G37186


Basic Information

Item Value
gene id G37186
gene name NA
gene type non-coding
species eurasian perch (Perca fluviatilis)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_053115.1
NCBI id CM020912.1
chromosome length 44863486
location 10257250 ~ 10260329 (+)
genome version GENO_Pfluv_1.0_2020_eurasian_perch_Genome

Sequence

>TU49881
aatccaaCGCTTTGGAGGCTAATGCAAAAAATCCAGAGTCGAGGCAATGATgtttggatttttgttttttactttttaggGACAGAGACTTAAAACATGTTGGCTTGGCCAGAGCCATGCTGTAGCAATGTCTGTTGTAGCAGAACCTTAaacatttacagaaaaaaatcGGACAGTTTTTTGTACTCCTAGACATTCAtacagtgtacacacacacacacacacacaagcagagcaaTTTGTCTTGACACATATTTAGTTCCATCTATCGAGCCACTTGAAAATGTATCCCCTTTAAGTTTCAGGGGTTCAAAGTTCACAATTGGATATCAGAATATCTGTGATGTAGCTCATAGTCTcaggttgacacacacacacacacacacacacactaaaatccAGGAGccattcatttgtgtgtgtttgtttgtaactAGAGCTTAAGCTAGCAGAGAAGACTGTTTTGACATCACTGTCTGCTGAGTGCCAAAGTCCTTCACTCCCTTGGTAATGCAGCTCTGGAGTCTGAAACCATGTTTAGACATTCAGTACAAGACCGCTATTTTACTGTTCAAGGATCTGTAACCAACACACTACTGGACTACCGTATAACAGGAAGTTACTgaagtagaaataaatacacattttttacaGCATACATTAAGGAGAATTGGTCAAGCTTTTATGTTGAATCtctaaaattattttcattttatttacagtatcgTAACAGTATCTGCAGCAATGTTGATCATGTCGACAAGCCAAATCACAAATAACACAATCGCAATTAACCCCATTATTGCATCATAGAAAACAACGTGTTATATACCAAGcatatttcttttcttgtttaCAGACACACGTCAGTATTTCTTGTAGATTGTATTGAGCATTTCTTTTCTGTAGGGGGTGTCCTTTGAGTCTGCCTGAACTAACTCATTTCTTACATCTTTTATATCAGCCTTGCATCTTTACGCTGTACTATCACTTTTAAAGAATGATTCCCTTTTTATTTCCCACCATGAACACTGATGCCGAAGAATGTCTCTTTTAATTTGAATGCTGTTGCTAACGTATTCCTCAAAAATGGATACATTGTTACTTCAATAGTGGAAGTGTGCCATGCCATGTTtgctcagtttttctttttataatggCTGTCCTGTGAGGACACCAACACTTGAATTacagtggggttttttttttcttcagatgaGGTCACATTGAGGCTATGCACTCAATTGTGATAAATGATGTTCGTTAACTGCAGGGCTTCAGGTCAGTCATGTCATCTTGTTCAGATCAGGAAATGACTGATTGCAGAATTGTTTAAATTTACAAATTGAAATGAGTTCATCTCCAAAGCTGACTCACATTTAAATGGTTTGACTCCCCACCAGAAGAATATTCAGACAGAAAGCCTTGTATGGATTTGAACAGAATTTgacatattaaaaatatttcttttaagAGTTTTCAAGCTAtttcaatgtttattttaaCAGAGAACAGCCCCATTCTTGTACATAATTGCATCCCACAACAGTCTAAATCACACTAACAGTCCCttattaaattactttttcCTGACGCGAGGAGCACAATCAATCCTAATTTATTGATAGTGGACAACTATCAATATGctgatttaaattttttttttttaggaaaggTAATGCGTCGATGTTAATTGTTGAACACACATGCACTATTTGCACCAAAAGCAAAGCCCTTAAAAATACGGAACCAAATGAGAGATGAGGTCAGAATGATGATATGGCCTTGAAATCAGAATATGGCAACTATATTAGCTCTTTTAGGGTTAAGCCTTCTCTAAGGCCCCTGTAGGGACTTAGAGTAGCAGATATTTTAATTGACCAGTCACTGAAATTGTTGGCTGTTCGTGCATCGTCATTTCAGGTCTTCTTTGGTTCCATTCATCACACAAGTGTCTGCACTATTCGTTAGGTGCCATTATGTTCTTCATTTATGTACTTTGTCACTTACCGTGTCTTTAGTTAACAGAGGAGGGGATTTTTGTTTGCCAATTCTGTCTGTGCTTAAATTACATGGGTTTCTTGTGTGTGCTTGAATAGTGACTGTCTCACTGCAATTTGACAGCAAAACATGACACTGTGCCAACCCATGAGACCCACTATTTTGCTATTATAGTGAACTTAAAAAAGTGCCTCACTTGCaggttttcaaaaacaaaaacattacgTAAAATATGTGCTGCAACCACTGTCCTCCTAAAGGCAGTCCTTTGCATTTTCCCAACTCGCATGTATTTTCTCAACTGTCACCTGCAGACCAATGACACACCTCTTTGTATGACAAATCAATAGGGCCAAAACCAAGAGTGGGTCAGTCATCCTTCCTTTTACATTCCCCCTAGTCACATATCCATAGATTCCTTAATTGTGCAGATCAAACTAACATTGAGGtcactttttaaataaatgccatcTTGATTAAATGGCTTAATTTAATTCCATATCACTGAAATGTGGTATCCATGACAAGTAATCAATTGTGGGTACCCGAATGTTCAACAGAAAATCATAAATTTTCccccacaacaaaaacaattgcATATTTTATGCATAATCACCAAGGGAAACCAAATAGTTGTGTTTCATATTCCTTTATTCCTGGAGCTTTTCACCAGTGGAGTGTTTTGAATGCCCCGGAGAATTAAAATACATCTCCATTTCTAGAGCATCGGACTGGAAGAAGACTAGAGTCCAATGTCCTTTATGTCTCCTGTCCAGCTCCACTCACTGCTGTCTACTCATCgccttcttttccttttttacttTGTCCTAGGACAAAGGCCCACTCGCTTTTGTACATAATGTGAggttatttatatttcattcCTGTCTGCTGCCTTGCTTATTATATTTTCTTCCCCACCCCCCCTtcttttttgaaataaaaaagatgTATAATGAACTGTATCGGGAccattttgaaatgtattaaaGATGTTTTGTTTCGGGCCATTTTTAATTTGGTATAATTGTCTTAAGCAAATCCTATTTTTTAATTTGC
>TU49882
aatccaaCGCTTTGGAGGCTAATGCAAAAAATCCAGAGTCGAGGCAATGATgtttggatttttgttttttactttttaggGACAGAGACTTAAAACATGTTGGCTTGGCCAGAGCCATGCTGTAGCAATGTCTGTTGTAGCAGAACCTTAaacatttacagaaaaaaatcGGACAGTTTTTTGTACTCCTAGACATTCAtacagtgtacacacagacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacactaaaatccAGGAGccattcatttgtgtgtgtttgtttgtaactAGAGCTTAAGCTAGCAGAGAAGACTGTTTTGACATCACTGTCTGCTGAGTGCCAAAGTCCTTCACTCCCTTGGTAATGCAGCTCTGGAGTCTGAAACCATGTTTAGACATTCAGTACAAGACCGCTATTTTACTGTTCAAGGATCTGTAACCAACACACTACTGGACTACCGTATAACAGGAAGTTACTgaagtagaaataaatacacattttttacaGCATACATTAAGGAGAATTGGTCAAGCTTTTATGTTGAATCtctaaaattattttcattttatttacagtatcgTAACAGTATCTGCAGCAATGTTGATCATGTCGACAAGCCAAATCACAAATAACACAATCGCAATTAACCCCATTATTGCATCATAGAAAACAACGTGTTATATACCAAGcatatttcttttcttgtttaCAGACACACGTCAGTATTTCTTGTAGATTGTATTGAGCATTTCTTTTCTGTAGGGGGTGTCCTTTGAGTCTGCCTGAACTAACTCATTTCTTACATCTTTTATATCAGCCTTGCATCTTTACGCTGTACTATCACTTTTAAAGAATGATTCCCTTTTTATTTCCCACCATGAACACTGATGCCGAAGAATGTCTCTTTTAATTTGAATGCTGTTGCTAACGTATTCCTCAAAAATGGATACATTGTTACTTCAATAGTGGAAGTGTGCCATGCCATGTTtgctcagtttttctttttataatggCTGTCCTGTGAGGACACCAACACTTGAATTacagtggggttttttttttcttcagatgaGGTCACATTGAGGCTATGCACTCAATTGTGATAAATGATGTTCGTTAACTGCAGGGCTTCAGGTCAGTCATGTCATCTTGTTCAGATCAGGAAATGACTGATTGCAGAATTGTTTAAATTTACAAATTGAAATGAGTTCATCTCCAAAGCTGACTCACATTTAAATGGTTTGACTCCCCACCAGAAGAATATTCAGACAGAAAGCCTTGTATGGATTTGAACAGAATTTgacatattaaaaatatttcttttaagAGTTTTCAAGCTAtttcaatgtttattttaaCAGAGAACAGCCCCATTCTTGTACATAATTGCATCCCACAACAGTCTAAATCACACTAACAGTCCCttattaaattactttttcCTGACGCGAGGAGCACAATCAATCCTAATTTATTGATAGTGGACAACTATCAATATGctgatttaaattttttttttttaggaaaggTAATGCGTCGATGTTAATTGTTGAACACACATGCACTATTTGCACCAAAAGCAAAGCCCTTAAAAATACGGAACCAAATGAGAGATGAGGTCAGAATGATGATATGGCCTTGAAATCAGAATATGGCAACTATATTAGCTCTTTTAGGGTTAAGCCTTCTCTAAGGCCCCTGTAGGGACTTAGAGTAGCAGATATTTTAATTGACCAGTCACTGAAATTGTTGGCTGTTCGTGCATCGTCATTTCAGGTCTTCTTTGGTTCCATTCATCACACAAGTGTCTGCACTATTCGTTAGGTGCCATTATGTTCTTCATTTATGTACTTTGTCACTTACCGTGTCTTTAGTTAACAGAGGAGGGGATTTTTGTTTGCCAATTCTGTCTGTGCTTAAATTACATGGGTTTCTTGTGTGTGCTTGAATAGTGACTGTCTCACTGCAATTTGACAGCAAAACATGACACTGTGCCAACCCATGAGACCCACTATTTTGCTATTATAGTGAACTTAAAAAAGTGCCTCACTTGCaggttttcaaaaacaaaaacattacgTAAAATATGTGCTGCAACCACTGTCCTCCTAAAGGCAGTCCTTTGCATTTTCCCAACTCGCATGTATTTTCTCAACTGTCACCTGCAGACCAATGACACACCTCTTTGTATGACAAATCAATAGGGCCAAAACCAAGAGTGGGTCAGTCATCCTTCCTTTTACATTCCCCCTAGTCACATATCCATAGATTCCTTAATTGTGCAGATCAAACTAACATTGAGGtcactttttaaataaatgccatcTTGATTAAATGGCTTAATTTAATTCCATATCACTGAAATGTGGTATCCATGACAAGTAATCAATTGTGGGTACCCGAATGTTCAACAGAAAATCATAAATTTTCccccacaacaaaaacaattgcATATTTTATGCATAATCACCAAGGGAAACCAAATAGTTGTGTTTCATATTCCTTTATTCCTGGAGCTTTTCACCAGTGGAGTGTTTTGAATGCCCCGGAGAATTAAAATACATCTCCATTTCTAGAGCATCGGACTGGAAGAAGACTAGAGTCCAATGTCCTTTATGTCTCCTGTCCAGCTCCACTCACTGCTGTCTACTCATCgccttcttttccttttttacttTGTCCTAGGACAAAGGCCCACTCGCTTTTGTACATAATGTGAggttatttatatttcattcCTGTCTGCTGCCTTGCTTATTATATTTTCTTCCCCACCCCCCCTtcttttttgaaataaaaaagatgTATAATGAACTGTATCGGGAccattttgaaatgtattaaaGATGTTTTGTTTCGGGCCATTTTTAATTTGGTATAATTGTCTTAAGCAAATCCTATTTTTTAATTTGC

