slc12a5a (LOC103355988)



Basic Information


Item Value
gene id slc12a5a
gene name LOC103355988
gene type misc
species eurasian perch (Perca fluviatilis)
category of species economic fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_053115.1
NCBI id CM020912.1
chromosome length 44863486
location 25208156 ~ 25310553 (+)
genome version GENO_Pfluv_1.0_2020_eurasian_perch_Genome

Sequence


>TU55897
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>XM_039796413.1
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Function


NR:

description
PREDICTED: solute carrier family 12 member 5-like isoform X2

GO:

id name namespace
GO:1902476 chloride transmembrane transport biological_process
GO:0006812 cation transport biological_process
GO:0016021 integral component of membrane cellular_component
GO:0015379 potassium molecular_function

KEGG:

id description
K23967 SLC12A5, KCC2; solute carrier family 12 (potassium/chloride transporter), member 5

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU55897 False 6611 lncRNA 0.39 2 25301713 25310553
XM_039796413.1 True 10261 mRNA 0.45 26 25208156 25310527

Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
LOC120558032 NA coding upstream 87790 25114918 ~ 25120366 (+)
LOC120557917 vapb,LOC101078863,LOC108231687,LOC103355448 coding upstream 261413 24923839 ~ 24946743 (+)
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LOC120556805 bcdin3d,LOC102799648 coding upstream 316742 24888607 ~ 24891414 (+)
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capza1a LOC104945687,LOC106582739 coding downstream 12841 25323394 ~ 25329667 (+)
mov10a LOC103356046,LOC100704454,LOC101471942,LOC102210509,LOC102290565 coding downstream 20595 25331148 ~ 25345776 (+)
tafa3a fam19a3,LOC106517667,LOC104918365,LOC102289964,LOC101471348 coding downstream 94927 25405480 ~ 25523601 (+)
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G41539 NA non-coding upstream 122314 25085414 ~ 25085842 (+)
LOC120557911 NA non-coding upstream 143020 25052836 ~ 25065136 (+)
G41518 NA non-coding upstream 185407 25022458 ~ 25022749 (+)
G41441 NA non-coding upstream 286305 24921636 ~ 24921851 (+)
G41570 NA non-coding downstream 3166 25313719 ~ 25314259 (+)
LOC120558141 NA non-coding downstream 188530 25499083 ~ 25500971 (+)
G41629 NA non-coding downstream 235364 25545917 ~ 25546300 (+)
G41630 NA non-coding downstream 235956 25546509 ~ 25546840 (+)
G41694 rplp2,LOC104941383,LOC104918380 non-coding downstream 574669 25885222 ~ 25887733 (+)
bloc1s1 bloc1s1,LOC102796612 other upstream 647838 24555525 ~ 24560318 (+)
znfx1 NA other upstream 1340644 23848047 ~ 23867512 (+)
cbfa2t2 cbfa2t2 other upstream 1436224 23734948 ~ 23771932 (+)
itga7 itga7 other upstream 3215545 21950376 ~ 21992611 (+)
vgll4b vgll4 other upstream 3864445 21295102 ~ 21343711 (+)
slc16a1a slc16a1,LOC102208676,LOC102781600 other downstream 371854 25682407 ~ 25690935 (+)
LOC120558082 kcna10,LOC104941363 other downstream 456539 25767092 ~ 25872919 (+)
LOC120558088 LOC104941431 other downstream 594216 25904769 ~ 25907738 (+)
G41825 NA other downstream 958049 26268602 ~ 26273315 (+)
G41850 rps10,LOC102793608 other downstream 1231954 26542507 ~ 26548799 (+)

Expression



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