G223746


Basic Information

Item Value
gene id G223746
gene name NA
gene type misc
species eurasian perch (Perca fluviatilis)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_053133.1
NCBI id CM020930.1
chromosome length 31697812
location 28176365 ~ 28195425 (-)
genome version GENO_Pfluv_1.0_2020_eurasian_perch_Genome

Sequence

>TU302917
gtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtttgtgtctataagtatatgtgtgtgactctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctatatgtatgtgtgtgtgtgtgtgtctatgtgtgtgtgtgtgtgtgtctatatgtatgtgtgtgtgtctatatgtatgtatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtctgtgtgtgtgtgtctatgtgtgtgtgtctgtttgtgtctatatgtgtgtgtgtctgtctgtgtgtgtgtgtctatgtgtgtgtgtctgtttgtgtctatatgtgtgtgtgtgtgtctatatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctatatgtaagtgtgtttgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtttgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtttgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctatattagggtgaccaaacgtcctc
>TU302918
gtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtttgtgtctataagtatatgtgtgtgactctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctatatgtatgtgtgtgtgtgtgtgtctatgtgtgtgtgtgtgtgtgtctatatgtatgtgtgtgtgtctatatgtatgtatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtctgtgtgtgtgtgtctatgtgtgtgtgtctgtttgtgtctatatgtgtgtgtgtctgtctgtgtgtgtgtgtctatgtgtgtgtgtctgtttgtgtctatatgtgtgtgtgtgtgtctatatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctatatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtttgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtttgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctatattagggtgaccaaacgtcctc
>TU302919
gtctgtgtgtgtgtgtgtgtctctatgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtttgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtttgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtatatgtctctgtttctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgt
>TU302920
atgtatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtctgtgtgtgtgtgtctatgtgtgtgtgtctgtttgtgtctatatgtgtgtgtgtctgtctgtgtgtgtgtgtctatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctatatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtttgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtttgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctatattagggtgaccaaacgtcctc

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU302917 True 574 TUCP 0.44 2 28194528 28195425
TU302918 False 554 TUCP 0.44 3 28194528 28195425
TU302919 False 288 lncRNA 0.48 3 28176365 28195245
TU302920 False 338 lncRNA 0.46 3 28194528 28194931

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC120552593 NA coding downstream 864000 27310012 ~ 27312365 (-)
LOC120552591 NA coding downstream 951373 27223754 ~ 27224992 (-)
LOC120552579 NA coding downstream 971212 27195330 ~ 27205153 (-)
LOC120552735 nebl coding downstream 986821 27136771 ~ 27189544 (-)
LOC120552734 nebl coding downstream 1046971 27046827 ~ 27129394 (-)
LOC120552567 NA coding upstream 107909 28303334 ~ 28355647 (-)
LOC120552600 NA coding upstream 181654 28377079 ~ 29112293 (-)
dnah5l LOC103377303,LOC103367559 coding upstream 734806 28930231 ~ 29094205 (-)
LOC120552571 NA coding upstream 929789 29125214 ~ 29147661 (-)
LOC120552587 hus1 coding upstream 956009 29151434 ~ 29161971 (-)
G223688 NA non-coding downstream 9417 28106828 ~ 28166948 (-)
G223744 NA non-coding downstream 22046 28121153 ~ 28154319 (-)
G223737 NA non-coding downstream 37510 28096267 ~ 28138855 (-)
G223739 NA non-coding downstream 42664 28112659 ~ 28133701 (-)
G223745 NA non-coding downstream 45061 28130975 ~ 28131304 (-)
G223752 NA non-coding upstream 35645 28231070 ~ 28236071 (-)
G223697 NA non-coding upstream 56000 28251425 ~ 28302968 (-)
G223754 NA non-coding upstream 70040 28265465 ~ 28317000 (-)
G223756 NA non-coding upstream 115415 28310840 ~ 28400467 (-)
G223757 NA non-coding upstream 118465 28313890 ~ 28327694 (-)
G223681 NA other downstream 260532 27897134 ~ 27915833 (-)
G223646 fars2,LOC102791206 other downstream 380514 27756346 ~ 27795851 (-)
G223665 fars2 other downstream 422031 27750705 ~ 27754334 (-)
G223645 NA other downstream 436393 27738782 ~ 27739972 (-)
LOC120552596 NA other downstream 475984 27694340 ~ 27700381 (-)
LOC120552566 NA other upstream 586465 28781890 ~ 28846253 (-)
LOC120552583 NA other upstream 1105265 29300690 ~ 29319934 (-)
LOC120552608 NA other upstream 1284384 29479809 ~ 29543351 (-)
G223911 NA other upstream 1354970 29550395 ~ 29563368 (-)
LOC120552738 yipf3,LOC106605823 other upstream 1416567 29611992 ~ 29620659 (-)

Expression


Co-expression Network