G34518


Basic Information

Item Value
gene id G34518
gene name NA
gene type misc
species eurasian perch (Perca fluviatilis)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_053114.1
NCBI id CM020911.1
chromosome length 46923577
location 45138656 ~ 45271013 (-)
genome version GENO_Pfluv_1.0_2020_eurasian_perch_Genome

Sequence

>TU45953
GCTACGTGTGAGAATTAATGGAGGATCTGCAGATGAACATCTCCAGTGTCTTGACAGTCTCAGCTGCAtccactgtctgtgtgtctgtgtgtctgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtctgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtttgtgtgtctgtgtgtgtgcgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtctgtgtgtgtgcgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtctgtctgtgtgtctgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtattgtttggaGCTATAACTCGACatcctcgtctgtccagactaaattgtcagcttttgttgttcgttTCGTGCTACtatggagaggagagggagacttGGTGGATcgcatttcacacacttttgcgtcaccatatgcacgcagatcccc
>TU45954
tgcgtgactgtgtgtgtgcgtgtgtgtgtctgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtttgtgtgtctgtgtgtgtgcgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtctgtgtgtgtgcgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtctgtgtctgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctgtgtgtctgtgtgtgtgcgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgcgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtattgtttggaGCTATAACTCGACatcctcgtctgtccagactaaattgtcagcttttgttgttcgttTCGTGCTACtatggagaggagagggagacttGGTGGATcgcatttcacacacttttgcgtcaccatatgcacgcagatcccc
>TU45955
gcgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgcgtgtgtgtgtctgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtttgtgtgtctgtgtgtgtgcgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtctgtgtgtgtgcgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtctgtgtctgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctgtgtgtctgtgtgtgtgcgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgcgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtttattgtttgga
>TU45958
tgcgtgactgtgtgtgtgcgtgtgtgtgtctgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtttgtgtgtctgtgtgtgtgcgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtctgtgtgtgtgcgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtctgtgtctgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctgtgtgtctgtgtgtgtgcgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgcgtgtgtgtgtctgtgtgtctgtctgtgtgtctgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtattgtttggaGCTATAACTCGACatcctcgtctgtccagactaaattgtcagcttttgttgttcgttTCGTGCTACtatggagaggagagggagacttGGTGGATcgcatttcacacacttttgcgtcaccatatgcacgcagatcccc
>TU45959
GCTACGTGTGAGAATTAATGGAGGATCTGCAGATGAACATCTCCAGTGTCTTGACAGTCTCAGCTGCAtccactgtctgtgtgtctgtgtgtctgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtctgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtttgtgtgtctgtgtgtgtgcgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtctgtgtgtgtgcgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtctgtgtctgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctgtgtgtctgtgtgtgtgcgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgcgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgctctctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgg
>TU45960
tgcgtgactgtgtgtgtgcgtgtgtgtgtctgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtttgtgtgtctgtgtgtgtgcgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtctgtgtgtgtgcgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtctgtgtctgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctgtgtgtctgtgtgtgtgcgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtctgtctgtgtgtctgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtattgtttggaGCTATAACTCGACatcctcgtctgtccagactaaattgtcagcttttgttgttcgttTCGTGCTACtatggagaggagagggagacttGGTGGATcgcatttcacacacttttgcgtcaccatatgcacgcagatcccc
>TU45961
gtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctgtgtgtctgtgtgtctgtgtgtgtgcgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtctgtgtctgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctgtgtgtctgtgtgtgtgcgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgcgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgg
>TU45963
tgcgtgactgtgtgtgtgcgtgtgtgtgtctgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtttgtgtgtctgtgtgtgtgcgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtctgtgtgtgtgcgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtctgtctgtgtgtctgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtattgtttggaGCTATAACTCGACatcctcgtctgtccagactaaattgtcagcttttgttgttcgttTCGTGCTACtatggagaggagagggagacttGGTGGATcgcatttcacacacttttgcgtcaccatatgcacgcagatcccc
>TU45964
CTGCATCCACtgtctgtgtgtctgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtctgtgtgtgtgcgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtctgtgtctgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctgtgtgtctgtgtgtgtgcgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgcgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgg
>TU45965
tgcgtgactgtgtgtgtgcgtgtgtgtgtctgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtttgtgtgtctgtgtgtgtgcgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtctgtgtgtgtgcgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtctgtgtctgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctgtgtgtctgtgtgtgtgcgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtctgtctgtgtgtctgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtattgtttggaGCTATAACTCGACatcctcgtctgtccagactaaattgtcagcttttgttgttcgttTCGTGCTACtatggagaggagagggagacttGGTGGATcgcatttcacacacttttgcgtcaccatatgcacgcagatcccc
>TU45966
GCTACGTGTGAGAATTAATGGAGGATCTGCAGATGAACATCTCCAGTGTCTTGACAGTCTCAGCTGCAtccactgtctgtgtgtctgtgtgtctgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtctgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtttgtgtgtctgtgtgtctgtgtgtctgtgtgtgtgcgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtctgtgtctgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctgtgtgtctgtgtgtgtgcgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgcgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgctctctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgg
>TU45967
gtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctgtgtgtctgtgtgtctgtgtgtgtgcgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtctgtgtctgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctgtgtgtctgtgtgtgtgcgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgcgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgctctctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgg
>TU45968
tgcgtgactgtgtgtgtgcgtgtgtgtgtctgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtttgtgtgtctgtgtgtgtgcgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtctgtgtgtgtgcgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtctgtgtctgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctgtgtgtctgtgtgtgtgcgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgcgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgg
>TU45969
GCTACGTGTGAGAATTAATGGAGGATCTGCAGATGAACATCTCCAGTGTCTTGACAGTCTCAGCTGCAtccactgtctgtgtgtctgtgtgtctgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtctgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtttgtgtgtctgtgtgtgtgcgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtctgtgtgtgtgcgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtctgtgtctgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctgtgtgtctgtgtgtgtgcgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgcgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgg
>TU45970
tgcgtgactgtgtgtgtgcgtgtgtgtgtctgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtttgtgtgtctgtgtgtgtgcgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtctgtgtgtgtgcgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtctgtgtctgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctgtgtgtctgtgtgtgtgcgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgcgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtctgtctgtgtgtctgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtattgtttggaGCTATAACTCGACatcctcgtctgtccagactaaattgtcagcttttgttgttcgttTCGTGCTACtatggagaggagagggagacttGGTGGATcgcatttcacacacttttgcgtcaccatatgcacgcagatcccc
>TU45971
gtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctgtgtgtctgtgtgtctgtgtgtgtgcgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtctgtctgtgtgtctgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtattgtttggaGCTATAACTCGACatcctcgtctgtccagactaaattgtcagcttttgttgttcgttTCGTGCTACtatggagaggagagggagacttGGTGGATcgcatttcacacacttttgcgtcaccatatgcacgcagatcccc
>TU45972
tgcgtgactgtgtgtgtgcgtgtgtgtgtctgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtttgtgtgtctgtgtgtgtgcgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtctgtgtgtgtgcgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtctgtgtctgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctgtgtgtctgtgtgtgtgcgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgcgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgctctctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgg

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU45953 False 525 TUCP 0.49 3 45179571 45180300
TU45954 False 414 lncRNA 0.50 4 45179571 45271013
TU45955 False 344 lncRNA 0.51 4 45168947 45195332
TU45958 False 496 lncRNA 0.50 4 45179571 45271013
TU45959 False 525 TUCP 0.50 3 45138656 45180300
TU45960 False 558 lncRNA 0.50 4 45179571 45271013
TU45961 False 260 lncRNA 0.51 4 45138656 45226732
TU45963 False 414 lncRNA 0.50 4 45179571 45271013
TU45964 False 277 lncRNA 0.51 5 45138656 45181775
TU45965 False 496 lncRNA 0.50 4 45179571 45271013
TU45966 False 511 TUCP 0.50 4 45138656 45180300
TU45967 False 357 lncRNA 0.51 4 45138656 45226732
TU45968 False 331 lncRNA 0.51 4 45138656 45271013
TU45969 False 452 TUCP 0.50 3 45138656 45180300
TU45970 True 584 lncRNA 0.50 3 45179571 45271013
TU45971 False 357 lncRNA 0.49 4 45179571 45226732
TU45972 False 396 lncRNA 0.51 4 45138656 45271013

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC120556292 anxa2,LOC103361870,LOC106530007 coding downstream 49161 45066782 ~ 45089495 (-)
LOC120556528 NA coding downstream 178803 44951306 ~ 44959853 (-)
gtf2a2 gtf2a2 coding downstream 311748 44816712 ~ 44826908 (-)
il17a/f1 NA coding downstream 394738 44741174 ~ 44743918 (-)
LOC120556004 NA coding downstream 454935 44679054 ~ 44683721 (-)
LOC120556531 NA coding upstream 109752 45380765 ~ 45385841 (-)
LOC120555444 NA coding upstream 114802 45385815 ~ 45388993 (-)
nob1 nob1,LOC107081613 coding upstream 190485 45461498 ~ 45473121 (-)
LOC120555446 NA coding upstream 229832 45500845 ~ 45502687 (-)
LOC120555447 NA coding upstream 256827 45527840 ~ 45530057 (-)
G34516 NA non-coding downstream 1781 45131716 ~ 45136875 (-)
G34513 NA non-coding downstream 27855 45110572 ~ 45110801 (-)
G34511 NA non-coding downstream 47385 45091054 ~ 45091271 (-)
G34509 NA non-coding downstream 72174 45063158 ~ 45066482 (-)
G34506 NA non-coding downstream 80527 45057919 ~ 45058129 (-)
G34523 NA non-coding upstream 103 45271116 ~ 45306967 (-)
G34520 NA non-coding upstream 5278 45276291 ~ 45305717 (-)
G34544 NA non-coding upstream 9283 45280296 ~ 45296873 (-)
G34524 NA non-coding upstream 35133 45306146 ~ 45391252 (-)
G34517 NA non-coding upstream 48460 45319473 ~ 45320511 (-)
LOC120556527 LOC102787635,LOC101476187,LOC100691227,LOC106610718 other downstream 222990 44791982 ~ 44915666 (-)
G34078 NA other downstream 1048965 44040360 ~ 44089691 (-)
LOC120556522 LOC103374105,LOC102297981 other downstream 1325431 43766691 ~ 43813225 (-)
G33914 NA other downstream 1681809 43452712 ~ 43456847 (-)
G33847 NA other downstream 1923669 43214634 ~ 43214987 (-)
G34551 NA other upstream 16792 45287805 ~ 45294207 (-)
G34617 NA other upstream 311484 45582497 ~ 45583667 (-)
G34584 LOC108242767,LOC105923784,LOC108242778 other upstream 488475 45759488 ~ 45769788 (-)
G34594 NA other upstream 583627 45854640 ~ 45857478 (-)
LOC120555951 LOC104934393,LOC103372831 other upstream 873971 46144984 ~ 46184302 (-)

Expression


Co-expression Network