pdpr (pdpr)


Basic Information

Item Value
gene id pdpr
gene name pdpr
gene type coding
species eurasian perch (Perca fluviatilis)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_053114.1
NCBI id CM020911.1
chromosome length 46923577
location 1037755 ~ 1056294 (-)
genome version GENO_Pfluv_1.0_2020_eurasian_perch_Genome

Sequence

>XM_039794675.1
AGTTGTTGTGATTCTATAGAGTTTGACATTGGTACTGACTGCTGTACCCCAACAACACTGGAACTCAGTCACTGGTATTTAAGCTACTTCAGTCCTTAGATTATCACAGTGTCTGGACTTGGCTGATTCGAAAGCACAGCTATGTGCAGCTGTGTGAGGAGCTCCAGGGCTCTGTCCCCTGTTCTGCTCCCCAGGCTGCTGCTTCCTCAGACGGGGTACAAATTGGCCTGCAGGGGACTCTGGACCTCCCCGCACTGTATGGCTGTCAGTGGAGACTCCCAGCTGCTCCCACTGCCCAGCCAGGCCCGCGTGGTGATCTGTGGAGGAGGTATTATGGGAACATCAGTAGCCTTCCACCTTGCCAAACTGGGCTGGACTGATGTAGTGCTGCTGGAGCAGGGCAGGCTTGGTGCAGGAACAACCAGACTGTGTGCTGGCATTGTCAGTGTGGCCAAGCCTATTTCCATAGAGTGTCAAATGGCAAACTACTCCAATAGTCTTTATCTGCAGCTGGAGGAAGAGACTGGGATCAAAACAGgtTATGTGAAGACTGGATCTCTGTGTCTGGCCCAAAATCAGGATCGCTTCCTCTCTCTGAAGCGCCTGGCATCCCGGCTAAAGGTTATGGGGATCAGCTGTAACATCATTAAGCCCAAAGAGGTGGCCAAACTTCACCCTCTTGTTAACATTCATGACCTGGTGGGGGCGCTCCACCTCCCTGCAGACGCTGTGGTGTCTCCACCTGATGTTAACCATGCCCTGGCTGTGGCTGCAGCTGGAAGAGGGGTTCAGATCCTGGAGCGAACCACTGTTCAGCAGGTTCTGGTGGAGAAGGGTCAAGTGACGGCGGTGGAGACTGATCGTGGCTCCATCGAGTGTgaatattttgtcaactgtgCTGGACAGTGGGCTTACGAGCTGGGCCAGGCTAGTGAGACGAAGGTGTCGGTTCCTCTTCATGGCTGTGAACACTTCTACCTCCTCACCAAACCTCTCCAGGAGCCACTTCCACCCAGCACGCCAGTGGTGATGGATATGGACGGCAGGTTATATGCACGGCCATGGCAGGGAGGCCTTCTATCAGGGGGCTTCGAGAAGAACCCCAAACCCATCTTTACTGAGGGACGCAACCAGCTGGAGATCCAGAACATGCAGGAGGACTGGGACCACTTTGAGCCAATGCTCAGTGCTTTGCTGAGGAGAATGCCGAGTCTTGAATCAGCTGAGATCCATCAGCTAGTCAACTGTCCGGAGTCCTTCACCCCTGATATGCGCTGCCTGATGGGGGAGACACCGGGTATCTCTGGCTACTACGTGCTGGCAGGGATGAACTCCTCTGGCCTGTCCTTTGCTGGAGGAGCTGGCAAGTACTTGGCAGAGTGGATGACCTATGGTTACCCCACTGCCAATGTGTGGCCACTGGACATCAAGCGCTTTGGCAACCTGCAGAGCAGCCGAACCTTCCTGCGACACAGAGTAATGGAGGTCATGCccCTGCTGTACGAACTAAAGGTTCCACGCTGGGACTTTCAGACTGGGCGTCAGCTGCGCACCAGCCCTCTGTATGACCGCCTGGACACCCAGGGAGCTCGCTGGATGGAGAAACATGGTTTTGAAAGGCCCAAATACTTTGTTCCTCCAGGAAAAGATTTGCTGTCTCTGGACCAGAGTAAGACCTTTTACAAGCCAGACTGGTTTGACATCGTTGGAGAAGAAGTGAAATGCTGCAAAGAAGCCGTCTGTGTCATCGACATGTCCTCCTTCACCAAGTTTGAACTGACTTCAACAAAGGACCAGGCCCTGGACCTGCTGCAACATCTGTGTGCCAACGACCTGGATGTTCCTGTTGGACATATCGTCCACACCGGCATGCTGAATGAGAGGGGAGGCTATGAGAACGACTGCAGCGTGGCCCGCCTCAGCAAGAACAGCTTCTTCATCGTCTCTCCGACAGACCAGCAGGTCCACTGTTGGTCCTGGATAAAGAAACACATGCCCAATGACCCAGACCTGCACCTAGAGGATGTCAGCTGGAAGTACACTGCTTTAAATCTGATTGGACCTCGTGCAATGGATGTTCTGGCTGAGCTGTCATATGTTTCCATGACACCTGACCATTTCCCCTCCATGTTCTGTAAGgagATGAGTGTTGGCTATGCCAATGGAATCCGAGTGATGAGTATGACTCACACTGGAGAACCAGGTTTCATGCTCTACATGCCTATAGAGTATGCACTGCATGTGTACAACGAGGTGATGTCAGTGGGTCAGAAGTATGGGATTCGTAACTCCGGGTACTACGCGCTGCGCAGCCTACGCATAGAGAAATTCTTTGCCTTCTGGGGTCAGGACCTCGACGCTTTCACCACCCCGCTGGAGTGTGGACGGGAGTTCAGGGTTAAATTTGACAAGGACACAGACTTCCTTGGTCGTGAGGCCTTGCTGCAGCAGCGTCAGGATGGTCCGTCTCGGCGATTTGTCATGCTGGTTCTAGAGGACCACGACACTGAGCTGGACCTGTGGCCGTGGTGGGGCGAGCCCATCTACCGTAACGGTCAGCTAGCTGGGACGACCACCAGCAGCGCCTACAGCTACACTCTGGAGCGCCACGTCTGCCTTGGCTTCGTATCTCCGCCGCCAGGCCCAGAGGGGCTCCCCACACCCATCACCCCAGACTTCATCAACCGTGGGGACTATGAGGTGGACATTGCTGGCCAGCGCTACCCAGCCAAAGCCAAACTCTACCCCTTCAGCTCCCTCTTCGCCCAGCAAAAACGCCGCAAGGAAGACATGGAGTTAAGCAACCTCCAGGCGAAGTGATGCAGAGTAATAGAAAATGGAAGGCCTCGCTTTTGCCTCAGAAGGGGCTTCTGTGACACTCCTTCAGTTTTTCAATCCACTCCTGCACTTACCTGGCAGTGCCAATCTACATCGTCCCCTTTCTAGTTCCtaatccgagggctgtatgcacAATCGCTATTTGTCTATCTAGTATTTAACTTCCACGCTGCATCTCCCTCTTTTGAAAGTGCAATATTTAGGAGGCACCAAATGCTTGAGCTGTATCAAATACAGCAATACAACAATACACCTGTGTCAAATCAAATTCTGCCCTGCCCGGCTTCACACTCAAACACGTTCCACGGTTAACTGGAGCGCTCTATGGTTAAGTGCCTTGGTCAAGGCAACATCAACACTATGTGTTCACGTAGTTCACTGTAACCACCCCGAAGGGATTTAGACAGACTATCTTCTGCAGTAGTGTTCCAGATTTGACACCGCACAGTCTGGAACAGTTTGAAAGAGATGTCATTCAATGCTAATGTGCAAAATGCCTACACAGTCAACACAGTTGTTGACGTCAATGTcattttacaaattaaaaatgttctGCTGTCAAAAATATGCGTGATGTGATCTAGAGAGCGATGTGGCCTAAGTCAGATACTGTCCACTACTATCATTGTCACTACATTATCGTCCCCAGTCAGGGGGAATAATCAGGAAGCCTGATATCATCATTAGTAAACCATTGTTTACACCTCTTCCAGTCCTGTTTAAAAGGCTTCCCAGGCTCTCCTTAAAGCCTAAAAGTAAAGCAAAATGACTTTTTCCCTATTGATTGTGTCTTTATAATCTGCTGTCTTTATTCTGCTGTGTCGAGCTTGTGGTAATGTATTTACGGTAATTGTTATTTATGTTTTGCTTTATGTTATGTATCACCCTGGTCGTTTTGAAGCAGCATTGCTCGTTTGATGCTCAAGTTTTGTTAGATTGATGTGTGTTGCTGAATGTGTGGCTGATGTTTAGGTGAAGTCAGGATGGGAAAGCTGGGGCTGTCTGTATTCCAAACATGTTGGTTGGAGTCCACAATATCTTCCACTGGCGATATGATTTTTGCCTGATCCAGAGTTACGATGTTTGTGTAAAGGAAGGACTTCATTGCGATCTGAAATaaagtaatgtatttttgtatagcTAGTGTGTATAAAATCTCTATTTTCAGTACTGCACCTTTTTTCTAGTCGATCAGCTTTAAGTCATATCAGCTGTATATGAAACATTGATACTTTGGTCAGTTGTTCCATTCTTGCAGTTATCCCTCTGATGATGCATTATTTCACATGCTTGCTGTACATGTAAAAGTCATTTGTCAGCAACGGCTTGATGTTTTCCTACATTTGCATTCGTATACACCTTTAGTCATTTGGCCCTCTTGTCCTCTTTCAGAGCTACAGATGAGCTGGTCTGGGGCTGGTAGGGAGTCTCTTCAGCAGTGCTGTTGTGAAGAACAATGTTACCACAAGAACGGCAGTTGAATATTGAATTCATCCTGCCAATGGTTCAAATGGCTATATGGTTGAGCAAAAACCTCTCTGTTGTGCAGTACTGGTGCTCTGATATGCTGCTTCCTCATAATTTCATATTCACATTTGGATGCAGATTGTTTCACTCGATCTTATGTCCAGCATTTAGTAATTGAGTGTGCTTGAGGAGGGTAGCACATGTTAAAATGAAAGGGATCATGAAAGCAGGACAGGGATCCCAGTGTTACAACTCCCAGTGATTGATAGACACATATCTCTAGACACCGACTAAATCTGTTTTACAATCTTGTTTAAaggtttttgtttgtgaatcAAAAAAGTGCAAAATGGTGATCAGAGTAACAAAAGGCTTATTTATAGTGTATCTCTAACTCTTTGTCTACCTGTCATGTATATGGTTGGAAAATGACATATTGATCCTTTAAGTATTTGCTTAGTTTGAATTTGAGATGGAATGGTTCAAGTCAAGAATCCTCTAGTCACAGTGTGGGACATGTATGTATCGTTTGGTTCATTTCAGTCTTATTTGtcaaatttattttaataacacAGTAGCATTTTTCCTTTCGATAAAAAATCCAGCCGTTCATTCATGGTATTTAAAATACTGCACTTTAAATTGGAaaatgaacatttaaaataagaaCTGACGTGTTCTAGTCTACTGTTGTT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>XM_039794676.1
GTGATTCTATAGAGTTTGACATTGGTACTGACTGCTGTACCCCAACAACACTGGAACTCAGTCACTGGTATTTAAGCTACTTCAGTCCTTAGATTATCACAGTGTCTGGACTTGGCTGATTCGGCTGCTGCTTCCTCAGACGGGGTACAAATTGGCCTGCAGGGGACTCTGGACCTCCCCGCACTGTATGGCTGTCAGTGGAGACTCCCAGCTGCTCCCACTGCCCAGCCAGGCCCGCGTGGTGATCTGTGGAGGAGGTATTATGGGAACATCAGTAGCCTTCCACCTTGCCAAACTGGGCTGGACTGATGTAGTGCTGCTGGAGCAGGGCAGGCTTGGTGCAGGAACAACCAGACTGTGTGCTGGCATTGTCAGTGTGGCCAAGCCTATTTCCATAGAGTGTCAAATGGCAAACTACTCCAATAGTCTTTATCTGCAGCTGGAGGAAGAGACTGGGATCAAAACAGgtTATGTGAAGACTGGATCTCTGTGTCTGGCCCAAAATCAGGATCGCTTCCTCTCTCTGAAGCGCCTGGCATCCCGGCTAAAGGTTATGGGGATCAGCTGTAACATCATTAAGCCCAAAGAGGTGGCCAAACTTCACCCTCTTGTTAACATTCATGACCTGGTGGGGGCGCTCCACCTCCCTGCAGACGCTGTGGTGTCTCCACCTGATGTTAACCATGCCCTGGCTGTGGCTGCAGCTGGAAGAGGGGTTCAGATCCTGGAGCGAACCACTGTTCAGCAGGTTCTGGTGGAGAAGGGTCAAGTGACGGCGGTGGAGACTGATCGTGGCTCCATCGAGTGTgaatattttgtcaactgtgCTGGACAGTGGGCTTACGAGCTGGGCCAGGCTAGTGAGACGAAGGTGTCGGTTCCTCTTCATGGCTGTGAACACTTCTACCTCCTCACCAAACCTCTCCAGGAGCCACTTCCACCCAGCACGCCAGTGGTGATGGATATGGACGGCAGGTTATATGCACGGCCATGGCAGGGAGGCCTTCTATCAGGGGGCTTCGAGAAGAACCCCAAACCCATCTTTACTGAGGGACGCAACCAGCTGGAGATCCAGAACATGCAGGAGGACTGGGACCACTTTGAGCCAATGCTCAGTGCTTTGCTGAGGAGAATGCCGAGTCTTGAATCAGCTGAGATCCATCAGCTAGTCAACTGTCCGGAGTCCTTCACCCCTGATATGCGCTGCCTGATGGGGGAGACACCGGGTATCTCTGGCTACTACGTGCTGGCAGGGATGAACTCCTCTGGCCTGTCCTTTGCTGGAGGAGCTGGCAAGTACTTGGCAGAGTGGATGACCTATGGTTACCCCACTGCCAATGTGTGGCCACTGGACATCAAGCGCTTTGGCAACCTGCAGAGCAGCCGAACCTTCCTGCGACACAGAGTAATGGAGGTCATGCccCTGCTGTACGAACTAAAGGTTCCACGCTGGGACTTTCAGACTGGGCGTCAGCTGCGCACCAGCCCTCTGTATGACCGCCTGGACACCCAGGGAGCTCGCTGGATGGAGAAACATGGTTTTGAAAGGCCCAAATACTTTGTTCCTCCAGGAAAAGATTTGCTGTCTCTGGACCAGAGTAAGACCTTTTACAAGCCAGACTGGTTTGACATCGTTGGAGAAGAAGTGAAATGCTGCAAAGAAGCCGTCTGTGTCATCGACATGTCCTCCTTCACCAAGTTTGAACTGACTTCAACAAAGGACCAGGCCCTGGACCTGCTGCAACATCTGTGTGCCAACGACCTGGATGTTCCTGTTGGACATATCGTCCACACCGGCATGCTGAATGAGAGGGGAGGCTATGAGAACGACTGCAGCGTGGCCCGCCTCAGCAAGAACAGCTTCTTCATCGTCTCTCCGACAGACCAGCAGGTCCACTGTTGGTCCTGGATAAAGAAACACATGCCCAATGACCCAGACCTGCACCTAGAGGATGTCAGCTGGAAGTACACTGCTTTAAATCTGATTGGACCTCGTGCAATGGATGTTCTGGCTGAGCTGTCATATGTTTCCATGACACCTGACCATTTCCCCTCCATGTTCTGTAAGgagATGAGTGTTGGCTATGCCAATGGAATCCGAGTGATGAGTATGACTCACACTGGAGAACCAGGTTTCATGCTCTACATGCCTATAGAGTATGCACTGCATGTGTACAACGAGGTGATGTCAGTGGGTCAGAAGTATGGGATTCGTAACTCCGGGTACTACGCGCTGCGCAGCCTACGCATAGAGAAATTCTTTGCCTTCTGGGGTCAGGACCTCGACGCTTTCACCACCCCGCTGGAGTGTGGACGGGAGTTCAGGGTTAAATTTGACAAGGACACAGACTTCCTTGGTCGTGAGGCCTTGCTGCAGCAGCGTCAGGATGGTCCGTCTCGGCGATTTGTCATGCTGGTTCTAGAGGACCACGACACTGAGCTGGACCTGTGGCCGTGGTGGGGCGAGCCCATCTACCGTAACGGTCAGCTAGCTGGGACGACCACCAGCAGCGCCTACAGCTACACTCTGGAGCGCCACGTCTGCCTTGGCTTCGTATCTCCGCCGCCAGGCCCAGAGGGGCTCCCCACACCCATCACCCCAGACTTCATCAACCGTGGGGACTATGAGGTGGACATTGCTGGCCAGCGCTACCCAGCCAAAGCCAAACTCTACCCCTTCAGCTCCCTCTTCGCCCAGCAAAAACGCCGCAAGGAAGACATGGAGTTAAGCAACCTCCAGGCGAAGTGATGCAGAGTAATAGAAAATGGAAGGCCTCGCTTTTGCCTCAGAAGGGGCTTCTGTGACACTCCTTCAGTTTTTCAATCCACTCCTGCACTTACCTGGCAGTGCCAATCTACATCGTCCCCTTTCTAGTTCCtaatccgagggctgtatgcacAATCGCTATTTGTCTATCTAGTATTTAACTTCCACGCTGCATCTCCCTCTTTTGAAAGTGCAATATTTAGGAGGCACCAAATGCTTGAGCTGTATCAAATACAGCAATACAACAATACACCTGTGTCAAATCAAATTCTGCCCTGCCCGGCTTCACACTCAAACACGTTCCACGGTTAACTGGAGCGCTCTATGGTTAAGTGCCTTGGTCAAGGCAACATCAACACTATGTGTTCACGTAGTTCACTGTAACCACCCCGAAGGGATTTAGACAGACTATCTTCTGCAGTAGTGTTCCAGATTTGACACCGCACAGTCTGGAACAGTTTGAAAGAGATGTCATTCAATGCTAATGTGCAAAATGCCTACACAGTCAACACAGTTGTTGACGTCAATGTcattttacaaattaaaaatgttctGCTGTCAAAAATATGCGTGATGTGATCTAGAGAGCGATGTGGCCTAAGTCAGATACTGTCCACTACTATCATTGTCACTACATTATCGTCCCCAGTCAGGGGGAATAATCAGGAAGCCTGATATCATCATTAGTAAACCATTGTTTACACCTCTTCCAGTCCTGTTTAAAAGGCTTCCCAGGCTCTCCTTAAAGCCTAAAAGTAAAGCAAAATGACTTTTTCCCTATTGATTGTGTCTTTATAATCTGCTGTCTTTATTCTGCTGTGTCGAGCTTGTGGTAATGTATTTACGGTAATTGTTATTTATGTTTTGCTTTATGTTATGTATCACCCTGGTCGTTTTGAAGCAGCATTGCTCGTTTGATGCTCAAGTTTTGTTAGATTGATGTGTGTTGCTGAATGTGTGGCTGATGTTTAGGTGAAGTCAGGATGGGAAAGCTGGGGCTGTCTGTATTCCAAACATGTTGGTTGGAGTCCACAATATCTTCCACTGGCGATATGATTTTTGCCTGATCCAGAGTTACGATGTTTGTGTAAAGGAAGGACTTCATTGCGATCTGAAATaaagtaatgtatttttgtatagcTAGTGTGTATAAAATCTCTATTTTCAGTACTGCACCTTTTTTCTAGTCGATCAGCTTTAAGTCATATCAGCTGTATATGAAACATTGATACTTTGGTCAGTTGTTCCATTCTTGCAGTTATCCCTCTGATGATGCATTATTTCACATGCTTGCTGTACATGTAAAAGTCATTTGTCAGCAACGGCTTGATGTTTTCCTACATTTGCATTCGTATACACCTTTAGTCATTTGGCCCTCTTGTCCTCTTTCAGAGCTACAGATGAGCTGGTCTGGGGCTGGTAGGGAGTCTCTTCAGCAGTGCTGTTGTGAAGAACAATGTTACCACAAGAACGGCAGTTGAATATTGAATTCATCCTGCCAATGGTTCAAATGGCTATATGGTTGAGCAAAAACCTCTCTGTTGTGCAGTACTGGTGCTCTGATATGCTGCTTCCTCATAATTTCATATTCACATTTGGATGCAGATTGTTTCACTCGATCTTATGTCCAGCATTTAGTAATTGAGTGTGCTTGAGGAGGGTAGCACATGTTAAAATGAAAGGGATCATGAAAGCAGGACAGGGATCCCAGTGTTACAACTCCCAGTGATTGATAGACACATATCTCTAGACACCGACTAAATCTGTTTTACAATCTTGTTTAAaggtttttgtttgtgaatcAAAAAAGTGCAAAATGGTGATCAGAGTAACAAAAGGCTTATTTATAGTGTATCTCTAACTCTTTGTCTACCTGTCATGTATATGGTTGGAAAATGACATATTGATCCTTTAAGTATTTGCTTAGTTTGAATTTGAGATGGAATGGTTCAAGTCAAGAATCCTCTAGTCACAGTGTGGGACATGTATGTATCGTTTGGTTCATTTCAGTCTTATTTGtcaaatttattttaataacacAGTAGCATTTTTCCTTTCGATAAAAAATCCAGCCGTTCATTCATGGTATTTAAAATACTGCACTTTAAATTGGAaaatgaacatttaaaataagaaCTGACGTGTTCTAGTCTACTGTTGTTAAAGAGCTTATGTTGAGCTGAATCTTCACTTTGTTTATGGCCTTCTATAGTAGTCTATAATTTGgccattt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Function

