mdm4 (mdm4)


Basic Information

Item Value
gene id mdm4
gene name mdm4
gene type misc
species eurasian perch (Perca fluviatilis)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_053115.1
NCBI id CM020912.1
chromosome length 44863486
location 13319684 ~ 13372372 (+)
genome version GENO_Pfluv_1.0_2020_eurasian_perch_Genome

Sequence

>TU51060
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>TU51065
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Function

symbol description
mdm4 Predicted to enable p53 binding activity. Predicted to be involved in regulation of transcription by RNA polymerase II. Predicted to act upstream of or within negative regulation of apoptotic process and regulation of cell cycle. Predicted to be active in nucleus. Orthologous to human MDM4 (MDM4 regulator of p53).

NR:

description
protein Mdm4 isoform X1

GO:

id name namespace
GO:0043066 negative regulation of apoptotic process biological_process
GO:0071157 negative regulation of cell cycle arrest biological_process
GO:0005634 nucleus cellular_component
GO:0008270 zinc ion binding molecular_function

KEGG:

id description
K10127 MDM4, MDMX; protein Mdm4

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU51060 False 1766 TUCP 0.45 5 13365554 13368289
TU51065 False 1905 lncRNA 0.36 3 13319684 13372351
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XM_039797213.1 False 3584 mRNA 0.44 12 13365524 13372372

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
trnar-acg_15 NA coding upstream 33373 13286239 ~ 13286311 (+)
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G38206 NA non-coding downstream 672985 14045357 ~ 14045559 (+)
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LOC120557956 nrn1,LOC104931831,LOC102785075,LOC100692329,LOC102195708,LOC102307414 other downstream 854725 14227097 ~ 14233537 (+)
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cdk4 LOC107684003,LOC107701179 other downstream 1368237 14740609 ~ 14757359 (+)
znf740a LOC107385642,LOC101469799,LOC102214350,LOC102304359,LOC103376569,LOC107082105,LOC100709046 other downstream 1392925 14765297 ~ 14857069 (+)

Expression


Co-expression Network