G236587


Basic Information

Item Value
gene id G236587
gene name NA
gene type non-coding
species eurasian perch (Perca fluviatilis)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_053135.1
NCBI id CM020932.1
chromosome length 21835524
location 21625938 ~ 21631196 (-)
genome version GENO_Pfluv_1.0_2020_eurasian_perch_Genome

Sequence

>TU321021
CTGATGtataacgtgttattagtgtttactttagctaacggtaggctaacgttacctgctgtctaatgtgttattagtgttaactGTAGCTTACTgtgggctaacgttacctgctgtaacgtgttattagtgtttactgtagctaacggtaggctaacgttacctgctgtctaatgtgttattagtgttaactGTAGCTTacttaggctaacgttacctgctgtgtaacggttattagtgtttactgtagctaacggtaggctaacgtttccTGCTTTCtaatgtgttattagtgttaactGTAGCTAACGgtgggctaacgttacctgctgtgtaacgtgttattagtgtttactgtagctaacggtgggctaacgctacctgctgtgtaacgtgttattagtgttaactGTAGCTAacgataggctaacgttacctgctgtgtaacgtgttgttagtgtttactgtagctaacggtaggctaacgttacctgctgtctaatgtgttattagtgttaactctagctaacggtaggttaataaaataaaaattgtgaaTCTGCTGttgcaaccatagactgtataataggTTGTAACACTTGATTTAAGGGACTGTATTGTTGGCTAACTTGCGAGTTAACATTAATAGTTGTTATTAAGAGAAATTAGTTTCTAATAGAGATGGGCGGATGATTTGTCTGATGATTTGTCATGTACACAGAGGGATGGGAGGGGCACTCGTAAAACCGAAACACAAAGCTTGTATCAAATGCTAAGTTATCTCAGGGCATGTTTTACAGCTAATCTCGGCACATAGTGGGATAAGAAGAGAGATTAATTGAGAAATATAGTGATAAAGAAGATCAGAAAGACATGAGAAAGTTTATTTCCTCCTCCTGATGACAACAATTCCAAGTACAGATGCATCAATATCACTGGAAAAGTGATTTGTTTTCCCCCcatactttaatttaaaaagtaaatcTTTAATATATTCTATTCAttacataaaaagtaaaatatttcaagCCTTTTATTGCTTTAATCTTGATGATAAGGGCTTACAGCTCATGTAAATCCAAACTCCAGTACAAATGTATTAGAATTTTAtaacaaataattttttatacGACCTGACAAGATCTCTAATCAGCTAAAAAATGTCCCCTAAAAAGGTGTTAGGTTTGTTTGATTATTAGTTGTATGTTTTGCCTCTGATTGATTTGTGCTTATCATTTCTTGCAGGATTATCAGAAGTGCTGTCGCTCTTCTTCCACTCGACACCATCACTACCCTCCTCACCTGGCCTTCATCCTCACCTGTATTGCTTTCTTTCTAAGTTTCTATTTGACCTGTTAAGGATACGTTTTGTATAAATTGAAATGTATGAATTAATAAATGGTTCTTGTTTTAAAAcagatttttattgttttattataatacattattattacttgTGTATTGTTTAAAAATACACGATAAACCTTGTTGGGCAGTTAAAGCTTCAATTGttcttttttccatttcatgGATTCTGATGTAGCAAATTTAACAGCTAAGCACAAACTAAACAGAACTGAACTCTTGAGATTAGTAACGATGTTTACACCAAATTCCAATTTTACCTACGTAGGCTAACTTAAAAATAGTCAGATAATGGTTGCCTCTTTTTAGTTGCCAGGGTTGAAAATGAGTCATCCTTAAaatttttggtgttttggatTCACTACAGCTGGAGAACCATTAAATACAAAATAGGTTGTAGGCTCTActgggtttttgtttttactgagTAACTATCATCATTTTCCCAGATAGTGTATAGAATTTTAGGCCTTCTATTATCTCAAACAGCCTGAAAAATAGTGCATTTAGCTGACGTAATTGGGAATAAAATCTCCACtgggggagcatgcccccggacccccctaggtTTGGGCTAAACCCCGAATGTTTATTGAGAATGAGGACATACGTCACGATTTGGGAGGTGTCTCAGCCCGTCCACCATTTTGGGATCCTACACTATCGGTTGCCAGGGGCAACAGTGTGAGAGCGACATAGACACGGAGCTGGAAAGACGGCTCAAGGAATTATCATTAAGGCGtcttgttctcttaatacatccatggtttaaaCAGAGAAATTACGAGAAAATTAAGAAGAAGGCAGCGAAAGAAAAGGGCCCTTACAGGGACaaactgataggaacaacaacctctgaaactggtccagtatatTAATCAGTtagtgtccactaaaagttcagtttttgccgctgacagactcagattattattctaagtgggtgacaacattatggaaatatTGCTACcaatacaaacaatgaacggGTCTGGCGGGTAGCCTCCCAAAATGGCGGaggggggcggtgacaaaagtcagctctcaagtcggacagttttccagctgattccagcagcattcaggctgaacaggaagtgacacaaacactgtggtccgattccgatttaataaattGTTATCAGTcccctatatcagctcctacggagtctccagttgattttattatgacagagtagctgtcaaaatgctctacatgtgatctgttgctgatttaaattaccaacagactgtagatgatcagtaatctgaacagatttagtctctctgacttctaacaTAACCATtagcctcacaacatgtgttctgttcagaataagcctttaaatcagacaaatagcagttaaaatcaaataaaaagcttatataaaacgtcatcatgttgagtcgattctgaaccaatcagctgttataTCAGATGAGAtcccggcgtttcccagcatgcagtgGGTCCACCTTTGGTTgatgaaaagcaactgcgctacctgcgtctcagaattGCGGCcaccttggtctcgtgagattatcgttgcccacgtgtgcacgacgtcagagcaagtcaggatcaagtcggacacaaatctacccagcatgcatcGGGCGGCGATCAATTCTGCGcaatctggctcatctcgaacgagcctgatatcgtctggctccgcccctgctGCATAGTATCCTTCAACAggggaggaatgtagcacaatatggatgtaaaagcagttataatttgttaggcctgctgctgctgctgcatggcagctctctgtctctgctctccccctcccctctgtccTTAGTTGCAGGAgtggagtctggtgtggggGAGTCAGGGTTCCAGCTGCAGCTCATCAACACTAACCACCTCTCCTACTAATACCTGGTCAACCTACCACTCCTCATCGGATCATAGTCAAgactagggatgggcgataccACACTTTTAGGATTCGATACGATACAGATACTTTTTCTTGCATTTTCATCGATACCGATACCGTTAATTTCTTATTGGCAATTTTTGTCAGtaaaaatattattacatttaagaCAAATCACAAGACAAATACGGACCatttatacaaaatgtattatggtcaatacatattaaaatttaaattaaagtaaataacataaatatgaatgaaataaattaaatatgaacaaaaacatacatattttcacttttcttatttctcaaaaaaagaaaaaatactaatCTTGGTAGAAAAAgctaaaaggaagaaaaaaaaactaatacatCATAATGTTATGTTTTGAACCTCTTTATAGAAGTAAACATGTAACACTTCACTGAAGCAAAAACAAGAGGTCATAAAGATCAGAATAAACTAGGATTTCCTTATCCTATAAACCTGCATAAGAAAGACAGTTGTTCCCTGAGAAAATGAACTTGGCTGTGTCGCACGCATTGGGTCGCACGTTGACGCTCATTTGCTCGTCTCCTGTCACGTGACATGGGCCAGCTCAATACGCCGCCAGGTACAGGGGTGTCACGGCACATAGTCATTTAAGTAAGTAATCTAAAACAGCTGAAAGTGATGCATACACCcccaattattatttttttgtttatatcgatactTTTTTAAGGAAATCAATGCCAAATGAGTAGCGTGAGTATATCGATCTATCGATACCACAGGATCGATACGCCCATCCCTAGTCACACACGTTGGTCTTGCTGCTGACTGTTTTTGCTTTCCCTGATTTGTTCTCTTTTGCCACAGTTCTTGGAACCTGACTCCTGCTGCCACTCCACTCCTGCCATCCACCATTTCTGCTCTCTCACTGGATCTCTGGACTATTGGGACGGACACTTGGACATTACGGTACCACTCCTGCTCTGTAACCTGGATCTGGAATCCATTGGATTCGGACTTTGTTTTTCCCCTGTTGCATTCATGAACTTGGACATTTGCTAATAAACCTGTTAGACGTTCATCTGACTCTGCATTAACGTCTGCACCTGGGTTCAACTGTAGTTTCACACGTAACATAATTagcctatactgtatgtgacaatactttttttgtggttaaaatcaacaaataatcgtgattatcattttggcgaTGTGCGACGtaaagttacatttttcaagaggTGCGCGTCAGCTATGCCGTCTATTTTAGGTACGACCATAAAATGGCCTTTAGTGTCCTGCAGGAACTTCTTCATCTTCACAGGGGCAACAACAGGCCTGATGCCCGGCTGACAACCAAACTACCCGAACAAAACCCACCACCAACTAACAACTACACAACTAAATGAACACATACAAACCCCAAATACACAGAAACAATCAAACAAAGATAGAAACTCACACGCTCCTTAGACTCACTCCGTACCAACATTCATGCATTCGCtcagataaagagagagagagagtgagagagcgagagagcgagagagagcgagagagagagattatctACAGCAGTGGGGGCCATGTATTTTACACCTGGGCCTTCAGTACTATCCTCCAGTTATTAAATCACCTTTGAATAACCTCACCATGACACTAGGACATTACCGTGTGGAATAACGTGATTTCACACCTAGAGACACTAATACACTACTGCagagtagg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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU321021 True 5207 lncRNA 0.40 2 21625938 21631196

