zgc:153981 (LOC104943448,LOC101465490,LOC103355374,LOC100701713,LOC104930939)


Basic Information

Item Value
gene id zgc:153981
gene name LOC104943448,LOC101465490,LOC103355374,LOC100701713,LOC104930939
gene type misc
species eurasian perch (Perca fluviatilis)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_053132.1
NCBI id CM020929.1
chromosome length 33651559
location 13180995 ~ 13184797 (+)
genome version GENO_Pfluv_1.0_2020_eurasian_perch_Genome

Sequence

>TU287408
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>XM_039787362.1
TCTGCCCTCTGCACGAGTAAGACTACACGCTAGGTTAAGCACTAAATTGGGTAACTGTTCAGTGACCGCAGATAAACACCTGTTCGTACAGATCATCCTGAGCCAGAGTGGACGGGAACTGCTTTGATACAGCAAACATTTGGACCAGCAATCGATCCAAGACGGGGGTTTTAGGACCTAAAATGTCAGACTTGAAAGGCAAGAGAAAAGAATATCTAAGTGTGAAGGATCTGCAGAAGGTTTTGGACTCGTGCAAACTACATCTCAGTCAAGTTGATGAGGTCTGGCCAAACATATACATAGGGAATGTGGCAGTAGCCCAAAACAAGACCGCTTTGCAGAAATTAGGTATAACTCATGTATTAAACGCTGCTCACTCCAAGCGAGGCAGCATAGGAAACCAAAGCTTTTATGGCAACGGCTTTGTGTATTGTGGCATTCCAGCAGATGACTCAACACACTTTGATCTGGATGTTTACTTCCAGCCTGCAGCTGATTTCATTCATAAAGCTCTGAAGGCACCTGATGGGAAGGTTCTGGTGCACTGCATCATGGGAATGAGCCGGTCATCGACCTTGGTGTTAGCGTACCTCATGATCTACCATCACCTCACGCTCAAACGGGCTTTGCAGAAATTGATCGAGAAGAGAGCCATCTACCCCAACAGGAATTTCCTGGCTTTGTTGTTGGATCTGGATCTTCAGCtaacaagaaaaaagaaaacatgtcaCATACTGTAATCAAGAGAAGTTTACACTTTTTTAGCCACACAGCAGCGTTATGTCTAGGGATGGTGATGCCGGTCGGTCtgttggtccagactgaaatatttctAATAGATTGTCATGAAATTTAGTTCAACTAATGAAATGAGATTAACAGTAGGTTAATCTATCATGTTGGCATGTTAaacgtaaaaataaaaagaatgggAAAGCTGCACACATTTAACTACACATAATAACTCAGCCCTCAGTTTTTAATTAGCATGTTGAATGTTGACATAACATTAATATAGGCCTACTAAATGTTATCGTAAGGAGAAAATCTGCACACtcataacttttctttttttaaactcagaatCAATGTTTCAGAACGTAATGCCGTCTTCTAAATATTAGAAAGTTACGCTGAGTTAAACATTAGCAggttaacatgctaacatactAAGCATTACATACAAAATATTAGCAATTTAAAAAGCTAATGTTGGCATGCTGACAtggtattgtaaatattagatGCCAACAACATGTAAGCTAGTTGTTAATatgcattaaaacatgatgacaGTATGTTAACACGCTAACATGTCAGCATTCAGCTCAGGAAACAGCTGAGTACACAAAGTACACTTCAAACTGGAAAGAAGTCTCGGAAAATTTGACAACGCAGAAATGTAGCGGTAACATAACCTGGCCAGGGCCGTATACGGCTCTGACATGGCCTGTTCTCTGGCGCCACCCTGAGGCCAAGCTTTACATTGCTTGCATCACCAGTGGTAAAGGAGTTGTAAAGTTGTCTCTCAATTAGAATAAAATGTAGGTGTCTGGTTTATAACAAGCTACATAACTTTCTCATGGACCTGCTACCATGGTTAAGGActttattgttcttttgttttttatgtttttagaggcagtgatgttaaaaacaaataatgtcTTAACAAAAAGACAGTTTGGAAACTTGATGCAACgcaaagtgaaaacagagaCAAGACTGAACAATGAATGCTAATGATTTGATGGAGcttttatgactatttatttatttatgtctttCAGTTACCTCTCATTCTTGTAAGATTTAATTTTCTTCAGCACCTCACTTTATTTACAGCCGAATGGACCAAATTTCTTACgtaaaaaatgtgtttacaaaGCATCAGTTTTTTTGTAAACTCTGTAGACGACTCAGAAAAGATTCATGTTTCTGCAATTCAACATTCAAACTAAAAATGGGAATCAATCTACAGCACCCGTCTCTTTAACAAGACCAACTCATCAGTGTTCACAGAATGAAATTCCTTTGGTGTATTTGTCAAGCTAGTTGAGCTGATCATCACTGTACATCAAAAGGTTTCAGATCTTTTGATTGTCCAAAAAGGTTCACACATGCATCTACTATATAGTAGTTTGACAGCAATGGTTCCTATTTGTTATAATTCATTATCGCTCAACCTCATTGTATCACACATGTAGTACAAACTGAATTATATATTGCATATTTGTATTGTTGGAGTCAGATGTTCAATTTCAAATGGTTTCGTTTATGGATATTTTATTTAGATACAcgaaaaataatattaaatttGGACGTTTTGCAAAGAAACATGATAAAAATATATCTATTGTATAAGATACGTATTTTTTGTACTTATGTTCATCTTTCTTGTGTAATTCTTTTTGACATGCTACTTTTATGCTTTAGCCAAGACTATGTCCACATCACAGTTTTAACTGTAAACCTTATATcagtttttctgttttatttactttatatgCGGATCATTTATAAATGATCCAAATATATAGTAAAAGAGATCAGAAACTCCTGATGTGACCAAATGCCCAGGTGTAAATTTTAACACACATCACTGTAGAGAAGAATCTCAGTAGCGACTGTGTCAGATTTAAGCTTAGCAGCACTGATCTAATTCTGTTGCTATTGAAAAAGCTGTGTCCTATCCTCCCTCGTCTGCTGGTAGCTCGGGTAACCTTAAAGGAATGCAGAAGATGATGCCAGAATTATTTTGGGCTGAGATTcagatgttaaaatagcaaaaaaGGTTGCAGGGTAGATTACCAAGGAGAACGCAGACAGTTGTGCTGTCGACCCACATGTAGCTCTTTTACAGAGAGACCTTGAAAAGCAACGTTTCCAGCCAAGGCAAGTGTCTGCTAACAATATGTTGTTACGGATTTGTTGCAGATAGAAGTCCATGTTGGAAAATATTGATTAGACTTTACAGTGTATGGATTTAAAGTACTTATACCTTTGTTTGAAGGGTAAACATGTTTatactgtaaagcacttttaatAAATTAGGATGTACTGTGA
>XM_039787363.1
CTGCCCTCTGCACGAGTAAGACTACACGCTAGGTTAAGCACTAAATTGGGTAACTGTTCAGTGACCGCAGATAAACACCTGTTCGTACAGATCATCCTGAGCCAGAGTGGACGGGAACTGCTTTGATACAGCAAACATTTGGACCAGCAATCGATCCAAGACGGGGGTTTTAGGACCTAAAATGTCAGACTTGAAAGGCAAGAGAAAAGAATATCTAAGTGTGAAGGATCTGCAGAAGGTTTTGGACTCGTGCAAACTACATCTCAGTCAAGTTGATGAGGTCTGGCCAAACATATACATAGGGAATGTGGCAGTAGCCCAAAACAAGACCGCTTTGCAGAAATTAGCAGATGACTCAACACACTTTGATCTGGATGTTTACTTCCAGCCTGCAGCTGATTTCATTCATAAAGCTCTGAAGGCACCTGATGGGAAGGTTCTGGTGCACTGCATCATGGGAATGAGCCGGTCATCGACCTTGGTGTTAGCGTACCTCATGATCTACCATCACCTCACGCTCAAACGGGCTTTGCAGAAATTGATCGAGAAGAGAGCCATCTACCCCAACAGGAATTTCCTGGCTTTGTTGTTGGATCTGGATCTTCAGCtaacaagaaaaaagaaaacatgtcaCATACTGTAATCAAGAGAAGTTTACACTTTTTTAGCCACACAGCAGCGTTATGTCTAGGGATGGTGATGCCGGTCGGTCtgttggtccagactgaaatatttctAATAGATTGTCATGAAATTTAGTTCAACTAATGAAATGAGATTAACAGTAGGTTAATCTATCATGTTGGCATGTTAaacgtaaaaataaaaagaatgggAAAGCTGCACACATTTAACTACACATAATAACTCAGCCCTCAGTTTTTAATTAGCATGTTGAATGTTGACATAACATTAATATAGGCCTACTAAATGTTATCGTAAGGAGAAAATCTGCACACtcataacttttctttttttaaactcagaatCAATGTTTCAGAACGTAATGCCGTCTTCTAAATATTAGAAAGTTACGCTGAGTTAAACATTAGCAggttaacatgctaacatactAAGCATTACATACAAAATATTAGCAATTTAAAAAGCTAATGTTGGCATGCTGACAtggtattgtaaatattagatGCCAACAACATGTAAGCTAGTTGTTAATatgcattaaaacatgatgacaGTATGTTAACACGCTAACATGTCAGCATTCAGCTCAGGAAACAGCTGAGTACACAAAGTACACTTCAAACTGGAAAGAAGTCTCGGAAAATTTGACAACGCAGAAATGTAGCGGTAACATAACCTGGCCAGGGCCGTATACGGCTCTGACATGGCCTGTTCTCTGGCGCCACCCTGAGGCCAAGCTTTACATTGCTTGCATCACCAGTGGTAAAGGAGTTGTAAAGTTGTCTCTCAATTAGAATAAAATGTAGGTGTCTGGTTTATAACAAGCTACATAACTTTCTCATGGACCTGCTACCATGGTTAAGGActttattgttcttttgttttttatgtttttagaggcagtgatgttaaaaacaaataatgtcTTAACAAAAAGACAGTTTGGAAACTTGATGCAACgcaaagtgaaaacagagaCAAGACTGAACAATGAATGCTAATGATTTGATGGAGcttttatgactatttatttatttatgtctttCAGTTACCTCTCATTCTTGTAAGATTTAATTTTCTTCAGCACCTCACTTTATTTACAGCCGAATGGACCAAATTTCTTACgtaaaaaatgtgtttacaaaGCATCAGTTTTTTTGTAAACTCTGTAGACGACTCAGAAAAGATTCATGTTTCTGCAATTCAACATTCAAACTAAAAATGGGAATCAATCTACAGCACCCGTCTCTTTAACAAGACCAACTCATCAGTGTTCACAGAATGAAATTCCTTTGGTGTATTTGTCAAGCTAGTTGAGCTGATCATCACTGTACATCAAAAGGTTTCAGATCTTTTGATTGTCCAAAAAGGTTCACACATGCATCTACTATATAGTAGTTTGACAGCAATGGTTCCTATTTGTTATAATTCATTATCGCTCAACCTCATTGTATCACACATGTAGTACAAACTGAATTATATATTGCATATTTGTATTGTTGGAGTCAGATGTTCAATTTCAAATGGTTTCGTTTATGGATATTTTATTTAGATACAcgaaaaataatattaaatttGGACGTTTTGCAAAGAAACATGATAAAAATATATCTATTGTATAAGATACGTATTTTTTGTACTTATGTTCATCTTTCTTGTGTAATTCTTTTTGACATGCTACTTTTATGCTTTAGCCAAGACTATGTCCACATCACAGTTTTAACTGTAAACCTTATATcagtttttctgttttatttactttatatgCGGATCATTTATAAATGATCCAAATATATAGTAAAAGAGATCAGAAACTCCTGATGTGACCAAATGCCCAGGTGTAAATTTTAACACACATCACTGTAGAGAAGAATCTCAGTAGCGACTGTGTCAGATTTAAGCTTAGCAGCACTGATCTAATTCTGTTGCTATTGAAAAAGCTGTGTCCTATCCTCCCTCGTCTGCTGGTAGCTCGGGTAACCTTAAAGGAATGCAGAAGATGATGCCAGAATTATTTTGGGCTGAGATTcagatgttaaaatagcaaaaaaGGTTGCAGGGTAGATTACCAAGGAGAACGCAGACAGTTGTGCTGTCGACCCACATGTAGCTCTTTTACAGAGAGACCTTGAAAAGCAACGTTTCCAGCCAAGGCAAGTGTCTGCTAACAATATGTTGTTACGGATTTGTTGCAGATAGAAGTCCATGTTGGAAAATATTGATTAGACTTTACAGTGTATGGATTTAAAGTACTTATACCTTTGTTTGAAGGGTAAACATGTTTatactgtaaagcacttttaatAAATTAGGATGTACTGTGA

Function

NR:

description
dual specificity protein phosphatase 13-like isoform X2

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU287408 False 2052 lncRNA 0.37 3 13181107 13184029
XM_039787362.1 True 3066 mRNA 0.37 3 13180995 13184797
XM_039787363.1 False 2969 mRNA 0.37 4 13180996 13184797

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC120550684 dusp13 coding upstream 728 13178276 ~ 13180267 (+)
LOC120550677 znf503,LOC100700352,LOC102790377 coding upstream 50669 13127529 ~ 13130326 (+)
LOC120550674 LOC102213110,LOC102789302,LOC102314531,LOC106919544,LOC106949528,LOC106517014 coding upstream 181989 12902315 ~ 12999006 (+)
LOC120550820 NA coding upstream 279430 12865482 ~ 12901565 (+)
anxa11b LOC101063934,LOC103369864 coding upstream 319322 12852761 ~ 12861673 (+)
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LOC120551796 c1ql1,LOC104931779,LOC102295538,LOC101469500 coding downstream 183952 13368749 ~ 13376763 (+)
LOC120551280 LOC104943457 coding downstream 216722 13401519 ~ 13410575 (+)
vti1a vti1a coding downstream 243638 13428435 ~ 13552705 (+)
tcf7l2 tcf7l2,LOC106949585 coding downstream 398521 13583318 ~ 13671993 (+)
G212043 vdac2,LOC104943447,LOC101464912,LOC100700892 non-coding upstream 11144 13168158 ~ 13169851 (+)
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G211956 NA non-coding upstream 368468 12811682 ~ 12812527 (+)
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G211919 NA non-coding upstream 556300 12617355 ~ 12624695 (+)
G212065 NA non-coding downstream 12704 13197501 ~ 13197930 (+)
G212086 vcl,LOC106959441,LOC103142331,LOC102228164,LOC102207794 non-coding downstream 148537 13333334 ~ 13335524 (+)
G212092 vcl non-coding downstream 158921 13343718 ~ 13347321 (+)
LOC120551193 NA non-coding downstream 159974 13344771 ~ 13349545 (+)
G212132 NA non-coding downstream 362963 13547760 ~ 13555737 (+)
LOC120550681 comtd1 other upstream 14603 13159976 ~ 13166392 (+)
LOC120551603 zmiz1,LOC102192508,LOC102310819 other upstream 353386 12720835 ~ 12827609 (+)
LOC120551485 adamts14,LOC103367006 other upstream 581531 12550577 ~ 12599464 (+)
G211777 NA other upstream 1092860 12087685 ~ 12088135 (+)
LOC120550876 fam196a other upstream 1780417 11363355 ~ 11400578 (+)
G212108 NA other downstream 195419 13380216 ~ 13380934 (+)
G212254 NA other downstream 816003 14000800 ~ 14032589 (+)
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ppp1cab pp1g,LOC101069117,LOC100706881,LOC102229527,LOC103381595,LOC105024386,LOC107094299 other downstream 3184139 16368936 ~ 16377024 (+)
LOC120551005 LOC107390451,LOC107380363,LOC107396089,LOC107391794 other downstream 3241462 16426259 ~ 16427924 (+)

Expression


Co-expression Network