yaf2 (yaf2,LOC102236902)


Basic Information

Item Value
gene id yaf2
gene name yaf2,LOC102236902
gene type misc
species eurasian perch (Perca fluviatilis)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_053134.1
NCBI id CM020931.1
chromosome length 29109922
location 15494677 ~ 15511178 (+)
genome version GENO_Pfluv_1.0_2020_eurasian_perch_Genome

Sequence

>TU309478
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>TU309479
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Function

symbol description
yaf2 Predicted to enable DNA binding activity and transcription coregulator activity. Acts upstream of or within forebrain development and negative regulation of apoptotic process. Predicted to be active in nucleus. Is expressed in forebrain; head; and midbrain. Orthologous to human YAF2 (YY1 associated factor 2).

NR:

description
PREDICTED: YY1-associated factor 2

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU309478 True 5015 lncRNA 0.44 3 15494689 15510679
TU309479 False 4889 lncRNA 0.43 2 15494689 15510679
XM_039791820.1 False 3945 mRNA 0.43 4 15494681 15511178
XM_039791822.1 False 839 mRNA 0.51 4 15494677 15506893
XM_039791823.1 False 3820 mRNA 0.43 3 15494680 15511178

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
zcrb1 zcrb1 coding upstream 1254 15491283 ~ 15493423 (+)
pus7l pus7l coding upstream 126558 15360929 ~ 15368119 (+)
LOC120553796 LOC104934096,LOC103355199 coding upstream 148952 15338839 ~ 15345725 (+)
fgl2a fgl2 coding upstream 238354 15246158 ~ 15256323 (+)
LOC120553461 NA coding upstream 740427 14750780 ~ 14754250 (+)
gxylt1b gxylt1,LOC103355206,LOC103459445 coding downstream 671 15511849 ~ 15521235 (+)
akap14 NA coding downstream 248133 15759311 ~ 15759832 (+)
avpr2l LOC103369361,LOC104965399,LOC107098425 coding downstream 251615 15762793 ~ 15764738 (+)
LOC120553452 NA coding downstream 258834 15770012 ~ 15772705 (+)
LOC120553449 LOC102291490,LOC101477496,LOC100701114,LOC102193524 coding downstream 265737 15776915 ~ 15789611 (+)
G228065 NA non-coding upstream 204169 15290187 ~ 15290508 (+)
G227995 nampt,LOC102790888 non-coding upstream 328468 15154129 ~ 15166209 (+)
G227969 NA non-coding upstream 349479 15141212 ~ 15145198 (+)
G227972 znf800,LOC102791911 non-coding upstream 433843 15060004 ~ 15060834 (+)
G227970 NA non-coding upstream 437199 15054705 ~ 15057478 (+)
G228119 NA non-coding downstream 19953 15531131 ~ 15531439 (+)
G228128 cntn1 non-coding downstream 166177 15677355 ~ 15680269 (+)
G228130 NA non-coding downstream 169195 15680373 ~ 15681491 (+)
G228136 NA non-coding downstream 178730 15689908 ~ 15699902 (+)
LOC120553205 NA non-coding downstream 210346 15721524 ~ 15722242 (+)
prickle1b prickle1 other upstream 22790 15441985 ~ 15471887 (+)
lrrc17 LOC103355197,LOC103382847 other upstream 163499 15300522 ~ 15331178 (+)
LOC120553256 gsap,LOC102790605 other upstream 291636 15168604 ~ 15203041 (+)
LOC120553353 spam1,LOC103370765,LOC102199515,LOC101470336,LOC102310263 other upstream 1032203 14454593 ~ 14462474 (+)
LOC120553485 tmem60,LOC101486292,LOC104924613,LOC103382814,LOC100699021 other upstream 1489772 14002132 ~ 14004905 (+)
tmem168a LOC103368481 other downstream 755958 16267136 ~ 16280061 (+)
cald1a LOC102212027,LOC102781594,LOC102298269,LOC103382882,LOC106941466,LOC103156466,LOC101472471,LOC106916645,LOC106525550,LOC107395349,LOC103356441 other downstream 1259880 16771058 ~ 16831243 (+)
stmp1 NA other downstream 1355132 16866310 ~ 16867796 (+)
morn2 morn2 other downstream 1369098 16880276 ~ 16916928 (+)
G228335 ahcyl2,LOC103371314,LOC107725924,LOC107656398 other downstream 1408485 16919663 ~ 16922823 (+)

Expression


Co-expression Network