symbol description
pdpr Predicted to enable oxidoreductase activity and transferase activity. Orthologous to human PDPR (pyruvate dehydrogenase phosphatase regulatory subunit).

NR:

description
PREDICTED: pyruvate dehydrogenase phosphatase regulatory subunit, mitochondrial

GO: NA

KEGG:

id description
K17509 PDPR; pyruvate dehydrogenase phosphatase regulatory subunit

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_039794675.1 True 6719 mRNA 0.45 18 1037755 1056294
XM_039794676.1 False 6648 mRNA 0.45 18 1037755 1056287

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
mrpl46 mrpl46 coding downstream 7700 1021963 ~ 1030055 (-)
sv2ba LOC103359500,LOC101162590,LOC101062552 coding downstream 711027 301918 ~ 326728 (-)
mespba LOC103359507 coding downstream 741468 293684 ~ 296287 (-)
mespaa LOC101162828 coding downstream 747380 289261 ~ 290375 (-)
igf1rb LOC103359504,LOC104920736 coding downstream 804161 173297 ~ 233594 (-)
LOC120556384 LOC104919714 coding upstream 120168 1176462 ~ 1190886 (-)
tdp1 tdp1 coding upstream 136746 1193040 ~ 1203082 (-)
LOC120555617 NA coding upstream 402870 1459164 ~ 1507908 (-)
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G24914 NA non-coding downstream 5153 1030372 ~ 1032602 (-)
G24895 NA non-coding downstream 104962 932258 ~ 932793 (-)
G24881 NA non-coding downstream 263056 765212 ~ 774699 (-)
G24880 NA non-coding downstream 302478 730918 ~ 735277 (-)
G24864 NA non-coding downstream 446405 591011 ~ 591350 (-)
G24931 NA non-coding upstream 77225 1133519 ~ 1133789 (-)
G24934 NA non-coding upstream 93934 1150228 ~ 1150957 (-)
G24935 NA non-coding upstream 94728 1151022 ~ 1151337 (-)
G24942 NA non-coding upstream 109368 1165662 ~ 1169759 (-)
G24941 NA non-coding upstream 115095 1171389 ~ 1174554 (-)
ntrk3b NA other downstream 116206 706157 ~ 921549 (-)
pnoca NA other upstream 4810 1061104 ~ 1105167 (-)
LOC120555898 mctp2 other upstream 354380 1410674 ~ 1457108 (-)
LOC120556048 abcc12,LOC101479372,LOC101076737,LOC102203605,LOC100701509,LOC102304683 other upstream 453871 1510165 ~ 1555646 (-)
LOC120556047 abcc12,LOC102304683,LOC101479372,LOC102203605 other upstream 531250 1587544 ~ 1642348 (-)
cep89 NA other upstream 608476 1664770 ~ 1740839 (-)

Expression


Co-expression Network