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC120554641 LOC103473932 coding downstream 476575 21126894 ~ 21149363 (-)
dytn NA coding downstream 550683 20965938 ~ 21075255 (-)
ftcd ftcd coding downstream 622669 20990890 ~ 21003269 (-)
vps16 vps16 coding downstream 758138 20853565 ~ 20867800 (-)
LOC120554361 NA coding downstream 823668 20794346 ~ 20802270 (-)
LOC120554016 NA coding upstream 20770 21651966 ~ 21691088 (-)
LOC120554648 NA coding upstream 69509 21700705 ~ 21725016 (-)
G236743 NA non-coding downstream 2482 21622498 ~ 21623456 (-)
G236595 NA non-coding downstream 3730 21608780 ~ 21622208 (-)
G236740 NA non-coding downstream 8367 21607435 ~ 21617571 (-)
LOC120554670 NA non-coding downstream 66898 21557632 ~ 21559040 (-)
LOC120554671 NA non-coding downstream 111868 21501548 ~ 21514070 (-)
G236593 NA non-coding upstream 222 21631418 ~ 21633112 (-)
G236574 NA non-coding upstream 5037 21636233 ~ 21639876 (-)
G236747 NA non-coding upstream 7081 21638277 ~ 21640732 (-)
G236594 NA non-coding upstream 12661 21643857 ~ 21667774 (-)
G236750 NA non-coding upstream 13269 21644465 ~ 21645608 (-)
LOC120554014 NA other downstream 68917 21300281 ~ 21557021 (-)
LOC120554013 LOC103366577 other downstream 383761 21200996 ~ 21242177 (-)
arl11 NA other downstream 674073 20940988 ~ 20951865 (-)
LOC120554644 NA other downstream 705440 20892914 ~ 20920498 (-)
G236646 NA other downstream 762627 20862680 ~ 20863311 (-)
LOC120554015 NA other upstream 3652 21634848 ~ 21651918 (-)
G236611 NA other upstream 42496 21673692 ~ 21674838 (-)

Expression


Co-expression Network