G224135


Basic Information

Item Value
gene id G224135
gene name NA
gene type non-coding
species eurasian perch (Perca fluviatilis)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_053133.1
NCBI id CM020930.1
chromosome length 31697812
location 30966190 ~ 31120078 (-)
genome version GENO_Pfluv_1.0_2020_eurasian_perch_Genome

Sequence

>TU303499
ctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtctgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctg
>TU303500
gtgtgtgtgtgtgtgtggggtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtttgtgtgtgtgtgtgtgtttgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgt
>TU303501
gtgtgtgtgtgtgtgtggggtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctctgtgtctgtgtgtgtgtgtggctgtgtgtgtgtgtgtgtttgtgtgtgtgtatgtgtgtgtgtgtgtatgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtg
>TU303502
gtgtgtgtgtgtgtgtggggtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtg
>TU303503
ctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtctgtctgtgtgtttgtgtgtgtgtgtgggtgtgtgtgtgtgtgtgtatctgtgtgtgtgtgtgtgcctctgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtatgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctg
>TU303504
gtgtgtgtctgtctgtgtatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtctgtgtgtgtgtatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctttgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtatgtgtgcgtgtctatgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtatgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgt
>TU303505
ctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtctgtctgtgtgtttgtgtgtgtgtgtgggtgtgtgtgtgtgtgtgtatctgtgtgtgtgtgtgtgcctctgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtctctctgtgtgtgt
>TU303506
ctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgggtgtgtgtgtgtgtgtgtatctgtgtgtgtgtgtgtgcctctgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtctgtgtgtgtatgtgtgtgtgtgtgt
>TU303507
gtgtgtgtgtgtgtgtggggtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtatgtgtgcgtgtctatgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtatgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgt

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU303499 False 215 lncRNA 0.50 2 31119684 31120078
TU303500 False 205 lncRNA 0.50 2 31045569 31086609
TU303501 False 268 lncRNA 0.50 3 30966190 31086609
TU303502 False 204 lncRNA 0.51 3 31028818 31086609
TU303503 False 299 lncRNA 0.49 2 31119684 31120078
TU303504 True 334 lncRNA 0.49 3 31028406 31045131
TU303505 False 238 lncRNA 0.50 2 31105051 31120078
TU303506 False 240 lncRNA 0.50 4 31045278 31120078
TU303507 False 297 lncRNA 0.50 3 31028406 31086609

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC120552139 NA coding downstream 159854 30797184 ~ 30806336 (-)
LOC120552744 prkag2,LOC107373612 coding downstream 367258 30579491 ~ 30598932 (-)
crygn2 crygn,LOC105025719 coding downstream 580184 30380109 ~ 30386006 (-)
xylb xylb coding downstream 632911 30296482 ~ 30333279 (-)
LOC120552613 NA coding downstream 1041449 29900410 ~ 29924741 (-)
LOC120552143 NA coding upstream 113676 31233754 ~ 31238960 (-)
G224133 kmt2c non-coding downstream 2748 30962281 ~ 30963442 (-)
G224126 NA non-coding downstream 28878 30937060 ~ 30937312 (-)
G224118 NA non-coding downstream 43380 30920803 ~ 30922810 (-)
G224117 kmt2c,LOC108251294,LOC106535402 non-coding downstream 45395 30918503 ~ 30920795 (-)
G224072 NA non-coding downstream 82142 30861516 ~ 30884048 (-)
G224184 NA non-coding upstream 41599 31161677 ~ 31348325 (-)
G224158 NA non-coding upstream 42651 31162729 ~ 31171801 (-)
G224188 NA non-coding upstream 49404 31169482 ~ 31169888 (-)
G224194 NA non-coding upstream 87830 31207908 ~ 31208791 (-)
G224200 NA non-coding upstream 99956 31220034 ~ 31602620 (-)
G224051 NA other downstream 284608 30632746 ~ 30681582 (-)
G224031 NA other downstream 387746 30397876 ~ 30578444 (-)
LOC120552614 NA other downstream 472811 30446866 ~ 30493379 (-)
LOC120552615 NA other downstream 545640 30405183 ~ 30420550 (-)
LOC120552628 NA other downstream 1109218 29850656 ~ 29856972 (-)
G224195 NA other upstream 90683 31210761 ~ 31211360 (-)
zbtb14 zbtb14,LOC108251587,LOC108228861,LOC106533852 other upstream 178520 31298598 ~ 31328575 (-)
G224245 NA other upstream 179945 31300023 ~ 31301032 (-)
LOC120551970 LOC103372613,LOC105921230,LOC107100929,LOC101066394,LOC100709658 other upstream 210618 31330696 ~ 31337397 (-)
epb41l3a LOC100705796,LOC102304920,LOC101475436,LOC102201773,LOC108251472,LOC107100932 other upstream 340553 31460631 ~ 31511341 (-)

Expression


Co-expression Network