G230401


Basic Information

Item Value
gene id G230401
gene name NA
gene type non-coding
species eurasian perch (Perca fluviatilis)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_053134.1
NCBI id CM020931.1
chromosome length 29109922
location 25595592 ~ 25616671 (+)
genome version GENO_Pfluv_1.0_2020_eurasian_perch_Genome

Sequence

>TU312504
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>TU312505
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>TU312507
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Function

NR:

description
nucleotide-binding oligomerization domain-containing protein 1-like isoform X2

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU312504 False 3188 lncRNA 0.39 3 25595592 25606850
TU312505 False 2956 lncRNA 0.39 2 25595592 25601614
TU312507 True 4089 lncRNA 0.39 4 25595592 25616671

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
cdnf LOC104964768 coding upstream 21570 25568539 ~ 25574022 (+)
prl2 LOC104964766,LOC103356682,LOC100697904 coding upstream 42591 25546940 ~ 25553001 (+)
LOC120553524 dennd5b,LOC102198357 coding upstream 103860 25402355 ~ 25491732 (+)
LOC120553526 NA coding upstream 195385 25392432 ~ 25400207 (+)
ttll12 ttll12 coding upstream 246251 25263996 ~ 25349341 (+)
lemd3 lemd3,LOC104964688,LOC106576661 coding downstream 4772 25621443 ~ 25640090 (+)
hmga2 hmga2 coding downstream 79210 25695881 ~ 25753815 (+)
dera dera coding downstream 152066 25768737 ~ 25779615 (+)
il17ra1a NA coding downstream 529236 26145907 ~ 26158913 (+)
LOC120553199 LOC104965315 coding downstream 599470 26216141 ~ 26219357 (+)
G230339 NA non-coding upstream 91156 25503664 ~ 25504436 (+)
G230337 NA non-coding upstream 95383 25499847 ~ 25500209 (+)
G230336 NA non-coding upstream 100193 25495148 ~ 25495399 (+)
G230327 NA non-coding upstream 101237 25436151 ~ 25494355 (+)
G230259 NA non-coding upstream 217991 25376347 ~ 25377601 (+)
G230404 NA non-coding downstream 1531 25618202 ~ 25619259 (+)
G230406 NA non-coding downstream 33987 25650658 ~ 25952405 (+)
G230415 NA non-coding downstream 104982 25721653 ~ 25722486 (+)
G230417 NA non-coding downstream 160340 25777011 ~ 25777634 (+)
G230418 NA non-coding downstream 171935 25788606 ~ 25789256 (+)
LOC120553523 NA other upstream 221596 25362882 ~ 25373996 (+)
G230148 LOC102781993,LOC101465723 other upstream 817334 24620812 ~ 24778258 (+)
LOC120553083 NA other upstream 1280885 24309542 ~ 24314707 (+)
LOC120553686 LOC105929833,LOC107382334 other upstream 1649952 23934300 ~ 23945640 (+)
adm2a NA other upstream 1746968 23833018 ~ 23848624 (+)
msrb3 msrb3 other downstream 25169 25641840 ~ 25662819 (+)
LOC120553706 NA other downstream 193736 25810407 ~ 25812828 (+)
arhgef39 arhgef39 other downstream 421517 26038188 ~ 26106823 (+)
mrps33 mrps33,LOC106591474 other downstream 756043 26372714 ~ 26381109 (+)
LOC120553759 NA other downstream 1076685 26693356 ~ 26971853 (+)

Expression


Co-expression Network