nfat5b (nfat5)


Basic Information

Item Value
gene id nfat5b
gene name nfat5
gene type misc
species eurasian perch (Perca fluviatilis)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_053114.1
NCBI id CM020911.1
chromosome length 46923577
location 25883454 ~ 25927726 (+)
genome version GENO_Pfluv_1.0_2020_eurasian_perch_Genome

Sequence

>TU39747
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Function

symbol description
nfat5 Enables DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific and RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding activity. Involved in several processes, including positive regulation of NIK/NF-kappaB signaling; positive regulation of leukocyte adhesion to vascular endothelial cell; and positive regulation of transcription by RNA polymerase II. Located in cytosol and nucleoplasm.

NR:

description
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G29915 NA non-coding upstream 21063 25861728 ~ 25862391 (+)
G29868 NA non-coding upstream 195346 25685840 ~ 25688108 (+)
G29851 NA non-coding upstream 246329 25624948 ~ 25637125 (+)
G29849 NA non-coding upstream 261002 25622189 ~ 25622452 (+)
LOC120555969 NA non-coding upstream 309033 25570791 ~ 25574421 (+)
G29922 NA non-coding downstream 2021 25929747 ~ 25929973 (+)
G29964 NA non-coding downstream 77537 26005263 ~ 26006950 (+)
G29974 NA non-coding downstream 130202 26057928 ~ 26059434 (+)
G29975 LOC103361962,LOC107659108,LOC101069992,LOC107565377 non-coding downstream 133465 26061191 ~ 26063421 (+)
G30003 NA non-coding downstream 190439 26118165 ~ 26118521 (+)
pkd1l2a vat1l,pkd1l2,LOC102776808 other upstream 94 25855839 ~ 25883360 (+)
sox6 sox6,LOC103363464 other upstream 1427766 24320064 ~ 24455688 (+)
plekha7b NA other upstream 1568809 24235723 ~ 24314645 (+)
G29433 NA other upstream 2150983 23727012 ~ 23732471 (+)
igdcc3 igdcc3 other upstream 2366191 23443149 ~ 23517263 (+)
LOC120556198 LOC103371916,LOC104965843 other downstream 1368031 27295757 ~ 27316181 (+)
nedd4a nedd4,LOC103371920,LOC102785817 other downstream 1390644 27318370 ~ 27351837 (+)
LOC120555577 NA other downstream 1481314 27409040 ~ 27410250 (+)
vrk3 NA other downstream 1498562 27426288 ~ 27440414 (+)
LOC120555924 LOC103398348,LOC104965831,LOC103374185 other downstream 1528690 27456416 ~ 27464759 (+)

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