G236394


Basic Information

Item Value
gene id G236394
gene name NA
gene type unknown
species eurasian perch (Perca fluviatilis)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_053135.1
NCBI id CM020932.1
chromosome length 21835524
location 20912655 ~ 20916777 (+)
genome version GENO_Pfluv_1.0_2020_eurasian_perch_Genome

Sequence

>TU320732
TCCCATCATGAAGGGCAATTTATTTGAgaagcttgcacacacacacacaaacacaaaaaaatctatcGTATCTAATAGACAACAGTCTCCGTcggtaggattaacagatagaatgccttctcctaaagctaaaaaccctgTTCGCAGCGGTGGAAGCCCGGTGCTCGGGAGCTCCACGGgccgctacgagttcatgtcgctgaccaagccgttGAACCGGTCCTCACTGTCGCATCTCCTCCAGCGGCTCGCATCCGAGCATCGGAGAGCCCCACTCGGTGccgtgtgtacgtgtgtgtgtatgtgttgtaataggagagagaaaatgggagaaggaagtttgtgtgaggtagacctggtcaccacagacccaaatcttctcagctgttgctactgtcatatgctgcactgtctcttcatgtgacacattatgtttggcacattgtatgggtaaCTTCTTATAACATAACAAGGTAATataatgtgtaatcaagtgatgactgattaacagtaatgcaaatgccctaatacctgttgatactacaacaatgcagagtataggctcttaaccttgcagttttgcacatatcatgtaagactcaatttctccatttctttgcacaaaactctccagaaagtgccatttaacggtttatttttcaatttttttcccgggggtccccggacccccctagggagAGCCCCTCCACATAACTAattccaatttaacccctgcttgCATGCATGTATAAATCATCATCCGTAATATATTGTGCTAGTACTAGTATTGAactacaagcagcaagacagttgcaagcctttaattagagttctgtaaagcttttgatgggacagttaggtcctAGAGATGTGGTGACAAAAGCTGCGCAGAGGGGGCCCAATTGGACTTTTTGTCATGGGGCCCAAAATTCCTGGCGGCGCCCCTGTGCTTATCTCATTTATCATCTGGCTGATAAAGGAACAAGGTTTGTCAGTGTTTACTCTTATATCGTTTGTATTGTCAGTCACTTTATGATATACCGTTTAAGAGTTTTACGGACTTGGAGATGAGTATGTGCAAGTAAAGCTAGCATGTCAACATATTTCAGCCTGCAGTTAATTACCAGGCTAATGAGCCTGTTTAGCTACATGAAACGGTGTAGCTAACTTGAGAGATAGAAATGCAATTACTACGgtatattggatgtgaaaaaaGTTCAAAGGAgaatcattttaatattgtaCTAGGCTTTTTATTTAGGTTGATTTCTGCATAGAAAGTGAATAAACCATCCAACCATGAAGACCATCTTTCAGCCGGGGAGGCTACACTATGACAATGATTATTTATGGTgcataatatactgtaatttATATAAACAAACATGTGAATGCTGTGATTGCTGGCTGTCAGATTCATCAATGAATTAATATTCTGGACACTATCTAGATAATGAATAATCATGATCGTCAAGGCAGCTCACCACTCACTAGGTAGAGTGTGTACCATTAAGGCTGCCCTAtcatgttttgttgtcatttgtaCAATATGTGTAAAGATTTGATGTTGATAGTGAACAATCAATTCTTGCGTCTGTAGCTTTTGCatgcatttaaaagaaattaataTATCCCACTTGGTTTGTTAGGTTTCAAGAGAGGAAAACTATCCAGAAGACATGACAGTGAAGATGACGAGAGCGCGACAATTTCCAATGTAATCTCCATACAGGATTTAAACTGTTATAGCTCTGAGTCTCAGTGGAAAGAAATATGAGAACTGACTCAGAATCAAATGAAAACcgtgtttacattttgaatatgtgtgtgcataacAGAAGGTTGTTGTGATTTGATTTCACATTGACATTGTTTCACTAATGTTTAAAAGCTGTGTGGACGTTTAAGTCAAAGAGTATTAATAAACTATGAATCATTGTTTAGTAATGATTATTCAGCACTCTTATGCATTTATCAAGTGtaagttaaggtgcatatgttcttaACTTTACAGTAAGTCTATCAAAGAGCATTCATAActgtttagttatggtttagtTAGGCTTGTTCAGTATTGTTATACATTAATTAAGTGTTATTTAAGGTGTATATATTctctactttacaataagtctaccaaagagcattactaactgtttagttatggtttagtCAGGCTTGTTCAGTATTGTTAAATACTAAattaagtgttagttaaggtgcatatgctctcaactttacaataagtctaccaaagagcatttATAACTGTTTAGTGATGGTTTAGTAAGGCTTATTCAatattgttacacattaattaagtgttagttaaggtgcatatgttctctactttacaaaaagtctaccaaagagcattaataactgtttattgaTGGTTAGGTAAAGCTTGTTCAGCattgttacacattaattaagtaTTAATAAAAgtgcatatgttctccactttacaataagtctaccaaagagcattaataactgtttattgatggtttattaaggcttattcagtattgttacaaattaattaagtgttagttaaggtgcatatgttctctactttacaataagtctaccaaagaggattaataactgtttattgaTGGTTAGTGAGGCTTGTTCAGCATTGTTACACGTTAATTAAGTGACCATTTAAGGTTAAGTAATGCTTATATAGCATGCACAAGGTTAATGTCTATATGAAGACCAAGGAAAAAGCAAATCTCTGCATGGAGACTATGGAGTATTTTCCCTGATCTCACCCTCTACCAAAAGTAAGTCATATGTTGGAGGATGGACAAATATAGTGGACAAAGGTATGTGAAAAACCATGACccgtaaataaacaataaaaaaaagttttctcaTAATGACATGGCTTGGCCATGAACCTCAAGACACACATGCTATCAAAAATCTTCATCACCCACCTAGTAATATTAGGAAATACCTTCATCAACATCAACTAAGGCTTTACTTAGACACTTTAGTTAGCTTTTATTTCCAGTTCAGGCTTTTTAGTACATTACCTAATGTCAAAATatacaccttagttaactgttattaacagttggtcaaggcttgttactgcattaactaatggttAAATAGACACCTCagttaactgttattaacagttaTTCAAGGCTTATTATTCCATTTACTAATGATATAATAGACACCttaattaactgtttttaaccctcatgccctccttaaaaaaacttactctcgacaccttcgaggcaaaaatgtccacgcacacaaaaactgttattaaatcatcatatatcaatatttgtttctgcttttttttcataaatcacttaaacaacttgtaacctaatcaaaactaccaaacattcaatcattttcaggattttaaccctttaaatgccagtttatgtatttgaagtatttcattttttattacaaaaaacacaaaaaattattttttttcccagataatgaataatatctagatggggctttggtggtgattagaggcttggatatgtcaaagataagcaacaaaattaatttgattgcattagtattttttacatagttccagatactccctttggacaccttcgaggcaaaaatgtacatgtccaaaaaactgatattaaatcatcatatatcaatatttttttctgcttttttttcataaatcacttaaacaacttgtaaattgctcaaaactaccaaaagtttaataattttctggattttaaccctttaaatgccagttttaaatctt

