btbd10b (btbd10,LOC103362377)



Basic Information


Item Value
gene id btbd10b
gene name btbd10,LOC103362377
gene type coding
species eurasian perch (Perca fluviatilis)
category of species economic fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_053114.1
NCBI id CM020911.1
chromosome length 46923577
location 25639529 ~ 25650613 (+)
genome version GENO_Pfluv_1.0_2020_eurasian_perch_Genome

Sequence


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Function


symbol description
btbd10 Predicted to be involved in negative regulation of neuron death; positive regulation of phosphorylation; and type B pancreatic cell proliferation. Located in fibrillar center and nucleoplasm.

NR:

description
PREDICTED: BTB/POZ domain-containing protein 10 isoform X1

GO: NA

KEGG:

id description
K10482 BTBD10; BTB/POZ domain-containing protein 10

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_039795590.1 True 2498 mRNA 0.46 9 25639529 25650613
XM_039795591.1 False 2419 mRNA 0.46 9 25639529 25650613
XM_039795592.1 False 2495 mRNA 0.46 9 25639529 25650613
XM_039795594.1 False 2345 mRNA 0.46 8 25639531 25650613
XM_039795595.1 False 2348 mRNA 0.46 8 25639531 25650613
XM_039795596.1 False 2266 mRNA 0.46 8 25639531 25650613
XM_039795597.1 False 2269 mRNA 0.46 8 25639531 25650613

Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
ctr9 ctr9 coding upstream 222743 25407601 ~ 25416786 (+)
ampd3a LOC104930104 coding upstream 283676 25326246 ~ 25355853 (+)
adma NA coding upstream 304050 25332984 ~ 25335479 (+)
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dkk3a dkk3 coding downstream 154832 25805445 ~ 25810504 (+)
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LOC120556589 NA coding downstream 314066 25964679 ~ 25964758 (+)
G29851 NA non-coding upstream 2404 25624948 ~ 25637125 (+)
G29849 NA non-coding upstream 17077 25622189 ~ 25622452 (+)
LOC120555969 NA non-coding upstream 65108 25570791 ~ 25574421 (+)
G29794 NA non-coding upstream 184390 25454668 ~ 25455139 (+)
LOC120555818 NA non-coding upstream 193477 25442301 ~ 25446052 (+)
G29868 NA non-coding downstream 35227 25685840 ~ 25688108 (+)
G29915 NA non-coding downstream 211115 25861728 ~ 25862391 (+)
G29922 NA non-coding downstream 279134 25929747 ~ 25929973 (+)
G29964 NA non-coding downstream 354650 26005263 ~ 26006950 (+)
G29974 NA non-coding downstream 407315 26057928 ~ 26059434 (+)
sox6 sox6,LOC103363464 other upstream 1183841 24320064 ~ 24455688 (+)
plekha7b NA other upstream 1324884 24235723 ~ 24314645 (+)
G29433 NA other upstream 1907058 23727012 ~ 23732471 (+)
igdcc3 igdcc3 other upstream 2122266 23443149 ~ 23517263 (+)
G29292 NA other upstream 2502502 23136732 ~ 23137027 (+)
pkd1l2a vat1l,pkd1l2,LOC102776808 other downstream 205226 25855839 ~ 25883360 (+)
nfat5b nfat5 other downstream 232841 25883454 ~ 25927726 (+)
LOC120556198 LOC103371916,LOC104965843 other downstream 1645144 27295757 ~ 27316181 (+)
nedd4a nedd4,LOC103371920,LOC102785817 other downstream 1667757 27318370 ~ 27351837 (+)
LOC120555577 NA other downstream 1758427 27409040 ~ 27410250 (+)

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