G35364


Basic Information

Item Value
gene id G35364
gene name NA
gene type misc
species eurasian perch (Perca fluviatilis)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_053115.1
NCBI id CM020912.1
chromosome length 44863486
location 2583514 ~ 2588162 (+)
genome version GENO_Pfluv_1.0_2020_eurasian_perch_Genome

Sequence

>TU47272
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>TU47273
TATTTCGTTCACGTTCTACAGAGCAGTAACCAGTTTGGCATTGAAGTGCAgttttcatgataaaaagaaagtAACGACAAACAAGTCATGTTCACCAAGGCATCTTAAACtgattaaagctgcactaatcaacaTCTTTATATAGAAATTGATCAAATTACATTCATCGAGTGGGCACAAACATGGATCCAATTGGATGATAATGTTCCTCCTTGTCTACAGGAGGTGTAAATAATCAACTCAAGAGGCCATTAAGTAATAATTAACTGACGCAGCTTTAACTATAACCATTAACTGCATTTAGTTTAATATGTCGGATCAGAAATCTCAGTCTCATCAGTCACGATTCCAGAGAAACACGTATGTAGTATGATCCTTCAGCCAGTTCATTGTAATTGTCCAGGAAATGCATAGTGAATCAAACAGGGTTTTTCCACTACATGGTAACAGCTCAGCTCGGCTGGTCATCGTGGcgccgccgcaggaaactgccgtgactaGAGATGCACGGATAGAGCGGCCGGTGACCAGAGTTGGCCGGTTTTCCCGTGCTCGGTCAGTCTGACCTAtggcgatttcatgccggtcaacgctacgaTTACCTGACAACAGAAGTTGGTTCTAACGTTggtctttagatgtgtgtgaatgtcccacaccaggagtaatttatataaatCTAttatatagtgatccattatctggtcaacacatgttctattaaagaaaggattgaaaatacatgtttgtgtgtgctgtaaagtggttagaaaagaTGAAAAATGAGCGTAACTCAAAAGAAAATCAgaaatcggcctagaaagttgtaattggtgcatctctagcctaacgtcacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacactagaaggtgtgtgtgtctgataacCCAAAAATAACCCACctctggctaaactatttaaaaatgggggggggggggtgttcagGACACACCCCCCCAGTCTGTCTCTaccaatgatgacgcagtgattagtgacgattctctccgaccaatcagcagtctgcaggttttctcGTGACCTTTTGGTGTCGCCTCAGCTCGCTGGGAGCCTCCACGGAGCTGGGACTAAATAAAGTagctgttggcaggtaccagggactgtTTATCAGAACGGAAAACCTAAAAAGGtgagccgagccgagccgagcaGGTTTAGTGGAagtggaaaaacgccataaacAGCAGTGTTCATATTGCTCtttaacacccccccccccaaatacaCTCCACACTAATCCCTCCACCATCTGACAGACACCAACATTAccagggctgctccctcttggTGGatcagtcgactaatcggtggttttggtcttagtcaacttagatctctttactccattagtcatgtctgatgctgttttcatgctgaatgactgatTTTACCAAGAAACATACGAGCTCaactctggtaaacacaagaattaaagggATAGGCCACCTCACCGTgtggtgaaatagggcttatcaaggtctcccctagctgtagataggtgaggtctcccctagctgtagataggtggggtctcctctagctgtagatagtggggtctcctctagctgtagataggtgaggtctcctctagctgtagataggtggggtctcctctagctgtagataggtgggtctcctctagctgtagataggtggggtctcctctagctgtagataggtgaggtctcctctagctgtagataggtggggtctcctctagctgtagataggtgagg
>TU47274
gtctcctctagctgtagataggtggggtctcctctagctgtagataggtggggtctcctctagatgtagataggtggggtctcctctagatgtagataggtggggtctcctctagctgtagataggtgaggtctcctctagctgtagataggaggggtctcctctagctgtagataggtggggtctcctctagctgtagataggtgggccaactcattttttgtgcatgcattgttttagtccggtgcaacaccggcagcgccgccgctagttagcttagcgtagtgaatggaatcctatgttgccggttagcatgttgtgagtaaaagtgagccgacaaaagacaaaaaaacaacctaattacttgcactgagacaaataatgcgttggcccacctatctacagccaggggagaccgtgataagacctatttcaactaacggtggagtatccctttaagggttgacattttacctcacagatatcaccgtgaaacctactttgattacttttaattaaggcagttatttgttgtattacacgttttctgaaatgttgtgtttaaatatgcaaaaggAGGTCATTATCTTATAcaatatatgcatccttttagcatgactctttgtggagaaactcagatttacagatctgtcgattaaatcaactaatcgattagtcggtacgattgagtgttagtcgacttaGAATTTATTCAAATCGAACACAGCCCTACGAATGGACcttcttcacagcagacatgttgacttgtcatagtaggaaaagcacagctgagattgatcaccttaacgatggctcagttccatcaagtgcacaataccaggacctctcctaagtggaatgcagccatcagtaatggtttaataccaggacctctcctaagtggattacagccatcagtaatggtttaataccaggacctCTCCTAAGAGGattacagccatcagtaatggtttaataccaggacctctcctaagtggaatacagccatcagtaatggtttaataccagggcctctcctaagtggattacagccatcagtaatggtttaataccaggacctctcctaagtggattacagccatcagtaatggtttaataccaggacctctcctaagtggattacagccatcagtaatggtttaataccaggacctctcctaagtggattacagccatcagtaatgggtcTGAATACACCTTGTGctgttcctactatgacatgtcaacatgtctgctgtgaagaagGTCTATtagctccctccctccccctttctctaATAAAGCAGTGggacaaacggagacatttacAGTCTGTCACCTCTAAGTCTGGTGTGTCACCTGCAGCAGCGCTGACACAAGTCTACGTATAACCCTTCCTGACGGGCCAGGCTGCTTCCTGACAGCTCACGCCATAGTTTCTGGCTGATGGACGGTGCAGCCAAGCAGGGCCAAAAACAAGTCCAAAATAATGAgaacaacaaagaaaagaactgtctcctcctcctcctcctccacccataTGTtcgtccctctctctctctcgctctgtggCACAGATTGGGTGTTCGGTGGCGTTCTGGGAGCTTCCTCCTGCGCCCGATGCTACATGATGATTCGTGGCTCTGGGACCGACTCGCTGATGGATTTGTGCGGCAGCACGTTGGCGCCGTTCAGGTACAGCTCGTCGTTCACGATCACGTCCTCGCCCAGCACCGTCACGTTCTCCATACGCACCTGGAGACGCAGAGGTCATCATCACACCTAACTACAAGCTAGCATAGACATAGAGTACATAGACATacagcacacagacatacaggacatagacATCACACCTAACTACAAGCTAGCATAGACATAGAATAC