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU49881 True 3060 lncRNA 0.37 2 10257250 10260329
TU49882 False 2929 lncRNA 0.37 2 10257250 10260329

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
ptpra ptpra coding upstream 156 10232892 ~ 10257094 (+)
idh3b idh3b coding upstream 26571 10219726 ~ 10230679 (+)
drd5a drd5 coding upstream 212701 10040300 ~ 10044549 (+)
otop1 otop1 coding upstream 218376 10029586 ~ 10038874 (+)
tmem128 tmem128 coding upstream 227763 10016907 ~ 10029487 (+)
gnrh2 NA coding downstream 4099 10264428 ~ 10266475 (+)
zmat1 NA coding downstream 6486 10266815 ~ 10274959 (+)
cd8b NA coding downstream 18124 10278453 ~ 10282520 (+)
cd8a NA coding downstream 29741 10290070 ~ 10293048 (+)
pcsk1 pcsk1 coding downstream 80351 10340680 ~ 10355619 (+)
G37177 NA non-coding upstream 50493 10204789 ~ 10206757 (+)
G37163 NA non-coding upstream 204913 10052128 ~ 10052337 (+)
G37104 NA non-coding upstream 250394 9928035 ~ 10006856 (+)
G37112 NA non-coding upstream 294673 9957835 ~ 9962577 (+)
G37064 NA non-coding upstream 523899 9731857 ~ 9733351 (+)
G37198 NA non-coding downstream 49738 10310067 ~ 10311163 (+)
G37215 ube2r2 non-coding downstream 141929 10402258 ~ 10434702 (+)
G37238 NA non-coding downstream 193156 10453485 ~ 10453731 (+)
G37337 NA non-coding downstream 266370 10526699 ~ 10526936 (+)
G37342 NA non-coding downstream 293703 10554032 ~ 10559006 (+)
prickle2b prickle2 other upstream 400594 9760233 ~ 9856656 (+)
G36744 NA other upstream 2028530 8227762 ~ 8228720 (+)
hcfc1a hcfc1,LOC102799381,LOC102206223 other upstream 2950907 7288907 ~ 7306343 (+)
G36458 LOC100304472,LOC107385856 other upstream 2984882 7209996 ~ 7272368 (+)
si:dkey-245f22.3 NA other upstream 3070036 7183199 ~ 7187214 (+)
G37197 NA other downstream 44858 10305187 ~ 10309996 (+)
glrx glrx other downstream 127579 10387908 ~ 10396187 (+)
G37397 LOC102299939,LOC103353648,LOC103366902,LOC102208776,LOC100700987,LOC104921056 other downstream 736901 10997230 ~ 11012909 (+)
G37525 evc2 other downstream 1091749 11352078 ~ 11352387 (+)
LOC120557336 LOC103359259,LOC100704408,LOC101476502,LOC102796717,LOC102216118 other downstream 1124855 11385184 ~ 11394398 (+)

Expression


Co-expression Network