G236593



Basic Information


Item Value
gene id G236593
gene name NA
gene type non-coding
species eurasian perch (Perca fluviatilis)
category of species economic fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_053135.1
NCBI id CM020932.1
chromosome length 21835524
location 21631418 ~ 21633112 (-)
genome version GENO_Pfluv_1.0_2020_eurasian_perch_Genome

Sequence


>TU321027
agagagagagagagaaaaagagagagaaagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagaaagagatggagggaggccGTTTAACAGTTGTGTACGCCTTGGTGcactggggtgtgtgtgtgtctagtgttAACTGTAGCTAACGGTGGGCTAACTTTATCTGATGTGTAAGgtgttattagtgttaactgtagctaacggtaggctaacgttacctgctgtgtaacgtgttaatAGTTTTTagtgtagctaacggtaggctaactttATCTgatgtgtaacgtgttattagtgttaactGTAACTAacgataggctaacgttacctgctgtgtaacgtgttattagtgtttgctgtagctaacggtgggctaacgttacctgctgtgtaacgtgttattagtgtttactataGCTAACAgtgggctaacgttacctgctgtgtaacgtgttattagtgtttactgtagctaacggtgggctaacgttacctgctgtgtaacgtgttattattGTTAACTGTAGCTAacgataggctaacgttacctgctgtgtaacgtcttattagtgtttactgtagctaacggtaggctaacgttacctgcggtctaatgtgttattagtgttaactGTAGCTAACGGTGGGCTAACTTTATCTgatgtgtaacgtgttattagtgttaactGTAGCTAAAGGTGGGCTAACTTTATCTGATGTGTAAGgtgttattagtgttaactgtagctaacggtaggctaacattacctgctctGTAACGTGTTAATAGTTTTTagtgtagctaacggtaggctaactttATCTgatgtgtaacgtgttattagcgTTAACTGTAgataacggtaggctaactttATCTgatgtgtaacgtgttattagtgttaactGTAACTAacgataggctaacgttacctgctgtgaaacgtgttattaatgtttactgtagctaacggtgggctaacgttacctgctgtgtaacgtgttattagtgtttactgtatctaacggtgggctaacgttacctgctgtgtaacgtgttattaatgtttactgtagctaacggtgggctaacgttacctgctgtgtaacgtgttattagtgtttactgtagctaacggtaggctaactttATCTgatgtgtaacgtgttattagcgTTAACTGTAgataacggtaggctaactttATCTgatgtgtaacgtgttattagtgttaactGTAACTAacgataggctaacgttacctgctgtgtaacgtgttattaatgtttactgtagctaacggtgggctaacattacctgctgtgtaacgtgttattagtgtttactgtatctAACGTGCATAAACGCTACCTgctgtaacgtgttattagtgtttactgtagctaacggtgggctaacgttacctgctgtgtaacgtgttattagtgttaactgtagctaacggtgggctaacgttacctgatgtgtaacgtgttattagtgtttactgtagctaacggtaggctaacgttacctgctgtgtaacgtgttattaatgtttactgtagctaacggtg

Function


GO: NA

KEGG: NA

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU321027 True 1590 lncRNA 0.40 2 21631418 21633112

Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
LOC120554641 LOC103473932 coding downstream 482055 21126894 ~ 21149363 (-)
dytn NA coding downstream 556163 20965938 ~ 21075255 (-)
ftcd ftcd coding downstream 628149 20990890 ~ 21003269 (-)
vps16 vps16 coding downstream 763618 20853565 ~ 20867800 (-)
LOC120554361 NA coding downstream 829148 20794346 ~ 20802270 (-)
LOC120554016 NA coding upstream 18854 21651966 ~ 21691088 (-)
LOC120554648 NA coding upstream 67593 21700705 ~ 21725016 (-)
G236587 NA non-coding downstream 222 21625938 ~ 21631196 (-)
G236743 NA non-coding downstream 7962 21622498 ~ 21623456 (-)
G236595 NA non-coding downstream 9210 21608780 ~ 21622208 (-)
G236740 NA non-coding downstream 13847 21607435 ~ 21617571 (-)
LOC120554670 NA non-coding downstream 72378 21557632 ~ 21559040 (-)
G236574 NA non-coding upstream 3121 21636233 ~ 21639876 (-)
G236747 NA non-coding upstream 5165 21638277 ~ 21640732 (-)
G236594 NA non-coding upstream 10745 21643857 ~ 21667774 (-)
G236750 NA non-coding upstream 11353 21644465 ~ 21645608 (-)
G236616 NA non-coding upstream 28716 21661828 ~ 21716852 (-)
LOC120554014 NA other downstream 74397 21300281 ~ 21557021 (-)
LOC120554013 LOC103366577 other downstream 389241 21200996 ~ 21242177 (-)
arl11 NA other downstream 679553 20940988 ~ 20951865 (-)
LOC120554644 NA other downstream 710920 20892914 ~ 20920498 (-)
G236646 NA other downstream 768107 20862680 ~ 20863311 (-)
LOC120554015 NA other upstream 1736 21634848 ~ 21651918 (-)
G236611 NA other upstream 40580 21673692 ~ 21674838 (-)

Expression



Co-expression Network