G225707


Basic Information

Item Value
gene id G225707
gene name NA
gene type non-coding
species eurasian perch (Perca fluviatilis)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_053134.1
NCBI id CM020931.1
chromosome length 29109922
location 3885713 ~ 3942427 (+)
genome version GENO_Pfluv_1.0_2020_eurasian_perch_Genome

Sequence

>TU306117
tgtctctctctctctctctctctctctctctctctgtctctctctgtctctctctccctctctctctctctctctctctctctctgtctctctctgtctctctctctctctctctctgtctctctctctgtctctctctctctctctctgtctctctctgtctctctctctctctgtctctctctctctgtctctctctctctctctctctctctgtctctctctctgtctctctctctctctctctctctctctctctctctgtctctctctctctctgtctctctgtctctgtctctctctctctctctctgtctctctctctctctctgtctctctgtctctctgtctctctctctctctctctctgtctgtctgtctctctctctctctctctctctctctctctctgtctctc
>TU306118
tatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatcgctctctctctctctctctctttctctgtctctgtctctctctctctctctctctctctctctgtctctctctctctctgtctctctctctctctctctctctctctctctctgtctctctctctctctctctctctgtctctctctctctctgtctctctctctctctctctctgtctctctctctctgtctctctctgtctctctctctctgtctctctctccctctctctctctctctctctctctctctgtctctctctgtctctctctctctctctctctgtctctctctctgtctctctctctctctctctgtctctctctgtctctctctctctctgtctctctctctctgtctctctctctctctctctctctctgtctctctctctgtctctctctctctctctctctctctctctctctctgtctctctctctctctgtctctctgtctctgtctctctctctctctctctgtctctctctctctctctgtctctctgtctctctgtctctctctctctctctctctgtctgtctgtctctctctctctctctctctctctctctctctgtctctc
>TU306119
tatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatcgctctctctctctctctctctttctctgtctctgtctctctctctctctctctctctctctctgtctctctctctctctgtctctctctctctctctctctctctctctctctgtctctctctctctctctctctctgtctctctctctctctgtctctctctctctctctctctctctctatctctctctcactctctctctctctctgtctctctctctctgtctctctctgtctctctctctacctctctctctctgtctgtctctctctctctctctctctctgtctctctctctctctctctctctctgtctctctctctgtctctctctctctctctctctctctctctctctctgtctctctctctctctgtctctctgtctctgtctctctctctctctctctgtctctctctctctctctgtctctctgtctctctgtctctctctctctctctctctgtctgtctgtctctctctctctctctctctctctctctctctgtctctc
>TU306120
tatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatcgctctctctctctctctctctttctctgtctctgtctctctctctctctctctctctctctctgtctctctctctctctgtctctctctctctctctctctctctctctctctgtctctctctctctctctctctctgtctctctctctctctgtctctctctctctctctctgtctgtctctctctctctgtctctctctctacctctctctctctctctgtctctctctctctgtctctctctgtctctctctctctgtctctctctccctctctctctctctctctctctctctctgtctctctctgtctctctctctctctctctctgtctctctctctgtctctctctctctctctctgtctctctctgtctctctctctctctgtctctctctctctgtctctctctctctctctctctctctgtctctctctctgtctctctctctctctctctctctctctctctctctgtctctctctctctctgtctctctgtctctgtctctctctctctctctctgtctctctctctctctctgtctctctgtctctctgtctctctctctctctctctctgtctgtctgtctctctctctctctctctctctctctctctctgtctctc
>TU306123
tgtctctctctctctctctctctctctctctctctgtctctctctctctgtctctctctctctgtctctctctccctctctctctctctctctctctctctctgtctctctctgtctctctctctctctctctctgtctctctctctgtctctctctctctctctctgtctctctctgtctctctctctctctgtctctctctctctgtctctctctctctctctctctctctgtctctctctctgtctctctctctctctctctctctctctctctctctgtctctctctctctctgtctctctgtctctgtctctctctctctctctctgtctctctctctctctctgtctctctgtctctctgtctctctctctctctctctctCCTCTCTATC
>TU306125
tatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatcgctctctctctctctctctctttctctgtctctgtctctctctctctctctctctctctctctgtctctctctctctctgtctctctctctctctctctctctctctctctctgtctctctctctctctctctctctctctgtctctctctctctgtctctctctgtctctctctctctgtctctctctccctctctctctctctctctctctctctctgtctctctctgtctctctctctctctctctctgtctctctctctgtctctctctctctctctctgtctctctctgtctctctctctctctgtctctctctctctgtctctctctctctctctctctctctgtctctctctctgtctctctctctctctctctctctctctctctctctgtctctctctctctctgtctctctctctgtctgtctgtctctctctctctctctctctctctctctctctgtctctc
>TU306126
tatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatcgctctctctctctctctctctttctctgtctctgtctctctctctctctctctctctctctctgtctctctctctctctgtctctctctctctctctctctctctctctctctgtctctctctctctctctctctctgtctctctctctctctgtctctctctctctctctctctctctctctgtctctctctctctgtctctctctgtctctctctctctgtctctctctccctctctctctctctctctctctctctctgtctctctctgtctctctgtctctctctctctctctctgtctctctctgtctctctctctctctgtctctctctctctgtctctctctctctctgtctctctgtctctgtctctctctctctctctctgtctctctctctctctctgtctctctgtctctctgtctctctctctctctctctctgtctgtctgtctctctctctctctctctctctctctctctctgtctctc
>TU306127
tgtctctctctctctctctctctctctctctctctgtctctctctctacctctctctcactctctctctctctctgtctctctctctctctctctctctctctgtctctctctctctgtctctctctgtctctctctctctgtctctctctccctctctctctctctctctctctctctctgtctctctctgtctctctctctctctctctctgtctctctctctgtctctctctctctctctctgtctctctctgtctctctctctctctgtctctctctctctgtctctctctctctctctctctctctgtctctctctctgtctctctctctctctctctctctctctctctctctgtctctctctctctctgtctctctctctctctctgtctgtctgtctctctctctctctctctctctctctctctctgtctctc