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU320732 True 3781 TUCP 0.35 3 20912655 20916777

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
ebpl NA coding upstream 22903 20887969 ~ 20889752 (+)
LOC120554009 NA coding upstream 205120 20706392 ~ 20707535 (+)
LOC120554008 NA coding upstream 218044 20692960 ~ 20694611 (+)
LOC120554612 rcan1,LOC103389732 coding upstream 432329 20459974 ~ 20480326 (+)
gyg2 NA coding upstream 493537 20409012 ~ 20419118 (+)
eef1b2 eef1b2,LOC102792575 coding downstream 35375 20952152 ~ 20956272 (+)
LOC120554650 NA coding downstream 95717 21012494 ~ 21026525 (+)
LOC120554642 NA coding downstream 110275 21027052 ~ 21047316 (+)
LOC120554645 NA coding downstream 132737 21049514 ~ 21063917 (+)
LOC120554651 NA coding downstream 181806 21098583 ~ 21120770 (+)
G236359 NA non-coding upstream 33685 20878290 ~ 20878970 (+)
G236378 NA non-coding upstream 39042 20870666 ~ 20873613 (+)
G236379 NA non-coding upstream 39525 20870846 ~ 20873130 (+)
G236364 NA non-coding upstream 41045 20800848 ~ 20871610 (+)
G236377 NA non-coding upstream 44854 20866678 ~ 20867801 (+)
G236405 NA non-coding downstream 45811 20962588 ~ 20965747 (+)
G236407 NA non-coding downstream 49619 20966396 ~ 20967733 (+)
G236413 NA non-coding downstream 63789 20980566 ~ 20988411 (+)
G236440 NA non-coding downstream 235636 21152413 ~ 21233973 (+)
G236446 NA non-coding downstream 276826 21193603 ~ 21247124 (+)
cavin2b NA other upstream 25286 20845648 ~ 20887369 (+)
fmnl2b LOC101465085,LOC102790854,LOC102292591,LOC106517599,LOC100693318 other upstream 70877 20769476 ~ 20841778 (+)
LOC120554627 runx1,LOC104961881 other upstream 276733 20595095 ~ 20635922 (+)
LOC120554724 plcd4,LOC103363317 other upstream 401579 20487667 ~ 20511076 (+)
cd99 NA other upstream 506329 20383318 ~ 20406326 (+)
zdbf2 NA other downstream 40172 20956949 ~ 20964585 (+)
LOC120554011 cd59,LOC102793758,LOC101486506,LOC100705993,LOC104934006,LOC103366567 other downstream 59295 20976072 ~ 21077796 (+)
G236467 NA other downstream 385549 21302326 ~ 21361235 (+)
G236461 LOC102792843 other downstream 491150 21407927 ~ 21422915 (+)
G236459 LOC103360213,LOC106936810,LOC103477369,LOC103473932,LOC106933094,LOC107835021,LOC108249964,LOC107380983,LOC108250351,LOC108242155,LOC108250349,LOC108229490 other downstream 507508 21424285 ~ 21634001 (+)

Expression


Co-expression Network