G211151


Basic Information

Item Value
gene id G211151
gene name NA
gene type unknown
species eurasian perch (Perca fluviatilis)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_053132.1
NCBI id CM020929.1
chromosome length 33651559
location 10053261 ~ 10062702 (+)
genome version GENO_Pfluv_1.0_2020_eurasian_perch_Genome

Sequence

>TU286110
ACTTTATTGTCGGttttctttgacattttcaCTCCTAGATTTAGAAAAGTGGGGGGTCTTGCAGATTTGGGACCCATTCCTTTGATATCATAATGTGACTGGTGCCAGAGAACGGCTTCATCTACACATTCGGACTGGGATCGCATGACTGTTTGCAGCTTGGATATATTAGTGCCGTCCTCTTGACTTAACAGTTCGGGTCAAGTGAATAGGGAGCCAGCAAACGATATATAACACTTCAGAGGGATGTGGTCCGGCTTTATGTGTGTGCAATGATCCATAATCAAGTATTCTACAGGAGGGAGCAGGCTGATCCAGACTAACATGCTTACTCTACTATCGCCTCATGCACTGCAAAGTGTGTTGTCTAGGAAACCGCTAATAGTGCATTAAATGTTGATATTGTCCCTTTTCAGTTATTCTTTATGTGAGCACGCATGTGTATAAACCTTTACCAATTTTTCACAAATTTTCATCCACATTCTAGTAAACGGCACAGTGTTTTGCAACAACTTAAAACACAGTAAAGGAGAACATCAACAGGTGAGCTATACATTAAAGTTatacaaaaccaaaacaacTAAAGCTTCACAAACGAGGAGAAAAGGGCTCGTTGGGGATGATAATAATATGAACAAAATTCCAGCTAACCACGGCGTGGCCTAAATCTCACGTTAAGGTTTTCAAATTGAGGTTTTTCCTCACAAAAAACAATTCCTTTACAAtggcaaaataaaaaacaaaataacaaacgCACTGAAATGTCTGAATTTGAATGTAATAGGCCAGTGCAAACACAGTTTTTGTTTGAACTGCACATGACCAACCTCCTGCAGGAGAAGAGGAGATGCAGCTTCGGCATCTTTATTGCTTGGTGGTACTTGTTGGTTTCCAGTTGCAAATACAATAATACTGACATGCTAAGATGGTGCTGCAGAAGGagaggatggtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtaaccagtTTAGGGTTCAAAGTTCATGTTTAATTCCAGTTTAGATGACGATTTAAATGTCACGTACATTCCCCTTCTAAAAGATCCACGTTCATTGTTCTACATTCTCTGTGACAAGtctctcttttttgttttcagtcCATTTCTGTTCATTTTGGCCGCCGTTTCTTGGCTCGTCAGCCGCCTTACAAGTCCGACCGCTTCTGTATTCACATTCAGCAAAGGTTGTTTGGAAATCATGGCGGGAATGAGAGGAAAATGTCAGCAGAGGTCTAAAGCTGCATGCGAAGTTGAGATGGGAGCTCCCTGATCCGAAGAGAGGAGTCAGCGCGTTTTAGTTCGCTAAGGTAAGGTAGTCCGGTGTGAGCCGACTTTTGAATATTGTCCAAACACTCGTTCAACATACAGTTTataagagagaagaagaagtacATTAGTAATAAATCAGATTGCCGATCACAGTAGCCCCTGACTGTTTGGCTGGTAATagaggagagggaaggagacGAGCAGCATGTATTTTTCTAGAGATAGTGTCATAATACACAGCTCTCATTGGTTAGACCTACaggtaataaataataatgtaacaGTAGGCTAATCAATCCCACAACAAGTTAGGtcacagacaaaaaaacaaacaaagaaactcCTGTGAGATCAAAGTGCACAGACAACAGACATGGGATgcccttctcttcctcttccctcctcACAACAATTAATCCAGGAAGTGTTCAAACGGATGGGGGGTGTCCCTGCTCAGTGAGGACAGTATCCAGTGATGCAGCACTATGGCAGGGTAAGAAAAGCCGACTCTGGACGGAGAAGTTggagtgtttttgtgtgtgagtttgtttgAGTGTGTTACACAATGAGTGGTCCGCGGCGGGGATGTTTGGGACTCTGGCCGTCCCGGTTCTCAGCCCCCTGCTCCTCCAGGTTGATGTTGCTGGTGGAGGTGTGGTGGGGGTGGGGCTCTAAAACAGGCCTGTAGCCCCCGAGATACATCAGAcctgaagaaaagaagaagaagacacacagagagagagagaaagagagagagagagagatagagagagagaggttgcaAAATCAGAGGAAATTTCCCCAACTCTTTTTAACAACACAGCTGTACATTCACCGGTGTAGATTCATGTCCCAAGACCAAGACACAGCTCCAAGATAGCAAACTACTGTCCCACTCATTTTCTACTAATAGaacaatttgtctttttttaagattatgttttggggtcttttttactttattagaTATTggcagtggatagacaggaaacgggaggggggatgacacgcagaaaAGGACCaaaggtcggactcgaacccagGCCGCTGGAAAGGACTCGGCCTACACGGGCCACACACTCTACTGGATGCAATTTGTCATTTTATCTTCTTTCGCCTGAGTGTGTTTAATAATTACAACATAACAATAGCCACTTGTTTTCATGTGCATTTTCAATTTgtggattaaaaaaacagagcGGAAACTTGAAAAAAAGTTGCTATACTGCAAGTATTTATGCTTGGCTGAGGTGGAAAAGATGTGtgttaataaaaagaaaacacaacaaaGCAATGTTTTTAACATGTAGTCTGACGTGTCTCTCACCAAGTCACAGCGGGAATTTAAAGCGGAGAGATCACCCAATACGACATTGTTGCCATTTCAAAAGACATAAATGGCTTGGTGTCTGATCCTGGCTTTACTGTACGTATGGCTGTGCTTTAATCAGACACTTCCTTTTCCTCTGTGCCCCTGTGGTGGGCTTAATTGATTCTCTTACAgctgaattaattaattaattacttaaTTATTTTGCACCCACTGCTACACTTTAAAGACATACTAAAATGCAAATGCTTATCTCAGGTCTCTGATTTAAGTGATTGATCTCTTGGTATACGTCAAAATATGTGTCACAAAAAGTTCCCTCTCTTCTCATCCTGTAAAACGATGATCCTGTGACGATTCATCCTACAGTCTGATTTGGACTTGATGTTAGCAGGTTGGACAATGATCAATACACATATCGGGATAAAAACATAATCGGTTATCACCCTACTAGGGTTCAAACCTGACGTGTTCCATTGCAATGGAAATGATACTCTACTTTTCTTGAAGTGCACAATACTTTGTTGTAACTGAATGTCTTGTTTATGGAATAAACATAATATTCTATATTGTTGTAATTTTGAGCCTAGATGATTGTATACCATGCATTACACTGCAGTCCTCCTGGCCTGTAATAAGGCCCACTTCAGCAACTCAAGGGCTCCCCAACCAACATAGTCGGTAAATACTGTATCAGCCAGGGAATAAAATCAATTATTGATCGTTTTAGATCTTGACCACAGAGAGTATGAATAATGAATAACATCCGCAATTAAAACTACTTCCACTCAACTATTACTGTGCAACTTGAAAGTATGAaaacattagggctgcaactaacgattattttcatagtcgattaatccaTCAactattttctcgattaattgattagttgtttgatctataaaatgtcaaaacatggtgaaaaatgtggatcagtgtttcccaaaagcccaatatgacgtcctcaaatgtcttgttttgtccacaactcaaagatattcagtttactgtcacagaggagagaagaaactaaaaattgttcacatttaagaagctggaatcagagaaatcttacttcttttttttacaaactcaaactgattaattgattatcaaaatagttggccattcatttaatagttgacaactaatcgattaattgattcatctttgcacCTCTGGAAAATATATAAGGTAGATTCTGAGCTGTGATTGAGAAAAGataaattctgaaaaaaaagatttccctTGTTGCATcacattttaaagatatttgcTTAGTGAATTAAACTATTTTTCAGGGGGGAACAtcttaaataaaactgaatcaTGATAAACATGAAAACGTTTAAGTAACAAAAGAGGGTGACTGTTAAGGTACATGCAAACGACAATATATAACCCTGGTGTCTGATCTACTATCTAGTCATAACTCCATACCTAGTCCTCAATGTGCACTGGGCACGACTCCTCATCTGTCCATCCGGCGAATCGGCTGTCGGGAGCCTGCTCATTATCCAACCCCAAAGAGGGCGTGTCACAGAGGGCGACGCCCTGATTGTTATTGGCCAACTCTGGACACCTGCTCCGCCCACCTGCAAGCGAGGGCAAAGGTCAAACAAGAGCAGCCAGGCACCGGCGGAGGGGACAGGCAGGGTGAGGAAGGGAGGGGCGAGGGTGTCAGAGGTGGAGGGGTGAGGTTGGCCATGCTGGAACgacattaataaaataataaatgatagAATATTTCGGCATTTTACCACTATGTATCTGACTAAGACGTGAGATTTAAAGAACTCAGTGTTGGGGACACCAAAATCAGCTCATTCGCTCTGATCCTCAGTACCTTAGGCAGACTTTCTTATAATCAAGTGGTTCTCACACTGAGGGGGCACGCATGACCAGGGTGAGCTTGTAAAGTTGGAAGAATCTGACTCATGAAGGAACAATAATCCAACAAGTGCAATCTGATACTTGCAAGTCTCGCTTTGTAAGATTTGATTAGACAGAACGAGTATGCACAAAATGGACAGTGTTAACAGAGAAGACATGAAAAACAAGCGATGCTCCTCTTGCTCTCTACTTTCTATTAATACAGCAGGAGAGATCTGaatcttttctgtcttttttcagTTGTACATTCATTTATTGGTTAATTACGTTCTGGGGGGctaaaaaaggcagcatgacaGGAAATATTTGACAACCACTGTGATGATCAAATATATCGAAGGCAGCCACAGTTGTTAAGCAACTTTGTAACTTTGTTACAACAAAATACTAAAACGAGTAAAGTTTGTATATTTCCTATTTTAAAAAGGCCTCTACATGTGATGATAGAAACCATTAA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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU286110 True 7879 TUCP 0.40 4 10053261 10062702