Function

GO: NA

KEGG:

id description
ko04130 SNARE interactions in vesicular transport

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU47272 True 3666 lncRNA 0.46 6 2583514 2588162
TU47273 False 1789 lncRNA 0.45 3 2583514 2585444
TU47274 False 1887 TUCP 0.46 3 2586175 2588162

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
ahcy ahcy coding upstream 616998 1938583 ~ 1966516 (+)
LOC120558247 NA coding upstream 627064 1956316 ~ 1956450 (+)
LOC120558248 NA coding upstream 631030 1952350 ~ 1952484 (+)
LOC120558249 NA coding upstream 636087 1947337 ~ 1947427 (+)
chmp4ba chmp4b,LOC101481733,LOC102786921,LOC102203309,LOC104933698,LOC107093444,LOC108243665 coding upstream 656868 1913110 ~ 1926646 (+)
LOC120558182 flnb coding downstream 52226 2640388 ~ 2734534 (+)
LOC120558018 NA coding downstream 147697 2735859 ~ 2745280 (+)
LOC120557397 NA coding downstream 222096 2810258 ~ 2818790 (+)
LOC120557395 NA coding downstream 238727 2826889 ~ 2836128 (+)
ccdc51 NA coding downstream 275374 2863536 ~ 2882763 (+)
G35371 NA non-coding upstream 40307 2522740 ~ 2543207 (+)
G35357 NA non-coding upstream 81066 2460483 ~ 2502448 (+)
G35355 NA non-coding upstream 94727 2456071 ~ 2488787 (+)
G35358 NA non-coding upstream 102573 2474076 ~ 2480941 (+)
G35332 NA non-coding upstream 181704 2154392 ~ 2401810 (+)
G35374 NA non-coding downstream 33713 2621875 ~ 2622740 (+)
G35377 NA non-coding downstream 40625 2628787 ~ 2664101 (+)
G35379 NA non-coding downstream 117438 2705600 ~ 2706455 (+)
G35380 NA non-coding downstream 131912 2720074 ~ 2720701 (+)
G35541 NA non-coding downstream 171042 2759204 ~ 2759496 (+)
G35359 NA other upstream 88923 2487994 ~ 2494591 (+)
LOC120556786 NA other upstream 195540 2385615 ~ 2387974 (+)
asip1 NA other upstream 531371 2024224 ~ 2052143 (+)
G35295 LOC107380983,LOC102290002,LOC108241855,LOC108250349,LOC106456447,LOC101470105,LOC102800009,LOC102214284,LOC101480046,LOC102215411,LOC102307835 other upstream 745859 1811624 ~ 1837655 (+)
G35191 NA other upstream 1354346 1224083 ~ 1229168 (+)
G35534 NA other downstream 159058 2747220 ~ 2747772 (+)
G35578 NA other downstream 342762 2930924 ~ 3017125 (+)
G35618 NA other downstream 656069 3244231 ~ 3358820 (+)
epha8 epha8,LOC102791453 other downstream 865438 3453600 ~ 3589612 (+)
G35791 LOC101072424,LOC104921976 other downstream 1360672 3948834 ~ 3950128 (+)

Expression


Co-expression Network