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU306117 False 418 lncRNA 0.50 2 3934316 3934899
TU306118 False 670 lncRNA 0.47 2 3885713 3934899
TU306119 False 600 lncRNA 0.46 3 3885713 3934899
TU306120 True 716 lncRNA 0.47 2 3885713 3934899
TU306123 False 397 lncRNA 0.50 3 3934316 3942427
TU306125 False 558 lncRNA 0.46 3 3885713 3934899
TU306126 False 578 lncRNA 0.47 4 3885713 3934899
TU306127 False 442 lncRNA 0.50 3 3934316 3934899

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
mdm1 NA coding upstream 12394 3841996 ~ 3873319 (+)
cand1 cand1 coding upstream 85118 3736482 ~ 3800595 (+)
LOC120553119 LOC104957567 coding upstream 318120 3546739 ~ 3567593 (+)
cct2 cct2 coding upstream 537727 3328950 ~ 3347986 (+)
LOC120553725 NA coding upstream 582963 3260679 ~ 3302750 (+)
LOC120553047 NA coding downstream 56307 3998734 ~ 4019042 (+)
LOC120553050 NA coding downstream 151233 4093660 ~ 4107645 (+)
LOC120553052 NA coding downstream 212868 4155295 ~ 4175824 (+)
trnal-caa_13 NA coding downstream 244134 4186561 ~ 4186671 (+)
trnal-caa_14 NA coding downstream 245742 4188169 ~ 4188279 (+)
G225607 NA non-coding upstream 53183 3831438 ~ 3832530 (+)
G225602 NA non-coding upstream 73300 3812130 ~ 3812413 (+)
G225592 NA non-coding upstream 84543 3747857 ~ 3801170 (+)
G225721 NA non-coding downstream 54538 3996965 ~ 4051123 (+)
G225725 NA non-coding downstream 98978 4041405 ~ 4041726 (+)
G225785 NA non-coding downstream 196101 4138528 ~ 4140277 (+)
G225790 NA non-coding downstream 222002 4164429 ~ 4165021 (+)
G225804 NA non-coding downstream 269651 4212078 ~ 4212312 (+)
LOC120553144 rap1b,LOC101070080,LOC100707998,LOC103368175,LOC102210937 other upstream 44539 3814481 ~ 3841174 (+)
trnat-ugu_40 NA other upstream 351041 3534600 ~ 3534672 (+)
trnat-ugu_39 NA other upstream 352052 3533589 ~ 3533661 (+)
trnat-ugu_38 NA other upstream 353633 3532008 ~ 3532080 (+)
trnat-ugu_37 NA other upstream 357152 3528489 ~ 3528561 (+)
G225894 NA other downstream 715017 4657444 ~ 4657969 (+)
abcc9 abcc9,LOC107387088 other downstream 1338831 5281258 ~ 5373637 (+)
prkcq prkcq,LOC102789446 other downstream 2718093 6660520 ~ 6686639 (+)
snrpf snrpf,LOC106576293 other downstream 3376090 7318517 ~ 7321189 (+)
amdhd1 amdhd1 other downstream 3380643 7323070 ~ 7332259 (+)

Expression


Co-expression Network