LOC120555780 (diaph3)


Basic Information

Item Value
gene id LOC120555780
gene name diaph3
gene type coding
species eurasian perch (Perca fluviatilis)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_053114.1
NCBI id CM020911.1
chromosome length 46923577
location 20504098 ~ 20692974 (+)
genome version GENO_Pfluv_1.0_2020_eurasian_perch_Genome

Sequence

>XM_039794835.1
ATTGCGCGGGTCTGTCAAAAATATCTGCCCCTTAAATGTATCCAGCCAACGCTTCAGCTAGTGCTTGTAATGATTATATAGCTTTCGTTTAACGTTGTTTGTCTGATCAAATTTGTCAAAGGAGAACACCGGTATGTTGTATGTAGCCTCCTTAGCAGAATCTCAAGCGTTAAATTAGTATACGTGACAGACAGTCCATAAATTGGATTAGCGCTAAGTAAAGCCACCAGTGAATGATAGTTTAGCAAACTTGCTAGCCAGTTAGCTAAACGGTATGTTTAGAGTGAAGACTTGAAaatataacgttaacgttacattttgACAAACTGTGATTTGCTATGCGTTAACCAACGTTAGCTGTCAATTTAAGACACGAATGGTAACattaatgtaacgttagctagacaATTCCGCGTGTGTCGTCCTTCACCATTTTAGGGTGTGTGCTACCGTTACATACATTAGGGTTACAAGGTTAACGTGGTAACGCTAGCTGTCAGCTCGTGTAGAAGTCATTAACGTTAGGTCAACAACATGGATAACGTTAGTTTTAGTTCGCAGCGGTTTGAATCCACTAGCAGTAAATCTCAAAAGAGGAAGGGTTCTTCCAACCAAAACACATGTAATGATGAAGGAGACCGCAAACCAAAGTTTCACTTACCCTTTAGAAACATCACAGATGATGTGCTGGACAGATTCGCCAGTATTCGGATTCCGGGTAGTAAAAAGGAGCGGCCACCCCTATCACACTCTAAACACAACACGAATGATTGGTCCATTTCTTCATCATCTACCGCGCATCAGTTTGAGGAACTTTCATCCAAGATCACCTCAGAAAAAGAGATCTTGGCTCTGTTTGAAAAGATGATGgaGGACATGAACttgaatgaggaaaaaaagactCCTTTGAGAGAAAAGGACCTcaacacaaagagagaaatgGTCATCCAGTATGTTTTTACTGCCTCTAAAACTgGTAGTTTGAGAAGCAGCCATCAGATATCTCCCCAGGAATTCCTGGGAGAGCTGAAGTCGGGGGTTATGGACGAACGTCTGTTTGCCTGTCTAGACTCATTGCGGGTGTCCCTTACCAGCAACCCTGTCAGttGGGTGCAGAGCTTCGGCCATGAGGGTCTTGGACTGCTGCTGGACATTTTGGAAAGGTTGCTGTTCAAGAAACAGCAAGATAAGCTTGACAAAAAGAATCAACATAAAGTTGTCCAGTGTCTCAAAGCCTTCATGAACAATAAGTATGGGTTGGATCGAATCCTGGGAGAGGAGAAAAGTCTTGCGTTACTGGCAAGAGCCATTGATCCCACCCAGTCTGCAATGATGACTGACGTGGTAAAGCTACTGTCAGCCATCTGCATCGTGGGCGAAGAGAACACTTTGGAAAAGGTCCTTGAAGCCATCACCACAGCAGGGGAATGGCGAGCCATCGAGAGGTTCAGTCCCATTGTGCAGGGACTACGAGATCGCTCGGTTCAATTACAAGTGGCATGCATGCAGCTCATCAATGCACTAGTAACATCCCCTGATGAGCTGGACTTCAGGCTGCACATCAGAAATGAATTCATGCGCTGTGGCCTGAAAGAAATATTGCCGCATCTGACAACCATCAGGAATGAGGCCCTTGACATTCAGCTAAAGGTATTTGAGGAGCACAAAGAAGAGGACATGATAGAGTTCTCTCACAGGCTGGAAGACATCAAAAGCGAACTGGATGATGTGGGGGACGTGTTCAGTATTGTACAGAGCATGGTGAAGGACAGCAGTGCAGAGCCCTATTTCCTGTCTATACTGCAGCACCTGATGCTTATACGCAACGACTACTTGGTCAGGCCCCAGTACTTTAAGATCATTGAGGAGTGTGTGTCTCAAATTGTGCTCCACCGTAGCGGCACTGACCCAGACTTCAGTTACCGCAAGCGCCTAGATGTGGACTTCAGCCACCTCTTAGaggTGTGTGTAGATAAAGCTCGAACTGACGAGTATGAACAGAGAGCTTCAGACCTGGCAGAGAAGTTTGACGAGGAGTTTCTAAGCAGACAGGAGGCACAAGCTCAGCTGGTTAAGTGTGATGAAAAAATAGCTGAACTCCAAGCAGAGCTGCAGGCCTTCAGGTCCCAGTTTGGAGCTGTACCTGTGGGTCTGTCCTCTGCCCATGTTGGACAGGCGTCCTCTTCCTCACCATTCTCATCTGGGCCTCCACCCCCTGCTGCAGCAGCTGGGATGCCAGCTCCCCCTCCTCCGCCTCCTTTGCCTGGTTGTCATGCCCCACCTCCCCCGCCTGGAGTGCCTCCTCCATTTGGtgccccccctccaccccctctAGGGTTTGGGGGTGGTCTAGGCTCCCCCACCCACCATGCATTGCCTTTTGGCCTCAGGCCTAAGAAGGATTTCAAGCCTGAGACCTCCATGAAACGCCTCAACTGGTCCAAGATTCGTCCCCAGGAAATGTCAGATGGCTGTTTCTGGGTGCGGGCTGATGAGAACCAATATGCGAAACCAGAGTTACTGTGCAGAGTTGCTCTCACTTTTTGTTCACAAAGAACAGAAACCAAGGACTGTGAGGAGAGTGTCCCAACAGAGGAGCCACCcaaaaaagaagaggaggatcTGGAGGATAAAAAATCCATAAAGAAAAGAATTAAAGAGCTCAAGGTGCTAGATCCTAAGATTGCACAGAATCTATCCATCTTCCTGGGTTCCTTCCGTATGCCTTACCAGGAAATCCGTCGGATGATAGTGGAGGTGGATGAGGAGCAACTCACTGAACCGATGATCCAGaACCTTGTGAAGCACCTACCAGAGCAGGAGCAGCTGAACGCCTTGGCCAAGTATAAAAATGAGTACGCAAATTTGTCGGAGCCTGAGCAATTTGGGGTTGTGATGAGCAGTGTGAAGAGGCTGCGTCCTCGCCTGAGCCACATCCTCTTCCGGCTGCAGTTTGAGGAGCAGGTAAACAACCTGCGTCCAGATATCCTGGCTGTTAACGCTGCGTGTGAGGAGGTCAGGAAGAGCCACTCCTTTGGCCGCTTGCTGGagctggtgctgctgctggggaATTACATGAACGCAGGATCTCGAAACGCCCAGTCATATGGCTTCGACCTCAGTTCCCTCTGCAAGCTGAAGGACACTAAGTCAGCGGACCAAAAAACCACATTACTTCACTTCCTGGTGCAAGTATGTGAGGAGGAATTTCCAGATGTGATCAAGTTTGTTGAAGACCTGGAGCATGTGGACCGATCTAGCAGAgtgtctgcAGAGAATCTGGAAAAGAGCCTCAGGCAGATGGAGatgcagctgctgcagctggagAGAGACCTGGAGACTTTCTCCTCCCCCGATGACCCCAACGACATGTTCCTCACTAAAATGGCTAGCTTCAGCAAGGTTGCCAGGGAGCAGTATGGCAAGCTGGTGATAATGCACCGCAATATGGAGACGCTATATCAAAATATGCTGGAGTACTTTGCCATCGACCCCAAGAAGACCTCTGTGGAGGAACTGTTTACAGATCTCAGCAACTTCCGTGCCATGTTCACTCAAGCACTGAAGGAAAACCTGAAGCAGAGGGAGTCAGAGGAGAAACAGAGGAGGGCACTGGCGGCAAAGGAGAAGGCTGAGCGTGAAAAGCAGGAGAGACAACAGAAGAAGAGGAGGTTGCTGGAAGTCAATGCAGAGAATGATGAGACAGGTGTGATGGATAGTTTGCTGGAAGCCCTACAGTCAGGAGCTGCTTTTAGAGACCGCAGGAGGAGAGCACCAAGACCCAGAGAGAACCAGCAGCAGGTGATCAGCCCCAGCTCCTTCCGCCAGGTTCTCAGGCCTGTTAACCATGaaaacaacaaGGCACCTTTGCAAAGGTCTCGCTCTCGGCAGAATATAAATTTAGGTTCAGCGGTGGTGAAAGCTCCCCCTGCCAAGGAGGCCCATAACGAGTCTGAGGGCCATCCATCTGCAGCCCGCACCAAGACTGCTGCATGTTCGGAGTCAGGCCGCAGGTACAGGAACACCCCGAGTCACAGCCACTGGCTGGACAGAGAGAGggtggtggagagagagactgtTAAGCTGACGGAAAATAAGATGGAGGTTGAAGCAGAGCCTCCGGCCTTCCAGCCGTCCTCCACTGCTGCTGCGGTCAGCAGCTGTGGCAGCAATGGAGAGTCCGACTTAGAGGCTCTCCTGGCCAAACTCAGGGCCTTGTGAGGTTCCTTTGCATTGTCTCTGAAACtacatacatttacagtatgtttgtACCCACACGTATTAACACACTCCAATGTGACCAAAAAGATTTAGGTGCAACAATTTAGTAAACAAGCAGAATATGTAGTTGGTAAGAAAAGGATTTGTCATTGCGTAAATAGCAGGGCAATTGAATTAAGCAATAACATCAAATAACCaacaaggattttttttaaagcttcgtagaaaatacatttgtttaaacAACCTATACATTTATGGACCATGCTTTTAACACTCGATACATTTCTAAAAGAATATTGAGAAAGGTGGAACACAGAATGTCCtcagaaataaataatatattgtgAATCAATGGAAACACTTAAGCATATTACCAAAATgcaacccaaatatattcagcAGTATCTACCGGATCCTGTAAAGTGCACTGCCAAAAGCGTTGGCTGCCATTCATATATTCTTAACTATGAGAATATAATATAACGTTTTGTCTGAAAGTAAAAGATGCAATGTAGGTAAGCACTTTCTTTGTATTCTAGAAGTATGCAATATTATGTTATCACATTTTCTTTCACATTGGCATTTCCTATAATAGCTTCTGTAgcatttattttacacatttatcATATTATCTTGTACTATCTGGATTTAAGTTTTTAATTACACATCAGTTACTTTCATATGTGTGTTAGAATTAAAAGACGTTAAgcttatatctgcatttattacTTTcagtatttaattattttcaatgtttttctctctttttttttttc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ttctAAAAAGAAAGCATTCTATAAAACTATAAATATGTATACACAAAGGATCAATGAATACGAGTTATGCCATTTGATTGTACTTTCACAAGTTAGATCAGTAATTAGATGTTAGTTGACAAGTCGAGTTTGGTTTTACTAGGCtgctttatttcatttatacaCAGTGAGAACAAGTCTGCAGAAAGTTAAGCGTATCTGAGAGTATTAATGTTCAAAATGTGGCACAAAAGAAACAAGTTCATCCAGCCACAAGTTAACCAGAGTTGATGCTGCTTTTCGCCACCTACATTCCCACCAAAATTACTCATATCTTAAGCATATTTGTTGTCTCTTTATCCGCTCACTTTTATATAGACCCGTTTACAATaaaatgaagcaaaaaaaaatacgtTGTCTCGTTTCATAAATCACGAAAGTTTCAACTGTATGACTGAAATGAATACATGTCAATGTttgtgtggctgtttgtgtttatttatgcTTGTTTTATTCTCAGTGTGTTGCTTATAGTCATTATACTTTAACATTTACCAAGTTAGAGTGCAGAAACACGGATCACAGCCTCTCTGTggctaatttaaatagttgcATTGATCAAGTATACGACTTGATTCGTGATAAATAGGACTTTAGTATTCAGCCTTCAGTTAGCTTGTATGTGCTTGTAATTGTAATAAAGATATTTGGGGAATATGTTAGCAGCACCTGCCAGCTGAACTGACACTTTGATGGTGGAGACGACATGAGACAATCGACACAGGCCCAAATGGCTCAGATCATCTGTGCCCAAATTCTCCCAAGTGATGATTTACTCCTTTTATTAAGTGTTCACAATATTTTCTCTACCCcctgtactgtttttttttttctgcatttgctTGGCTTTTAGGTGGGCATTCCTTTAGCAGGACAACATGCTGCTAAGAGAGAACTGTAAGTGTTACTACATGTTTTTGTCCACATATCGGTGGTCTGTCGGTGGCGACTTTTGTATGTTCCTCTGTTTCTTGttgattctttatttttatttacttatttctaAAATGTGATAAATGGGCTCTTCAAAAATGTAGTGCCTTGGTTGAACAACATACAACAAAAAGAAGTTATAGTGTGCCGTGTCCTTGTAGAAGTTCTCTTGTTGTTCGTGCATAATTTGGTACATAATGATCTCAGTTTTCTTGTGATTTATGAATGGGTTTGCTCATAAAACAATACATAATCCTGTGTACACATAATACAAATCCAGATTTATCATATTTTCTGCGTTGTTAAATTGTCTAAATAAAAGTCACACCTGACTCAAA

Function

symbol description
diaph3 Predicted to enable actin binding activity. Predicted to act upstream of or within actin cytoskeleton organization. Human ortholog(s) of this gene implicated in autosomal dominant auditory neuropathy 1. Orthologous to human DIAPH3 (diaphanous related formin 3).

NR:

description
PREDICTED: protein diaphanous homolog 3

GO:

id name namespace
GO:0030036 actin cytoskeleton organization biological_process
GO:0003779 actin binding molecular_function

KEGG:

id description
K05745 DIAPH3, DRF3; diaphanous 3

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_039794835.1 True 6385 mRNA 0.44 30 20504098 20692974
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XM_039794840.1 False 6310 mRNA 0.44 27 20504098 20692974

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
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LOC120556481 NA coding downstream 593869 21286843 ~ 21287974 (+)
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LOC120556135 tmem255b coding downstream 741285 21434259 ~ 21453303 (+)
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LOC120555792 pcdh9,LOC102784100 other upstream 510144 19772119 ~ 19993954 (+)
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tpp2 tpp2 other downstream 832618 21525592 ~ 21562814 (+)
dcun1d2b dcun1d2,LOC102792160 other downstream 903357 21596331 ~ 21603906 (+)

Expression


Co-expression Network