nkpd1 (LOC104962748)


Basic Information

Item Value
gene id nkpd1
gene name LOC104962748
gene type coding
species eurasian perch (Perca fluviatilis)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_053114.1
NCBI id CM020911.1
chromosome length 46923577
location 21331153 ~ 21352064 (+)
genome version GENO_Pfluv_1.0_2020_eurasian_perch_Genome

Sequence

>XM_039795974.1
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>XM_039795975.1
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Function

NR:

description
PREDICTED: NTPase KAP family P-loop domain-containing protein 1-like

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_039795974.1 True 4119 mRNA 0.42 6 21331153 21352064
XM_039795975.1 False 4114 mRNA 0.42 5 21331893 21352064
XM_039795976.1 False 4052 mRNA 0.42 5 21331153 21352064

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC120556481 NA coding upstream 43179 21286843 ~ 21287974 (+)
LOC120555780 diaph3 coding upstream 638179 20504098 ~ 20692974 (+)
LOC120555422 pcdh20 coding upstream 884380 20442399 ~ 20446773 (+)
pou4f1 pou4f1,LOC103143517,LOC106914826 coding upstream 1713701 19614845 ~ 19617452 (+)
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trmt10c NA coding downstream 20093 21372157 ~ 21374142 (+)
ercc5 ercc5,LOC104958986 coding downstream 29145 21381209 ~ 21390547 (+)
LOC120556135 tmem255b coding downstream 82195 21434259 ~ 21453303 (+)
adprhl1 adprhl1,LOC102790835 coding downstream 253053 21605117 ~ 21613287 (+)
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LOC120556583 NA non-coding downstream 57588 21409652 ~ 21413209 (+)
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LOC120555792 pcdh9,LOC102784100 other upstream 1337199 19772119 ~ 19993954 (+)
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tpp2 tpp2 other downstream 173528 21525592 ~ 21562814 (+)
dcun1d2b dcun1d2,LOC102792160 other downstream 244267 21596331 ~ 21603906 (+)
gpc5a gpc5,LOC103365231 other downstream 367970 21720034 ~ 21872025 (+)

Expression


Co-expression Network