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC120551200 NA coding upstream 104062 9931194 ~ 9949199 (+)
nat9 nat9,LOC102799219 coding upstream 126936 9923421 ~ 9926325 (+)
syt15 LOC102290952 coding upstream 130194 9918121 ~ 9923067 (+)
timm23a timm23 coding upstream 145322 9904130 ~ 9907939 (+)
prph2a prph2,LOC101069021 coding upstream 174187 9872129 ~ 9879074 (+)
srsf2a srsf2,LOC104956441 coding downstream 14488 10077190 ~ 10080626 (+)
LOC120551228 LOC104936997,LOC102229976,LOC106927477 coding downstream 21869 10084571 ~ 10090078 (+)
trim8b trim8 coding downstream 159621 10222323 ~ 10233271 (+)
sfxn2 sfxn2 coding downstream 184996 10247698 ~ 10255361 (+)
timp2a timp2,LOC103367827 coding downstream 193372 10256074 ~ 10268624 (+)
G211157 NA non-coding upstream 42094 10010881 ~ 10011167 (+)
G211130 NA non-coding upstream 68565 9926654 ~ 9984696 (+)
G211139 NA non-coding upstream 98580 9953875 ~ 9954681 (+)
G211085 NA non-coding upstream 215136 9835060 ~ 9838125 (+)
G211084 NA non-coding upstream 223219 9828849 ~ 9830042 (+)
LOC120551238 NA non-coding downstream 73223 10135925 ~ 10136650 (+)
G211175 NA non-coding downstream 77079 10139781 ~ 10140042 (+)
G211181 NA non-coding downstream 100680 10163382 ~ 10163678 (+)
G211182 NA non-coding downstream 102441 10165143 ~ 10165526 (+)
LOC120551242 NA non-coding downstream 124215 10186917 ~ 10188973 (+)
qki2 LOC104923420,LOC105926446,LOC103481625,LOC106939037,LOC106928957,LOC102292206,LOC100712570,LOC103376616,LOC106516672,LOC107090926,LOC103381788,LOC106519024 other upstream 154752 9884370 ~ 9898509 (+)
LOC120551355 LOC102295310,LOC103352803,LOC102796261,LOC107102520 other upstream 203363 9839019 ~ 9849898 (+)
rpl38 NA other upstream 476843 9567529 ~ 9576418 (+)
LOC120551795 NA other upstream 1003133 9042646 ~ 9050128 (+)
gngt2b NA other upstream 1555607 8496613 ~ 8497654 (+)
G211164 rnf157 other downstream 83 10062785 ~ 10065126 (+)
socs3b LOC104933891,LOC103372658,LOC104967452 other downstream 226877 10289579 ~ 10329262 (+)
G211301 LOC108248045,LOC103381519 other downstream 386977 10449679 ~ 10531279 (+)
usp54b usp54,LOC102211175,LOC101471098,LOC102784247,LOC103371171,LOC103145175,LOC103381525 other downstream 501519 10564221 ~ 10621412 (+)
sncgb snca,LOC103381528,LOC104922219,LOC103370408,LOC106948771,LOC104951044,LOC106904390 other downstream 640264 10702966 ~ 10715354 (+)

Expression


Co-expression Network