G225652


Basic Information

Item Value
gene id G225652
gene name NA
gene type misc
species eurasian perch (Perca fluviatilis)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_053134.1
NCBI id CM020931.1
chromosome length 29109922
location 3675809 ~ 3811290 (-)
genome version GENO_Pfluv_1.0_2020_eurasian_perch_Genome

Sequence

>TU306040
tctccggaaattcaaagccagactgtcatggcggctcgttcagaatctgatctcatatcggactaaaatagttcacagagacatgttactggaaacatctggagagagaaataggccgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtctctgtgtgtctgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtctgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtctgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgcgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtg
>TU306042
gtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgagagtgtctctgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctgtgtctctgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtctgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctgtgtctctgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctctctctctctctctctctctctctctctgtctctctctctgtctctctctctctgtgtgtgtgtct
>TU306044
tctccggaaattcaaagccagactgtcatggcggctcgttcagaatctgatctcatatcggactaaaatagttcacagagacatgttactggaaacatctggagagagaaataggccgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgcgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtg
>TU306045
gtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgagagtgtctctgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtctgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtctgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgttaggg
>TU306047
tctccggaaattcaaagccagactgtcatggcggctcgttcagaatctgatctcatatcggactaaaatagttcacagagacatgttactggaaacatctggagagagaaataggctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtctctgtgtctctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgttaggg
>TU306048
gtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgagagtgtctctgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtctgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtctgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtctctgtgtctctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgttaggg
>TU306050
gtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgagagtgtctctgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgttaggg
>TU306051
gtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgagagtgtctctgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtctgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtctgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgttaggg

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU306040 True 518 TUCP 0.49 2 3675809 3748586
TU306042 False 328 lncRNA 0.50 3 3747235 3811290
TU306044 False 214 lncRNA 0.48 2 3675809 3748586
TU306045 False 415 lncRNA 0.50 3 3747859 3811290
TU306047 False 388 lncRNA 0.48 3 3747859 3748586
TU306048 False 481 lncRNA 0.50 3 3747859 3811290
TU306050 False 255 lncRNA 0.50 3 3747859 3811290
TU306051 False 455 lncRNA 0.50 3 3747859 3811290

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
lsm8 lsm8,LOC106596712 coding downstream 99758 3570824 ~ 3576051 (-)
LOC120553027 best3,LOC103382512 coding downstream 273454 3380283 ~ 3402355 (-)
rab21 rab21 coding downstream 513698 3133484 ~ 3162111 (-)
LOC120553515 ptprr coding downstream 581565 3026749 ~ 3094244 (-)
LOC120553082 LOC102204254,LOC108414267,LOC103462478,LOC103381127,LOC108414279,LOC108269716,LOC103379246 coding downstream 975820 2699307 ~ 2699989 (-)
dyrk2 dyrk2,LOC104934917,LOC102780451 coding upstream 244146 4055436 ~ 4094491 (-)
LOC120553727 NA coding upstream 304409 4115699 ~ 4125066 (-)
LOC120553051 NA coding upstream 329398 4140688 ~ 4150126 (-)
mdm2 mdm2,LOC104943639 coding upstream 645322 4456612 ~ 4468828 (-)
nup107 nup107,LOC102776523 coding upstream 658023 4469313 ~ 4482973 (-)
G225635 shank3,LOC107374533,LOC103382509,LOC103154279 non-coding downstream 169186 3498112 ~ 3506623 (-)
G225632 NA non-coding downstream 202129 3473097 ~ 3473680 (-)
G225622 NA non-coding downstream 254859 3420484 ~ 3420950 (-)
G225614 NA non-coding downstream 272835 3402505 ~ 3402974 (-)
G225539 cct2 non-coding downstream 335616 3339217 ~ 3340193 (-)
G225688 NA non-coding upstream 25200 3836490 ~ 3841168 (-)
G225744 NA non-coding upstream 123092 3934382 ~ 3934899 (-)
G225753 NA non-coding upstream 168673 3979963 ~ 3985951 (-)
G225763 NA non-coding upstream 230013 4041303 ~ 4041736 (-)
G225811 NA non-coding upstream 389542 4200832 ~ 4201285 (-)
G225541 NA other downstream 327817 3342555 ~ 3347992 (-)
G225495 NA other downstream 542624 3036167 ~ 3133185 (-)
LOC120553723 ptprb,LOC108249720 other downstream 657206 2937313 ~ 3018603 (-)
G225398 NA other downstream 882705 2792262 ~ 2793104 (-)
G225300 NA other downstream 1228451 2433932 ~ 2447358 (-)
G225751 NA other upstream 236026 4047316 ~ 4051191 (-)
LOC120553649 NA other upstream 718697 4529987 ~ 4539797 (-)
cpm cpm,LOC106925010 other upstream 945631 4756921 ~ 4782759 (-)
LOC120553807 LOC104934913 other upstream 1431600 5242890 ~ 5263052 (-)
G226200 gns other upstream 2919017 6730307 ~ 6730782 (-)

Expression


Co-expression Network