LOC120551437


Basic Information

Item Value
gene id LOC120551437
gene name NA
gene type non-coding
species eurasian perch (Perca fluviatilis)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_053132.1
NCBI id CM020929.1
chromosome length 33651559
location 1198922 ~ 1200173 (+)
genome version GENO_Pfluv_1.0_2020_eurasian_perch_Genome

Sequence

>TU283021
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>TU283025
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>TU283029
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>TU283031
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>XR_005637874.1
ATTCAGTGCATCCCTGATATTAAAGTCTGTCTCGATATGATTTCAATTCAGGtgcctctgattggtcctcCTTCAGGTGCTTCTGATTGGTCCTCCTTCAGGTGCTTCTGATTGGTCCTCCTTCAGGtgcctctgattggtcctcCTTCAGGtgcctctgattggtcctcCTTCAGGTGCTTCTGATTGGTCCTCCTTCAGGTGCTTCTGATTGGTCCTCCTTCAGGTGCTTCTGATTGGTCCTCCTTCAGGTGCTTCTGATTGGTCCTCCTTCAGGTGCTTCTGATTGGTCCTCCTTCAGGTGCTTCTGATTGGTCCTCCTTCAGGtgcctctgattggtcctcCTTCAGGTGCTTCTGATTGGTCCTCCTTCAGGTGCTTCTGATTGGTCCTCCTTCAGGTGCCTCTGATTGGACCTCATTCAGGtgcctctgattggtcctcCTTCAGGTGCTTCTGATTGGTCCTCCTTCAGGTGCTTCTGATTGGTCCTCCTTCAGGtgcctctgattggtcctcCTTCAGGGGCCTCTGATTGGTCCTCCTTCAGGtgcctctgattggtcctcCTTCAGGtgcctctgattggtcctcCTTCAGGTGCTTCTGATTGGTCCTCCTTCAGGtgcctctgattggtcctcCTTCAGGtgcctctgattggtcctcCTTCAGGTGCTTCTGATTGGTCCTCCTTCAGGGGCCTCTGATTGGTCCTCCTTCAGGtgcctctgattggtcctcCTTCAGGtgcctctgattggtcctcCTTCAGGGGCCTCTGATTGGTCCTCCTTCAGGGGCCTCTGATTGGTCCTCCTTCAGGGGCCTCTGATTGGTCCTCTGCATGAGGACGGAGTAACGAGTCGTATTTCCGTCGTTTTGAGTCTGAAGAGGAACCGCGACTCAGCGAATGATTCCTTCCGTTTACGTCACCAAACCTGCCGAGACGGAGCTCAGATTTTAACGTTCTCTTCCTCCGTTTGTCCGTTAGTTTGGAGTTGGCACGGTAACCATATTGGatgttcatgtttttctttaatCTGTGAAACAGAAACGTTATGGTAACTTCCTGTATCACCGTGGAAACATTTCATATTAAACTGCCCCCTCCCcgcccccccatccccccctcctcttcttctcgtTTTATAGTGAAATAAAAACGCTGTAAAGGTGAATAAACTATTTATAACTACAA

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU283021 False 1132 lncRNA 0.52 2 1198922 1200103
TU283025 False 617 lncRNA 0.49 3 1198922 1200138
TU283029 False 557 lncRNA 0.50 3 1198922 1200103
TU283031 False 582 lncRNA 0.50 2 1198922 1200103
XR_005637874.1 True 1202 lncRNA 0.51 2 1198922 1200173

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
ptenb pten coding upstream 5701 1181045 ~ 1193221 (+)
LOC120551414 NA coding upstream 109762 1043694 ~ 1089160 (+)
LOC120551421 NA coding upstream 149312 1043672 ~ 1049610 (+)
LOC120551430 atad1 coding upstream 180032 1015297 ~ 1018890 (+)
LOC120551425 NA coding upstream 216184 977736 ~ 982738 (+)
LOC120551397 NA coding downstream 97854 1298027 ~ 1303083 (+)
LOC120551407 NA coding downstream 178478 1378651 ~ 1380831 (+)
LOC120551423 NA coding downstream 185190 1385363 ~ 1398958 (+)
LOC120551406 NA coding downstream 213615 1413788 ~ 1427061 (+)
LOC120551410 NA coding downstream 230299 1430472 ~ 1437585 (+)
G208853 minpp1 non-coding upstream 98074 1099315 ~ 1100848 (+)
G208841 NA non-coding upstream 105177 1015928 ~ 1093745 (+)
LOC120551440 NA non-coding upstream 115488 1071580 ~ 1083434 (+)
G208850 NA non-coding upstream 140494 1056886 ~ 1058428 (+)
G208784 NA non-coding upstream 149294 1039125 ~ 1049628 (+)
G208864 NA non-coding downstream 9250 1209423 ~ 1226685 (+)
G208885 NA non-coding downstream 111883 1312056 ~ 1335340 (+)
G208886 NA non-coding downstream 128965 1329138 ~ 1383544 (+)
G208887 acta2,LOC107594158,LOC105896556,LOC101064889,LOC103374497 non-coding downstream 132573 1332746 ~ 1333550 (+)
G208888 NA non-coding downstream 134809 1334982 ~ 1367880 (+)
G208852 minpp1 other upstream 105325 1090547 ~ 1093597 (+)
G208851 minpp1,LOC102795090 other upstream 139482 1058842 ~ 1059440 (+)
LOC120551422 NA other upstream 159553 1027301 ~ 1039369 (+)
G208768 NA other upstream 543702 654899 ~ 655220 (+)
LOC120551420 NA other upstream 577153 614865 ~ 621769 (+)
G208867 NA other downstream 4417 1204590 ~ 1205248 (+)
stambpl1 NA other downstream 113028 1313201 ~ 1328029 (+)
G208777 NA other downstream 230336 1430509 ~ 1493181 (+)
G208911 NA other downstream 265845 1466018 ~ 1571837 (+)
LOC120550772 NA other downstream 298274 1498447 ~ 1577370 (+)

Expression


Co-expression Network