LOC120553059


Basic Information

Item Value
gene id LOC120553059
gene name NA
gene type coding
species eurasian perch (Perca fluviatilis)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_053134.1
NCBI id CM020931.1
chromosome length 29109922
location 29090957 ~ 29099400 (+)
genome version GENO_Pfluv_1.0_2020_eurasian_perch_Genome

Sequence

>XM_039791124.1
AGGTGACAGGAGATGGACAAACTGATGTTTGACTGTCACTGAAATGATGAAGCTGTCAGTGTTGTTGCTGCCGGCCCTGCTGGCTATTTCCTCTAGTGCTAGTCTGCAAGACATCGTGAAGAAGAGCTCACAGATCggaaaagTTCCAATTCTGAACCCAGATCTAGGGAACAGGATTCCTCAAATCACCACCAACGGATCTTTGTTGGCTCTTCCGCCCCCTGCTGAATTTGAGAACAGGCTGGGTCAATCTTCCTCCTTTGTGTTTGGTGACTCCAACCTGAAATGGCAGACCTCGTCTGGCTCTCTCCCGTCTGGTGCCGTTTCAATTTACAATGGATATGCCGATCGCACCGACTATGTCTGCAAATATGGGTGCTCATCTGGCTTCTACAACCCCAACTGGAGTGGTCATTACTGCTACTACCCCTTGTCAGGTAAAGAGCATCGTGCCAGCTCATTTGAGTTCCTGGTAAACAAAGACAACTTAGAATTTTTAGAATGGAAGGATGGCTCCTGGGGTTCAGTGCCTCGCAATGCAGTCTCCACATGCGGAGACACATATGTTGGGAAGAACAAATATGGCCTTGGGAAGGTGAGTGTTAAACACGAGGCCTTCTTCCTTCCCTGGAACGGTAAGGAGCATTGGTACAAGAGCTACCAGGTCCTGACCCTCAATAAAGAAATAAGCAGCGAGCGCATTTCCAATGTCAATTACAACACTAATGTTAAAGTCTTCCAGCATCCTCCAGAGACCATGACCAAGTCCATCATATCCAACAATGAGTGCAGCCCAGTTGTGAAAAGACTTGAGCTCTCAAAAACCTACATGGAGGAGAAAAGGTGGGACACCAGCACTGCCATCACGAGTGGGGTCAGTAGTAGCATCACCGCCAAAATCCCATTCATCGGCTCTGCAGGTATTGCGCTCAGTGTTgaaacaacaaagcaattcTCAAGAGGAACCACTGTGGTGGAGTCGAAAACCTACTCGGTCTCTGTGGAGCAAACTGTTCCACCAAACCACTCCTGCAGTGTCAGTATGGTGGGATATAAGTATAAGGCAGACATCCCCTACACAGCTCGCCTCAGCCGCACCTACAGAAATGGGAAGACGACATGGGTGTACATCACTGGGACCTACAAGGGAGTCGATGTTGGAGAAGTCCACTCTGTTGTGGATCGCTGTGAACCTATACCCAATTCCAAACCTTGTCCCTGAAAGAAAAATTTTATCTTAAGATATCTGACATAATCAATGTTAAATATTGGTGAAAATGATAAATGTACTATACTAATTCTAGTTATAATTGGCTGGGCAACAGGATAGGTTTTAGGAGTGGTGAAGAAGGAGTCCAGAAAGCTCCCCTGAGATGACATATCCAATGATTTCAGCAGAACACTGAAAAATGAGTAACTTTTCACCACAGAGAGCAGAGAACATAATATGGTAAAGGGCTTTTTCATGTTGAGCTTTATATTTTTCTCTGTTAAGTCCCAGTCAGTAATTTTTGGAACGTACTGTATATGTTGCAGTTATagtaaaaatacaatgatgatgagtttttgtttgttttattacaaaTGAATGTAGGCTTGCAATAAAATGATTTATATATGTAAGGAATTGTATTGTTACCTCTGTTTAATGATAAGAGGAAGTTAAGCCatagagcttttattgtgaaggggaAAGCAGAAGTGTGAAATGCTGTGATAAGTTTCCAttgattgtgtttttgattAATATCTGAACCGAGACAGCACTGCATGTCTTCTCTTTTATTAAAgcttgtgttttcattttatagtttcatagtatagtatataggtGACATACAAAACCCTTTGTTacatatgtgtgcatgtatgaggAAGCATTTTTCTGATTCTTgaatgattataataaatacagTGGCGAATCGGGTGATTTACTGATGTAAACAAACCTATCATCAGCAACAGAATACAATAACAACTTCATAGATTTAGTTTTTGTACACTGTTAGTCCATAACGGTCTTGTGAATCAAATTAAGCGCAACTGAAGACAATACACAGCCTCTTTTGGTTACTGAAGCATGAGGAGGAAGAGCTGTATGCACTGTGAAGGGGATCAAGCCTTTGCTGTTGTGGAACAGCATCGCTGTAAGACGTGCCCCCACAATTTAATTTTAATCCCACCACAAAGGCAATTTTAGGCTTTTGGACCTGCAGTGTGTGTTTCTTCTGTGATGCTTGTTTTCTCACATGTGATTTTTAGGCTTTTTAGAAAAGAAGGGATATACACCATTCATATGGACGCTTCGATCAGTGATatagaaattgaaattgaaaattatgttgttttaagaaaagatagaaatcGTAATGGGGGAGGAGTATGTGTTTATATTACGGCTGATATTTGTTTTAACCGCAGAATGGATTTAAATCATGATCTTATTGAAGCTGTGTGGTTTGATGTACAGTTAACTAAAAGTAAGCCTATTTTAATTGGGGCTCTGTATAGACCTTGTATGATCCATGTAGTGATTTTAAGGGTGAGGTTATAATGAtaggtgattttaatactgATGTTTCTAACAAAAATCATGGGATGTATAAAGCCTTTAATAGGTTTTGTCAGGTTCTGGATCTACAGCAAATAATTAAAGAGCCCACACGAGTAGCTAAAATGAGTCAAACGGTCATTGATCTCATTTTGGTATCAGAGCAATCTATGATTTCTCAGAGTGGGGTTGTAAATTGTACTATAAGTGCCCActcattaatttatttttcaaggaaaaaatttaaagttgcattgaagaaacaaaacacaattaagatcaggtcattaaaaaaacatagtCGTGAGGTTTTTATTGAGTGTTTTAAATCACTGAATTGTCCTCTAGTGTTATGTTTGGATGTTGATGAGGCATGGGAGCAGTTTAAACATTTGTTCTTAGAGGCATTAGATAAAGTTGCTCCTATAAAAACGATTCGAGTAAAACTGAGGTCAGAGCCATGGATGAATGATGATATTTTAGAAGCAATTACTAATAGAAATAAAGCCTTTTCTGTTTTTAGGAAGAGTAAAGAGCAAATTGACTTAAGTTAAGGAATATGGTGCAAAAGAtgattaaaatgtgtaaaagagACTTTTTTCATGATAAATTAACTGAGCATTAAGGTAACCCAAAGAAACTTTGGCAGTCTTTGAAACAAATGGGGTTCAGTAATAGACTTAAGACAAAGTCAAATAATATTTGCCTTAATATTAATGGGGAGTTCTCTTCAAATCAACTAAAGGTTGCGGATAAATTTAACTCATTTTTTTACTACTATAGCTGGACACTTAGTTGAAAAATTACCAAGAAAACCAGGGTTATATGATGGTGAGGCCATGTCTAAGTATTACTCTAAGCTTGGAGTTGTAGCAGACTCTTTTTGCCTTTCTATGGTTTCACAGGATGAGGTATTAAAGTTATTGAATGAACTTAAGTGTTCGAAGGCAATTGGTCTAGATGAAATACCGGCCAGATTTTTAAAAGATGCTGCAGAATTTATTTCTCCATATCTCACTCATATTTTTAATCTTTCAATTATGTCAGGTAGATTTCCGAAAGATCTGAAGCTTGCTAGGGTTGTTCTGCTATATAAAAAAAGGGAACAAATTAGAAGAGGGTAATTATAGACCAATTTCGATTTTGGGAGTCGTTTCAAAAGTCTTGGAGAAAATATATAATTACATTAGTAATTCTgatttgttttatgatttgcaATCTGGTTTTAGAACATCTTATTCTACAGATAAGTGTTTATTATATCTAACAGACTATTTAAGAAGAGAGATCGATTTGGGTAAACTTTGTGGCATGGTATTGCTAGACCTCCAGAAAGCATTTGACACTGTTGACCATCAGATCTTGCTGATCAAACTAAAAGCCCTAGGTTTTAACAGTATGGCATGTAATTGGATTCGATCGTATTTGACTGAAAGGCATCAAAGAGTTGATATTAACTGCACTCTATCTGAGGCAAGAGAAATAACATGTGGGGTGCCACAGGGTAGTGTCCTGGGTCCATTGTTCTTTCTCTTGTATATCAACGATATGAAATCTGTTTGCAATTGTAATGTAGTGAATCATCTCTATGCGGATGATTCAGCCTTGGTGTTCTCCAATAAGGACATAAAAGTTATTGAGAATCATTTAAGTGATGAGTTACAAAATATAAGTGAATGGCTGATAGAAAACAAACTGTCTTTGCATTTGGGGAAAACTGAATCTATTTTATTTGGTTCTGAAATAAGGTTGAGTAGGACTCCTGAGCTTTAAATTTCTTTGGGTGGTATCCAGATTGAAGCTAAGAATTGTGTTAAATATTTGGGCTGTGATTTAGACAGTTCTGTGAGTGGAGAAAGTATGAGTCAAAAGGTTGTCAAAAAAGTGAACCAAAGAATAAAATTCCTGGCTCGTAAGGCTCAGTTTCTAAataaagaaactttaaaaatgttggcAAATGCTTTAATTCAGCCACACTTCGATTATGCCTGTACTACATGGTACAGTAGCACACCCAAGAGGATAAAAGTTCAACTTCAAACGGCACAGAATAAATTAGTCAGGTTGATTTTAAATCTCAACTATAGAGAACATATTGGCTCTTctgaaattaacaaaattaaaatggctgacagttgaaaaccaagggggtaagcttcgcttctgaacgcgaacctccgatggcgccattttgttgctacaaaggtatcac
>XM_039791125.1
TGTTTGACTGTCACTGAAATGGTAAGATGAAGCTGTCAGTGTTGTTGCTGCCGGCCCTGCTGGCTATTTCCTCTAGTGCTAGTCTGCAAGACATCGTGAAGAAGAGCTCACAGATCggaaaagTTCCAATTCTGAACCCAGATCTAGGGAACAGGATTCCTCAAATCACCACCAACGGATCTTTGTTGGCTCTTCCGCCCCCTGCTGAATTTGAGAACAGGCTGGGTCAATCTTCCTCCTTTGTGTTTGGTGACTCCAACCTGAAATGGCAGACCTCGTCTGGCTCTCTCCCGTCTGGTGCCGTTTCAATTTACAATGGATATGCCGATCGCACCGACTATGTCTGCAAATATGGGTGCTCATCTGGCTTCTACAACCCCAACTGGAGTGGTCATTACTGCTACTACCCCTTGTCAGGTAAAGAGCATCGTGCCAGCTCATTTGAGTTCCTGGTAAACAAAGACAACTTAGAATTTTTAGAATGGAAGGATGGCTCCTGGGGTTCAGTGCCTCGCAATGCAGTCTCCACATGCGGAGACACATATGTTGGGAAGAACAAATATGGCCTTGGGAAGGTGAGTGTTAAACACGAGGCCTTCTTCCTTCCCTGGAACGGTAAGGAGCATTGGTACAAGAGCTACCAGGTCCTGACCCTCAATAAAGAAATAAGCAGCGAGCGCATTTCCAATGTCAATTACAACACTAATGTTAAAGTCTTCCAGCATCCTCCAGAGACCATGACCAAGTCCATCATATCCAACAATGAGTGCAGCCCAGTTGTGAAAAGACTTGAGCTCTCAAAAACCTACATGGAGGAGAAAAGGTGGGACACCAGCACTGCCATCACGAGTGGGGTCAGTAGTAGCATCACCGCCAAAATCCCATTCATCGGCTCTGCAGGTATTGCGCTCAGTGTTgaaacaacaaagcaattcTCAAGAGGAACCACTGTGGTGGAGTCGAAAACCTACTCGGTCTCTGTGGAGCAAACTGTTCCACCAAACCACTCCTGCAGTGTCAGTATGGTGGGATATAAGTATAAGGCAGACATCCCCTACACAGCTCGCCTCAGCCGCACCTACAGAAATGGGAAGACGACATGGGTGTACATCACTGGGACCTACAAGGGAGTCGATGTTGGAGAAGTCCACTCTGTTGTGGATCGCTGTGAACCTATACCCAATTCCAAACCTTGTCCCTGAAAGAAAAATTTTATCTTAAGATATCTGACATAATCAATGTTAAATATTGGTGAAAATGATAAATGTACTATACTAATTCTAGTTATAATTGGCTGGGCAACAGGATAGGTTTTAGGAGTGGTGAAGAAGGAGTCCAGAAAGCTCCCCTGAGATGACATATCCAATGATTTCAGCAGAACACTGAAAAATGAGTAACTTTTCACCACAGAGAGCAGAGAACATAATATGGTAAAGGGCTTTTTCATGTTGAGCTTTATATTTTTCTCTGTTAAGTCCCAGTCAGTAATTTTTGGAACGTACTGTATATGTTGCAGTTATagtaaaaatacaatgatgatgagtttttgtttgttttattacaaaTGAATGTAGGCTTGCAATAAAATGATTTATATATGTAAGGAATTGTATTGTTACCTCTGTTTAATGATAAGAGGAAGTTAAGCCatagagcttttattgtgaaggggaAAGCAGAAGTGTGAAATGCTGTGATAAGTTTCCAttgattgtgtttttgattAATATCTGAACCGAGACAGCACTGCATGTCTTCTCTTTTATTAAAgcttgtgttttcattttatagtttcatagtatagtatataggtGACATACAAAACCCTTTGTTacatatgtgtgcatgtatgaggAAGCATTTTTCTGATTCTTgaatgattataataaatacagTGGCGAATCGGGTGATTTACTGATGTAAACAAACCTATCATCAGCAACAGAATACAATAACAACTTCATAGATTTAGTTTTTGTACACTGTTAGTCCATAACGGTCTTGTGAATCAAATTAAGCGCAACTGAAGACAATACACAGCCTCTTTTGGTTACTGAAGCATGAGGAGGAAGAGCTGTATGCACTGTGAAGGGGATCAAGCCTTTGCTGTTGTGGAACAGCATCGCTGTAAGACGTGCCCCCACAATTTAATTTTAATCCCACCACAAAGGCAATTTTAGGCTTTTGGACCTGCAGTGTGTGTTTCTTCTGTGATGCTTGTTTTCTCACATGTGATTTTTAGGCTTTTTAGAAAAGAAGGGATATACACCATTCATATGGACGCTTCGATCAGTGATatagaaattgaaattgaaaattatgttgttttaagaaaagatagaaatcGTAATGGGGGAGGAGTATGTGTTTATATTACGGCTGATATTTGTTTTAACCGCAGAATGGATTTAAATCATGATCTTATTGAAGCTGTGTGGTTTGATGTACAGTTAACTAAAAGTAAGCCTATTTTAATTGGGGCTCTGTATAGACCTTGTATGATCCATGTAGTGATTTTAAGGGTGAGGTTATAATGAtaggtgattttaatactgATGTTTCTAACAAAAATCATGGGATGTATAAAGCCTTTAATAGGTTTTGTCAGGTTCTGGATCTACAGCAAATAATTAAAGAGCCCACACGAGTAGCTAAAATGAGTCAAACGGTCATTGATCTCATTTTGGTATCAGAGCAATCTATGATTTCTCAGAGTGGGGTTGTAAATTGTACTATAAGTGCCCActcattaatttatttttcaaggaaaaaatttaaagttgcattgaagaaacaaaacacaattaagatcaggtcattaaaaaaacatagtCGTGAGGTTTTTATTGAGTGTTTTAAATCACTGAATTGTCCTCTAGTGTTATGTTTGGATGTTGATGAGGCATGGGAGCAGTTTAAACATTTGTTCTTAGAGGCATTAGATAAAGTTGCTCCTATAAAAACGATTCGAGTAAAACTGAGGTCAGAGCCATGGATGAATGATGATATTTTAGAAGCAATTACTAATAGAAATAAAGCCTTTTCTGTTTTTAGGAAGAGTAAAGAGCAAATTGACTTAAGTTAAGGAATATGGTGCAAAAGAtgattaaaatgtgtaaaagagACTTTTTTCATGATAAATTAACTGAGCATTAAGGTAACCCAAAGAAACTTTGGCAGTCTTTGAAACAAATGGGGTTCAGTAATAGACTTAAGACAAAGTCAAATAATATTTGCCTTAATATTAATGGGGAGTTCTCTTCAAATCAACTAAAGGTTGCGGATAAATTTAACTCATTTTTTTACTACTATAGCTGGACACTTAGTTGAAAAATTACCAAGAAAACCAGGGTTATATGATGGTGAGGCCATGTCTAAGTATTACTCTAAGCTTGGAGTTGTAGCAGACTCTTTTTGCCTTTCTATGGTTTCACAGGATGAGGTATTAAAGTTATTGAATGAACTTAAGTGTTCGAAGGCAATTGGTCTAGATGAAATACCGGCCAGATTTTTAAAAGATGCTGCAGAATTTATTTCTCCATATCTCACTCATATTTTTAATCTTTCAATTATGTCAGGTAGATTTCCGAAAGATCTGAAGCTTGCTAGGGTTGTTCTGCTATATAAAAAAAGGGAACAAATTAGAAGAGGGTAATTATAGACCAATTTCGATTTTGGGAGTCGTTTCAAAAGTCTTGGAGAAAATATATAATTACATTAGTAATTCTgatttgttttatgatttgcaATCTGGTTTTAGAACATCTTATTCTACAGATAAGTGTTTATTATATCTAACAGACTATTTAAGAAGAGAGATCGATTTGGGTAAACTTTGTGGCATGGTATTGCTAGACCTCCAGAAAGCATTTGACACTGTTGACCATCAGATCTTGCTGATCAAACTAAAAGCCCTAGGTTTTAACAGTATGGCATGTAATTGGATTCGATCGTATTTGACTGAAAGGCATCAAAGAGTTGATATTAACTGCACTCTATCTGAGGCAAGAGAAATAACATGTGGGGTGCCACAGGGTAGTGTCCTGGGTCCATTGTTCTTTCTCTTGTATATCAACGATATGAAATCTGTTTGCAATTGTAATGTAGTGAATCATCTCTATGCGGATGATTCAGCCTTGGTGTTCTCCAATAAGGACATAAAAGTTATTGAGAATCATTTAAGTGATGAGTTACAAAATATAAGTGAATGGCTGATAGAAAACAAACTGTCTTTGCATTTGGGGAAAACTGAATCTATTTTATTTGGTTCTGAAATAAGGTTGAGTAGGACTCCTGAGCTTTAAATTTCTTTGGGTGGTATCCAGATTGAAGCTAAGAATTGTGTTAAATATTTGGGCTGTGATTTAGACAGTTCTGTGAGTGGAGAAAGTATGAGTCAAAAGGTTGTCAAAAAAGTGAACCAAAGAATAAAATTCCTGGCTCGTAAGGCTCAGTTTCTAAataaagaaactttaaaaatgttggcAAATGCTTTAATTCAGCCACACTTCGATTATGCCTGTACTACATGGTACAGTAGCACACCCAAGAGGATAAAAGTTCAACTTCAAACGGCACAGAATAAATTAGTCAGGTTGATTTTAAATCTCAACTATAGAGAACATATTGGCTCTTctgaaattaacaaaattaaaatggctgacagttgaaaaccaagggggtaagcttcgcttctgaacgcgaacctccgatggcgccattttgttgctacaaaggtatcac

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_039791124.1 True 4763 mRNA 0.38 3 29090957 29099400
XM_039791125.1 False 4743 mRNA 0.38 3 29090982 29099400

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
trnag-gcc_23 NA coding upstream 231893 28858994 ~ 28859064 (+)
trnag-gcc_22 NA coding upstream 232234 28858653 ~ 28858723 (+)
trnag-gcc_21 NA coding upstream 232918 28857969 ~ 28858039 (+)
trnag-acc_1 NA coding upstream 234278 28856609 ~ 28856679 (+)
trnac-gca_37 NA coding upstream 234619 28856268 ~ 28856338 (+)
G231203 NA non-coding upstream 14513 29076114 ~ 29076444 (+)
G231199 NA non-coding upstream 20493 29068330 ~ 29070464 (+)
LOC120553838 NA non-coding upstream 25189 29065653 ~ 29065768 (+)
LOC120553822 NA non-coding upstream 25711 29065051 ~ 29065246 (+)
LOC120553842 NA non-coding upstream 26189 29064654 ~ 29064768 (+)
G231160 NA other upstream 98764 28986322 ~ 28992193 (+)
G231113 NA other upstream 445420 28645036 ~ 28645537 (+)
LOC120553776 NA other upstream 460945 28612555 ~ 28630012 (+)
LOC120553833 NA other upstream 589538 28501234 ~ 28501419 (+)
trnak-uuu_24 NA other upstream 619779 28471106 ~ 28471178 (+)

Expression


Co-expression Network