XLOC_005072


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_005072
gene name NA
gene type non-coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007123.7
NCBI id CM002896.2
chromosome length 49182954
location 2625669 ~ 2669500 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00011064
CCATGGGTCGTCTCGCCAATTATCATTGCACGTCCCAACCTCTTCATGATGAAAACAAACTCTTCAGCGGCACCGGCGGTCACACCACTGCCCTTCCAGGTCTGTTGTCACAGCATAAGGAAAATAAGGTCAAGCTTCCAAAGGATCTTATGCAACGCTATCTGCTGATTCCCTCCGGCCAATCAGAGGCGATGACTGGAGTTTTGTGAAATGCGTCTGATAAGAGGAATCATTTTTGGTGAAAGAAGCAGATCACGGGCCAGCAGTCTCAGCAGAGAACCCCTTTATCGACAATGGACAGATTCCACAGATGTCGAACATTCTTCATGCAAACCAAAGATGCAGATTAAGATGTTTTACTTTTAAGAGTCTCGTGGCTCCAAGAAGCGATTTTCGACCGTAATCTACCATATCCggagatataaaacagttcatcAATCACTATGAACAGACATTTGGACTCCTAATAAGCAACTCCTGCACCAAAACCACTGGAACGTCAACCACAAGGACGGACAACCAAAACTGCTGTCGTTTTGTGAGTGACAACCCTTCACCAGAGCACAAGAATCCGCCGCAATTATCTATAGCATTCATCTTCAGAAATCATCCTCAAAACCAGAAAGCAGTTCAATGCAGCAAAGGTTATAATTTATTGCAATTTTGCTGTCAGAGTAACAGTTTATTCACCAGGAGTTGGATGAAAAGCAGGTTTACGGTGTCAGAGGACATGCTGGATCATAGTCTGAAGTTATGAAGCTTGGCATGATCTATACGTTACAGACGGCGGTTTAACTTTGCGAAGAAGCAATACCAACAACAATCCTTCAAGATAACAGTCGAAAGgcttaaaacaaaaaagtttgatAGACGAATAAATCAAACCGTGTGCAAATTAAATTCATCTACTACACTGAGAGAATGTGAAATGTGCTGGATCATTTTTAGGATGGgggttttaataaaaaaaggtagAAATTTATGAGACCGATTTTGGAGTAGCTACAGTGTaaagaaatgctgggttgttgtaactcaatgttgggtcaaatacggACAAATGTCATTTAAGTTTAGCTGAAAAAATGTACCCAACATTgcattagtttattcattcattcattttcttttcagcttagtccctttattaatctgcggtcgccacagcggaatgaatcgcca
>TCONS_00011065
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Function

GO: NA

KEGG:

id description
ko03230 Viral genome structure
ko05164 Influenza A
ko03200 Viral proteins

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00011064 False 1182 lncRNA 0.41 4 2625669 2669500
TCONS_00011065 True 12330 lncRNA 0.37 1 2645615 2657944

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_005071 CU929359.1 coding downstream 8159 2579237 ~ 2617510 (-)
XLOC_005070 mapk8b coding downstream 103182 2505519 ~ 2522487 (-)
XLOC_005069 NA coding downstream 145738 2067963 ~ 2479931 (-)
XLOC_005068 NA coding downstream 623845 2000636 ~ 2001824 (-)
XLOC_005067 NA coding downstream 624179 2000019 ~ 2001490 (-)
XLOC_005073 NA coding upstream 33855 2703355 ~ 2744641 (-)
XLOC_005074 ubtd1b coding upstream 110690 2780190 ~ 2800859 (-)
XLOC_005075 zdhhc16b coding upstream 180084 2849584 ~ 2869584 (-)
XLOC_005076 fam20a coding upstream 237110 2906610 ~ 2940070 (-)
XLOC_005077 si:dkey-202c14.3 coding upstream 281686 2951186 ~ 2993095 (-)
XLOC_005063 CU694266.1 non-coding downstream 1135081 1490472 ~ 1490588 (-)
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XLOC_005092 NA non-coding upstream 1113121 3782621 ~ 3786382 (-)

Expression


Co-expression Network