G35374


Basic Information

Item Value
gene id G35374
gene name NA
gene type non-coding
species eurasian perch (Perca fluviatilis)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_053115.1
NCBI id CM020912.1
chromosome length 44863486
location 2621875 ~ 2622740 (+)
genome version GENO_Pfluv_1.0_2020_eurasian_perch_Genome

Sequence

>TU47291
ccgccacctacaggtctcgttacacctccacctacaggtctcgttacacctccacctacaggtctcgttacaccgccacctacaggtctcgttacacctccacctacaggtctcgttacacctccacctacaggtctcgttacaccgccacctacaggtctcgttacacctccacctacaggtctcgttacacctccacctacaggtctcgttacaccgccacctacaggtctggttacaccgccacctacaggtctggttacaccgccacctacaggtctcgttacacctccacctacaggtctcgttacaccgccacctacaggtctcgttacaccgccacctacaggtctggttacaccgccatctacaggtctcgttacacctccacctacaggtctcgttacaccgccatctacaggtctcgttacaccgc
>TU47292
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>TU47294
ccgccacctacaggtctcgttacacctccacctacaggtctcgttacacctccacctacaggtctcgttacacctccacctacaggtctcgttacacctccacctacaggtctcgttacaccgccacctacaggtctcgttacacctccacctacaggtctcgttacacctccacctacaggtctcgttacaccgccacctacaggtctggttacaccgccacctacaggtctcgttacacctccacctacaggtctcgttacaccgccacctacaggtctcgctacaccgccacctacaggtctcgtcacacctccacctacaggtctcgttacaccgccacctacaggtctggttacaccgccacctacaggtctcgttacacctccacctacaggtctcgttacaccgccacctacaggtctcgttacacctccacctacaggtctggttacaccgccatctacaggtctcgttacacctccacctacaggtctcgttacaccgccatctacaggtctcgttacaccgc
>TU47295
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>TU47296
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>TU47297
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>TU47300
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>TU47301
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>TU47302
ccgccacctacaggtctcgttacacctccacctacaggtctcgttacacctccacctacaggtctcgttacaccgccacctacaggtctcgttacacctccacctacaggtctcgttacacctccacctacaggtctcgttacaccgccacctacaggtctggttacaccgccacctacaggtctcgttacacctccacctacaggtctcgttacaccgccacctacaggtctcgttacaccgccacctacaggtctggttacaccgccatctacaggtctcgttacacctccacctacaggtctcgttacaccgccatctacaggtctcgttacaccgc

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU47291 False 436 lncRNA 0.56 4 2621875 2622740
TU47292 True 650 lncRNA 0.56 2 2621875 2622740
TU47294 False 532 lncRNA 0.57 3 2621875 2622740
TU47295 False 364 lncRNA 0.56 3 2621875 2622740
TU47296 False 388 lncRNA 0.56 2 2621875 2622740
TU47297 False 340 lncRNA 0.56 4 2621875 2622740
TU47300 False 340 lncRNA 0.57 3 2621875 2622740
TU47301 False 340 lncRNA 0.56 4 2621875 2622740
TU47302 False 340 lncRNA 0.56 4 2621875 2622740

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
ahcy ahcy coding upstream 655359 1938583 ~ 1966516 (+)
LOC120558247 NA coding upstream 665425 1956316 ~ 1956450 (+)
LOC120558248 NA coding upstream 669391 1952350 ~ 1952484 (+)
LOC120558249 NA coding upstream 674448 1947337 ~ 1947427 (+)
chmp4ba chmp4b,LOC101481733,LOC102786921,LOC102203309,LOC104933698,LOC107093444,LOC108243665 coding upstream 695229 1913110 ~ 1926646 (+)
LOC120558182 flnb coding downstream 17648 2640388 ~ 2734534 (+)
LOC120558018 NA coding downstream 113119 2735859 ~ 2745280 (+)
LOC120557397 NA coding downstream 187518 2810258 ~ 2818790 (+)
LOC120557395 NA coding downstream 204149 2826889 ~ 2836128 (+)
ccdc51 NA coding downstream 240796 2863536 ~ 2882763 (+)
G35363 NA non-coding upstream 12359 2577634 ~ 2609516 (+)
G35361 NA non-coding upstream 30527 2481317 ~ 2591348 (+)
G35371 NA non-coding upstream 78668 2522740 ~ 2543207 (+)
G35357 NA non-coding upstream 119427 2460483 ~ 2502448 (+)
G35355 NA non-coding upstream 133088 2456071 ~ 2488787 (+)
G35377 NA non-coding downstream 6047 2628787 ~ 2664101 (+)
G35379 NA non-coding downstream 82860 2705600 ~ 2706455 (+)
G35380 NA non-coding downstream 97334 2720074 ~ 2720701 (+)
G35541 NA non-coding downstream 136464 2759204 ~ 2759496 (+)
G35544 NA non-coding downstream 144067 2766807 ~ 2774590 (+)
G35364 NA other upstream 33713 2583514 ~ 2588162 (+)
G35359 NA other upstream 127284 2487994 ~ 2494591 (+)
LOC120556786 NA other upstream 233901 2385615 ~ 2387974 (+)
asip1 NA other upstream 569732 2024224 ~ 2052143 (+)
G35295 LOC107380983,LOC102290002,LOC108241855,LOC108250349,LOC106456447,LOC101470105,LOC102800009,LOC102214284,LOC101480046,LOC102215411,LOC102307835 other upstream 784220 1811624 ~ 1837655 (+)
G35534 NA other downstream 124480 2747220 ~ 2747772 (+)
G35578 NA other downstream 308184 2930924 ~ 3017125 (+)
G35618 NA other downstream 621491 3244231 ~ 3358820 (+)
epha8 epha8,LOC102791453 other downstream 830860 3453600 ~ 3589612 (+)
G35791 LOC101072424,LOC104921976 other downstream 1326094 3948834 ~ 3950128 (+)

Expression


Co-expression Network