G207742


Basic Information

Item Value
gene id G207742
gene name NA
gene type misc
species eurasian perch (Perca fluviatilis)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_053131.1
NCBI id CM020928.1
chromosome length 36057207
location 33094185 ~ 33149293 (-)
genome version GENO_Pfluv_1.0_2020_eurasian_perch_Genome

Sequence

>TU281304
gtgtgtctgtttgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctatgtgtgtgtgtctctgtctgtctgtctctgtgtgtctgtttgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtctgtctgtgtgtgtgtgtctgtctgtctgtctctgtctgtctgtctctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctctgtgtgtctgtctctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtctctgtgtgtgtctgtctctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtctctgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctgtctctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctgtctctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtg
>TU281305
gtgtgtctgtttgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctatgtgtgtgtgtctctgtctgtctgtctctgtgtgtctgtttgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtctatgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctgtctctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtt
>TU281306
gtgtgtctgtttgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctatgtgtgtgtgtctctgtctgtctgtctctgtgtgtctgtttgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtctgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctctgtgtgtctgtctctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctctgtgtgtctgtctctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtctctgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctgtctctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctgtctctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctgtctctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctctgtgtgt
>TU281307
gtgtgtctgtttgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctatgtgtgtgtgtctctgtctgtctgtctctgtgtgtctgtttgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtctatgtgtgtgtgtctctctgtctgtctgtctgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctctgtgtgtctgtctctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtctctgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctgtctctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctgtctctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtg

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU281304 False 589 TUCP 0.49 4 33118888 33149293
TU281305 False 501 lncRNA 0.49 4 33094185 33149293
TU281306 True 628 TUCP 0.49 2 33148146 33149293
TU281307 False 581 TUCP 0.49 3 33118888 33149293

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC120548945 NA coding downstream 130136 32961278 ~ 32964049 (-)
LOC120549825 afg3l2 coding downstream 403272 32687730 ~ 32690913 (-)
LOC120549706 NA coding downstream 2117227 30971115 ~ 30976958 (-)
LOC120549705 NA coding downstream 2126105 30961020 ~ 30968080 (-)
ankrd6a NA coding downstream 2133892 30944479 ~ 30960293 (-)
foxg1a foxg1,LOC106934576,LOC103147766,LOC102223528 coding upstream 154458 33303751 ~ 33305439 (-)
sptbn5 NA coding upstream 174314 33323607 ~ 33460847 (-)
LOC120549249 LOC103353941,LOC101078900 coding upstream 359315 33508608 ~ 33524752 (-)
coch coch,LOC102779905 coding upstream 444775 33594068 ~ 33623644 (-)
LOC120549318 LOC104924818,LOC103353924,LOC102795936,LOC101485054 coding upstream 1091533 34240826 ~ 34256495 (-)
G207740 NA non-coding downstream 13202 33064670 ~ 33080983 (-)
G207728 NA non-coding downstream 56159 32958695 ~ 33038026 (-)
G207726 NA non-coding downstream 171533 32920745 ~ 32922652 (-)
G207685 NA non-coding downstream 246273 32845885 ~ 32847912 (-)
G207687 NA non-coding downstream 272904 32758197 ~ 32821281 (-)
G207747 NA non-coding upstream 988 33150281 ~ 33254663 (-)
G207749 NA non-coding upstream 22837 33172130 ~ 33172563 (-)
G207750 NA non-coding upstream 28102 33177395 ~ 33177727 (-)
G207755 NA non-coding upstream 47141 33196434 ~ 33284747 (-)
G207756 NA non-coding upstream 59002 33208295 ~ 33254206 (-)
prkd1 prkd1,LOC107391660 other downstream 15866 32994358 ~ 33078319 (-)
G207741 NA other downstream 23458 33070261 ~ 33070727 (-)
LOC120548944 npas3 other downstream 162175 32859559 ~ 32932010 (-)
G207670 NA other downstream 402300 32609535 ~ 32691885 (-)
LOC120549602 klhl18,LOC102789664 other downstream 412283 32673953 ~ 32681902 (-)
G207802 NA other upstream 342280 33491573 ~ 33498532 (-)
ehd4 LOC107391916,LOC105938093,LOC106527300,LOC102223325,LOC103156172,LOC103382107,LOC101073507 other upstream 383194 33532487 ~ 33647324 (-)
G207808 NA other upstream 384184 33533477 ~ 33611751 (-)
scfd1 scfd1,LOC105419774,LOC105419155,LOC107719485 other upstream 483686 33632979 ~ 33702742 (-)
g2e3 g2e3,LOC102781532 other upstream 560570 33709863 ~ 33731941 (-)

Expression


Co-expression Network