCAACATGGTGGAGACCTAAGATGACATTTTGATACTTACATGTTGGACTACTTCTGAAGTCGATGTGTACTGGGTCTCTGGGTTTACACGGGCACACGCCTTgtaatgtaataagataaatttAAATGGGTCTGTTTCGATACTTGTCATTTCTGCATGTTAATCACATGTTTTGATTATGTAACACTTTATATTATTGCCAAATTAAATGGCATTTTCCTGATCTAGAAACATTGATTCCACTGGATTGGGTTAATTTCCATCAACCCTCATCACACTACCGTATTGTAATGTATTCAGAATTGtatagtgttaaaaaaaaaaagtccttttCATGGGAGAAGGTAGAtgagttttgtgtgtttttattttgacaccATAGCCAATATGCAAGACTTTCATACCTGGATGTATGGGGACAAGAATGTatgccttttttgttttattattattattgtattattctcGAAACACATTGGGGTCTagaatatatatgtattataataACAAATGATGACTGTATATAAAGTGCCAACACAAGCACTAATTCATGAGAATTTggtgatgcatttttttttaatattcaccCATTCTCCATGTACTACAGTTTCAAACAACGTTTAGGTATTATCACCATCATTATAATTCAATGCCAATGTTCTACATTGATGTAGTTTGAAAGGCACAAGCAAGATTGTATTGTCCTTTTCAATAAA

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU267082 True 2483 lncRNA 0.37 1 25496668 25499150
TU267083 False 2277 lncRNA 0.37 1 25497004 25499280

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
fam204a fam204a,LOC102781047 coding upstream 65759 25413993 ~ 25430909 (+)
neurog3 NA coding upstream 178535 25316395 ~ 25318133 (+)
pcbd1 pcbd1,LOC106525612 coding upstream 197222 25296263 ~ 25299446 (+)
LOC120548364 sec23ip coding upstream 264156 25222425 ~ 25232512 (+)
inpp5f inpp5f coding upstream 283164 25198539 ~ 25213504 (+)
dennd10 fam45a coding downstream 106186 25605466 ~ 25610518 (+)
vwc2 vwc2 coding downstream 178915 25678195 ~ 25707242 (+)
LOC120548498 NA coding downstream 223329 25722609 ~ 25734715 (+)
ikzf1 ikzf1,LOC102780616 coding downstream 240845 25740125 ~ 25758318 (+)
ttl ttl coding downstream 270367 25769647 ~ 25778043 (+)
G196690 NA non-coding upstream 62772 25427643 ~ 25433896 (+)
G196648 pdlim1 non-coding upstream 175799 25318266 ~ 25320869 (+)
G196595 mcmbp non-coding upstream 276754 25219547 ~ 25219914 (+)
G196563 NA non-coding upstream 306989 25189430 ~ 25189679 (+)
G196558 NA non-coding upstream 314855 25178159 ~ 25181813 (+)
LOC120548233 NA non-coding downstream 2249 25501529 ~ 25584577 (+)
G196782 NA non-coding downstream 280246 25779526 ~ 25794408 (+)
G196788 NA non-coding downstream 312935 25812215 ~ 25812441 (+)
G196841 pex13 non-coding downstream 405440 25904720 ~ 25907869 (+)
G196836 NA non-coding downstream 412481 25911761 ~ 25939959 (+)
LOC120548229 rab11fip2 other upstream 1163 25481831 ~ 25495505 (+)
cacul1 cacul1,LOC103374658,LOC102794354 other upstream 352414 25139047 ~ 25144254 (+)
dact2 dact2,LOC103391347 other upstream 483419 25008474 ~ 25013249 (+)
G196439 wdr11 other upstream 927501 24564550 ~ 24569167 (+)
LOC120548495 ate1 other upstream 1070166 24367954 ~ 24426502 (+)
zgc:110045 LOC102779765,LOC102305383,LOC100704767,LOC101482925,LOC102197868 other downstream 95216 25594496 ~ 25674906 (+)
prdx3 prdx3 other downstream 114127 25613407 ~ 25620675 (+)
LOC120548053 LOC103353497,LOC102790632,LOC102299158,LOC102194143,LOC101482614,LOC100706574 other downstream 317971 25817251 ~ 25826429 (+)
stpg4 LOC103353520,LOC101467386,LOC102793681,LOC102299197 other downstream 1036004 26535284 ~ 26548760 (+)
G197053 NA other downstream 1163879 26663159 ~ 26663785 (+)

Expression


Co-expression Network