rassf3 (rassf3,LOC102298244,LOC102210289,LOC103364097,LOC106956171,LOC103129390)
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GAATGAAGAGTTGATATATGACACCTGGTATGTATTCAGATATCTTGTTTTAAGGCTGTTCAATCGTGACAAAATATTCACATGGTTTATCGTATCTAGTTTCTCCAACAATTGTCATGTTACACCACGTAATGCTGATTGTTTAATTGCTGATGAGATGTGGTTGAAAGTTTTGGGAAAACAAGTTTAGTAGTTTGCTTCCTAGAGTTTCTTTTATACATTCAGTTTTGACTGGAGCTTCAACAATTAGTCGAGTCGATCATAAGACAGATATTCTGAGACTATTTTGATCGTTTATCAAGTAAAAATATATGCCAAACCTGCTtctgttccagcttctcaaatgtgaggactcgcttctttcttttgttttatatgTTGACAAACTGAATATCGTTGTCCGCACAAAACAACCAGTTTTTAATATGTTGTCGTTGGCTCTGGGGAGTAATTATTGgcattttctgctgttttcttacgTTTGAGAGTGCCCcaaaatgtttaattaaagatatttaataagattatcttttttaacaaaactaTTTTTGTGCATCCCAAAATATTTAGATGTTGTCAGTGAATATAAAGTGGACATATCAGCATTAAGTGGTGTAAAAGGACAATTGGAATTATACTCGATACAagaatatttatttactttgttgTGGTTTTATAAATCGCACATTTAGATGgcagctgttctggagcttttgatCATTTTACATGATCTTCATCACCAAATGGAACTTTAGAAAATCTAGTTTACATTTTTTCTGAGCACTTGAACTGTAAGTTCTTTTCATCCAAAGCTGAGGTTCAAAGTTTATTCATATTCTTGGAAACTTATGTCGTGATCATTTCATAtgattgaaagctccagaacggCCACTACTAAATGGGCCTTGTGGGGAGTTTTCTCAGCAGCTCCTAAATTATATATCTGACCTATCAGCTTAAAGTTCCGAGCAGTTTCTAGGCTCTTAAGATCTTCTGTTTTGTGCGATATGTGTTTAGTTTGAACATCCAGAGACTGTAATGTCAAATGCCAAAGATCTGTGTATAGCTCTTCTGccatttattgatattttttccaATTATGCTGTTTTTTGTTGATTATATAGAGAACAGATCAGGTGTATCTCACATGATGAGATCCTCGTAAGCATCCGAGCTCAGAAACACAAAGttctctgtttgttttacacacaaaaaaaggtcACAGGTTTTAATTTCAGACCTGAGCTGCATAATCCAAAATGATTGTCGTGTTTAGAATCAAAAGAGAGGATGAAAAGAAGATGCTTCATAATGACACATTATCCTTTTTTCTGTCAATCTGTCTACTCACAATTCAAGTCAATGGAAGCTATATATTTTAGTGCAAGATTTAGTTGAAGTTTGGCCTTTGAGCTCAGGTCTGAAAGCTCTGACCGCCGCAGTGccttttttaaagtttgaaagaaaaacaaagctgTAGGAGGAACAGAGGGTTTCATCACATCTTGCTTTTTGTTGCAGTTCTCTCTGCAGGCGAAAGCAGTTAACTTGAGGCAGGTTTATTTTTGTCGGTATCTTGTGGTTTCTCTTTAAATCGTTACCAAATGTGGCCTTTCCTCAACACAAGGCAGGCTGCAGCTATTAAAggtgaaattaaaacaaaa
Function
symbol |
description |
rassf3
|
Predicted to be involved in signal transduction. Predicted to act upstream of or within regulation of apoptotic process. Predicted to be active in cytoplasm. Orthologous to human RASSF3 (Ras association domain family member 3).
|
NR:
description |
PREDICTED: ras association domain-containing protein 3 isoform X3 |
GO:
id |
name |
namespace |
GO:0007165
|
signal transduction |
biological_process |
KEGG:
id |
description |
K09852
|
RASSF3; Ras association domain-containing protein 3 |
RNA
RNA id |
representative |
length |
rna type |
GC content |
exon number |
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end site |
XM_039791563.1 |
True |
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False |
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mRNA |
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7 |
6747501 |
6814839 |
XM_039791565.1 |
False |
6664 |
mRNA |
0.38 |
6 |
6747501 |
6788402 |
Neighbor
gene id |
symbol |
gene type |
direction |
distance |
location |
zgc:194209 |
LOC103375033,LOC102787798,LOC102205194,LOC101467670
|
coding |
downstream |
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|
coding |
downstream |
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tmem110l |
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|
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downstream |
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itih2 |
itih2
|
coding |
downstream |
213840 |
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atp5c1
|
coding |
downstream |
234333 |
6506578 ~ 6513168 (-) |
LOC120553692 |
NA
|
coding |
upstream |
616 |
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dgki |
NA
|
coding |
upstream |
16235 |
6840140 ~ 6920612 (-) |
creb3l2 |
creb3l2
|
coding |
upstream |
102406 |
6926311 ~ 6962094 (-) |
ssbp1 |
ssbp1,LOC102786007
|
coding |
upstream |
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6963276 ~ 6974561 (-) |
c23h12orf56 |
NA
|
coding |
upstream |
207307 |
7031212 ~ 7048093 (-) |
G226199 |
NA
|
non-coding |
downstream |
12231 |
6732438 ~ 6735270 (-) |
LOC120553101 |
NA
|
non-coding |
downstream |
58679 |
6634650 ~ 6688822 (-) |
G226113 |
NA
|
non-coding |
downstream |
305177 |
6442038 ~ 6442324 (-) |
G226083 |
NA
|
non-coding |
downstream |
913287 |
5833734 ~ 5834214 (-) |
G226074 |
NA
|
non-coding |
downstream |
1193086 |
5553966 ~ 5554415 (-) |
G226216 |
NA
|
non-coding |
upstream |
100126 |
6924031 ~ 6926245 (-) |
G226244 |
NA
|
non-coding |
upstream |
204843 |
7028748 ~ 7028958 (-) |
G226259 |
NA
|
non-coding |
upstream |
240720 |
7064625 ~ 7072997 (-) |
G226273 |
NA
|
non-coding |
upstream |
278033 |
7101938 ~ 7107207 (-) |
LOC120553545 |
NA
|
non-coding |
upstream |
278607 |
7102512 ~ 7105702 (-) |
G226200 |
gns
|
other |
downstream |
16719 |
6730307 ~ 6730782 (-) |
LOC120553807 |
LOC104934913
|
other |
downstream |
1484449 |
5242890 ~ 5263052 (-) |
cpm |
cpm,LOC106925010
|
other |
downstream |
1964742 |
4756921 ~ 4782759 (-) |
LOC120553649 |
NA
|
other |
downstream |
2207704 |
4529987 ~ 4539797 (-) |
G225751 |
NA
|
other |
downstream |
2696310 |
4047316 ~ 4051191 (-) |
tmem243b |
tmem243
|
other |
upstream |
249988 |
7073893 ~ 7086322 (-) |
meig1 |
meig1
|
other |
upstream |
263039 |
7086944 ~ 7089168 (-) |
usp44 |
usp44,LOC102783730
|
other |
upstream |
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7269037 ~ 7278324 (-) |
LOC120553151 |
LOC107386793,LOC104950937
|
other |
upstream |
598260 |
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G226495 |
LOC103356655,LOC105934024
|
other |
upstream |
1064666 |
7888571 ~ 7891311 (-) |
Expression