G217378


Basic Information

Item Value
gene id G217378
gene name NA
gene type non-coding
species eurasian perch (Perca fluviatilis)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_053133.1
NCBI id CM020930.1
chromosome length 31697812
location 1653177 ~ 1731066 (+)
genome version GENO_Pfluv_1.0_2020_eurasian_perch_Genome

Sequence

>TU294213
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>TU294214
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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU294213 False 3720 lncRNA 0.36 2 1653177 1716771
TU294214 True 5200 lncRNA 0.38 2 1653177 1731066

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
trnan-guu_46 NA coding upstream 1529 1651577 ~ 1651648 (+)
trnan-guu_45 NA coding upstream 2037 1651067 ~ 1651140 (+)
trnan-guu_44 NA coding upstream 3506 1649598 ~ 1649671 (+)
trnan-guu_43 NA coding upstream 4549 1648555 ~ 1648628 (+)
trnan-guu_42 NA coding upstream 5074 1648030 ~ 1648103 (+)
LOC120552004 aoc1,LOC102789916 coding downstream 527854 2258920 ~ 2313426 (+)
aoc1 aoc1,LOC102789916 coding downstream 695094 2426160 ~ 2438599 (+)
slc12a7b LOC103361595 coding downstream 727593 2458659 ~ 2558626 (+)
gfod1 gfod1,LOC100711398,LOC102233768,LOC102788772 coding downstream 836599 2567665 ~ 2615901 (+)
LOC120552716 kif5b coding downstream 893620 2624686 ~ 2672738 (+)
G217352 ift74 non-coding upstream 131640 1517494 ~ 1521537 (+)
G217326 NA non-coding upstream 299593 1352160 ~ 1353584 (+)
G217268 NA non-coding upstream 304353 886018 ~ 1348824 (+)
LOC120551977 NA non-coding upstream 798305 852609 ~ 854872 (+)
G217250 NA non-coding upstream 937857 715121 ~ 715320 (+)
G217384 NA non-coding downstream 19407 1750473 ~ 1835068 (+)
G217389 NA non-coding downstream 72753 1803819 ~ 1830678 (+)
LOC120552171 NA non-coding downstream 337237 2068303 ~ 2069213 (+)
G217444 NA non-coding downstream 476185 2207251 ~ 2207564 (+)
G217449 aoc1,LOC102789916 non-coding downstream 531481 2262547 ~ 2438589 (+)
zcchc2 zcchc2 other upstream 147962 1462750 ~ 1505215 (+)
G217606 svil other downstream 1275217 3006283 ~ 3021642 (+)
LOC120552392 mtpap other downstream 1489549 3220615 ~ 3233822 (+)
G217723 cnn3 other downstream 1764384 3495450 ~ 3543785 (+)
chchd7 chchd7,LOC102799933 other downstream 1939354 3670420 ~ 3704375 (+)
ppp1r17 NA other downstream 2524982 4256048 ~ 4261598 (+)

Expression


Co-expression Network